seq1 = pF1KA0898.tfa, 2892 bp
seq2 = pF1KA0898/gi568815581r_58899380.tfa (gi568815581r:58899380_59204396), 305017 bp

>pF1KA0898 2892
>gi568815581r:58899380_59204396 (Chr17)

(complement)

1-21  (97936-97956)   100% ->
22-123  (100003-100104)   100% ->
124-164  (113057-113097)   100% ->
165-281  (115990-116106)   100% ->
282-369  (120308-120395)   100% ->
370-492  (123178-123300)   100% ->
493-616  (124520-124643)   100% ->
617-684  (128683-128750)   100% ->
685-809  (133450-133574)   100% ->
810-860  (139992-140042)   100% ->
861-942  (141749-141830)   100% ->
943-1019  (143289-143365)   100% ->
1020-1199  (147343-147522)   100% ->
1200-1314  (153069-153183)   100% ->
1315-1530  (155004-155219)   100% ->
1531-1667  (156578-156714)   100% ->
1668-1753  (162499-162584)   100% ->
1754-1948  (172307-172501)   100% ->
1949-2257  (175674-175982)   100% ->
2258-2386  (186973-187101)   100% ->
2387-2576  (188598-188787)   100% ->
2577-2695  (191951-192069)   100% ->
2696-2812  (202683-202799)   100% ->
2813-2892  (204938-205017)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAACAGAGCGTGGAG         AGCATTGCTGAGGTTTTCCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  97936 ATGGATGAACAGAGCGTGGAGGTG...CAGAGCATTGCTGAGGTTTTCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATGTTTCATTTGTATGGAGAAATTGCGGGATGCACGCCTGTGTCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 ATGTTTCATTTGTATGGAGAAATTGCGGGATGCACGCCTGTGTCCTCATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTCCAAACTGTGTTGTTTCAGCTGTATTAGG         CGCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100073 GCTCCAAACTGTGTTGTTTCAGCTGTATTAGGGTA...TAGCGCTGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACAGAGCAGAGAGCTCAATGTCCTCATTGCCG         TGCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113066 ACAGAGCAGAGAGCTCAATGTCCTCATTGCCGGTA...CAGTGCTCCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CCAGCTACGAGAACTAGTAAATTGTCGTTGGGCAGAAGAAGTAACACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115999 CCAGCTACGAGAACTAGTAAATTGTCGTTGGGCAGAAGAAGTAACACAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTTGATACTCTTCAACTCTGCAGTCTCACCAAACATGAAGAAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116049 AGCTTGATACTCTTCAACTCTGCAGTCTCACCAAACATGAAGAAAATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGGACAA         ATGTGAAAATCACCATGAAAAACTTAGTGTATT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116099 AAGGACAAGTA...TAGATGTGAAAATCACCATGAAAAACTTAGTGTATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTGCTGGACTTGTAAGAAGTGTATCTGCCATCAGTGTGCACTTTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120341 TTGCTGGACTTGTAAGAAGTGTATCTGCCATCAGTGTGCACTTTGGGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GAATG         CATGGCGGACATACCTTTAAACCTTTGGCAGAAATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120391 GAATGGTG...TAGCATGGCGGACATACCTTTAAACCTTTGGCAGAAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATGAGCAACACGTCACTAAAGTGAATGAAGAGGTAGCCAAACTTCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123214 TATGAGCAACACGTCACTAAAGTGAATGAAGAGGTAGCCAAACTTCGTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCGTCTCATGGAACTGATCAGCTTAGTTCAAGAAGTG         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 123264 GCGTCTCATGGAACTGATCAGCTTAGTTCAAGAAGTGGTA...TAGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GGAATGTAGAAGCTGTAAGAAATGCAAAAGATGAGCGTGTTCGGGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124524 GGAATGTAGAAGCTGTAAGAAATGCAAAAGATGAGCGTGTTCGGGAAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AGGAATGCAGTGGAGATGATGATTGCACGGTTAGACACACAGCTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124574 AGGAATGCAGTGGAGATGATGATTGCACGGTTAGACACACAGCTGAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TAAGCTTATAACACTGATGG         GTCAGAAGACATCTCTAACCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 124624 TAAGCTTATAACACTGATGGGTA...CAGGTCAGAAGACATCTCTAACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AAGAAACAGAGCTTTTGGAATCCTTACTTCAGGAGGTGGAGCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128704 AAGAAACAGAGCTTTTGGAATCCTTACTTCAGGAGGTGGAGCACCAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    685       TTGCGGTCTTGTAGTAAGAGTGAGTTGATATCTAAGAGCTCAGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128754 ...CAGTTGCGGTCTTGTAGTAAGAGTGAGTTGATATCTAAGAGCTCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GATCCTTATGATGTTTCAGCAAGTTCATCGGAAGCCCATGGCATCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133494 GATCCTTATGATGTTTCAGCAAGTTCATCGGAAGCCCATGGCATCTTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTACCACTCCTGTTCCACCAGACTTTACCAG         TGAATTAGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 133544 TTACCACTCCTGTTCCACCAGACTTTACCAGGTA...TAGTGAATTAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 CCATCTTACGATTCAGCTACTTTTGTTTTAGAGAATTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 140002 CCATCTTACGATTCAGCTACTTTTGTTTTAGAGAATTTCAGGTA...TAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 CACTTTGCGTCAGAGAGCAGATCCTGTTTACAGTCCACCTCTTCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141749 CACTTTGCGTCAGAGAGCAGATCCTGTTTACAGTCCACCTCTTCAAGTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CAGGACTTTGCTGGAGGTTAAAAGTTTACCCA         GATGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 141799 CAGGACTTTGCTGGAGGTTAAAAGTTTACCCAGTA...TAGGATGGAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 GGAGTTGTGCGAGGTTACTACTTATCTGTGTTTCTGGAGCTCTCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143298 GGAGTTGTGCGAGGTTACTACTTATCTGTGTTTCTGGAGCTCTCAGCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CTTGCCTGAAACTTCTAA         ATATGAATATCGTGTAGAGATGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 143348 CTTGCCTGAAACTTCTAAGTA...TAGATATGAATATCGTGTAGAGATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 TTCACCAGTCCTGTAATGATCCTACAAAAAATATCATTCGAGAATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147366 TTCACCAGTCCTGTAATGATCCTACAAAAAATATCATTCGAGAATTTGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 TCTGACTTTGAAGTTGGAGAATGCTGGGGCTATAATAGATTTTTCCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147416 TCTGACTTTGAAGTTGGAGAATGCTGGGGCTATAATAGATTTTTCCGTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GGACTTACTCGCAAATGAAGGATACTTGAATCCACAAAATGATACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147466 GGACTTACTCGCAAATGAAGGATACTTGAATCCACAAAATGATACAGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTTTAAG         GTTTCAGGTACGTTCACCAACTTTCTTTCAAAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147516 TTTTAAGGTA...AAGGTTTCAGGTACGTTCACCAACTTTCTTTCAAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 TCCCGGGACCAGCATTGGTACATTACTCAGTTGGAAGCTGCACAGACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153103 TCCCGGGACCAGCATTGGTACATTACTCAGTTGGAAGCTGCACAGACTAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TTATATCCAACAAATAAACAACCTTAAAGAG         AGACTTACTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 153153 TTATATCCAACAAATAAACAACCTTAAAGAGGTA...AAGAGACTTACTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TTGAGCTGTCTCGAACTCAGAAGTCAAGAGATTTGTCACCACCAGATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155014 TTGAGCTGTCTCGAACTCAGAAGTCAAGAGATTTGTCACCACCAGATAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CATCTTAGCCCCCAAAATGATGATGCTCTGGAGACACGAGCTAAGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155064 CATCTTAGCCCCCAAAATGATGATGCTCTGGAGACACGAGCTAAGAAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 TGCATGCTCTGACATGCTTCTCGAAGGTGGTCCTACTACAGCTTCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155114 TGCATGCTCTGACATGCTTCTCGAAGGTGGTCCTACTACAGCTTCTGTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 GAGAGGCCAAAGAGGATGAAGAAGATGAGGAGAAGATTCAGAATGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155164 GAGAGGCCAAAGAGGATGAAGAAGATGAGGAGAAGATTCAGAATGAAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TATCAT         CACGAGCTTTCAGATGGAGATCTGGATCTGGATCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155214 TATCATGTA...TAGCACGAGCTTTCAGATGGAGATCTGGATCTGGATCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 TGTTTATGAGGATGAAGTAAATCAGCTCGATGGCAGCAGTTCCTCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156613 TGTTTATGAGGATGAAGTAAATCAGCTCGATGGCAGCAGTTCCTCTGCTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GTTCCACAGCAACAAGTAATACAGAAGAAAATGATATTGATGAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156663 GTTCCACAGCAACAAGTAATACAGAAGAAAATGATATTGATGAAGAAACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 AT         GTCTGGAGAAAATGATGTGGAATATAACAACATGGAATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156713 ATGTG...TAGGTCTGGAGAAAATGATGTGGAATATAACAACATGGAATT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 AGAAGAGGGAGAACTCATGGAAGATGCAGCTGCTGCAGGACCCGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 162538 AGAAGAGGGAGAACTCATGGAAGATGCAGCTGCTGCAGGACCCGCAGGTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1754       GTAGTAGCCATGGTTATGTGGGTTCCAGTAGTAGAATATCAAGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162588 ...CAGGTAGTAGCCATGGTTATGTGGGTTCCAGTAGTAGAATATCAAGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 AGAACACATTTATGCTCCGCTGCTACCAGTAGTTTACTAGACATTGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172351 AGAACACATTTATGCTCCGCTGCTACCAGTAGTTTACTAGACATTGATCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 ATTAATTTTAATACATTTGTTGGACCTTAAGGACCGGAGCAGTATAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172401 ATTAATTTTAATACATTTGTTGGACCTTAAGGACCGGAGCAGTATAGAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ATTTGTGGGGCTTACAGCCTCGCCCACCTGCTTCACTTCTGCAGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172451 ATTTGTGGGGCTTACAGCCTCGCCCACCTGCTTCACTTCTGCAGCCCACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 G         CATCATATTCTCGAAAAGATAAAGACCAAAGGAAGCAACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172501 GGTA...AAGCATCATATTCTCGAAAAGATAAAGACCAAAGGAAGCAACA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 GGCAATGTGGCGAGTGCCCTCTGATTTAAAGATGCTAAAAAGACTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175714 GGCAATGTGGCGAGTGCCCTCTGATTTAAAGATGCTAAAAAGACTCAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 CTCAAATGGCCGAAGTTCGATGTATGAAAACTGATGTAAAGAATACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175764 CTCAAATGGCCGAAGTTCGATGTATGAAAACTGATGTAAAGAATACACTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 TCAGAAATAAAAAGCAGCAGTGCTGCTTCTGGAGACATGCAGACAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175814 TCAGAAATAAAAAGCAGCAGTGCTGCTTCTGGAGACATGCAGACAAGCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 TTTTTCTGCTGACCAGGCAGCTCTGGCTGCATGTGGAACTGAAAACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175864 TTTTTCTGCTGACCAGGCAGCTCTGGCTGCATGTGGAACTGAAAACTCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 GCAGATTGCAGGATTTGGGAATGGAACTCCTGGCAAAGTCATCAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175914 GCAGATTGCAGGATTTGGGAATGGAACTCCTGGCAAAGTCATCAGTTGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 AATTGTTACATACGAAACT         CCACAAATAAGAAGAGTAATTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 175964 AATTGTTACATACGAAACTGTA...CAGCCACAAATAAGAAGAGTAATTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 GCCCAAGCCAGCTCGATCCAGTGTAGCAGGTAGTCTATCACTTCGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186995 GCCCAAGCCAGCTCGATCCAGTGTAGCAGGTAGTCTATCACTTCGAAGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 CAGTGGACCCTGGAGAAAATAGTCGTTCAAAGGGAGACTGTCAGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187045 CAGTGGACCCTGGAGAAAATAGTCGTTCAAAGGGAGACTGTCAGACTCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 TCTGAAG         GCTCCCCAGGAAGCTCTCAGTCTGGGAGCAGGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187095 TCTGAAGGTA...AAGGCTCCCCAGGAAGCTCTCAGTCTGGGAGCAGGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 CAGTTCTCCCCGAGCCTTGATACATGGCAGTATCGGTGATATTCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188632 CAGTTCTCCCCGAGCCTTGATACATGGCAGTATCGGTGATATTCTGCCAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 AAACTGAAGACCGGCAGTGTAAAGCTTTGGATTCAGATGCTGTTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188682 AAACTGAAGACCGGCAGTGTAAAGCTTTGGATTCAGATGCTGTTGTGGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 GCAGTTTTCAGTGGCTTGCCTGCGGTTGAGAAAAGGAGGAAAATGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188732 GCAGTTTTCAGTGGCTTGCCTGCGGTTGAGAAAAGGAGGAAAATGGTCAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 CTTGGG         GGCTAATGCTAAAGGAGGTCATCTGGAAGGACTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188782 CTTGGGGTA...GAGGGCTAATGCTAAAGGAGGTCATCTGGAAGGACTGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 AGATGACTGATTTGGAAAATAATTCTGAAACTGGAGAGTTACAGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191986 AGATGACTGATTTGGAAAATAATTCTGAAACTGGAGAGTTACAGCCTGTA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 CTACCTGAAGGAGCTTCAGCTGCCCCTGAAGAAG         GAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 192036 CTACCTGAAGGAGCTTCAGCTGCCCCTGAAGAAGGTA...CAGGAATGAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TAGCGACAGTGACATTGAATGTGACACTGAGAATGAGGAGCAGGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202690 TAGCGACAGTGACATTGAATGTGACACTGAGAATGAGGAGCAGGAAGAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 ATACCAGTGTGGGCGGGTTTCACGACTCCTTCATGGTCATGACACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202740 ATACCAGTGTGGGCGGGTTTCACGACTCCTTCATGGTCATGACACAGCCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 CCGGATGAAG         ATACACATTCCAGTTTTCCTGATGGTGAACA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 202790 CCGGATGAAGGTG...TAGATACACATTCCAGTTTTCCTGATGGTGAACA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2844 AATAGGCCCTGAAGATCTCAGCTTCAATACAGATGAAAATAGTGGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204969 AATAGGCCCTGAAGATCTCAGCTTCAATACAGATGAAAATAGTGGAAGG