Result of SIM4 for
pF1KA1113
seq1 = pF1KA1113.tfa, 3381 bp
seq2 = pF1KA1113/gi568815597r_114297651.tfa (gi568815597r:114297651_114610930), 313280 bp
>pF1KA1113 3381
>gi568815597r:114297651_114610930 (Chr1)
(complement)
1-526 (99855-100380) 100% ->
527-645 (146543-146661) 100% ->
646-790 (147375-147519) 100% ->
791-923 (147695-147827) 100% ->
924-1040 (177198-177314) 100% ->
1041-1155 (180019-180133) 99% ->
1156-1302 (183037-183183) 100% ->
1303-1420 (183637-183754) 100% ->
1421-1695 (185208-185482) 100% ->
1696-1860 (186176-186340) 100% ->
1861-2061 (189295-189495) 100% ->
2062-2194 (200615-200747) 100% ->
2195-2258 (202191-202254) 100% ->
2259-2418 (203831-203990) 100% ->
2419-2768 (205172-205521) 99% ->
2769-2892 (208048-208171) 100% ->
2893-2967 (209468-209542) 100% ->
2968-3120 (211322-211474) 100% ->
3121-3171 (212941-212991) 100% ->
3172-3381 (213071-213280) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGAAAACAAAGGCGGCGGCGAGGCTGAGAGCGGCGGCGGGGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99855 ATGGCGGAAAACAAAGGCGGCGGCGAGGCTGAGAGCGGCGGCGGGGGCAG
50 . : . : . : . : . :
51 CGGCAGCGCGCCGGTAACTGCCGGGGCCGCCGGGCCCGCCGCGCAGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99905 CGGCAGCGCGCCGGTAACTGCCGGGGCCGCCGGGCCCGCCGCGCAGGAGG
100 . : . : . : . : . :
101 CGGAGCCGCCTCTCACCGCGGTGCTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99955 CGGAGCCGCCTCTCACCGCGGTGCTGGTGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGGC
150 . : . : . : . : . :
151 GGCAGGGCCGGCGCTGAGGGCGGCGCGGCCGGGCCCGACGACGGGGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100005 GGCAGGGCCGGCGCTGAGGGCGGCGCGGCCGGGCCCGACGACGGGGGGGT
200 . : . : . : . : . :
201 GGCCGCGGCCTCCTCGGGCTCGGCCCAGGCTGCTTCATCTCCTGCGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100055 GGCCGCGGCCTCCTCGGGCTCGGCCCAGGCTGCTTCATCTCCTGCGGCCT
250 . : . : . : . : . :
251 CAGTGGGCACTGGAGTTGCCGGGGGCGCAGTATCGACGCCGGCTCCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100105 CAGTGGGCACTGGAGTTGCCGGGGGCGCAGTATCGACGCCGGCTCCAGCT
300 . : . : . : . : . :
301 CCAGCCTCGGCTCCCGCTCCGGGTCCCTCGGCAGGGCCGCCTCCTGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100155 CCAGCCTCGGCTCCCGCTCCGGGTCCCTCGGCAGGGCCGCCTCCTGGACC
350 . : . : . : . : . :
351 GCCAGCCTCGCTCCTGGACACCTGCGCCGTGTGTCAGCAGAGCTTGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100205 GCCAGCCTCGCTCCTGGACACCTGCGCCGTGTGTCAGCAGAGCTTGCAGA
400 . : . : . : . : . :
401 GCCGGCGTGAGGCGGAGCCCAAGCTGCTGCCCTGTCTTCACTCCTTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100255 GCCGGCGTGAGGCGGAGCCCAAGCTGCTGCCCTGTCTTCACTCCTTCTGC
450 . : . : . : . : . :
451 CTGCGCTGCCTGCCCGAGCCGGAGCGCCAGCTCAGCGTGCCCATCCCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100305 CTGCGCTGCCTGCCCGAGCCGGAGCGCCAGCTCAGCGTGCCCATCCCGGG
500 . : . : . : . : . :
501 GGGCAGCAACGGCGACATCCAGCAAG TTGGTGTAATACGGT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
100355 GGGCAGCAACGGCGACATCCAGCAAGGTG...TAGTTGGTGTAATACGGT
550 . : . : . : . : . :
542 GCCCAGTATGCCGCCAAGAATGCAGACAGATAGACCTTGTGGATAATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146558 GCCCAGTATGCCGCCAAGAATGCAGACAGATAGACCTTGTGGATAATTAT
600 . : . : . : . : . :
592 TTTGTGAAAGACACATCTGAAGCTCCTAGCAGTTCTGATGAAAAATCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146608 TTTGTGAAAGACACATCTGAAGCTCCTAGCAGTTCTGATGAAAAATCAGA
650 . : . : . : . : . :
642 ACAG GTATGTACTAGTTGTGAAGACAATGCAAGTGCAGTTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146658 ACAGGTA...TAGGTATGTACTAGTTGTGAAGACAATGCAAGTGCAGTTG
700 . : . : . : . : . :
683 GCTTTTGTGTAGAATGTGGAGAGTGGCTATGTAAGACATGTATCGAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147412 GCTTTTGTGTAGAATGTGGAGAGTGGCTATGTAAGACATGTATCGAAGCA
750 . : . : . : . : . :
733 CATCAAAGAGTAAAATTTACTAAAGATCACTTGATCAGGAAGAAAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147462 CATCAAAGAGTAAAATTTACTAAAGATCACTTGATCAGGAAGAAAGAAGA
800 . : . : . : . : . :
783 TGTCTCAG AGTCTGTTGGAGCATCTGGTCAACGCCCTGTTT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
147512 TGTCTCAGGTA...CAGAGTCTGTTGGAGCATCTGGTCAACGCCCTGTTT
850 . : . : . : . : . :
824 TCTGCCCTGTACACAAACAAGAACAGTTGAAACTTTTCTGTGAAACATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147728 TCTGCCCTGTACACAAACAAGAACAGTTGAAACTTTTCTGTGAAACATGT
900 . : . : . : . : . :
874 GATAGATTGACATGTAGAGACTGTCAGCTATTGGAACACAAAGAACATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147778 GATAGATTGACATGTAGAGACTGTCAGCTATTGGAACACAAAGAACATAG
950 . : . : . : . : . :
924 GTATCAGTTTTTGGAAGAAGCTTTTCAAAATCAGAAGGGTG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147828 GTA...AAGGTATCAGTTTTTGGAAGAAGCTTTTCAAAATCAGAAGGGTG
1000 . : . : . : . : . :
965 CAATTGAGAATCTACTGGCGAAACTTCTTGAGAAGAAGAATTATGTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177239 CAATTGAGAATCTACTGGCGAAACTTCTTGAGAAGAAGAATTATGTTCAT
1050 . : . : . : . : . :
1015 TTTGCAGCTACTCAGGTGCAGAATAG GATAAAAGAAGTAAA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
177289 TTTGCAGCTACTCAGGTGCAGAATAGGTA...CAGGATAAAAGAAGTAAA
1100 . : . : . : . : . :
1056 TGAGACTAACAAACGAGTAGAACAGGAAATTAAAGTGGCCATTTTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180034 TGAGACTAACAAACGAGTAGAACAGGAAATTAAAGTGGCCATTTTCACCC
1150 . : . : . : . : . :
1106 TTATCAATGAAATTAATAAGAAAGGAAAATCTCTCTTACAGCAGCTAGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
180084 TTATCAATGAAATTAATAAGAAAGGAAAATCTCTCTTACAACAGCTAGAG
1200 . : . : . : . : . :
1156 AATGTTACAAAGGAAAGACAGATGAAGTTACTACAGCAGCA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180134 GTA...CAGAATGTTACAAAGGAAAGACAGATGAAGTTACTACAGCAGCA
1250 . : . : . : . : . :
1197 GAATGACATCACAGGCCTTTCCCGGCAGGTGAAGCATGTTATGAACTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183078 GAATGACATCACAGGCCTTTCCCGGCAGGTGAAGCATGTTATGAACTTCA
1300 . : . : . : . : . :
1247 CAAATTGGGCAATTGCAAGTGGCAGCAGCACAGCACTACTATACAGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183128 CAAATTGGGCAATTGCAAGTGGCAGCAGCACAGCACTACTATACAGCAAG
1350 . : . : . : . : . :
1297 CGACTG ATTACTTTCCAGTTGCGTCATATTTTGAAAGCACG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
183178 CGACTGGTG...AAGATTACTTTCCAGTTGCGTCATATTTTGAAAGCACG
1400 . : . : . : . : . :
1338 GTGTGATCCTGTCCCTGCTGCTAATGGAGCAATACGTTTCCATTGTGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183672 GTGTGATCCTGTCCCTGCTGCTAATGGAGCAATACGTTTCCATTGTGATC
1450 . : . : . : . : . :
1388 CCACCTTCTGGGCAAAGAATGTAGTCAATTTAG GTAATCTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
183722 CCACCTTCTGGGCAAAGAATGTAGTCAATTTAGGTG...CAGGTAATCTA
1500 . : . : . : . : . :
1429 GTAATAGAGAGTAAACCAGCTCCTGGTTATACTCCTAATGTTGTAGTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185216 GTAATAGAGAGTAAACCAGCTCCTGGTTATACTCCTAATGTTGTAGTTGG
1550 . : . : . : . : . :
1479 GCAAGTTCCTCCAGGGACAAACCACATTAGTAAAACCCCTGGACAGATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185266 GCAAGTTCCTCCAGGGACAAACCACATTAGTAAAACCCCTGGACAGATTA
1600 . : . : . : . : . :
1529 ACTTAGCACAGCTTCGACTCCAGCACATGCAACAACAAGTATATGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185316 ACTTAGCACAGCTTCGACTCCAGCACATGCAACAACAAGTATATGCACAG
1650 . : . : . : . : . :
1579 AAACATCAGCAGTTGCAACAGATGAGGATGCAGCAACCACCAGCACCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185366 AAACATCAGCAGTTGCAACAGATGAGGATGCAGCAACCACCAGCACCTGT
1700 . : . : . : . : . :
1629 ACCAACTACAACAACAACAACACAACAGCATCCTAGACAAGCAGCCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185416 ACCAACTACAACAACAACAACACAACAGCATCCTAGACAAGCAGCCCCTC
1750 . : . : . : . : . :
1679 AGATGTTACAACAACAG CCTCCTCGATTGATCAGTGTGCAA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
185466 AGATGTTACAACAACAGGTA...TAGCCTCCTCGATTGATCAGTGTGCAA
1800 . : . : . : . : . :
1720 ACAATGCAAAGAGGCAACATGAACTGTGGAGCTTTTCAAGCCCATCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186200 ACAATGCAAAGAGGCAACATGAACTGTGGAGCTTTTCAAGCCCATCAGAT
1850 . : . : . : . : . :
1770 GAGACTGGCTCAGAATGCTGCCAGAATACCAGGGATACCCAGGCACAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186250 GAGACTGGCTCAGAATGCTGCCAGAATACCAGGGATACCCAGGCACAGCG
1900 . : . : . : . : . :
1820 GCCCTCAATATTCCATGATGCAGCCACACCTCCAAAGACAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
186300 GCCCTCAATATTCCATGATGCAGCCACACCTCCAAAGACAAGTA...TAG
1950 . : . : . : . : . :
1861 CACTCAAACCCAGGGCATGCTGGACCCTTTCCCGTAGTATCGGTACACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189295 CACTCAAACCCAGGGCATGCTGGACCCTTTCCCGTAGTATCGGTACACAA
2000 . : . : . : . : . :
1911 CACCACAATCAACCCAACGAGCCCTACTACAGCAACTATGGCAAATGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189345 CACCACAATCAACCCAACGAGCCCTACTACAGCAACTATGGCAAATGCAA
2050 . : . : . : . : . :
1961 ACCGAGGTCCCACCAGCCCATCTGTTACAGCAATAGAGCTAATCCCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189395 ACCGAGGTCCCACCAGCCCATCTGTTACAGCAATAGAGCTAATCCCCTCA
2100 . : . : . : . : . :
2011 GTTACCAATCCAGAAAACCTTCCATCGCTGCCAGATATTCCACCCATACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189445 GTTACCAATCCAGAAAACCTTCCATCGCTGCCAGATATTCCACCCATACA
2150 . : . : . : . : . :
2061 G TTGGAAGATGCTGGCTCAAGTAGTTTAGATAATCTACTAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189495 GGTT...CAGTTGGAAGATGCTGGCTCAAGTAGTTTAGATAATCTACTAA
2200 . : . : . : . : . :
2102 GTAGATACATCTCAGGCAGTCACCTACCCCCACAGCCTACAAGCACCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200655 GTAGATACATCTCAGGCAGTCACCTACCCCCACAGCCTACAAGCACCATG
2250 . : . : . : . : . :
2152 AATCCTTCTCCAGGTCCCTCTGCCCTTTCTCCGGGATCATCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
200705 AATCCTTCTCCAGGTCCCTCTGCCCTTTCTCCGGGATCATCAGGTA...T
2300 . : . : . : . : . :
2195 GTTTATCCAATTCTCACACACCTGTGAGACCCCCAAGTACTTCTAGTA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202189 AGGTTTATCCAATTCTCACACACCTGTGAGACCCCCAAGTACTTCTAGTA
2350 . : . : . : . : . :
2243 CTGGCAGTCGAGGCAG CTGTGGGTCATCAGGAAGAACTGCT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
202239 CTGGCAGTCGAGGCAGGTG...TAGCTGTGGGTCATCAGGAAGAACTGCT
2400 . : . : . : . : . :
2284 GAGAAGACAAGTCTTAGTTTCAAATCTGATCAGGTGAAGGTCAAGCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203856 GAGAAGACAAGTCTTAGTTTCAAATCTGATCAGGTGAAGGTCAAGCAAGA
2450 . : . : . : . : . :
2334 ACCTGGGACTGAAGATGAAATATGTAGCTTTTCAGGAGGTGTAAAACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203906 ACCTGGGACTGAAGATGAAATATGTAGCTTTTCAGGAGGTGTAAAACAAG
2500 . : . : . : . : . :
2384 AAAAAACAGAGGATGGCAGGAGGAGTGCTTGCATG TTGAGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
203956 AAAAAACAGAGGATGGCAGGAGGAGTGCTTGCATGGTA...TAGTTGAGC
2550 . : . : . : . : . :
2425 AGTCCTGAGAGTAGCTTGACACCACCTCTCTCAACCAACCTGCATCTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
205178 AGTCCTGAGAGTAGCTTGACACCACCTCTCTCAACCAACCTGCATCTAGA
2600 . : . : . : . : . :
2475 AAGTGAATTGGATGCATTGGCAAGCCTGGAAAACCATGTGAAAACTGAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
205228 AAGTGAATTGGATGCATTGGCAAGCCTGGAAAACCATGTGAAAATTGAAC
2650 . : . : . : . : . :
2525 CTGCAGATATGAATGAAAGCTGCAAACAGTCAGGGCTCAGCAGCCTTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
205278 CTGCAGATATGAATGAAAGCTGCAAACAGTCAGGGCTCAGCAGCCTTGTT
2700 . : . : . : . : . :
2575 AATGGAAAGTCCCCAATTCGAAGCCTCATGCACAGGTCGGCAAGGATTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
205328 AATGGAAAGTCCCCAATTCGAAGCCTCATGCACAGGTCGGCAAGGATTGG
2750 . : . : . : . : . :
2625 AGGAGATGGCAACAATAAAGATGATGACCCAAATGAAGACTGGTGTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
205378 AGGAGATGGCAACAATAAAGATGATGACCCAAATGAAGACTGGTGTGCTG
2800 . : . : . : . : . :
2675 TCTGCCAAAACGGAGGAGATCTCTTGTGCTGCGAAAAATGTCCAAAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
205428 TCTGCCAAAACGGAGGAGATCTCTTGTGCTGCGAAAAATGTCCAAAGGTC
2850 . : . : . : . : . :
2725 TTTCATCTAACTTGTCATGTTCCAACACTACTTAGCTTTCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
205478 TTTCATCTAACTTGTCATGTTCCAACACTACTTAGCTTTCCAAGGTA...
2900 . : . : . : . : . :
2769 TGGGGACTGGATATGCACATTTTGTAGAGATATTGGAAAGCCAGAAG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
208045 TAGTGGGGACTGGATATGCACATTTTGTAGAGATATTGGAAAGCCAGAAG
2950 . : . : . : . : . :
2816 TTGAATATGATTGTGATAATTTGCAACATAGTAAGAAGGGGAAAACTGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
208095 TTGAATATGATTGTGATAATTTGCAACATAGTAAGAAGGGGAAAACTGCG
3000 . : . : . : . : . :
2866 CAGGGGTTAAGCCCCGTGGACCAAAGG AAATGTGAACGTCT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
208145 CAGGGGTTAAGCCCCGTGGACCAAAGGGTA...CAGAAATGTGAACGTCT
3050 . : . : . : . : . :
2907 TCTGCTTTACCTCTATTGCCATGAATTAAGTATTGAATTCCAGGAGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
209482 TCTGCTTTACCTCTATTGCCATGAATTAAGTATTGAATTCCAGGAGCCTG
3100 . : . : . : . : . :
2957 TTCCTGCTTCG ATACCAAACTACTATAAAATTATAAAGAAA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
209532 TTCCTGCTTCGGTG...TAGATACCAAACTACTATAAAATTATAAAGAAA
3150 . : . : . : . : . :
2998 CCAATGGATTTATCCACCGTGAAAAAGAAGCTTCAGAAAAAACATTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211352 CCAATGGATTTATCCACCGTGAAAAAGAAGCTTCAGAAAAAACATTCCCA
3200 . : . : . : . : . :
3048 ACACTACCAAATCCCGGATGACTTTGTGGCCGATGTCCGTTTGATCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211402 ACACTACCAAATCCCGGATGACTTTGTGGCCGATGTCCGTTTGATCTTCA
3250 . : . : . : . : . :
3098 AGAACTGTGAAAGGTTTAATGAA ATGATGAAAGTTGTTCAA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
211452 AGAACTGTGAAAGGTTTAATGAAGTA...TAGATGATGAAAGTTGTTCAA
3300 . : . : . : . : . :
3139 GTTTATGCAGACACACAAGAGATTAATTTGAAG GCTGATTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
212959 GTTTATGCAGACACACAAGAGATTAATTTGAAGGTA...CAGGCTGATTC
3350 . : . : . : . : . :
3180 AGAAGTAGCTCAGGCAGGGAAAGCAGTTGCATTGTACTTTGAAGATAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213079 AGAAGTAGCTCAGGCAGGGAAAGCAGTTGCATTGTACTTTGAAGATAAAC
3400 . : . : . : . : . :
3230 TCACAGAGATCTACTCAGACAGGACCTTCGCACCTTTGCCAGAGTTTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213129 TCACAGAGATCTACTCAGACAGGACCTTCGCACCTTTGCCAGAGTTTGAG
3450 . : . : . : . : . :
3280 CAGGAAGAGGATGATGGTGAGGTAACTGAGGACTCTGATGAAGACTTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213179 CAGGAAGAGGATGATGGTGAGGTAACTGAGGACTCTGATGAAGACTTTAT
3500 . : . : . : . : . :
3330 ACAGCCCCGCAGAAAACGCCTAAAGTCAGATGAGAGACCAGTACATATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213229 ACAGCCCCGCAGAAAACGCCTAAAGTCAGATGAGAGACCAGTACATATAA
3550
3380 AG
||
213279 AG