seq1 = pF1KA1144.tfa, 1431 bp
seq2 = pF1KA1144/gi568815590f_98327980.tfa (gi568815590f:98327980_98529410), 201431 bp

>pF1KA1144 1431
>gi568815590f:98327980_98529410 (Chr8)

1-1431  (100001-101431)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGGCCAGAGCCTGTGGGACGTGTCGGAGGCTAACGTCGAGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGGCCAGAGCCTGTGGGACGTGTCGGAGGCTAACGTCGAGGACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGATCCGCATCAATGTGGGCGGCTTCAAGAGGAGGCTGCGCTCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGATCCGCATCAATGTGGGCGGCTTCAAGAGGAGGCTGCGCTCGCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGCTGCGCTTCCCCGAGACGCGCCTGGGCCGCTTGCTGCTCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTGCTGCGCTTCCCCGAGACGCGCCTGGGCCGCTTGCTGCTCTGCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGCGCGAGGCCATTCTGGAGCTCTGCGATGACTACGACGACGTCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGCGCGAGGCCATTCTGGAGCTCTGCGATGACTACGACGACGTCCAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGTTCTACTTCGACCGCAACCCTGAGCTCTTCCCCTACGTGCTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGTTCTACTTCGACCGCAACCCTGAGCTCTTCCCCTACGTGCTGCATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTATCACACCGGCAAGCTTCACGTCATGGCTGAGCTATGTGTCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTATCACACCGGCAAGCTTCACGTCATGGCTGAGCTATGTGTCTTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCAGCCAGGAGATCGAGTACTGGGGCATCAACGAGTTCTTCATTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCAGCCAGGAGATCGAGTACTGGGGCATCAACGAGTTCTTCATTGACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCTGCAGCTACAGCTACCATGGCCGCAAAGTAGAGCCCGAGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCTGCAGCTACAGCTACCATGGCCGCAAAGTAGAGCCCGAGCAGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGGGACGAGCAGAGTGACCAGGAGAGCACCACGTCTTCCTTCGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGGGACGAGCAGAGTGACCAGGAGAGCACCACGTCTTCCTTCGATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCTTGCCTTCTACAACGACGCCTCCAAGTTCGATGGGCAGCCCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCTTGCCTTCTACAACGACGCCTCCAAGTTCGATGGGCAGCCCCTCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAACTTCCGCAGGCAGCTGTGGCTGGCGCTGGACAACCCCGGCTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAACTTCCGCAGGCAGCTGTGGCTGGCGCTGGACAACCCCGGCTACTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAGCAGGGTCTTCAGCATCCTGTCCATCCTGGTGGTGATGGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAGCAGGGTCTTCAGCATCCTGTCCATCCTGGTGGTGATGGGGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCATCACCATGTGCCTCAATAGCCTGCCCGATTTCCAAATCCCTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCATCACCATGTGCCTCAATAGCCTGCCCGATTTCCAAATCCCTGACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCAGGGCAACCCTGGCGAGGACCCTAGGTTCGAAATCGTGGAGCACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCAGGGCAACCCTGGCGAGGACCCTAGGTTCGAAATCGTGGAGCACTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATTGCCTGGTTCACATTTGAGCTGGTGGCCAGGTTTGCTGTGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATTGCCTGGTTCACATTTGAGCTGGTGGCCAGGTTTGCTGTGGCCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACTTCCTCAAGTTCTTCAAGAATGCCCTAAACCTTATTGACCTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACTTCCTCAAGTTCTTCAAGAATGCCCTAAACCTTATTGACCTCATGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATCGTCCCCTTTTACATCACTCTGGTGGTGAACCTGGTGGTGGAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATCGTCCCCTTTTACATCACTCTGGTGGTGAACCTGGTGGTGGAGAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACCTACTTTAGCCAACTTGGGCAGGGTGGCCCAGGTCCTGAGGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACCTACTTTAGCCAACTTGGGCAGGGTGGCCCAGGTCCTGAGGCTGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGGATCTTCCGCATCTTAAAGCTGGCCAGGCACTCCACTGGCCTCCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGGATCTTCCGCATCTTAAAGCTGGCCAGGCACTCCACTGGCCTCCGCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTGGGGGCCACTTTGAAATACAGCTACAAAGAAGTAGGGCTGCTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTGGGGGCCACTTTGAAATACAGCTACAAAGAAGTAGGGCTGCTCTTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTACCTCTCCGTGGGGATTTCCATCTTCTCCGTGGTGGCCTACACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTACCTCTCCGTGGGGATTTCCATCTTCTCCGTGGTGGCCTACACCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAAAGGAGGAGAACGAGGGCCTGGCCACCATCCCTGCCTGCTGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAAAGGAGGAGAACGAGGGCCTGGCCACCATCCCTGCCTGCTGGTGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCTACCGTCAGTATGACCACAGTGGGGTACGGGGATGTGGTCCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCTACCGTCAGTATGACCACAGTGGGGTACGGGGATGTGGTCCCAGGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCACGGCAGGAAAGCTGACTGCCTCTGCCTGCATCTTGGCAGGCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCACGGCAGGAAAGCTGACTGCCTCTGCCTGCATCTTGGCAGGCATCCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GTGGTGGTCCTGCCCATCACCTTGATCTTCAATAAGTTCTCCCACTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GTGGTGGTCCTGCCCATCACCTTGATCTTCAATAAGTTCTCCCACTTTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCGGCGCCAAAAGCAACTTGAGAGTGCCATGCGCAGCTGTGACTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCGGCGCCAAAAGCAACTTGAGAGTGCCATGCGCAGCTGTGACTTTGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGGAATGAAGGAGGTCCCTTCGGTCAATTTAAGGGACTATTATGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGGAATGAAGGAGGTCCCTTCGGTCAATTTAAGGGACTATTATGCCCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAAGTTAAATCCCTTATGGCAAGCCTGACGAACATGAGCAGGAGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAAGTTAAATCCCTTATGGCAAGCCTGACGAACATGAGCAGGAGCTCACC

   1400     .    :    .    :    .    :
   1401 AAGTGAACTCAGTTTAAATGATTCCCTACGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AAGTGAACTCAGTTTAAATGATTCCCTACGT