seq1 = pF1KA0892.tfa, 1839 bp
seq2 = pF1KA0892/gi568815579f_19220926.tfa (gi568815579f:19220926_19455779), 234854 bp

>pF1KA0892 1839
>gi568815579f:19220926_19455779 (Chr19)

1-282  (99935-100210)   97% ->
283-360  (115187-115262)   91% ->
361-456  (116245-116340)   100% ->
457-551  (117920-118014)   98% ->
552-579  (119921-119948)   100% ->
580-735  (120327-120482)   100% ->
736-882  (121610-121756)   100% ->
883-973  (121851-121941)   100% ->
974-1077  (122912-123015)   100% ->
1078-1155  (123924-124001)   100% ->
1156-1221  (124379-124444)   100% ->
1222-1308  (126355-126441)   100% ->
1309-1358  (127964-128013)   100% ->
1359-1436  (128230-128307)   100% ->
1437-1548  (128400-128511)   100% ->
1549-1639  (133430-133520)   100% ->
1640-1767  (134339-134466)   100% ->
1768-1839  (134783-134854)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTCAGGCGGCGGCAGCGGCCCAGGCGGCGGCGGCCCAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99935 ATGGCGGCTCAGGCGGCGGCAGCGGCCCAGGCGGCGGCGGCCCAGGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGCCGAGGCGGCCGACTCGTGGTACCTGGCGCTTCTGGGCTTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99985 GCAGGCCGAGGCGGCCGACTCGTGGTACCTGGCGCTTCTGGGCTTCGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCACTTCCGCACTTCCAGCCCGCCCAAAATCCGCCTGTGCGTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100035 AGCACTTCCGCACTTCCAGCCCGCCCAAAATCCGCCTGTGCGTGCACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCAGGCCGTGTTCCCCTTCAAGCCGCCGCAGCGCATCGAGGCCCGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100085 CTGCAGGCCGTGTTCCCCTTCAAGCCGCCGCAGCGCATCGAGGCCCGTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACACCTGCAGCTGGGCTCCGTTCTCTATCACCACACCAAGAACAGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100135 ACACCTGCAGCTGGGCTCCGTTCTCTATCACCACACCAAGAACAGCGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCGCGCAGCCACCTGGAGAAGGCGTGGTTG         ATATCAC A
        ||||||||||||||||||||||||||------>>>...>>>|  ||||-|
 100185 AGGCGCGCAGCCACCTGGAGAAGGCG      GTG...TGGACGTCACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 GCAAATCCCACAGTTCGAAGATGTTAAATTTGAAGCAGCAAGTCTGTTGT
        |---||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115196 G   ATCCCGCAGTTCGAAGATGTTAAATTTGAAGCAGCAAGTCTGTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341 CTGAATTGTACTGTCAAGAG         AATTCCGTTGATGCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115243 CTGAATTGTACTGTCAAGAGGTA...CAGAATTCCGTTGATGCAGCAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 CCGCTGCTGCGGAAGGCGATCCAGATCTCACAGCAGACCCCATATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116266 CCGCTGCTGCGGAAGGCGATCCAGATCTCACAGCAGACCCCATATTGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432 CTGCCGCCTGCTCTTCCAGCTCGCT         CAACTGCACACGCTTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116316 CTGCCGCCTGCTCTTCCAGCTCGCTGTG...TAGCAACTGCACACGCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473 AGAAGGACCTGGTGTCTGCCTGTGACCTCCTGGGTGTAGGGGCCGAGTAC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 117936 AGAAGGACCTGGTGTCGGCCTGTGACCTCCTGGGTGTAGGGGCCGAGTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    523 GCCCGGGTGGTGGGATCTGAATACACACG         GGCGCTGTTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117986 GCCCGGGTGGTGGGATCTGAATACACACGGTA...CAGGGCGCTGTTCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 CCTCAGCAAGGGGATG         CTGCTGCTGATGGAGCGAAAGCTGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119933 CCTCAGCAAGGGGATGGTA...CAGCTGCTGCTGATGGAGCGAAAGCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605 AGGAGGTGCACCCGCTGCTGACCCTCTGCGGGCAGATCGTGGAGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120352 AGGAGGTGCACCCGCTGCTGACCCTCTGCGGGCAGATCGTGGAGAACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655 CAGGGGAACCCCATCCAGAAGGAGTCGCTGCGTGTCTTCTTCCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120402 CAGGGGAACCCCATCCAGAAGGAGTCGCTGCGTGTCTTCTTCCTGGTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705 CCAGGTCACCCACTATCTGGATGCCGGGCAG         GTGAAGAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 120452 CCAGGTCACCCACTATCTGGATGCCGGGCAGGTG...CAGGTGAAGAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    746 TGAAGCCGTGTCTGAAGCAGCTGCAGCAGTGCATCCAGACCATCTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121620 TGAAGCCGTGTCTGAAGCAGCTGCAGCAGTGCATCCAGACCATCTCCACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796 CTGCACGATGATGAGATCCTGCCCAGCAACCCCGCTGACCTCTTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121670 CTGCACGATGATGAGATCCTGCCCAGCAACCCCGCTGACCTCTTCCACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    846 GCTGCCCAAGGAGCACATGTGTGTGCTTGTCTACCTG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 121720 GCTGCCCAAGGAGCACATGTGTGTGCTTGTCTACCTGGTG...TAGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887 CTGTGATGCACTCCATGCAGGCCGGCTACCTGGAGAAGGCGCAGAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121855 CTGTGATGCACTCCATGCAGGCCGGCTACCTGGAGAAGGCGCAGAAGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937 ACGGACAAGGCCCTCATGCAGCTGGAGAAGCTCAAGA         TGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 121905 ACGGACAAGGCCCTCATGCAGCTGGAGAAGCTCAAGAGTA...TAGTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    978 GGACTGCAGCCCCATCCTGTCATCCTTCCAAGTGATCCTGCTGGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122916 GGACTGCAGCCCCATCCTGTCATCCTTCCAAGTGATCCTGCTGGAGCACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1028 TCATCATGTGCCGCCTTGTCACGGGTCACAAGGCCACGGCGCTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122966 TCATCATGTGCCGCCTTGTCACGGGTCACAAGGCCACGGCGCTGCAGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078          ATCTCCCAGGTCTGCCAGCTGTGCCAGCAGTCCCCCCGGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123016 GTA...CAGATCTCCCAGGTCTGCCAGCTGTGCCAGCAGTCCCCCCGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119 CTTCTCCAACCATGCAGCACAGCTGCACACATTGCTG         GGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 123965 CTTCTCCAACCATGCAGCACAGCTGCACACATTGCTGGTG...CAGGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1160 TGTACTGTGTCTCTGTCAACTGCATGGACAACGCGGAAGCCCAGTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124383 TGTACTGTGTCTCTGTCAACTGCATGGACAACGCGGAAGCCCAGTTCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1210 ACGGCCCTGCGG         CTCACCAACCACCAGGAGCTGTGGGCCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 124433 ACGGCCCTGCGGGTA...CAGCTCACCAACCACCAGGAGCTGTGGGCCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CATCGTCACCAACCTGGCGAGTGTGTATATACGGGAAGGAAATAGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126384 CATCGTCACCAACCTGGCGAGTGTGTATATACGGGAAGGAAATAGACACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AAGAGGTA         CTCTACAGTCTGCTGGAGAGGATCAACCCGGAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 126434 AAGAGGTAGTA...CAGCTCTACAGTCTGCTGGAGAGGATCAACCCGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CACAGCTTCCCTGTCAG         CTCGCACTGCCTCCGAGCAGCCGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 127997 CACAGCTTCCCTGTCAGGTG...CAGCTCGCACTGCCTCCGAGCAGCCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CTTCTATGTGCGTGGGCTCTTCTCCTTCTTCCAGGGACGCTACAACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128254 CTTCTATGTGCGTGGGCTCTTCTCCTTCTTCCAGGGACGCTACAACGAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 CCAA         GCGATTTCTGCGGGAAACTCTGAAGATGTCCAATGCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128304 CCAAGTA...CAGGCGATTTCTGCGGGAAACTCTGAAGATGTCCAATGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAGGACCTGAACCGGCTCACAGCCTGCTCCCTCGTGCTTCTGGGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128437 GAGGACCTGAACCGGCTCACAGCCTGCTCCCTCGTGCTTCTGGGCCACAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CTTCTATGTGCTGGGAAACCACAGG         GAGAGTAACAACATGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128487 CTTCTATGTGCTGGGAAACCACAGGGTG...CAGGAGAGTAACAACATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TGGTGCCTGCCATGCAGCTCGCCAGCAAGATCCCGGACATGTCGGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133446 TGGTGCCTGCCATGCAGCTCGCCAGCAAGATCCCGGACATGTCGGTACAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CTGTGGTCGTCAGCACTGCTGAGAG         ACCTGAATAAAGCCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 133496 CTGTGGTCGTCAGCACTGCTGAGAGGTG...CAGACCTGAATAAAGCCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 TGGGAACGCCATGGATGCCCATGAAGCCGCCCAGATGCACCAGAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134355 TGGGAACGCCATGGATGCCCATGAAGCCGCCCAGATGCACCAGAACTTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CGCAGCAGCTGCTCCAGGACCACATTGAGGCCTGCAGCCTCCCCGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134405 CGCAGCAGCTGCTCCAGGACCACATTGAGGCCTGCAGCCTCCCCGAACAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 AACCTCATCACG         TGGACAGACGGTCCACCCCCCGTGCAGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 134455 AACCTCATCACGGTA...CAGTGGACAGACGGTCCACCCCCCGTGCAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 CCAAGCTCAGAATGGACCCAACACCAGCCTGGCCAGCCTCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134812 CCAAGCTCAGAATGGACCCAACACCAGCCTGGCCAGCCTCCTG