seq1 = pF1KA1115.tfa, 2643 bp
seq2 = pF1KA1115/gi568815579r_55130613.tfa (gi568815579r:55130613_55347103), 216491 bp

>pF1KA1115 2643
>gi568815579r:55130613_55347103 (Chr19)

(complement)

1-227  (100001-100227)   100% ->
228-414  (101426-101612)   99% ->
415-552  (101702-101839)   100% ->
553-618  (101919-101984)   100% ->
619-731  (104616-104728)   100% ->
732-845  (104825-104938)   100% ->
846-1008  (105465-105627)   99% ->
1009-1161  (105713-105865)   100% ->
1162-1296  (106025-106159)   100% ->
1297-1361  (106804-106868)   100% ->
1362-1477  (106990-107105)   100% ->
1478-1563  (107193-107278)   100% ->
1564-1653  (107421-107510)   100% ->
1654-1751  (107602-107699)   100% ->
1752-1809  (110134-110191)   100% ->
1810-1988  (110283-110461)   100% ->
1989-2125  (114893-115029)   100% ->
2126-2306  (115122-115302)   100% ->
2307-2377  (115436-115506)   100% ->
2378-2459  (115613-115694)   100% ->
2460-2570  (116220-116330)   100% ->
2571-2643  (116420-116491)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTGGAAGTTTGACCTGCACACAAGCTCGCACCTGGACACGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTTGGAAGTTTGACCTGCACACAAGCTCGCACCTGGACACGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCGGGAGGACCTGAGCCTGCCCGAGCTGCTGGACGAGGAAGACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCGGGAGGACCTGAGCCTGCCCGAGCTGCTGGACGAGGAAGACGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGGAGTGCAAGGTCGTCAACCGCAAGCTGCTGGACTTCCTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGGAGTGCAAGGTCGTCAACCGCAAGCTGCTGGACTTCCTGCTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCACCCCACCTGCAAGCAATGGTGGCCTGGGTCACCCAGGAGCCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCACCCCACCTGCAAGCAATGGTGGCCTGGGTCACCCAGGAGCCGCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGCGGTGAGGAGCGGCTGCGCTACAA         GTACCCCAGTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100201 TAGCGGTGAGGAGCGGCTGCGCTACAAGTG...CAGGTACCCCAGTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGCGAGATTCTGACCTCAGATGTGCCCCAGATCAATGATGCCCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101440 CCTGCGAGATTCTGACCTCAGATGTGCCCCAGATCAATGATGCCCTGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCGATGAGTCCCTTCTGAACCGGCTCTACGGCTTCCTGCAGAGCACCGG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101490 GCTGATGAGTCCCTTCTGAACCGGCTCTACGGCTTCCTGCAGAGCACCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCCTCAACCCACTGCTGGCCAGCTTCTTCAGCAAGGTCATGGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101540 CAGCCTCAACCCACTGCTGGCCAGCTTCTTCAGCAAGGTCATGGGCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCATCAACCGCAAGACAGACCAG         CTCGTGTCCTTTCTTCGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101590 TCATCAACCGCAAGACAGACCAGGTG...CAGCTCGTGTCCTTTCTTCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGAAGGATGACTTCGTGGACCTGCTGCTGCAGCACATTGGCACCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101720 AAGAAGGATGACTTCGTGGACCTGCTGCTGCAGCACATTGGCACCTCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCATGGACCTCCTGCTGCGCCTGCTCACCTGTGTGGAGCGGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101770 CATCATGGACCTCCTGCTGCGCCTGCTCACCTGTGTGGAGCGGCCTCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGAGGCAGGATGTTGTCAAT         TGGCTCAACGAGGAGAAGATC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101820 TGAGGCAGGATGTTGTCAATGTG...CAGTGGCTCAACGAGGAGAAGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCCAGCGGCTGATTGAGCAGATCCACCCGTCGAAGGATGAGAAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101940 GTCCAGCGGCTGATTGAGCAGATCCACCCGTCGAAGGATGAGAATGTG..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    619     CAACATTCCAACGCATCCCAGTCCCTGTGTGACATCATCCGCCTGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101990 .CAGCAACATTCCAACGCATCCCAGTCCCTGTGTGACATCATCCGCCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCGGGAGCAGATGATCCAAGTCCAGGACAGCCCAGAGCCTGACCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104662 GCCGGGAGCAGATGATCCAAGTCCAGGACAGCCCAGAGCCTGACCAACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGGCCACCCTGGAGAA         GCAGGAGACGATTGAGCAGCTCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104712 CTGGCCACCCTGGAGAAGTG...CAGGCAGGAGACGATTGAGCAGCTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAGCAACATGTTCGAGGGGGAGCAGAGCCAGTCTGTCATCGTCAGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104849 AAGCAACATGTTCGAGGGGGAGCAGAGCCAGTCTGTCATCGTCAGTGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCAGGTGCTGCTGACCCTGCTGGAGCCCAGGAGGCCGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104899 TCCAGGTGCTGCTGACCCTGCTGGAGCCCAGGAGGCCGAGGTG...CAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCGAGTCCGTGACCGTGAACAGCTTCTTCAGCAGTGTGGATGGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105466 TCCGAGTCCGTGACCGTGAACAGCTTCTTCAGCAGTGTGGATGGGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGAGCTCCTGGCCCAAGGGGCCCTGGAAAGCACTGTGTCCAGTGTGGGCG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105516 GGAGCTCCTGGCCCAGGGGGCCCTGGAAAGCACTGTGTCCAGTGTGGGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCTTGCACGCCCTACGCCCGCGGCTCAGCTGCTTCCACCAGCTCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105566 CCTTGCACGCCCTACGCCCGCGGCTCAGCTGCTTCCACCAGCTCCTGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGCCTCCCAAG         CTGGAGCCGCTACAGATGACATGGGGCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105616 GAGCCTCCCAAGGTC...CAGCTGGAGCCGCTACAGATGACATGGGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCTGGCTCCGCCTCTGGGCAACACGCGGCTGCACGTGGTCAAGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105742 GCTGGCTCCGCCTCTGGGCAACACGCGGCTGCACGTGGTCAAGCTCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCAGTGCCCTGAGCGCCAATGATGCAGCCCTGACGCACGAGCTCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105792 CCAGTGCCCTGAGCGCCAATGATGCAGCCCTGACGCACGAGCTCCTGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGGACGTGCCCAACACCATGCTG         GACCTCTTCTTCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105842 CTGGACGTGCCCAACACCATGCTGGTG...TAGGACCTCTTCTTCCATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGTCTTCAACAACTTCTTGCATGCCCAAGTAGAGGGATGCGTGAGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106042 TGTCTTCAACAACTTCTTGCATGCCCAAGTAGAGGGATGCGTGAGCACCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGCTGAGCTTGGGGCCACCTCCTGACAGCAGCCCTGAGACGCCCATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106092 TGCTGAGCTTGGGGCCACCTCCTGACAGCAGCCCTGAGACGCCCATCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AACCCTGTTGTGAAACAT         CTGCTGCAGCAGTGCCGCCTGGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106142 AACCCTGTTGTGAAACATGTG...CAGCTGCTGCAGCAGTGCCGCCTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGAGCGGATCCTGACGTCCTGGGAGGAGAACGACCGTGTACA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 106827 GGAGCGGATCCTGACGTCCTGGGAGGAGAACGACCGTGTACAGTG...CA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1362  GTGTGCGGGAGGCCCTCGGAAAGGCTACATGGGTCACCTGACAAGAGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106989 GGTGTGCGGGAGGCCCTCGGAAAGGCTACATGGGTCACCTGACAAGAGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GCCGGTGCCCTGGTGCAGAACACGGAGAAGGGGCCCAATGCAGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107039 GCCGGTGCCCTGGTGCAGAACACGGAGAAGGGGCCCAATGCAGAGCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GCGGCAGCTGCTGAAGG         AGCTGCCCAGCGAGCAGCAGGAGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107089 GCGGCAGCTGCTGAAGGGTG...CAGAGCTGCCCAGCGAGCAGCAGGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGTGGGAAGCCTTCGTATCGGGGCCCCTGGCGGAGACCAACAAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107217 AGTGGGAAGCCTTCGTATCGGGGCCCCTGGCGGAGACCAACAAGAAGAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATGGTGGACCTG         GTGAACACCCACCACCTACACTCCTCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107267 ATGGTGGACCTGGTG...CAGGTGAACACCCACCACCTACACTCCTCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGACGATGAGGACGACCGGCTCAAGGAGTTCAACTTCCCTGAGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107450 TGACGATGAGGACGACCGGCTCAAGGAGTTCAACTTCCCTGAGGAGGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGCTGCAGCAG         GCCTTCATGGACTTCCAGATGCAGCGCATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 107500 TGCTGCAGCAGGTG...CAGGCCTTCATGGACTTCCAGATGCAGCGCATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACCTCTGCCTTCATTGACCACTTCGGCTTCAATGATGAGGAGTTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107632 ACCTCTGCCTTCATTGACCACTTCGGCTTCAATGATGAGGAGTTTGGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCAGGAGGAGAGTGTGAA         CGCACCTTTTGACAAGACAGCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 107682 GCAGGAGGAGAGTGTGAAGTG...TAGCGCACCTTTTGACAAGACAGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACATCACCTTCTCCCTCAATGCTGACGATGAGAAC         CCCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110157 ACATCACCTTCTCCCTCAATGCTGACGATGAGAACGTG...CAGCCCAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GCCAACCTACTTGAGATATGCTACAAGGACCGCATCCAGCAGTTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110289 GCCAACCTACTTGAGATATGCTACAAGGACCGCATCCAGCAGTTTGATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGATGAGGAAGAGGAGGACGAGGAAGAGGCCCAGGGCTCAGGGGAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110339 TGATGAGGAAGAGGAGGACGAGGAAGAGGCCCAGGGCTCAGGGGAGTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGGAGAAGATGGCGCCTGGCAGGGCAGCCAGCTGGCCAGGGGGGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110389 ATGGAGAAGATGGCGCCTGGCAGGGCAGCCAGCTGGCCAGGGGGGCCCGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CTGGGCCAGCCACCTGGTGTCCG         GAGTGGAGGCAGCACAGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110439 CTGGGCCAGCCACCTGGTGTCCGGTG...CAGGAGTGGAGGCAGCACAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CAGTGAGGACGAAGAAGAGGAGGACGAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114911 CAGTGAGGACGAAGAAGAGGAGGACGAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GCATTGGCTGTGCAGCCCGTGGAGGGGCCACCCCTCTGTCCTACCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114961 GCATTGGCTGTGCAGCCCGTGGAGGGGCCACCCCTCTGTCCTACCCCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CCTGGCCCTCAGCCTCCAG         GCCCCAGCTGGACAGCCACCTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115011 CCTGGCCCTCAGCCTCCAGGTG...CAGGCCCCAGCTGGACAGCCACCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGACCCAGTGCCTACAGATGCCCCGACCAGCCCCCGAGTCTCCGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115144 TGACCCAGTGCCTACAGATGCCCCGACCAGCCCCCGAGTCTCCGGGGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 AAGAGCTGCACACTGGGCCTCCAGCCCCACAGGGGCCCCTCAGTGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115194 AAGAGCTGCACACTGGGCCTCCAGCCCCACAGGGGCCCCTCAGTGTGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 CAGGGCCTCCCCACTCAGAGCCTGGCCAGCCCTCCTGCCCGTGACGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115244 CAGGGCCTCCCCACTCAGAGCCTGGCCAGCCCTCCTGCCCGTGACGCCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GCAGCTCAG         GTCTCAGGACCCCACACCCCCCTCAGCACCTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 115294 GCAGCTCAGGTG...CAGGTCTCAGGACCCCACACCCCCCTCAGCACCTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AGGAAGCCACAGAAGGCAGCAAAGTCACGGAGCCCTCAG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115468 AGGAAGCCACAGAAGGCAGCAAAGTCACGGAGCCCTCAGGTG...CAGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 CCTTGCCAGGCCTTGGTTAGCATCGGGGACCTTCAGGCCACCTTCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115615 CCTTGCCAGGCCTTGGTTAGCATCGGGGACCTTCAGGCCACCTTCCACGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GATCCGTTCTGCCCCCAGCTCCTCGGACAG         TGCAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115665 GATCCGTTCTGCCCCCAGCTCCTCGGACAGGTG...CAGTGCAACCAGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 ACCCCTCTACCTCTGTCCCAGCCTCCGGGGCCCACCAGCCCCCCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116231 ACCCCTCTACCTCTGTCCCAGCCTCCGGGGCCCACCAGCCCCCCCAGACC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 ACAGAAGGGGAGAAGAGCCCAGAGCCCTTGGGGCTTCCCCAAAGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116281 ACAGAAGGGGAGAAGAGCCCAGAGCCCTTGGGGCTTCCCCAAAGCCAGAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571          TGCCCAGGCCCTCACGCCTCCTCCGATACCCAATGGCTCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116331 GTG...CAGTGCCCAGGCCCTCACGCCTCCTCCGATACCCAATGGCTCTG

   2800     .    :    .    :    .    :
   2612 CCCCGGAAGGGCCTGCATCCCCAGGCTCCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||-
 116461 CCCCGGAAGGGCCTGCATCCCCAGGCTCCCA