seq1 = pF1KA1033.tfa, 3519 bp
seq2 = pF1KA1033/gi568815586f_105007801.tfa (gi568815586f:105007801_105266928), 259128 bp

>pF1KA1033 3519
>gi568815586f:105007801_105266928 (Chr12)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-201  (103325-103464)   100% ->
202-255  (106416-106469)   100% ->
256-321  (106562-106627)   100% ->
322-367  (107384-107429)   100% ->
368-435  (107861-107928)   100% ->
436-518  (110646-110728)   100% ->
519-561  (112755-112797)   100% ->
562-665  (113301-113404)   100% ->
666-786  (114318-114438)   100% ->
787-910  (118204-118327)   100% ->
911-1038  (118435-118562)   100% ->
1039-1199  (119329-119489)   100% ->
1200-1326  (125970-126096)   100% ->
1327-1452  (130086-130211)   100% ->
1453-1560  (132494-132601)   100% ->
1561-1707  (133099-133245)   100% ->
1708-1787  (133367-133446)   100% ->
1788-1893  (134653-134758)   100% ->
1894-2010  (135327-135443)   100% ->
2011-2179  (136487-136655)   100% ->
2180-2334  (136918-137072)   100% ->
2335-2409  (138652-138726)   100% ->
2410-2514  (139242-139346)   100% ->
2515-2649  (141815-141949)   100% ->
2650-2758  (144543-144651)   99% ->
2759-2825  (148926-148992)   100% ->
2826-2912  (149436-149522)   100% ->
2913-3060  (152201-152348)   100% ->
3061-3157  (154949-155045)   100% ->
3158-3354  (156311-156507)   100% ->
3355-3454  (156841-156940)   100% ->
3455-3519  (159064-159128)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGAGACTCTGTCCCCGGACTGGGAGTTTGACCGCGTTGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTGGAGACTCTGTCCCCGGACTGGGAGTTTGACCGCGTTGACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTCGCAGA         AAATTCATGCCGAAGTCCAACTTAAGAATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTCGCAGAGTA...TAGAAATTCATGCCGAAGTCCAACTTAAGAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGGGAAATTTCTTGAGGAGTATACCTCTCAACTGAGAAGAATTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103355 ATGGGAAATTTCTTGAGGAGTATACCTCTCAACTGAGAAGAATTGAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTCTGGATGACTCAATTGGAGATGTTTGGGATTTCAATCTTGATCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103405 GCTCTGGATGACTCAATTGGAGATGTTTGGGATTTCAATCTTGATCCTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCATTAAAG         CTTTTGCCTTATGAACAGTCCTCTCTTTTGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103455 AGCATTAAAGGTT...TAGCTTTTGCCTTATGAACAGTCCTCTCTTTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACTCATAAAGACTGAAAACAAG         GTCTTAAACAAAGTCATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106447 AACTCATAAAGACTGAAAACAAGGTA...TAGGTCTTAAACAAAGTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACTGTTTATGCTGCACTTTGTTGTGAAATCAAGAAATTAAAATATGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106580 ACTGTTTATGCTGCACTTTGTTGTGAAATCAAGAAATTAAAATATGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322        GCTGAAACTAAATTTTACAATGGTCTCTTGTTTTATGGAGAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106630 A...CAGGCTGAAACTAAATTTTACAATGGTCTCTTGTTTTATGGAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GAG         CTACAGATGCCAGCATGGTGGAAGGTGATTGCCAAATT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107427 GAGGTA...CAGCTACAGATGCCAGCATGGTGGAAGGTGATTGCCAAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CAAATGGGGAGATTTATTTCATTCTTACAG         GAACTGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107899 CAAATGGGGAGATTTATTTCATTCTTACAGGTA...CAGGAACTGTCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 CTTTGTTACGAGGTGCTATGAAGTGGTGATGAACGTAGTCCACCAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110657 CTTTGTTACGAGGTGCTATGAAGTGGTGATGAACGTAGTCCACCAGTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CTGCCCTCTATATCAGTAACAA         GATTGCACCCAAAATTATA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110707 CTGCCCTCTATATCAGTAACAAGTA...TAGGATTGCACCCAAAATTATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GAGACAACTGGAGTTCATTTTCAG         ACTATGTATGAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 112774 GAGACAACTGGAGTTCATTTTCAGGTA...CAGACTATGTATGAGCACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 GGGAGAACTGCTAACAGTTTTGCTCACCCTGGATGAAATTATTGATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113318 GGGAGAACTGCTAACAGTTTTGCTCACCCTGGATGAAATTATTGATAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 ATATCACACTGAAAGACCACTGGACTATGTACAAAAG         GTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113368 ATATCACACTGAAAGACCACTGGACTATGTACAAAAGGTA...AAGGTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 CTGAAATCTGTCCATCACAATCCTTCAAAATTTGGAATTCAGGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114322 CTGAAATCTGTCCATCACAATCCTTCAAAATTTGGAATTCAGGAAGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 ATTAAAGCCATTTGAAAAGTTCTTGCTGAAGCTAGAAGGGCAATTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114372 ATTAAAGCCATTTGAAAAGTTCTTGCTGAAGCTAGAAGGGCAATTACTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 ATGGAATGATATTCCAG         GCCTGTATAGAACAACAATTTGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114422 ATGGAATGATATTCCAGGTA...TAGGCCTGTATAGAACAACAATTTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 TCTCTCAATGGAGGAGTATCTGTGTCAAAAAATAGTACTTTTGCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118228 TCTCTCAATGGAGGAGTATCTGTGTCAAAAAATAGTACTTTTGCTGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 ATTTGCACATAGTATTCGGTCAATTTTTGCAAATGTAGAAGCCAAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118278 ATTTGCACATAGTATTCGGTCAATTTTTGCAAATGTAGAAGCCAAACTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911          GAGAACCTTCTGAAATTGACCAGAGAGACAAGTATGTTGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118328 GTA...AAGGAGAACCTTCTGAAATTGACCAGAGAGACAAGTATGTTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 ATTTGTGGACTCTTTGTATTGCACTTTCAGATTTTTCGAACTATTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118476 ATTTGTGGACTCTTTGTATTGCACTTTCAGATTTTTCGAACTATTGATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 AAAGTTTTATAAGTCTTTATTGGACATTTGTAAGAAG         GTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118526 AAAGTTTTATAAGTCTTTATTGGACATTTGTAAGAAGGTA...CAGGTAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 CAGCCATCACTCTAACTGCTAATATTATTTGGTTTCCTGATAATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119333 CAGCCATCACTCTAACTGCTAATATTATTTGGTTTCCTGATAATTTTCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 ATCCAGAAAATACCAGCAGCTGCCAAACTGCTAGACAGAAAAAGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119383 ATCCAGAAAATACCAGCAGCTGCCAAACTGCTAGACAGAAAAAGTCTTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 AGCCATTAAAATACACAGGGATACTTTTCTACAACAGAAAGCTCAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119433 AGCCATTAAAATACACAGGGATACTTTTCTACAACAGAAAGCTCAATCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTACCAA         AGATGTACAGTCTTACTACGTCTTTGTGAGCTCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119483 TTACCAAGTA...TAGAGATGTACAGTCTTACTACGTCTTTGTGAGCTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 TGGATGATGAAAATGGAATCTATTTTGTCTAAAGAGCAGAGAATGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126004 TGGATGATGAAAATGGAATCTATTTTGTCTAAAGAGCAGAGAATGGATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 ATTTGCTGAAGATCTCACCAATAGATGTAATGTTTTTATACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 126054 ATTTGCTGAAGATCTCACCAATAGATGTAATGTTTTTATACAGGTA...C

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1327   GGCTTCTTGTATGCATATAGTATTAGTACCATTATTAAAACCACAATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130084 AGGGCTTCTTGTATGCATATAGTATTAGTACCATTATTAAAACCACAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 AATCTCTACATGTCCATGCAAAAGCCAATGACCAAAACCTCAGTTAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130134 AATCTCTACATGTCCATGCAAAAGCCAATGACCAAAACCTCAGTTAAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 ATTGTGCAGGCTTGTTGAACTTCTCAAG         GCAATAGAGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 130184 ATTGTGCAGGCTTGTTGAACTTCTCAAGGTA...TAGGCAATAGAGCATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TGTTCTACAGGAGAAGCATGGTTGTGGCTGATTCAGTTTCACATATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132507 TGTTCTACAGGAGAAGCATGGTTGTGGCTGATTCAGTTTCACATATAACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CAGCACCTTCAACATCAGGCTCTTCATTCTATTTCTGTGGCCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 132557 CAGCACCTTCAACATCAGGCTCTTCATTCTATTTCTGTGGCCAAGGTA..

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561     AAAAGAGTGATTTCTGACAAAAAATACAGCGAACAGCGTCTTGATG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132607 .AAGAAAAGAGTGATTTCTGACAAAAAATACAGCGAACAGCGTCTTGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 TGCTCTCTGCTCTAGTTTTGGCTGAAAACACTCTAAATGGACCAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133145 TGCTCTCTGCTCTAGTTTTGGCTGAAAACACTCTAAATGGACCAAGCACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 AAGCAACGGCGACTTATTGTTTCTTTGGCACTAAGTGTTGGCACACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133195 AAGCAACGGCGACTTATTGTTTCTTTGGCACTAAGTGTTGGCACACAAAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 G         AAAACATTTAAAGATGAAGAACTCTTTCCACTTCAAGTAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133245 GGTA...TAGAAAACATTTAAAGATGAAGAACTCTTTCCACTTCAAGTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 TCATGAAAAAACTGGATCTTATTAGTGAACTTAGAGAACG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 133407 TCATGAAAAAACTGGATCTTATTAGTGAACTTAGAGAACGGTA...TAGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GTCCAAACACAATGTGACTGTTGTTTTTTATACTGGCATCGAGCTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134654 GTCCAAACACAATGTGACTGTTGTTTTTTATACTGGCATCGAGCTGTCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CCCAATTTATTTAGATGATGTATATGAAAATGCTGTTGATGCAGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134704 CCCAATTTATTTAGATGATGTATATGAAAATGCTGTTGATGCAGCCAGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 TACAT         TACATGTTCAGTGCTTTGCGCGACTGTGTACCTGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134754 TACATGTA...TAGTACATGTTCAGTGCTTTGCGCGACTGTGTACCTGCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 ATGATGCATGCAAGGCATTTAGAGTCCTATGAGATACTTCTGGATTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135363 ATGATGCATGCAAGGCATTTAGAGTCCTATGAGATACTTCTGGATTGCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 TGACAAGGAAATTATGGAAATTTTAAATGAG         CATTTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 135413 TGACAAGGAAATTATGGAAATTTTAAATGAGGTA...TAGCATTTGCTGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 ACAAATTATGCAAAGAAATAGAGAAAGATCTGCGACTTTCTGTGCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136497 ACAAATTATGCAAAGAAATAGAGAAAGATCTGCGACTTTCTGTGCATACT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 CATTTAAAGCTGGATGACCGAAACCCTTTCAAAGTTGGCATGAAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136547 CATTTAAAGCTGGATGACCGAAACCCTTTCAAAGTTGGCATGAAAGACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 GGCTCTTTTTTTCTCTCTGAATCCAATTCGGTTTTTCAATCGTTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136597 GGCTCTTTTTTTCTCTCTGAATCCAATTCGGTTTTTCAATCGTTTCATTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 ACATTCGGG         CTTACGTAACTCACTACCTAGACAAGACTTTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 136647 ACATTCGGGGTG...TAGCTTACGTAACTCACTACCTAGACAAGACTTTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 TACAATCTAACAACTGTAGCCCTTCATGACTGGGCCACTTATAGTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136950 TACAATCTAACAACTGTAGCCCTTCATGACTGGGCCACTTATAGTGAGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 GAGAAACTTAGCTACTCAGCGTTATGGACTGGTTATGACAGAGGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137000 GAGAAACTTAGCTACTCAGCGTTATGGACTGGTTATGACAGAGGCACATC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 TTCCCAGTCAGACTTTGGAACAG         GGCCTTGATGTTTTAGAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 137050 TTCCCAGTCAGACTTTGGAACAGGTA...TAGGGCCTTGATGTTTTAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 ATTATGAGAAACATTCATATATTTGTGTCCCGATACCTCTATAATCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138670 ATTATGAGAAACATTCATATATTTGTGTCCCGATACCTCTATAATCTCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 CAATCAG         ATTTTTATTGAACGAACAAGCAATAACAAGCATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138720 CAATCAGGTG...CAGATTTTTATTGAACGAACAAGCAATAACAAGCATT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2444 TGAATACTATTAATATTCGGCATATTGCTAATTCAATTCGAACACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139276 TGAATACTATTAATATTCGGCATATTGCTAATTCAATTCGAACACATGGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2494 ACGGGAATTATGAATACAACT         GTTAATTTCACCTACCAGTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 139326 ACGGGAATTATGAATACAACTGTA...TAGGTTAATTTCACCTACCAGTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2535 TTTGAAAAAGAAGTTCTATATATTTAGCCAATTTATGTATGATGAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141835 TTTGAAAAAGAAGTTCTATATATTTAGCCAATTTATGTATGATGAACACA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2585 TCAAATCCAGATTGATTAAAGATATTCGATTTTTCAGGGAAATTAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141885 TCAAATCCAGATTGATTAAAGATATTCGATTTTTCAGGGAAATTAAGGAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2635 CAAAATGATCATAAG         TATCCTTTTGATAGAGCAGAAAAATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 141935 CAAAATGATCATAAGGTA...TAGTATCCTTTTGATAGAGCAGAAAAATT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2676 CAATCGAGGCATCAGAAAACTTGGAATAACACCTGAGGGACAGAGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 144569 CAATCGAGGCATCAGAAAACTTGGAGTAACACCTGAGGGACAGAGCTACC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2726 TTGATCAATTCAGGCAACTCATCAGCCAGATTG         GTAATGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 144619 TTGATCAATTCAGGCAACTCATCAGCCAGATTGGTA...AAGGTAATGCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2767 ATGGGCTATGTACGAATGATAAGATCTGGTGGTCTTCATTGTAGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148934 ATGGGCTATGTACGAATGATAAGATCTGGTGGTCTTCATTGTAGCAGCAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2817 TGCCATTAG         ATTTGTTCCTGATCTTGAAGATATTGTAAATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 148984 TGCCATTAGGTA...TAGATTTGTTCCTGATCTTGAAGATATTGTAAATT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2858 TTGAAGAACTAGTAAAAGAAGAAGGTCTTGCAGAAGAAACATTAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149468 TTGAAGAACTAGTAAAAGAAGAAGGTCTTGCAGAAGAAACATTAAAAGCA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2908 GCAAG         GCATTTGGATTCAGTCCTCAGTGATCACACACGAAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149518 GCAAGGTA...TAGGCATTTGGATTCAGTCCTCAGTGATCACACACGAAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2949 TTCTGCCGAAGGCACAGAATATTTCAAAATGCTTGTAGACGTTTTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152237 TTCTGCCGAAGGCACAGAATATTTCAAAATGCTTGTAGACGTTTTTGCTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2999 CAGAATTTCGAAGGCCAAAGAATATACATCTCCGAAATTTCTATATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152287 CAGAATTTCGAAGGCCAAAGAATATACATCTCCGAAATTTCTATATAATT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3049 GTTCCCCCTCTG         ACCCTCAACTTTGTAGAGCATTCCATTAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 152337 GTTCCCCCTCTGGTG...TAGACCCTCAACTTTGTAGAGCATTCCATTAG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3090 TTGCAAGGAAAAATTAAATAAAAAAAATAAAATTGGAGCTGCCTTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154978 TTGCAAGGAAAAATTAAATAAAAAAAATAAAATTGGAGCTGCCTTTACTG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3140 ATGATGGCTTTGCCATGG         GTGTGGCTTACATTCTAAAGCTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 155028 ATGATGGCTTTGCCATGGGTA...CAGGTGTGGCTTACATTCTAAAGCTT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3181 TTGGATCAGTATCGGGAGTTTGATTCACTTCACTGGTTCCAGTCTGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156334 TTGGATCAGTATCGGGAGTTTGATTCACTTCACTGGTTCCAGTCTGTTAG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3231 AGAGAAATACCTGAAGGAGATAAGAGCAGTTGCTAAGCAACAGAATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156384 AGAGAAATACCTGAAGGAGATAAGAGCAGTTGCTAAGCAACAGAATGTAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3281 AGTCAGCCAGTCAAGATGAAAAACTCTTACAAACCATGAATCTCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156434 AGTCAGCCAGTCAAGATGAAAAACTCTTACAAACCATGAATCTCACTCAG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3331 AAGCGACTGGATGTCTATCTACAG         GAATTTGAATTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 156484 AAGCGACTGGATGTCTATCTACAGGTA...TAGGAATTTGAATTGCTGTA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3372 TTTCTCACTGAGCAGTGCAAGAATTTTCTTCAGAGCAGACAAGACTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156858 TTTCTCACTGAGCAGTGCAAGAATTTTCTTCAGAGCAGACAAGACTGCGG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3422 CTGAAGAAAACCAAGAAAAGAAAGAGAAGGAAG         AAGAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 156908 CTGAAGAAAACCAAGAAAAGAAAGAGAAGGAAGGTC...CAGAAGAAACT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3463 AAAACAAGCAATGGAGACCTGTCTGACAGCACTGTGTCTGCTGATCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159072 AAAACAAGCAATGGAGACCTGTCTGACAGCACTGTGTCTGCTGATCCTGT

   3800     .
   3513 TGTGAAA
        |||||||
 159122 TGTGAAA