seq1 = pF1KA0890.tfa, 3582 bp
seq2 = pF1KA0890/gi568815595f_47727347.tfa (gi568815595f:47727347_47950117), 222771 bp

>pF1KA0890 3582
>gi568815595f:47727347_47950117 (Chr3)

1-28  (83338-83365)   100% ->
29-124  (90676-90771)   100% ->
125-255  (100001-100131)   100% ->
256-366  (101678-101788)   100% ->
367-668  (113531-113832)   100% ->
669-789  (114271-114391)   100% ->
790-939  (115760-115909)   100% ->
940-1092  (118354-118506)   100% ->
1093-1929  (118819-119655)   100% ->
1930-2005  (119927-120002)   100% ->
2006-2110  (120086-120190)   100% ->
2111-2286  (120435-120610)   100% ->
2287-2493  (120834-121040)   100% ->
2494-2575  (121123-121204)   100% ->
2576-2769  (121278-121471)   100% ->
2770-2929  (121574-121733)   100% ->
2930-3087  (121846-122003)   100% ->
3088-3191  (122105-122208)   100% ->
3192-3331  (122284-122423)   100% ->
3332-3582  (122521-122771)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGCCTGGACTCATTCAGAAAAG         ATCGGGCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  83338 ATGTTCAGCCTGGACTCATTCAGAAAAGGTA...CAGATCGGGCCCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAGGCAGCGTCAGTGCAAACTTCCCCCACCCCGCCTTCCACCCATGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  90689 CAGGCAGCGTCAGTGCAAACTTCCCCCACCCCGCCTTCCACCCATGTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAACCCTACCCCAGGAGGGACCATCTCTCGAG         CTTCTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  90739 TCAACCCTACCCCAGGAGGGACCATCTCTCGAGGTA...TAGCTTCTAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GACCTATTAAAAGAGTTCCCACAGCCCAAAAATCTTCTCAACAGTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 GACCTATTAAAAGAGTTCCCACAGCCCAAAAATCTTCTCAACAGTGTGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGAAGAGCCCTCGGCATCTCACATGCAAAAGACAAACTAGTCTACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 TGGAAGAGCCCTCGGCATCTCACATGCAAAAGACAAACTAGTCTACGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACACAAATGGACCGAAGAAAAAG         AAAGTCACACTGCACATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100109 ACACAAATGGACCGAAGAAAAAGGTA...CAGAAAGTCACACTGCACATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAATGGCCCAAGAGCGTGGAGGTAGAAGGCTATGGCAGCAAGAAGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101696 AAATGGCCCAAGAGCGTGGAGGTAGAAGGCTATGGCAGCAAGAAGATCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCTGAGCGGCAGGCTGCAGCTGCAGCCTGCCAGCTGTTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101746 TGCTGAGCGGCAGGCTGCAGCTGCAGCCTGCCAGCTGTTCAAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    367   GGTTGGGGTCTGCTAGGTCCCCGGAATGAGTTGTTTGACGCAGCCAAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113529 AGGGTTGGGGTCTGCTAGGTCCCCGGAATGAGTTGTTTGACGCAGCCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACCGAGTGCTAGCTGATCGCTTTGGCTCCCCTGCCGACAGCTGGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113579 TACCGAGTGCTAGCTGATCGCTTTGGCTCCCCTGCCGACAGCTGGTGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCGGAACCCACCATGCCCCCTACTTCCTGGCGGCAGCTGAATCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113629 TCCGGAACCCACCATGCCCCCTACTTCCTGGCGGCAGCTGAATCCAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTATTCGACCAGGGGGACCTGGGGGCCTATCCCGCTCTTTAGGCCGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113679 GTATTCGACCAGGGGGACCTGGGGGCCTATCCCGCTCTTTAGGCCGGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGAGGAGGACGAGGAGGAAGAGCTAGAAGAAGGGACCATAGATGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113729 GAAGAGGAGGACGAGGAGGAAGAGCTAGAAGAAGGGACCATAGATGTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGACTTCTTGTCCATGACCCAGCAGGATTCCCACGCTCCACTCAGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113779 CGACTTCTTGTCCATGACCCAGCAGGATTCCCACGCTCCACTCAGGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAAG         GGGGAGTTCCTTTGAGATGACAGATGACGACAGTGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113829 CAAGGTA...CAGGGGGAGTTCCTTTGAGATGACAGATGACGACAGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATTAGGGCTCTGACCCAGTTTCCACTTCCCAAGAACCTTCTGGCCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114308 ATTAGGGCTCTGACCCAGTTTCCACTTCCCAAGAACCTTCTGGCCAAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GATTCAGATTGCAACGTCATCCTCCACAGCTAAG         AACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114358 GATTCAGATTGCAACGTCATCCTCCACAGCTAAGGTG...TAGAACCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCAGTTCCATACTGTGGGCACCAAGACCAAGCTGTCTACACTCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115767 TGCAGTTCCATACTGTGGGCACCAAGACCAAGCTGTCTACACTCACCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCTGGCCCTGCCCCATGACCTTTGTTGCCAAAGGGCGCCGCAAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115817 CTCTGGCCCTGCCCCATGACCTTTGTTGCCAAAGGGCGCCGCAAAGCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGCTGAGAATAAGGCGGCAGCCTTGGCCTGCAAGAAACTGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 115867 GGCTGAGAATAAGGCGGCAGCCTTGGCCTGCAAGAAACTGAAGGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    940   AGCCTGGGCCTGGTGGACAGGAACAACGAACCGCTTACACACGCCATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118352 AGAGCCTGGGCCTGGTGGACAGGAACAACGAACCGCTTACACACGCCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TATAACCTGGCCTCTTTGCGTGAGCTGGGTGAGACCCAGCGCCGACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118402 TATAACCTGGCCTCTTTGCGTGAGCTGGGTGAGACCCAGCGCCGACCATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACCATCCAGGTGCCCGAGCCCATCCTCCGCAAGATAGAGACCTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118452 CACCATCCAGGTGCCCGAGCCCATCCTCCGCAAGATAGAGACCTTCCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACCAT         TACCCTGTGGAGAGTTCATGGATCGCCCCAGAACTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118502 ACCATGTA...CAGTACCCTGTGGAGAGTTCATGGATCGCCCCAGAACTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGGCTGCAGAGTGATGACATCTTGCCCTTGGGCAAGGACTCAGGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118855 CGGCTGCAGAGTGATGACATCTTGCCCTTGGGCAAGGACTCAGGGCCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAGTGACCCTATCACAGGCAAGCCCTATGTGCCCCTGTTGGAAGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118905 GAGTGACCCTATCACAGGCAAGCCCTATGTGCCCCTGTTGGAAGCAGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGGTACGTCTCAGCCAGAGTCTGCTAGAACTGTGGCGGCGGCGAGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118955 AGGTACGTCTCAGCCAGAGTCTGCTAGAACTGTGGCGGCGGCGAGGGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTCTGGCAGGAGGCCCCCCAGCTACCTGTGGACCCACATCGGGACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119005 GTCTGGCAGGAGGCCCCCCAGCTACCTGTGGACCCACATCGGGACACCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CCTCAACGCCATTGAGCAGCACCCGGTGGTGGTCATCTCTGGGGACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119055 CCTCAACGCCATTGAGCAGCACCCGGTGGTGGTCATCTCTGGGGACACGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCTGTGGGAAGACCACGCGCATCCCCCAGCTGTTGCTGGAGCGCTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119105 GCTGTGGGAAGACCACGCGCATCCCCCAGCTGTTGCTGGAGCGCTATGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACCGAGGGCCGAGGTGCCCGCTGCAATGTTATCATCACCCAACCTCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119155 ACCGAGGGCCGAGGTGCCCGCTGCAATGTTATCATCACCCAACCTCGCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CATCTCTGCTGTGTCTGTGGCACAGCGGGTCAGCCACGAACTGGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119205 CATCTCTGCTGTGTCTGTGGCACAGCGGGTCAGCCACGAACTGGGCCCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCCTGCGCCGGAATGTGGGCTTCCAGGTGCGGTTGGAAAGTAAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119255 CCCTGCGCCGGAATGTGGGCTTCCAGGTGCGGTTGGAAAGTAAGCCCCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 TCCCGAGGCGGGGCCCTGCTCTTCTGCACTGTGGGTATCCTGCTGCGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119305 TCCCGAGGCGGGGCCCTGCTCTTCTGCACTGTGGGTATCCTGCTGCGTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GCTGCAGAGCAACCCCAGCCTGGAGGGCGTGAGCCACGTCATCGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119355 GCTGCAGAGCAACCCCAGCCTGGAGGGCGTGAGCCACGTCATCGTGGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AGGTGCATGAGCGGGACGTGAACACAGACTTTCTGCTGATCCTGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119405 AGGTGCATGAGCGGGACGTGAACACAGACTTTCTGCTGATCCTGCTCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GGCCTGCAGCGGCTCAACCCGGCCCTGCGGCTGGTGCTCATGAGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119455 GGCCTGCAGCGGCTCAACCCGGCCCTGCGGCTGGTGCTCATGAGTGCCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 AGGGGACAATGAGCGCTTCTCCCGATACTTTGGTGGCTGCCCCGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119505 AGGGGACAATGAGCGCTTCTCCCGATACTTTGGTGGCTGCCCCGTCATCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AGGTGCCTGGCTTCATGTACCCAGTCAAGGAGCACTACCTAGAGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119555 AGGTGCCTGGCTTCATGTACCCAGTCAAGGAGCACTACCTAGAGGACATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CTGGCCAAGTTGGGCAAGCACCAGTACCTGCACCGGCACCGGCACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119605 CTGGCCAAGTTGGGCAAGCACCAGTACCTGCACCGGCACCGGCACCATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 G         TCTGAGGATGAATGCGCACTCGATTTGGACCTTGTGACTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119655 GGTG...CAGTCTGAGGATGAATGCGCACTCGATTTGGACCTTGTGACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 ATCTGGTTCTGCACATCGATGCTCGCGGGGAACCAG         GTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 119967 ATCTGGTTCTGCACATCGATGCTCGCGGGGAACCAGGTG...CAGGTGGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 ATCCTGTGCTTCCTGCCTGGGTGGCAGGAGATCAAAGGAGTGCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120091 ATCCTGTGCTTCCTGCCTGGGTGGCAGGAGATCAAAGGAGTGCAGCAGCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CCTCCAGGAGGCCCTGGGCATGCACGAGAGCAAGTACCTCATCCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120141 CCTCCAGGAGGCCCTGGGCATGCACGAGAGCAAGTACCTCATCCTGCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111          TGCACTCCAACATCCCCATGATGGATCAGAAGGCCATATTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120191 GTG...CAGTGCACTCCAACATCCCCATGATGGATCAGAAGGCCATATTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 CAGCAGCCTCCAGTTGGGGTGCGCAAGATTGTCTTGGCCACCAACATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120476 CAGCAGCCTCCAGTTGGGGTGCGCAAGATTGTCTTGGCCACCAACATTGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 TGAGACTTCCATCACAATCAATGACATCGTGCATGTGGTGGACAGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120526 TGAGACTTCCATCACAATCAATGACATCGTGCATGTGGTGGACAGTGGGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 TGCACAAGGAAGAACGCTATGACCTGAAGACCAAG         GTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 120576 TGCACAAGGAAGAACGCTATGACCTGAAGACCAAGGTG...CAGGTGTCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 TGCCTGGAGACAGTGTGGGTATCAAGAGCCAATGTGATCCAGCGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120840 TGCCTGGAGACAGTGTGGGTATCAAGAGCCAATGTGATCCAGCGCCGGGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 CCGGGCGGGCCGCTGCCAGTCCGGCTTTGCCTACCACTTGTTCCCTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120890 CCGGGCGGGCCGCTGCCAGTCCGGCTTTGCCTACCACTTGTTCCCTCGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 GCCGGCTGGAGAAAATGGTCCCTTTCCAAGTGCCAGAGATCCTGCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120940 GCCGGCTGGAGAAAATGGTCCCTTTCCAAGTGCCAGAGATCCTGCGCACA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 CCTCTTGAGAACCTGGTGCTGCAAGCGAAAATCCACATGCCTGAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120990 CCTCTTGAGAACCTGGTGCTGCAAGCGAAAATCCACATGCCTGAGAAGAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 G         GCGGTGGAGTTCCTGTCCAAGGCTGTGGACAGTCCAAACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121040 GGTG...TAGGCGGTGGAGTTCCTGTCCAAGGCTGTGGACAGTCCAAACA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TCAAGGCAGTGGACGAGGCTGTGATCTTGCTCCAGGAGATCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 121163 TCAAGGCAGTGGACGAGGCTGTGATCTTGCTCCAGGAGATCGGTA...CA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2576  GGGTGCTGGACCAGCGGGAGTACCTGACTACCCTGGGGCAGCGCCTGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121277 GGGGTGCTGGACCAGCGGGAGTACCTGACTACCCTGGGGCAGCGCCTGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 TCACATCTCCACCGACCCCCGGTTGGCCAAGGCCATTGTGTTGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121327 TCACATCTCCACCGACCCCCGGTTGGCCAAGGCCATTGTGTTGGCTGCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 TCTTCCGTTGCCTGCACCCACTACTGGTGGTCGTTTCCTGCCTCACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121377 TCTTCCGTTGCCTGCACCCACTACTGGTGGTCGTTTCCTGCCTCACCCGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 GACCCCTTCAGCAGCAGCCTACAGAACCGGGCAGAGGTGGACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 121427 GACCCCTTCAGCAGCAGCCTACAGAACCGGGCAGAGGTGGACAAGGTC..

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770     GTGAAAGCACTGTTGAGCCATGACAGCGGCAGTGACCACCTGGCCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121477 .CAGGTGAAAGCACTGTTGAGCCATGACAGCGGCAGTGACCACCTGGCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 TTGTGCGGGCTGTCGCCGGCTGGGAGGAGGTGCTGCGTTGGCAGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121620 TTGTGCGGGCTGTCGCCGGCTGGGAGGAGGTGCTGCGTTGGCAGGACCGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 AGCTCCCGGGAGAATTACCTGGAGGAAAACCTGCTGTACGCACCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121670 AGCTCCCGGGAGAATTACCTGGAGGAAAACCTGCTGTACGCACCCAGCCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 GCGCTTCATCCACG         GACTCATCAAGCAGTTCTCAGAGAACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121720 GCGCTTCATCCACGGTC...TAGGACTCATCAAGCAGTTCTCAGAGAACA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 TTTATGAGGCCTTCCTGGTGGGGAAGCCCTCGGACTGCACCCTGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121873 TTTATGAGGCCTTCCTGGTGGGGAAGCCCTCGGACTGCACCCTGGCCTCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 GCCCAGTGCAACGAGTACAGTGAGGAGGAGGAGCTGGTGAAGGGCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121923 GCCCAGTGCAACGAGTACAGTGAGGAGGAGGAGCTGGTGAAGGGCGTGCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 GATGGCCGGCCTCTACCCCAACCTCATCCAG         GTGAGGCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 121973 GATGGCCGGCCTCTACCCCAACCTCATCCAGGTG...CAGGTGAGGCAGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 GCAAGGTCACCCGGCAGGGGAAGTTCAAGCCCAACAGCGTCACATATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122115 GCAAGGTCACCCGGCAGGGGAAGTTCAAGCCCAACAGCGTCACATATAGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 ACCAAATCAGGCAACATCCTGCTGCACAAGTCGACCATTAACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 122165 ACCAAATCAGGCAACATCCTGCTGCACAAGTCGACCATTAACAGGTG...

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3192    GGAGGCCACACGGTTACGGAGCCGATGGCTGACGTATTTCATGGCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122281 TAGGGAGGCCACACGGTTACGGAGCCGATGGCTGACGTATTTCATGGCAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 TCAAGTCCAATGGCAGCGTCTTCGTCCGGGACTCCTCTCAGGTGCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122331 TCAAGTCCAATGGCAGCGTCTTCGTCCGGGACTCCTCTCAGGTGCACCCG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 CTAGCTGTGCTGCTGCTGACCGACGGGGACGTGCACATCCGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 122381 CTAGCTGTGCTGCTGCTGACCGACGGGGACGTGCACATCCGTGGTG...C

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3332   ATGACGGGCGCCGGGCCACCATCTCACTGAGCGACAGTGACCTGCTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122519 AGATGACGGGCGCCGGGCCACCATCTCACTGAGCGACAGTGACCTGCTGC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 GGCTGGAGGGTGACTCGCGTACCGTGCGGCTGCTGAAGGAGCTGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122569 GGCTGGAGGGTGACTCGCGTACCGTGCGGCTGCTGAAGGAGCTGCGGCGG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 GCCCTGGGCCGCATGGTGGAGCGGAGCCTGCGCAGCGAGCTGGCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122619 GCCCTGGGCCGCATGGTGGAGCGGAGCCTGCGCAGCGAGCTGGCTGCACT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3480 TCCCCCCAGCGTACAGGAGGAGCACGGGCAGCTGCTTGCGCTACTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122669 TCCCCCCAGCGTACAGGAGGAGCACGGGCAGCTGCTTGCGCTACTGGCAG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3530 AGCTGCTGCGAGGACCCTGTGGCAGCTTTGATGTGCGCAAGACAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122719 AGCTGCTGCGAGGACCCTGTGGCAGCTTTGATGTGCGCAAGACAGCTGAC

   3750 
   3580 GAC
        |||
 122769 GAC