seq1 = pF1KA0901.tfa, 3645 bp
seq2 = pF1KA0901/gi568815575f_48702693.tfa (gi568815575f:48702693_48924609), 221917 bp

>pF1KA0901 3645
>gi568815575f:48702693_48924609 (ChrX)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-222  (100179-100307)   100% ->
223-311  (100436-100524)   100% ->
312-396  (102746-102830)   100% ->
397-437  (102939-102979)   100% ->
438-534  (103676-103772)   100% ->
535-632  (103917-104014)   100% ->
633-737  (105341-105445)   100% ->
738-806  (105566-105634)   100% ->
807-933  (111748-111874)   100% ->
934-999  (111983-112048)   100% ->
1000-1059  (112142-112201)   100% ->
1060-1149  (112270-112359)   100% ->
1150-1256  (112692-112798)   100% ->
1257-1324  (112883-112950)   100% ->
1325-1493  (113192-113360)   100% ->
1494-1622  (113449-113577)   100% ->
1623-1791  (113773-113941)   100% ->
1792-1925  (114634-114767)   100% ->
1926-1994  (115349-115417)   100% ->
1995-2187  (115528-115720)   100% ->
2188-2337  (117414-117563)   100% ->
2338-2512  (119928-120102)   100% ->
2513-3189  (120220-120896)   100% ->
3190-3303  (120980-121093)   100% ->
3304-3450  (121230-121376)   100% ->
3451-3579  (121474-121602)   100% ->
3580-3645  (121852-121917)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCTCAACCGGCCAGGATTCCACCACAACCAGGCAGCGAAGAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCTCAACCGGCCAGGATTCCACCACAACCAGGCAGCGAAGAAGTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGAACCCCCAGTCGCCCCCTCAGGACTCCAGTGTCACTTCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 GCAGAACCCCCAGTCGCCCCCTCAGGACTCCAGTGTCACTTCGGTG...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   AAGCGAAATATTAAAAAGGGAGCCGTTCCCCGCTCTATCCCCAATCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100177 AGAAGCGAAATATTAAAAAGGGAGCCGTTCCCCGCTCTATCCCCAATCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGAGGTAAAGAAGAAAGGCAAAATGAAGAAGCTCGGCCAAGCAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100227 GCGGAGGTAAAGAAGAAAGGCAAAATGAAGAAGCTCGGCCAAGCAATGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGACCTAATCGTGGGACTGCAAGGGATG         GATCTGAACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100277 AGAAGACCTAATCGTGGGACTGCAAGGGATGGTG...CAGGATCTGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGAGGCTGAAGCACTGGCTGGCACTGGCTTGGTGTTGGATGAGCAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100446 TTGAGGCTGAAGCACTGGCTGGCACTGGCTTGGTGTTGGATGAGCAGTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGAATTCCATTGCCTCTGGGATGACAG         CTTCCCGGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100496 AATGAATTCCATTGCCTCTGGGATGACAGGTG...CAGCTTCCCGGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCTGAGCGGCTCCATGCCATCAAGGAGCAACTGATCCAGGAGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102758 CCCTGAGCGGCTCCATGCCATCAAGGAGCAACTGATCCAGGAGGGCCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAGATCGCTGCGTGTCCTTTCAG         GCCCGGTTTGCTGAAAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102808 TAGATCGCTGCGTGTCCTTTCAGGTA...CAGGCCCGGTTTGCTGAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAGAGCTGATGTTGGTTCACAG         CCTAGAATATATTGATCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102957 GAAGAGCTGATGTTGGTTCACAGGTG...TAGCCTAGAATATATTGATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GATGGAAACAACCCAGTACATGAATGAGGGAGAACTCCGTGTCCTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103694 GATGGAAACAACCCAGTACATGAATGAGGGAGAACTCCGTGTCCTAGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACACCTACGACTCAGTTTATCTGCATCCG         AACTCATACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103744 ACACCTACGACTCAGTTTATCTGCATCCGGTA...CAGAACTCATACTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TGTGCCTGCCTGGCCTCAGGCTCTGTCCTCAGGCTGGTGGATGCGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103929 TGTGCCTGCCTGGCCTCAGGCTCTGTCCTCAGGCTGGTGGATGCGGTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGGGGCTGAGATCCGGAATGGCATGGCCATCATTAG         GCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103979 GGGGGCTGAGATCCGGAATGGCATGGCCATCATTAGGTA...CAGGCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTGGACATCACGCCCAGCACAGTCTTATGGATGGCTATTGCATGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105346 CTGGACATCACGCCCAGCACAGTCTTATGGATGGCTATTGCATGTTCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CACGTGGCTGTGGCAGCCCGCTATGCTCAACAGAAACACCGCATCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105396 CACGTGGCTGTGGCAGCCCGCTATGCTCAACAGAAACACCGCATCCGGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738          GGTCCTTATCGTAGATTGGGATGTGCACCACGGTCAAGGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105446 GTC...TAGGGTCCTTATCGTAGATTGGGATGTGCACCACGGTCAAGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CACAGTTCACCTTCGACCAGGACCCCAG         TGTCCTCTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105607 CACAGTTCACCTTCGACCAGGACCCCAGGTA...CAGTGTCCTCTATTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TCCATCCACCGCTACGAGCAGGGTAGGTTCTGGCCCCACCTGAAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111761 TCCATCCACCGCTACGAGCAGGGTAGGTTCTGGCCCCACCTGAAGGCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TAACTGGTCCACCACAGGTTTCGGCCAAGGCCAAGGATATACCATCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111811 TAACTGGTCCACCACAGGTTTCGGCCAAGGCCAAGGATATACCATCAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCCTTGGAACCAG         GTGGGGATGCGGGATGCTGACTACATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 111861 TGCCTTGGAACCAGGTC...CAGGTGGGGATGCGGGATGCTGACTACATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GCTGCTTTCCTGCACGTCCTGCTGCCAGTCGCCCTCGAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112010 GCTGCTTTCCTGCACGTCCTGCTGCCAGTCGCCCTCGAGGTC...CAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CCAGCCTCAGCTGGTCCTGGTGGCTGCTGGATTTGATGCCCTGCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112144 CCAGCCTCAGCTGGTCCTGGTGGCTGCTGGATTTGATGCCCTGCAAGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 ACCCCAAG         GGTGAGATGGCCGCCACTCCGGCAGGGTTCGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 112194 ACCCCAAGGTA...CAGGGTGAGATGGCCGCCACTCCGGCAGGGTTCGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 CAGCTAACCCACCTGCTCATGGGTCTGGCAGGAGGCAAGCTGATCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112303 CAGCTAACCCACCTGCTCATGGGTCTGGCAGGAGGCAAGCTGATCCTGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TCTGGAG         GGTGGCTACAACCTCCGCGCCCTGGCTGAAGGCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112353 TCTGGAGGTG...CAGGGTGGCTACAACCTCCGCGCCCTGGCTGAAGGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 TCAGTGCTTCGCTCCACACCCTTCTGGGAGACCCTTGCCCCATGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112726 TCAGTGCTTCGCTCCACACCCTTCTGGGAGACCCTTGCCCCATGCTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 TCACCTGGTGCCCCCTGCCGGAG         TGCCCAGGCTTCAGTTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112776 TCACCTGGTGCCCCCTGCCGGAGGTG...CAGTGCCCAGGCTTCAGTTTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 CTGTGCTCTGGAAGCCCTTGAGCCCTTCTGGGAGGTTCTTGTGAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112901 CTGTGCTCTGGAAGCCCTTGAGCCCTTCTGGGAGGTTCTTGTGAGATCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325          CTGAGACCGTGGAGAGGGACAACATGGAGGAGGACAATGTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112951 GTA...TAGCTGAGACCGTGGAGAGGGACAACATGGAGGAGGACAATGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 GAGGAGAGCGAGGAGGAAGGACCCTGGGAGCCCCCTGTGCTCCCAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113233 GAGGAGAGCGAGGAGGAAGGACCCTGGGAGCCCCCTGTGCTCCCAATCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GACATGGCCAGTGCTACAGTCTCGCACAGGGCTGGTCTATGACCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113283 GACATGGCCAGTGCTACAGTCTCGCACAGGGCTGGTCTATGACCAAAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TGATGAATCACTGCAACTTGTGGGACAG         CCACCACCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 113333 TGATGAATCACTGCAACTTGTGGGACAGGTA...TAGCCACCACCCTGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GTACCCCAGCGCATCTTGCGGATCATGTGCCGTCTGGAGGAGCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113462 GTACCCCAGCGCATCTTGCGGATCATGTGCCGTCTGGAGGAGCTGGGCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 TGCCGGGCGCTGCCTCACCCTGACACCGCGCCCTGCCACAGAGGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113512 TGCCGGGCGCTGCCTCACCCTGACACCGCGCCCTGCCACAGAGGCTGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 TGCTCACCTGTCACAG         TGCTGAGTACGTGGGTCATCTCCGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113562 TGCTCACCTGTCACAGGTC...CAGTGCTGAGTACGTGGGTCATCTCCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GCCACAGAGAAAATGAAAACCCGGGAGCTGCACCGTGAGAGTTCCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113798 GCCACAGAGAAAATGAAAACCCGGGAGCTGCACCGTGAGAGTTCCAACTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 TGACTCCATCTATATCTGCCCCAGTACCTTCGCCTGTGCACAGCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113848 TGACTCCATCTATATCTGCCCCAGTACCTTCGCCTGTGCACAGCTTGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 CTGGCGCTGCCTGCCGCCTGGTGGAGGCTGTGCTCTCAGGAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113898 CTGGCGCTGCCTGCCGCCTGGTGGAGGCTGTGCTCTCAGGAGAGGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792    GTTCTGAATGGTGCTGCTGTGGTGCGTCCCCCAGGACACCACGCAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114631 CAGGTTCTGAATGGTGCTGCTGTGGTGCGTCCCCCAGGACACCACGCAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 GCAGGATGCAGCTTGCGGTTTTTGCTTTTTCAACTCTGTGGCTGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114681 GCAGGATGCAGCTTGCGGTTTTTGCTTTTTCAACTCTGTGGCTGTGGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CTCGCCATGCCCAGACTATCAGTGGGCATGCCCTACG         GATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114731 CTCGCCATGCCCAGACTATCAGTGGGCATGCCCTACGGTA...CAGGATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 CTGATTGTGGATTGGGATGTCCACCACGGTAATGGAACTCAGCACATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115353 CTGATTGTGGATTGGGATGTCCACCACGGTAATGGAACTCAGCACATGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 TGAGGATGACCCCAG         TGTGCTATATGTGTCCCTGCACCGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115403 TGAGGATGACCCCAGGTA...CAGTGTGCTATATGTGTCCCTGCACCGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 ATGATCATGGCACCTTCTTCCCCATGGGGGATGAGGGTGCCAGCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115554 ATGATCATGGCACCTTCTTCCCCATGGGGGATGAGGGTGCCAGCAGCCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 ATCGGCCGGGCTGCGGGCACAGGCTTCACCGTCAACGTGGCATGGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115604 ATCGGCCGGGCTGCGGGCACAGGCTTCACCGTCAACGTGGCATGGAACGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 GCCCCGCATGGGTGATGCTGACTACCTAGCTGCCTGGCATCGCCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115654 GCCCCGCATGGGTGATGCTGACTACCTAGCTGCCTGGCATCGCCTGGTGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 TTCCCATTGCCTACGAG         TTTAACCCAGAACTGGTGCTGGTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 115704 TTCCCATTGCCTACGAGGTA...CAGTTTAACCCAGAACTGGTGCTGGTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 TCAGCTGGCTTTGATGCTGCACGGGGGGATCCGCTGGGGGGCTGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117438 TCAGCTGGCTTTGATGCTGCACGGGGGGATCCGCTGGGGGGCTGCCAGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 GTCACCTGAGGGTTATGCCCACCTCACCCACCTGCTGATGGGCCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117488 GTCACCTGAGGGTTATGCCCACCTCACCCACCTGCTGATGGGCCTTGCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 GTGGCCGCATTATCCTTATCCTAGAG         GGTGGCTATAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117538 GTGGCCGCATTATCCTTATCCTAGAGGTA...AAGGGTGGCTATAACCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 ACATCCATCTCAGAGTCCATGGCTGCCTGCACTCGCTCCCTCCTTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119943 ACATCCATCTCAGAGTCCATGGCTGCCTGCACTCGCTCCCTCCTTGGAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 CCCACCACCCCTGCTGACCCTGCCACGGCCCCCACTATCAGGGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119993 CCCACCACCCCTGCTGACCCTGCCACGGCCCCCACTATCAGGGGCCCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 CCTCAATCACTGAGACCATCCAAGTCCATCGCAGATACTGGCGCAGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120043 CCTCAATCACTGAGACCATCCAAGTCCATCGCAGATACTGGCGCAGCTTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 CGGGTCATGA         AGGTAGAAGACAGAGAAGGACCCTCCAGTTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120093 CGGGTCATGAGTG...CAGAGGTAGAAGACAGAGAAGGACCCTCCAGTTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 TAAGTTGGTCACCAAGAAGGCACCCCAACCAGCCAAACCTAGGTTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120251 TAAGTTGGTCACCAAGAAGGCACCCCAACCAGCCAAACCTAGGTTAGCTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 AGCGGATGACCACACGAGAAAAGAAGGTTCTGGAAGCAGGCATGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120301 AGCGGATGACCACACGAGAAAAGAAGGTTCTGGAAGCAGGCATGGGGAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 GTCACCTCGGCATCATTTGGGGAAGAGTCCACTCCAGGCCAGACTAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120351 GTCACCTCGGCATCATTTGGGGAAGAGTCCACTCCAGGCCAGACTAACTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2694 AGAGACAGCTGTGGTGGCCCTCACTCAGGACCAGCCCTCAGAGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120401 AGAGACAGCTGTGGTGGCCCTCACTCAGGACCAGCCCTCAGAGGCAGCCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 CAGGGGGAGCCACTCTGGCCCAGACCATTTCTGAGGCAGCCATTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120451 CAGGGGGAGCCACTCTGGCCCAGACCATTTCTGAGGCAGCCATTGGGGGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 GCCATGCTGGGCCAGACCACCTCAGAGGAGGCTGTCGGGGGAGCCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120501 GCCATGCTGGGCCAGACCACCTCAGAGGAGGCTGTCGGGGGAGCCACTCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 GGACCAGACCACCTCAGAGGAGACTGTGGGAGGAGCCATTCTGGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120551 GGACCAGACCACCTCAGAGGAGACTGTGGGAGGAGCCATTCTGGACCAGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 CCACCTCAGAGGATGCTGTTGGGGGAGCCACGCTGGGCCAGACTACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120601 CCACCTCAGAGGATGCTGTTGGGGGAGCCACGCTGGGCCAGACTACCTCA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 GAGGAGGCTGTAGGAGGAGCTACACTGGCCCAGACCACCTCGGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120651 GAGGAGGCTGTAGGAGGAGCTACACTGGCCCAGACCACCTCGGAGGCAGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 CATGGAGGGAGCCACACTGGACCAGACTACGTCAGAGGAGGCTCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120701 CATGGAGGGAGCCACACTGGACCAGACTACGTCAGAGGAGGCTCCAGGGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 GCACCGAGCTGATCCAAACTCCTCTAGCCTCGAGCACAGACCACCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120751 GCACCGAGCTGATCCAAACTCCTCTAGCCTCGAGCACAGACCACCAGACC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 CCCCCAACCTCACCTGTGCAGGGAACTACACCCCAGATATCTCCCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120801 CCCCCAACCTCACCTGTGCAGGGAACTACACCCCAGATATCTCCCAGTAC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 ACTGATTGGGAGTCTCAGGACCTTGGAGCTAGGCAGCGAATCTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 120851 ACTGATTGGGAGTCTCAGGACCTTGGAGCTAGGCAGCGAATCTCAGGTA.

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3190      GGGGCCTCAGAATCTCAGGCCCCAGGAGAGGAGAACCTACTAGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120901 ..CAGGGGGCCTCAGAATCTCAGGCCCCAGGAGAGGAGAACCTACTAGGA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 GAGGCAGCTGGAGGTCAGGACATGGCTGATTCGATGCTGATGCAGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121025 GAGGCAGCTGGAGGTCAGGACATGGCTGATTCGATGCTGATGCAGGGATC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3285 TAGGGGCCTCACTGATCAG         GCCATATTTTATGCTGTGACAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121075 TAGGGGCCTCACTGATCAGGTG...CAGGCCATATTTTATGCTGTGACAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3326 CACTGCCCTGGTGTCCCCATTTGGTGGCAGTATGCCCCATACCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121252 CACTGCCCTGGTGTCCCCATTTGGTGGCAGTATGCCCCATACCTGCAGCA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3376 GGCCTAGACGTGACCCAACCTTGTGGGGACTGTGGAACAATCCAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121302 GGCCTAGACGTGACCCAACCTTGTGGGGACTGTGGAACAATCCAAGAGAA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3426 TTGGGTGTGTCTCTCTTGCTATCAG         GTCTACTGTGGTCGTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121352 TTGGGTGTGTCTCTCTTGCTATCAGGTA...CAGGTCTACTGTGGTCGTT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3467 ACATCAATGGCCACATGCTCCAACACCATGGAAATTCTGGACACCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121490 ACATCAATGGCCACATGCTCCAACACCATGGAAATTCTGGACACCCGCTG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3517 GTCCTCAGCTACATCGACCTGTCAGCCTGGTGTTACTACTGTCAGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121540 GTCCTCAGCTACATCGACCTGTCAGCCTGGTGTTACTACTGTCAGGCCTA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3567 TGTCCACCACCAG         GCTCTCCTAGATGTGAAGAACATCGCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 121590 TGTCCACCACCAGGTG...CAGGCTCTCCTAGATGTGAAGAACATCGCCC

   3850     .    :    .    :    .    :    .
   3608 ACCAGAACAAGTTTGGGGAGGATATGCCCCACCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121880 ACCAGAACAAGTTTGGGGAGGATATGCCCCACCCACAC