seq1 = pF1KA0930.tfa, 1239 bp
seq2 = pF1KA0930/gi568815576r_45097179.tfa (gi568815576r:45097179_45312198), 215020 bp

>pF1KA0930 1239
>gi568815576r:45097179_45312198 (Chr22)

(complement)

1-243  (100001-100243)   100% ->
244-363  (106287-106406)   100% ->
364-441  (106492-106569)   100% ->
442-543  (106881-106982)   100% ->
544-684  (108214-108354)   100% ->
685-879  (109015-109209)   100% ->
880-1042  (112164-112326)   100% ->
1043-1201  (114251-114409)   100% ->
1202-1239  (114983-115020)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGGGTATGGGCGCAGCTTGGCCAAGGCCATGCTGCAAGGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGGGTATGGGCGCAGCTTGGCCAAGGCCATGCTGCAAGGGCCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGCCGTCCTTCCTCACTCCTGTCTGGCCTCCCTCTGCAGGGTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGCCGTCCTTCCTCACTCCTGTCTGGCCTCCCTCTGCAGGGTGCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATGACCGCATCGTCTTCTGGACTTGGATGTTCTCCACCTACTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATGACCGCATCGTCTTCTGGACTTGGATGTTCTCCACCTACTTCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAAATGGGCTCCCCGGCAGGACGACATGCTTTTCTATGTGCGCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAAATGGGCTCCCCGGCAGGACGACATGCTTTTCTATGTGCGCCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGCGTACTCCGGCAGCGAAAGCGGTGCAGACGGGAGGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 GCTGGCGTACTCCGGCAGCGAAAGCGGTGCAGACGGGAGGAAGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   GCAGCTGAGCCTGAGGTGGAGGTGGAGGTGTACCGGCGGGACTCCAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106285 AGGCAGCTGAGCCTGAGGTGGAGGTGGAGGTGTACCGGCGGGACTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGCTGCCAGGCCTGGGAGACCCTGACATCGACTGGGAGGAGAGCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106335 AAGCTGCCAGGCCTGGGAGACCCTGACATCGACTGGGAGGAGAGCGTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGAATCTCATCCTGCAGAAG         CTGGACTACATGGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106385 CCTGAATCTCATCCTGCAGAAGGTA...CAGCTGGACTACATGGTGACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGCGGTGTGCACACGTGCTGACGGCGGGGACATTCACATCCATAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106511 GTGCGGTGTGCACACGTGCTGACGGCGGGGACATTCACATCCATAAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAATCTCAG         CAAGTGTTCGCGTCCCCCAGTAAACACCCCAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106561 AAATCTCAGGTG...CAGCAAGTGTTCGCGTCCCCCAGTAAACACCCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGACAGCAAGGGGGAGGAGTCCAAGATCAGCTACCCCAACATCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106913 GGACAGCAAGGGGGAGGAGTCCAAGATCAGCTACCCCAACATCTTCTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGATTGACAGCTTCGAGGAG         GTGTTCAGCGACATGACCGTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106963 TGATTGACAGCTTCGAGGAGGTG...CAGGTGTTCAGCGACATGACCGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGGAAGGAGAGATGGTCTGTGTGGAGCTGGTGGCTAGTGACAAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108235 GGGGAAGGAGAGATGGTCTGTGTGGAGCTGGTGGCTAGTGACAAAACCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACGTTCCAGGGGGTCATCTTTCAGGGCTCCATCCGCTACGAGGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108285 CACGTTCCAGGGGGTCATCTTTCAGGGCTCCATCCGCTACGAGGCGCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGGTGTATGACAACCGG         GTGAGCGTGGCCGCCCGCATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108335 AGAAGGTGTATGACAACCGGGTG...CAGGTGAGCGTGGCCGCCCGCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCACAGAAGATGTCGTTTGGCTTCTACAAGTACAGCAACATGGAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109036 GCACAGAAGATGTCGTTTGGCTTCTACAAGTACAGCAACATGGAGTTTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCGCATGAAGGGCCCCCAGGGCAAGGGCCACGCCGAGATGGCGGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109086 GCGCATGAAGGGCCCCCAGGGCAAGGGCCACGCCGAGATGGCGGTCAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGTGTCTACAGGTGACACATCCCCCTGTGGGACTGAAGAGGACTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109136 GAGTGTCTACAGGTGACACATCCCCCTGTGGGACTGAAGAGGACTCCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCAGCTTCGCCCATGCACGAGCGG         GTGACCTCCTTCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109186 CCAGCTTCGCCCATGCACGAGCGGGTA...CAGGTGACCTCCTTCAGCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACCCCCCACCCCAGAACGGAACAACCGGCCTGCCTTCTTCTCCCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112181 ACCCCCCACCCCAGAACGGAACAACCGGCCTGCCTTCTTCTCCCCATCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCAAGAGGAAGGTGCCCCGGAACCGGATCGCTGAGATGAAGAAGTCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112231 TCAAGAGGAAGGTGCCCCGGAACCGGATCGCTGAGATGAAGAAGTCGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCGGCCAACGACAGCGAGGAGTTCTTCCGGGAGGACGACGGTGGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 112281 TCGGCCAACGACAGCGAGGAGTTCTTCCGGGAGGACGACGGTGGAGGTG.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043      CCGATCTGCACAATGCAACCAACCTGCGGTCTCGGTCCCTGTCGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112331 ..CAGCCGATCTGCACAATGCAACCAACCTGCGGTCTCGGTCCCTGTCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCACAGGACGGTCCCTGGTCGGGTCCTGGCTGAAGCTGAACAGAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114296 GCACAGGACGGTCCCTGGTCGGGTCCTGGCTGAAGCTGAACAGAGCAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGAAACTTCCTTCTCTATGCACACTTAACCTACGTCACGTTGCCGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114346 GGAAACTTCCTTCTCTATGCACACTTAACCTACGTCACGTTGCCGCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCGGATTTTAACAG         ACATCCTGGAAGTTCGGCAGAAGCCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114396 TCGGATTTTAACAGGTA...TAGACATCCTGGAAGTTCGGCAGAAGCCCA

   1300     .    :
   1229 TCCTGATGACC
        |||||||||||
 115010 TCCTGATGACC