seq1 = pF1KA0983.tfa, 2049 bp
seq2 = pF1KA0983/gi568815576r_29408460.tfa (gi568815576r:29408460_29649147), 240688 bp

>pF1KA0983 2049
>gi568815576r:29408460_29649147 (Chr22)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-240  (104545-104688)   100% ->
241-354  (105606-105719)   100% ->
355-452  (106192-106289)   100% ->
453-599  (109672-109818)   100% ->
600-714  (112410-112524)   100% ->
715-847  (117185-117317)   100% ->
848-925  (119909-119986)   100% ->
926-966  (120682-120722)   100% ->
967-1066  (120971-121070)   100% ->
1067-1175  (123202-123310)   100% ->
1176-1277  (128049-128150)   100% ->
1278-1374  (129044-129140)   100% ->
1375-1489  (130028-130142)   100% ->
1490-1593  (131782-131885)   99% ->
1594-1681  (132032-132119)   100% ->
1682-1797  (137012-137127)   100% ->
1798-1988  (137852-138042)   100% ->
1989-2049  (140628-140688)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATCAGAATCGAGCAAAAAACGGAAGCCCAAAGTGATCCGAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATCAGAATCGAGCAAAAAACGGAAGCCCAAAGTGATCCGAAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGCCCCAGCTGAAGGAAAGCGGAATCGATCTGACACCGAGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 TGGAGCCCCAGCTGAAGGAAAGCGGAATCGATCTGACACCGAGCAGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GAAGGTAAATACTACAGTGAGGAGGCCGAGGTGGATCTGCGGGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGAAGGTAAATACTACAGTGAGGAGGCCGAGGTGGATCTGCGGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGGCAGAGACTATGAGTTATACAAGTACACCTGCCAGGAGCTACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104590 CCTGGCAGAGACTATGAGTTATACAAGTACACCTGCCAGGAGCTACAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGATGGCTGAGATCCAAGACCTGAAGAGCAGGGGTGGCAAGGATGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104640 GCTGATGGCTGAGATCCAAGACCTGAAGAGCAGGGGTGGCAAGGATGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GCAATAGAAATAGAAGAACGGAGGATCCAGAGCTGTGTGCAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104690 TA...CAGGCAATAGAAATAGAAGAACGGAGGATCCAGAGCTGTGTGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCATGACTCTAAAGAAGCTTAACCGATTAGCCCACATCAGGTTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105648 TTCATGACTCTAAAGAAGCTTAACCGATTAGCCCACATCAGGTTGAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGAAGAGATCAGACCCACGAG         GCTAAGCAGAAAGTAGATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105698 AGGAAGAGATCAGACCCACGAGGTA...CAGGCTAAGCAGAAAGTAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTATCATCTGCAGCTCCAGAACCTGTTGTATGAGGTGATGCACCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106211 CCTATCATCTGCAGCTCCAGAACCTGTTGTATGAGGTGATGCACCTACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGAGATCACCAAATGTTTGGAGTTTAA         GTCAAAGCATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106261 AAGGAGATCACCAAATGTTTGGAGTTTAAGTG...TAGGTCAAAGCATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGAAATTGATCTGGTCAGTTTAGAGGAGTTTTATAAGGAGGCTCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109684 AGAAATTGATCTGGTCAGTTTAGAGGAGTTTTATAAGGAGGCTCCACCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATATCAGCAAGGCCGAAGTCACCATGGGAGACCCTCACCAGCAAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109734 ATATCAGCAAGGCCGAAGTCACCATGGGAGACCCTCACCAGCAAACACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCACGTCTGGACTGGGAGCTGGAGCAGCGGAAAAG         GCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109784 GCACGTCTGGACTGGGAGCTGGAGCAGCGGAAAAGGTA...CAGGCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAGAAGTACCGAGAGTGCCTATCTAACAAGGAGAAGATTCTCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112416 AGAGAAGTACCGAGAGTGCCTATCTAACAAGGAGAAGATTCTCAAGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGAGGTGAAGAAGGAGTACCTGAGCAGCCTCCAGCCCCGCCTCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112466 TTGAGGTGAAGAAGGAGTACCTGAGCAGCCTCCAGCCCCGCCTCAACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATCATGCAG         GCTTCCCTTCCGGTGCAGGAGTACCTGTTTAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112516 ATCATGCAGGTG...CAGGCTTCCCTTCCGGTGCAGGAGTACCTGTTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCCATTCGACCAGGCTCACAAGCAGTATGAGACAGCCAGACACCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117217 GCCATTCGACCAGGCTCACAAGCAGTATGAGACAGCCAGACACCTGCCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTCCCCTCTATGTCCTCTTTGTTCAGGCCACTGCGTATGGGCAGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117267 CTCCCCTCTATGTCCTCTTTGTTCAGGCCACTGCGTATGGGCAGGCCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 G         ATAAGACGTTATCTGTGGCAATCGAAGGCAGTGTGGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117317 GGTG...CAGATAAGACGTTATCTGTGGCAATCGAAGGCAGTGTGGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGCCAAGGCTCTGTTCAAACCTCCAGAGGACTCCCAAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 119949 AGCCAAGGCTCTGTTCAAACCTCCAGAGGACTCCCAAGGTA...CAGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACGAGAGTGACTCAGATGCCGAGGAGGAGCAGACTACG         AAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 120685 ACGAGAGTGACTCAGATGCCGAGGAGGAGCAGACTACGGTG...CAGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CGCCGGAGACCCACACTGGGGGTTCAGTTGGACGACAAACGCAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120974 CGCCGGAGACCCACACTGGGGGTTCAGTTGGACGACAAACGCAAGGAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCTGAAGAGGCACCCACTGTCTGTCATGCTCGACCTGAAGTGCAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 121024 GCTGAAGAGGCACCCACTGTCTGTCATGCTCGACCTGAAGTGCAAAGGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1067       ATGACAGTGTGCTTCACCTGACTTTCTACTACCTCATGAACCTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121074 ...CAGATGACAGTGTGCTTCACCTGACTTTCTACTACCTCATGAACCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AACATCATGACAGTAAAAGCCAAAGTGACAACTGCCATGGAGCTGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123246 AACATCATGACAGTAAAAGCCAAAGTGACAACTGCCATGGAGCTGATCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CCCCATCAGTGCAGG         TGACTTGCTGTCTCCTGACTCAGTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123296 CCCCATCAGTGCAGGGTA...TAGTGACTTGCTGTCTCCTGACTCAGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGAGTTGCTTGTATCCTGGGGATCATGGAAAGAAAACTCCGAATCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128075 TGAGTTGCTTGTATCCTGGGGATCATGGAAAGAAAACTCCGAATCCAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AATCAGTATCAGTTTGATAAAGTTGG         CATCCTGACTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 128125 AATCAGTATCAGTTTGATAAAGTTGGGTG...CAGCATCCTGACTTTGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CGACTATGTACTTGAGCTAGGTCACCCCTATTTGTGGGTGCAGAAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129059 CGACTATGTACTTGAGCTAGGTCACCCCTATTTGTGGGTGCAGAAGCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GTGGCCTCCACTTCCCCAAAGAGCAGCCCCAG         CAAACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 129109 GTGGCCTCCACTTCCCCAAAGAGCAGCCCCAGGTC...CAGCAAACAGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 ATTGCTGACCACTCGCTGAGCGCCAGCCACATGGAGACCACCATGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130037 ATTGCTGACCACTCGCTGAGCGCCAGCCACATGGAGACCACCATGAAACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TCTGAAGACCAGGGTGCAGTCCCGCCTGGCCCTCCACAAACAGTTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130087 TCTGAAGACCAGGGTGCAGTCCCGCCTGGCCCTCCACAAACAGTTTGCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCCTAG         AACATGGCATTGTGCCAGTTACCAGTGATTGCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130137 CCCTAGGTA...TAGAACATGGCATTGTGCCAGTTACCAGTGATTGCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TACCTCTTCCCTGCCAAGGTTGTCTCTCGCCTGGTGAAATGGGTGACAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 131817 TACCTCTTCCCTGCCAAGGTTGTCTCTCGCCTGGTGAAATGGGTGACAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGCCCATGAGGATTACATG         GAGCTGCACTTCACCAAAGACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 131867 TGCCCATGAGGATTACATGGTA...TAGGAGCTGCACTTCACCAAAGACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TTGTGGATGCGGGACTGGCTGGGGACACCAATCTCTACTACATGGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132054 TTGTGGATGCGGGACTGGCTGGGGACACCAATCTCTACTACATGGCGCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ATCGAAAGGGGCACAG         CCAAACTGCAGGCCGCTGTGGTGTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 132104 ATCGAAAGGGGCACAGGTA...CAGCCAAACTGCAGGCCGCTGTGGTGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GAACCCTGGCTACTCCTCCATCCCACCTGTTTTCCAGCTCTGTTTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137037 GAACCCTGGCTACTCCTCCATCCCACCTGTTTTCCAGCTCTGTTTGAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 GGAAAGGGGAGAAAACCAACAGCAACGATGACAACATTCGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 137087 GGAAAGGGGAGAAAACCAACAGCAACGATGACAACATTCGGGTA...CAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 GCCATGGAGGGCGAAGTCAATGTGTGCTACAAGGAGCTGTGTGGCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137852 GCCATGGAGGGCGAAGTCAATGTGTGCTACAAGGAGCTGTGTGGCCCTTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GCCCAGCCACCAGCTGTTGACCAACCAGCTGCAGCGGCTGTGTGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137902 GCCCAGCCACCAGCTGTTGACCAACCAGCTGCAGCGGCTGTGTGTGCTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TGGATGTTTACCTGGAGACCGAGAGCCATGACGACAGTGTGGAGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137952 TGGATGTTTACCTGGAGACCGAGAGCCATGACGACAGTGTGGAGGGGCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 AAGGAATTTCCCCAGGAGAAGATGTGTCTGCGGCTCTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 138002 AAGGAATTTCCCCAGGAGAAGATGTGTCTGCGGCTCTTCAGGTG...TAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 GGGTCCTAGCAGGATGAAGCCATTTAAATACAACCATCCTCAGGGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140628 GGGTCCTAGCAGGATGAAGCCATTTAAATACAACCATCCTCAGGGATTCT

   2200     .    :
   2039 TCAGCCATCGC
        |||||||||||
 140678 TCAGCCATCGC