seq1 = pF1KA0869.tfa, 3339 bp
seq2 = pF1KA0869/gi568815593f_168192153.tfa (gi568815593f:168192153_168569014), 376862 bp

>pF1KA0869 3339
>gi568815593f:168192153_168569014 (Chr5)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-229  (179272-179381)   100% ->
230-433  (193059-193262)   100% ->
434-510  (205572-205648)   100% ->
511-590  (207336-207415)   100% ->
591-720  (214046-214175)   100% ->
721-867  (216355-216501)   100% ->
868-941  (217770-217843)   100% ->
942-1184  (222196-222438)   100% ->
1185-1274  (229856-229945)   100% ->
1275-1810  (231381-231916)   99% ->
1811-1919  (235881-235989)   100% ->
1920-2000  (236555-236635)   100% ->
2001-2087  (237985-238071)   100% ->
2088-2280  (239100-239292)   100% ->
2281-2433  (249530-249682)   98% ->
2434-2525  (252342-252433)   100% ->
2526-2658  (261816-261948)   100% ->
2659-2823  (263204-263368)   100% ->
2824-2916  (268498-268590)   100% ->
2917-3150  (272577-272810)   100% ->
3151-3275  (275688-275812)   100% ->
3276-3339  (276799-276862)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCGGCCGGAGCTGCCCCTGCCGGAGGGCTGGGAGGAGGCGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCGGCCGGAGCTGCCCCTGCCGGAGGGCTGGGAGGAGGCGCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCGACGGCAAGGTCTACTACATAGACCACACGAACCGCACCACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCGACGGCAAGGTCTACTACATAGACCACACGAACCGCACCACCAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGATCGACCCGCGGGACAG         GTACACCAAACCGCTCACCTTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 GGATCGACCCGCGGGACAGGTA...CAGGTACACCAAACCGCTCACCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGACTGCATTAGTGATGAGTTGCCGCTAGGATGGGAAGAGGCATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179294 GCTGACTGCATTAGTGATGAGTTGCCGCTAGGATGGGAAGAGGCATATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCACAGGTTGGAGATTACTTCATAGACCACAACACCA         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 179344 CCCACAGGTTGGAGATTACTTCATAGACCACAACACCAGTA...CAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCACTCAGATTGAGGATCCTCGAGTACAATGGCGGCGGGAGCAGGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193062 CCACTCAGATTGAGGATCCTCGAGTACAATGGCGGCGGGAGCAGGAACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGCTGAAGGATTACCTGGTGGTGGCCCAGGAGGCTCTGAGTGCACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193112 ATGCTGAAGGATTACCTGGTGGTGGCCCAGGAGGCTCTGAGTGCACAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGATCTACCAGGTGAAGCAGCAGCGCCTGGAGCTTGCACAGCAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193162 GGAGATCTACCAGGTGAAGCAGCAGCGCCTGGAGCTTGCACAGCAGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCAGCAACTGCATGCCGTCTGGGAGCATAAGCTGGGCTCCCAGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193212 ACCAGCAACTGCATGCCGTCTGGGAGCATAAGCTGGGCTCCCAGGTCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 T         TGGTCTCTGGTTCATCATCCAGCTCCAAGTATGACCCTGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193262 TGTG...CAGTGGTCTCTGGTTCATCATCCAGCTCCAAGTATGACCCTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATCCTGAAAGCTGAAATTGCCACTGCAAAATCCCGG         GTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 205612 GATCCTGAAAGCTGAAATTGCCACTGCAAAATCCCGGGTA...CAGGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACAAGCTGAAGAGAGAGATGGTTCACCTCCAGCACGAGCTGCAGTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207340 ACAAGCTGAAGAGAGAGATGGTTCACCTCCAGCACGAGCTGCAGTTCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGCGTGGCTTTCAGACCCTGAAGAA         AATCGATAAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 207390 GAGCGTGGCTTTCAGACCCTGAAGAAGTA...TAGAATCGATAAGAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTCTGATGCTCAGGGCAGCTACAAACTGGATGAAGCTCAGGCTGTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214061 GTCTGATGCTCAGGGCAGCTACAAACTGGATGAAGCTCAGGCTGTCTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGAAACAAAAGCCATCAAAAAGGCTATTACCTGTGGGGAAAAGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214111 GAGAAACAAAAGCCATCAAAAAGGCTATTACCTGTGGGGAAAAGGAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAAGATCTCATTAAG         AGCCTTGCCATGTTGAAGGACGGCTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 214161 CAAGATCTCATTAAGGTA...CAGAGCCTTGCCATGTTGAAGGACGGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCGCACTGACAGGGGGTCTCACTCAGACCTGTGGTCCAGCAGCAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216381 CCGCACTGACAGGGGGTCTCACTCAGACCTGTGGTCCAGCAGCAGCTCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGAGAGTTCGAGTTTCCCGCTACCGAAACAGTACCTGGATGTGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216431 TGGAGAGTTCGAGTTTCCCGCTACCGAAACAGTACCTGGATGTGAGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGACAGACATCTCGGGAAGC         TTCGGCATCAACAGCAACAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 216481 CAGACAGACATCTCGGGAAGCGTG...CAGTTCGGCATCAACAGCAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCAGTTGGCAGAGAAGGTCAGATTGCGCCTTCGATATGAAGAGGCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217790 TCAGTTGGCAGAGAAGGTCAGATTGCGCCTTCGATATGAAGAGGCTAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAAG         GATCGCCAACCTGAAGATCCAGCTGGCCAAGCTTGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217840 GAAGGTA...CAGGATCGCCAACCTGAAGATCCAGCTGGCCAAGCTTGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGTGAGGCCTGGCCTGGGGTGCTGGACTCAGAGAGGGACCGGCTGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222233 AGTGAGGCCTGGCCTGGGGTGCTGGACTCAGAGAGGGACCGGCTGATCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TATCAACGAGAAGGAGGAGCTGCTGAAGGAGATGCGCTTCATCAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222283 TATCAACGAGAAGGAGGAGCTGCTGAAGGAGATGCGCTTCATCAGCCCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCAAGTGGACCCAGGGGGAGGTGGAGCAGCTGGAGATGGCCCGGAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222333 GCAAGTGGACCCAGGGGGAGGTGGAGCAGCTGGAGATGGCCCGGAAGCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CTGGAAAAGGACCTGCAGGCAGCCCGGGACACCCAGAGCAAGGCGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222383 CTGGAAAAGGACCTGCAGGCAGCCCGGGACACCCAGAGCAAGGCGCTGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GGAGAG         GTTAAAGTTAAACAGTAAGAGGAACCAGCTTGTGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222433 GGAGAGGTG...CAGGTTAAAGTTAAACAGTAAGAGGAACCAGCTTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAGAACTGGAGGAAGCCACCCGGCAGGTGGCAACTCTGCACTCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229891 GAGAACTGGAGGAAGCCACCCGGCAGGTGGCAACTCTGCACTCCCAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAAAG         TCTCTCAAGCAGCATGCAGTCCCTGTCCTCAGGCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229941 AAAAGGTG...CAGTCTCTCAAGCAGCATGCAGTCCCTGTCCTCAGGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGCCCCGGATCCCTCACGTCCAGCCGGGGCTCCCTGGTTGCATCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231417 CAGCCCCGGATCCCTCACGTCCAGCCGGGGCTCCCTGGTTGCATCCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGGACTCCTCCACTTCAGCCAGCTTCACTGACCTCTACTATGACCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231467 TGGACTCCTCCACTTCAGCCAGCTTCACTGACCTCTACTATGACCCCTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GAGCAGCTGGACTCAGAGCTGCAGAGCAAGGTGGAGTTCCTGCTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231517 GAGCAGCTGGACTCAGAGCTGCAGAGCAAGGTGGAGTTCCTGCTCCTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGGGGCCACCGGCTTCCGGCCCTCGGGCTGCATCACCACCATCCACGAGG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 231567 GGGGGCCACCGGCTTCCGGCCCTCAGGCTGCATCACCACCATCCACGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ATGAGGTGGCCAAGACCCAGAAGGCAGAGGGAGGTGGCCGCCTGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231617 ATGAGGTGGCCAAGACCCAGAAGGCAGAGGGAGGTGGCCGCCTGCAGGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CTGCGTTCCCTGTCTGGCACCCCAAAGTCCATGACCTCCCTATCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231667 CTGCGTTCCCTGTCTGGCACCCCAAAGTCCATGACCTCCCTATCCCCACG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTCCTCTCTCTCCTCCCCCTCCCCACCCTGTTCCCCTCTCATGGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231717 TTCCTCTCTCTCCTCCCCCTCCCCACCCTGTTCCCCTCTCATGGCTGACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCCTCCTGGCTGGTGATGCCTTCCTCAACTCCTTGGAGTTTGAAGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231767 CCCTCCTGGCTGGTGATGCCTTCCTCAACTCCTTGGAGTTTGAAGACCCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GAGCTGAGTGCCACTCTTTGTGAACTGAGCCTTGGTAACAGCGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231817 GAGCTGAGTGCCACTCTTTGTGAACTGAGCCTTGGTAACAGCGCCCAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 AAGATACCGGCTGGAGGAACCAGGAACGGAGGGCAAGCAGCTGGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231867 AAGATACCGGCTGGAGGAACCAGGAACGGAGGGCAAGCAGCTGGGCCAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811          CTGTGAATACGGCCCAGGGGTGTGGCCTGAAAGTGGCCTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231917 GTA...TAGCTGTGAATACGGCCCAGGGGTGTGGCCTGAAAGTGGCCTGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GTCTCAGCCGCCGTATCGGACGAGTCAGTGGCTGGAGACAGTGGTGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235922 GTCTCAGCCGCCGTATCGGACGAGTCAGTGGCTGGAGACAGTGGTGTGTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CGAGGCTTCCGTGCAGAG         ACTGGGTGCTTCAGAAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 235972 CGAGGCTTCCGTGCAGAGGTA...CAGACTGGGTGCTTCAGAAGCTGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CATTTGACAGTGACGAATCGGAAGCAGTGGGTGCGACCCGAATTCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236578 CATTTGACAGTGACGAATCGGAAGCAGTGGGTGCGACCCGAATTCAGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GCCCTGAA         GTATGATGAGAAGAATAAGCAATTTGCAATATT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 236628 GCCCTGAAGTA...CAGGTATGATGAGAAGAATAAGCAATTTGCAATATT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 AATCATCCAGCTGAGTAACCTTTCTGCTCTGTTGCAGCAACAAGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238018 AATCATCCAGCTGAGTAACCTTTCTGCTCTGTTGCAGCAACAAGACCAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AAGT         GAATATCCGCGTGGCTGTCCTTCCTTGCTCTGAAAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238068 AAGTGTG...TAGGAATATCCGCGTGGCTGTCCTTCCTTGCTCTGAAAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ACAACCTGCCTGTTCCGGACCCGGCCTCTGGACGCCTCAGACACTCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239137 ACAACCTGCCTGTTCCGGACCCGGCCTCTGGACGCCTCAGACACTCTAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GTTCAATGAGGTGTTCTGGGTATCCATGTCCTATCCAGCCCTTCACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239187 GTTCAATGAGGTGTTCTGGGTATCCATGTCCTATCCAGCCCTTCACCAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 AGACCTTAAGAGTCGATGTCTGTACCACCGACAGGAGCCATCTGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239237 AGACCTTAAGAGTCGATGTCTGTACCACCGACAGGAGCCATCTGGAAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TGCCTG         GGAGGCGCCCAGATCAGCCTGGCGGAGGTCTGCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239287 TGCCTGGTA...CAGGGAGGCGCCCAGATCAGCCTGGCGGAGGTCTGCCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GTCTGGGGAGAGGTCGACTCGCTGGTACAACCTTCTCAGCTACAAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249565 GTCTGGGGAGAGGTCGACTCGCTGGTACAACCTTCTCAGCTACAAATACT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TGAAGAAGCAGAGCAGGGAGCTCAAGCCAGTGGGAGTTATGGCCCCTGCC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 249615 TGAAGAAACAGAGCAGGGAGCTCAAGCCAGTGGGAGTCATGGCCCCTGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 TCAGGGCCTGCCAGCACG         GACGCTGTGTCTGCTCTGTTGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 249665 TCAGGGCCTGCCAGCACGGTG...TAGGACGCTGTGTCTGCTCTGTTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 ACAGACAGCAGTGGAGCTGGAGAAGAGGCAGGAGGGCAGGAGCAGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252365 ACAGACAGCAGTGGAGCTGGAGAAGAGGCAGGAGGGCAGGAGCAGCACAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AGACACTGGAAGACAGCTG         GAGGTATGAGGAGACCAGTGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 252415 AGACACTGGAAGACAGCTGGTG...CAGGAGGTATGAGGAGACCAGTGAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 AATGAGGCAGTAGCCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261838 AATGAGGCAGTAGCCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGAGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AGAAGAGGATGTTTTCACCGAGAAAGCCTCACCTGATATGGATGGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261888 AGAAGAGGATGTTTTCACCGAGAAAGCCTCACCTGATATGGATGGGTACC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CAGCATTAAAG         GTGGACAAAGAGACCAACACGGAGACCCCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 261938 CAGCATTAAAGGTA...CAGGTGGACAAAGAGACCAACACGGAGACCCCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GCCCCATCCCCCACAGTGGTGCGACCTAAGGACCGGAGAGTGGGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263234 GCCCCATCCCCCACAGTGGTGCGACCTAAGGACCGGAGAGTGGGCACCCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 GTCCCAGGGGCCATTTCTTCGAGGGAGCACCATCATCCGCTCTAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263284 GTCCCAGGGGCCATTTCTTCGAGGGAGCACCATCATCCGCTCTAAGACCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 TCTCCCCAGGACCCCAGAGCCAGTACGTGTGCCGG         CTGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 263334 TCTCCCCAGGACCCCAGAGCCAGTACGTGTGCCGGGTA...CAGCTGAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 CGGAGTGATAGTGACAGCTCCACTCTGTCCAAAAAGCCACCTTTTGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268504 CGGAGTGATAGTGACAGCTCCACTCTGTCCAAAAAGCCACCTTTTGTTCG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 AAACTCCCTGGAGCGACGCAGCGTCCGGATGAAGCGG         CCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 268554 AAACTCCCTGGAGCGACGCAGCGTCCGGATGAAGCGGGTA...CAGCCTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 CCTCGGTCAAGTCGCTGCGCTCCGAGCGTCTGATCCGTACCTCGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272581 CCTCGGTCAAGTCGCTGCGCTCCGAGCGTCTGATCCGTACCTCGCTGGAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 CTGGAGTTAGACCTGCAGGCGACAAGAACCTGGCACAGCCAATTGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272631 CTGGAGTTAGACCTGCAGGCGACAAGAACCTGGCACAGCCAATTGACCCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GGAGATCTCGGTGCTGAAGGAGCTCAAGGAGCAGCTGGAACAAGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272681 GGAGATCTCGGTGCTGAAGGAGCTCAAGGAGCAGCTGGAACAAGCCAAGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 GCCACGGGGAGAAGGAGCTGCCACAGTGGTTGCGTGAGGACGAGCGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272731 GCCACGGGGAGAAGGAGCTGCCACAGTGGTTGCGTGAGGACGAGCGTTTC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 CGCCTGCTGCTGAGGATGCTGGAGAAGCGG         CAGATGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 272781 CGCCTGCTGCTGAGGATGCTGGAGAAGCGGGTG...CAGCAGATGGACCG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 AGCGGAGCACAAGGGTGAGCTTCAGACAGACAAGATGATGAGGGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275699 AGCGGAGCACAAGGGTGAGCTTCAGACAGACAAGATGATGAGGGCAGCTG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212 CCAAGGATGTGCACAGGCTCCGAGGCCAGAGCTGTAAGGAACCCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275749 CCAAGGATGTGCACAGGCTCCGAGGCCAGAGCTGTAAGGAACCCCCAGAA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3262 GTTCAGTCTTTCAG         GGAGAAGATGGCATTTTTCACCCGGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 275799 GTTCAGTCTTTCAGGTA...TAGGGAGAAGATGGCATTTTTCACCCGGCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .
   3303 TCGGATGAATATCCCAGCTCTCTCTGCAGATGACGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 276826 TCGGATGAATATCCCAGCTCTCTCTGCAGATGACGTC