seq1 = pF1KA1006.tfa, 3558 bp
seq2 = pF1KA1006/gi568815595f_120809579.tfa (gi568815595f:120809579_121519094), 709516 bp

>pF1KA1006 3558
>gi568815595f:120809579_121519094 (Chr3)

1-189  (100001-100189)   100% ->
190-287  (145362-145459)   100% ->
288-369  (232122-232203)   100% ->
370-470  (235857-235957)   100% ->
471-605  (305347-305481)   100% ->
606-669  (312063-312126)   100% ->
670-753  (342899-342982)   100% ->
754-877  (347926-348049)   100% ->
878-956  (396345-396423)   100% ->
957-1111  (413425-413579)   100% ->
1112-1184  (424038-424110)   100% ->
1185-1332  (429393-429540)   100% ->
1333-1400  (430862-430929)   100% ->
1401-1441  (441145-441185)   100% ->
1442-1659  (445317-445534)   100% ->
1660-1832  (447583-447755)   100% ->
1833-1958  (449465-449590)   100% ->
1959-2110  (470227-470378)   100% ->
2111-2182  (472688-472759)   100% ->
2183-2248  (508897-508962)   100% ->
2249-2419  (569138-569308)   100% ->
2420-2659  (571715-571954)   100% ->
2660-3020  (597665-598025)   100% ->
3021-3186  (603580-603745)   100% ->
3187-3298  (606279-606390)   100% ->
3299-3519  (608759-608979)   100% ->
3520-3558  (609478-609516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAGTTTAATTTCCGAAAAGTTTTGGATGGCTTAACTGCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAGTTTAATTTCCGAAAAGTTTTGGATGGCTTAACTGCCTCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGGCAGTGGTAGCAGCAGTGGCAGTAACAGTGGTGGTGGGGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGGCAGTGGTAGCAGCAGTGGCAGTAACAGTGGTGGTGGGGCTGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGGTTCCGTACATCCGGCGGGGACTGCAGGGGTTCTCAGAGAGGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGGTTCCGTACATCCGGCGGGGACTGCAGGGGTTCTCAGAGAGGAAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAAACTTTGACTTCGGAGTATTTCCAGATTTGCAAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 CAGGAAACTTTGACTTCGGAGTATTTCCAGATTTGCAAGGTA...CAGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTTCGGCATGGTTTTCCTCATCAGCCCACAGCATTAGCCTTTGATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145364 AGTTCGGCATGGTTTTCCTCATCAGCCCACAGCATTAGCCTTTGATCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCAGAAAATCTTGGCTATTGGGACGAGAACAGGTGCTATACGAAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 145414 TTCAGAAAATCTTGGCTATTGGGACGAGAACAGGTGCTATACGAATGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    288      ACTCGGGAGACCTGGTGTTGATTGCTATTGCCAACATGAAAGTGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145464 ..TAGACTCGGGAGACCTGGTGTTGATTGCTATTGCCAACATGAAAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCAGCTGTCCTACAGCTCCAATTTTTGATCAATGAG         GGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 232167 TGCAGCTGTCCTACAGCTCCAATTTTTGATCAATGAGGTA...TAGGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTTGGTCAGTGCAAGTTCAGATGATACACTTCATTTGTGGAACCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235861 CCTTGGTCAGTGCAAGTTCAGATGATACACTTCATTTGTGGAACCTTAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAAAAAAGGCCAGCCATACTCCATTCTCTTAAATTTAACCGGGAACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 235911 CAAAAAAGGCCAGCCATACTCCATTCTCTTAAATTTAACCGGGAACGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    471       AATTACTTACTGTCATCTACCTTTCCAGAGTAAATGGCTTTATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235961 ...CAGAATTACTTACTGTCATCTACCTTTCCAGAGTAAATGGCTTTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGGAACAGAAAGAGGAAATACACATATTGTAAATATTGAATCTTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305391 TTGGAACAGAAAGAGGAAATACACATATTGTAAATATTGAATCTTTCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTTCTGGATATGTTATCATGTGGAACAAGGCAATTGAACT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 305441 CTTTCTGGATATGTTATCATGTGGAACAAGGCAATTGAACTGTA...CAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATCCACTAAGACTCATCCAGGTCCAGTTGTACATTTAAGCGATAGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 312063 ATCCACTAAGACTCATCCAGGTCCAGTTGTACATTTAAGCGATAGCCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGATGAAGGCAAA         CTGCTAATAGGTTATGAAAATGGTACT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 312113 GAGATGAAGGCAAAGTG...CAGCTGCTAATAGGTTATGAAAATGGTACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTAGTATTCTGGGACTTGAAATCTAAAAGAGCAGAACTGAGAGTTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 342926 GTAGTATTCTGGGACTTGAAATCTAAAAGAGCAGAACTGAGAGTTTATTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGATGAG         GCTATTCATTCAATTGATTGGCATCATGAGGGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 342976 TGATGAGGTA...TAGGCTATTCATTCAATTGATTGGCATCATGAGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AACAGTTCATGTGCAGCCATTCAGATGGTAGTTTGACTTTATGGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 347960 AACAGTTCATGTGCAGCCATTCAGATGGTAGTTTGACTTTATGGAACCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAAAGCCCAAGTCGCCCTTTCCAGACCACAATTCCACATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 348010 AAAAGCCCAAGTCGCCCTTTCCAGACCACAATTCCACATGGTA...TAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAAAAGTCAAAGAGAAGGAAGAAAATCTGAATCTTGTAAACCAATTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396346 AAAAAGTCAAAGAGAAGGAAGAAAATCTGAATCTTGTAAACCAATTCTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAGTAGAATACAAGACCTGCAAAAACAG         CGAACCATTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 396396 AAGTAGAATACAAGACCTGCAAAAACAGGTA...TAGCGAACCATTCATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATATTCTCTGGTGGGCTGTCCTATGACAAAGCTTGTAGAAGACCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 413438 ATATTCTCTGGTGGGCTGTCCTATGACAAAGCTTGTAGAAGACCAAGTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AACCATCATGCATGGAAAAGCAATTACAGTACTTGAAATGGATCATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 413488 AACCATCATGCATGGAAAAGCAATTACAGTACTTGAAATGGATCATCCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTGTTGAATTTCTAACTTTATGTGAAACGCCCTATCCAAATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 413538 TTGTTGAATTTCTAACTTTATGTGAAACGCCCTATCCAAATGGTA...TA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1112  AATTTCAAGAACCCTATGCTGTCGTGGTACTTCTGGAGAAAGATCTCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 424037 GAATTTCAAGAACCCTATGCTGTCGTGGTACTTCTGGAGAAAGATCTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGTAGTTGATCTGACACAAAGCAA         TTTTCCAATCTTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 424087 TGTAGTTGATCTGACACAAAGCAAGTA...TAGTTTTCCAATCTTTGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATCCATATCCCATGGACATTCATGAATCACCAGTTACATGCACAGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 429410 ATCCATATCCCATGGACATTCATGAATCACCAGTTACATGCACAGCATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TTTGCAGATTGTCCTCCGGATTTGATTCTAGTACTGTATTCTATAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 429460 TTTGCAGATTGTCCTCCGGATTTGATTCTAGTACTGTATTCTATAGGAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAAGCATAAAAAACAAGGATACAGTAATAAG         GAGTGGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 429510 CAAGCATAAAAAACAAGGATACAGTAATAAGGTA...TAGGAGTGGCCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCAGTGGAGGAGCTTGGAACCTTGGAGCACAAACATATCCAGAAATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 430872 TCAGTGGAGGAGCTTGGAACCTTGGAGCACAAACATATCCAGAAATTATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATTACTGG         TCATGCAGATGGATCAATAAAATTTTGGGATGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 430922 ATTACTGGGTA...TAGTCATGCAGATGGATCAATAAAATTTTGGGATGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TTCTGCAA         TAACTCTGCAGATGCTGTACAAGCTAAAAACTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 441178 TTCTGCAAGTA...TAGTAACTCTGCAGATGCTGTACAAGCTAAAAACTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 CAAAAGTGTTTGAAAAACAGAAGGTAGGAGAAGGAAAACAAACATGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445350 CAAAAGTGTTTGAAAAACAGAAGGTAGGAGAAGGAAAACAAACATGTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 ATTGTAGAGGAAGACCCATTTGCCATTCAGATGATTTACTGGTGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445400 ATTGTAGAGGAAGACCCATTTGCCATTCAGATGATTTACTGGTGTCCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GAGCAGAATATTCTGTGTATCAGGAGTCTCTGCATATGTCATAATTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445450 GAGCAGAATATTCTGTGTATCAGGAGTCTCTGCATATGTCATAATTTATA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AATTCAGCAGACATGAAATTACAACAGAAATAGTG         TCATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 445500 AATTCAGCAGACATGAAATTACAACAGAAATAGTGGTA...AAGTCATTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GAGGTACGACTTCAGTATGATGTTGAAGATATTATTACCCCTGAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447589 GAGGTACGACTTCAGTATGATGTTGAAGATATTATTACCCCTGAACCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 AACAAGTCCTCCGTTTCCAGATCTCTCAGCCCAGCTTCCTTCTTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447639 AACAAGTCCTCCGTTTCCAGATCTCTCAGCCCAGCTTCCTTCTTCAAGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 GTCTTTCTGGGAGCACTAACACTGTTGCTAGTGAAGGAGTAACAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447689 GTCTTTCTGGGAGCACTAACACTGTTGCTAGTGAAGGAGTAACAAAGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AGTATTCCATGCCTCAA         TGTGAAGACACGGCCAGTGCGAAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 447739 AGTATTCCATGCCTCAAGTA...AAGTGTGAAGACACGGCCAGTGCGAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 GCCTCCAGGATATCAAGCAGAACTTGTTATTCAATTGGTGTGGGTAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 449489 GCCTCCAGGATATCAAGCAGAACTTGTTATTCAATTGGTGTGGGTAGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 GTGAACCTCCACAACAGATTACTAGTCTTGCTGTAAGCTCAGCATATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 449539 GTGAACCTCCACAACAGATTACTAGTCTTGCTGTAAGCTCAGCATATGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 AT         AGTTGCATTTGGGAACTGCAATGGGTTGGCTGTGGTGGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 449589 ATGTA...TAGAGTTGCATTTGGGAACTGCAATGGGTTGGCTGTGGTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 TTTTATACAGAAGACAGTACTGTTAAGCATGGGGACCATTGACCTATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470266 TTTTATACAGAAGACAGTACTGTTAAGCATGGGGACCATTGACCTATATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GATCAAGTGACTTATACCAGCGACAACCACGGTCTCCTCGAAAAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470316 GATCAAGTGACTTATACCAGCGACAACCACGGTCTCCTCGAAAAAACAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CAGTTCATTGCAG         ACAACTTTTGCATGCGTGGCCTGTCTAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 470366 CAGTTCATTGCAGGTA...AAGACAACTTTTGCATGCGTGGCCTGTCTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CTTTTATCCTGATTTAACGAAACGGATCCGTACTTCCTATCAGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 472716 CTTTTATCCTGATTTAACGAAACGGATCCGTACTTCCTATCAGAGTA...

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2183    GTTTAACTGAACTGAATGACAGTCCAGTTCCCCTAGAACTTGAGCGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 508894 CAGGTTTAACTGAACTGAATGACAGTCCAGTTCCCCTAGAACTTGAGCGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 TGCAAGTCTCCTACCTCAG         ACCATGTAAATGGACACTGCAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 508944 TGCAAGTCTCCTACCTCAGGTA...CAGACCATGTAAATGGACACTGCAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 AAGTCCAACTTCTCAGAGTTGCAGTTCTGGAAAACGTCTTTCTAGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 569160 AAGTCCAACTTCTCAGAGTTGCAGTTCTGGAAAACGTCTTTCTAGTGCCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 ATGTTTCAAAAGTAAATCGCTGGGGTCCTGGAAGACCACCATTTCGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 569210 ATGTTTCAAAAGTAAATCGCTGGGGTCCTGGAAGACCACCATTTCGAAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 GCCCAGTCAGCAGCCTGCATGGAGATTTCTTTACCAGTTACAACAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 569260 GCCCAGTCAGCAGCCTGCATGGAGATTTCTTTACCAGTTACAACAGAAGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420         AAAACCGAGAAAATTCCTATAATCGTTCTAGAAGCTCTAGTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 569310 TA...TAGAAAACCGAGAAAATTCCTATAATCGTTCTAGAAGCTCTAGTA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 TCTCCAGTATTGACAAAGATTCTAAAGAAGCAATTACAGCACTATACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 571757 TCTCCAGTATTGACAAAGATTCTAAAGAAGCAATTACAGCACTATACTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 ATGGACTCCTTTGCACGGAAAAATGACTCTACCATCTCTCCTTGTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 571807 ATGGACTCCTTTGCACGGAAAAATGACTCTACCATCTCTCCTTGTCTGTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CGTTGGAACCAGTCTGGGAATGGTGTTAATCATCTCCTTAAACCTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 571857 CGTTGGAACCAGTCTGGGAATGGTGTTAATCATCTCCTTAAACCTACCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 TAGCAGATGAACAAAGGTTTACAGAGCCAGTCATGGTATTGCCAAGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 571907 TAGCAGATGAACAAAGGTTTACAGAGCCAGTCATGGTATTGCCAAGTGGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2660        GTACATTCCTCTCATTGAAAGGAGCTGTGCTAACATTCTCCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 571957 A...TAGGTACATTCCTCTCATTGAAAGGAGCTGTGCTAACATTCTCCTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TATGGACCGAATGGGTGGATTAATGCAACCGCCATATGAAGTTTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597708 TATGGACCGAATGGGTGGATTAATGCAACCGCCATATGAAGTTTGGAGGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 ATCCAAACAACATAGATGAAAATGAAAAATCTTGGAGAAGGAAAGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597758 ATCCAAACAACATAGATGAAAATGAAAAATCTTGGAGAAGGAAAGTGGTA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 ATGAACTCATCTTCTGCATCCCAAGAAATAGGAGATCATCAGTATACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597808 ATGAACTCATCTTCTGCATCCCAAGAAATAGGAGATCATCAGTATACAAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 AATCTGCTCAGAAAAACAAGCCAAAGTCTTCTCACTGCCTTCTCAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597858 AATCTGCTCAGAAAAACAAGCCAAAGTCTTCTCACTGCCTTCTCAGACTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 GCCTTTATGTTCATAACATCACGGAGACATCTTTTATACTGCAAGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597908 GCCTTTATGTTCATAACATCACGGAGACATCTTTTATACTGCAAGCAAAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GTGGTGGTCATGTGTAGCAGTGCCTGCTTGGCATGCTTTTGTGCTAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 597958 GTGGTGGTCATGTGTAGCAGTGCCTGCTTGGCATGCTTTTGTGCTAACGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 ACATATCATGATAATGAG         CCTACCTAGTCTTCGCCCAATGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 598008 ACATATCATGATAATGAGGTA...CAGCCTACCTAGTCTTCGCCCAATGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 TGGATGTTAATTATTTGCCACTGACAGACATGAGGATAGCACGAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 603603 TGGATGTTAATTATTTGCCACTGACAGACATGAGGATAGCACGAACATTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 TGTTTTACCAATGAAGGACAGGCATTATACCTCGTCTCTCCTACTGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 603653 TGTTTTACCAATGAAGGACAGGCATTATACCTCGTCTCTCCTACTGAAAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 TCAGCGGTTAACATACAGCCAAGAAATGTGTGATAATCTACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 603703 TCAGCGGTTAACATACAGCCAAGAAATGTGTGATAATCTACAGGTA...C

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3187   GACATGCTAGGAGATTTGTTTACTCCCATAGAGACACCAGAAGCTCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 606277 AGGACATGCTAGGAGATTTGTTTACTCCCATAGAGACACCAGAAGCTCAA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 AACAGAGGCTTTCTCAAGGGACTGTTTGGTGGAAGCGGACAAACATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 606327 AACAGAGGCTTTCTCAAGGGACTGTTTGGTGGAAGCGGACAAACATTTGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285 CAGAGAAGAGCTCT         TTGGGGAAGCTTCGGCAGGAAAAGCAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 606377 CAGAGAAGAGCTCTGTG...CAGTTGGGGAAGCTTCGGCAGGAAAAGCAT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3326 CCCGCAGCCTTGCGCAACACATTCCTGGACCAGGTAGTATAGAAGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 608786 CCCGCAGCCTTGCGCAACACATTCCTGGACCAGGTAGTATAGAAGGGATG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3376 AAAGGCGCTGCTGGAGGGGTGATGGGAGAGCTGACCCGTGCACGGATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 608836 AAAGGCGCTGCTGGAGGGGTGATGGGAGAGCTGACCCGTGCACGGATTGC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3426 ACTTGATGAAAGAGGACAGAGGCTAGGAGAGCTGGAAGAGAAAACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 608886 ACTTGATGAAAGAGGACAGAGGCTAGGAGAGCTGGAAGAGAAAACTGCAG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3476 GCATGATGACCAGTGCAGAAGCATTTTCCAAACATGCACATGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 608936 GCATGATGACCAGTGCAGAAGCATTTTCCAAACATGCACATGAGGTA...

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :
   3520    TTAATGCTGAAATACAAGGATAAGAAATGGTACCAATTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 609475 CAGTTAATGCTGAAATACAAGGATAAGAAATGGTACCAATTC