seq1 = pF1KA0868.tfa, 3993 bp
seq2 = pF1KA0868/gi568815591f_146016877.tfa (gi568815591f:146016877_148515613), 2498737 bp

>pF1KA0868 3993
>gi568815591f:146016877_148515613 (Chr7)

207-402  (822833-823028)   100% ->
403-550  (1027031-1027178)   100% ->
551-754  (1091271-1091474)   99% ->
755-939  (1104103-1104287)   99% ->
940-1083  (1111817-1111960)   100% ->
1084-1350  (1115369-1115635)   100% ==
1497-1670  (1378731-1378904)   99% ==
1894-2098  (1622226-1622430)   100% ->
2099-2256  (1886689-1886846)   100% ==
2384-2554  (2101242-2101412)   100% ->
2555-2773  (2130615-2130833)   100% ->
2774-3010  (2155366-2155602)   100% ->
3011-3247  (2200412-2200648)   100% ->
3248-3381  (2212770-2212903)   100% ->
3382-3475  (2250157-2250250)   100% ->
3476-3715  (2366773-2367012)   100% ->
3716-3796  (2392515-2392595)   100% ->
3797-3993  (2398541-2398737)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    207 AGGTGCTGGGGGATGGTCTCCATCAGACAGCGACCATTATCAATGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 822833 AGGTGCTGGGGGATGGTCTCCATCAGACAGCGACCATTATCAATGGCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    257 AGGTTGACTTTGGCAATCGGAAGCAGATCAGTGCCATTGCAACCCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 822883 AGGTTGACTTTGGCAATCGGAAGCAGATCAGTGCCATTGCAACCCAAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    307 AGGTATAGCAGCTCAGATTGGGTGACCCAATACCGGATGCTCTACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 822933 AGGTATAGCAGCTCAGATTGGGTGACCCAATACCGGATGCTCTACAGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    357 CACAGGGAGAAACTGGAAACCCTATCATCAAGATGGGAATATCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 822983 CACAGGGAGAAACTGGAAACCCTATCATCAAGATGGGAATATCTGGGTA.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    403      GCATTTCCCGGAAACATTAACTCTGACGGTGTGGTCCGGCACGAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 823033 ..CAGGCATTTCCCGGAAACATTAACTCTGACGGTGTGGTCCGGCACGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    448 TTACAGCATCCGATTATTGCCCGCTATGTGCGCATAGTGCCTCTGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1027076 TTACAGCATCCGATTATTGCCCGCTATGTGCGCATAGTGCCTCTGGATTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    498 GAATGGAGAAGGTCGCATTGGACTCAGAATTGAAGTTTATGGCTGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1027126 GAATGGAGAAGGTCGCATTGGACTCAGAATTGAAGTTTATGGCTGTTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    548 ACT         GGGCTGATGTTATCAACTTTGATGGCCATGTTGTATTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1027176 ACTGTG...TAGGGGCTGATGTTATCAACTTTGATGGCCATGTTGTATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589 CCATATAGATTCAGAAACAAGAAGATGAAAACACTGAAAGATGTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1091309 CCATATAGATTCAGAAACAAGAAGATGAAAACACTGAAAGATGTCATTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    639 CTTGAACTTTAAGACGTCTGAAAGTGAAGGAGTAATCCTGCACGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1091359 CTTGAACTTTAAGACGTCTGAAAGTGAAGGAGTAATCCTGCACGGAGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    689 GACAGCAAGGAGATTACATTACCTTGGAACTGAAAAAAGCCAAGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1091409 GACAGCAAGGAGATTACATTACCTTGGAACTGAAAAAAGCCAAGCTGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    739 CTCAGTTTGAACTTAG         GAAGCAACCAGCTTGGCCCCATATA
        |||||||| |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
1091459 CTCAGTTTAAACTTAGGTG...CAGGAAGCAACCAGCTTGGCCCCATATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    780 TGGCCACACATCAGTGATGACAGGAAGTTTGCTGGATGACCACCACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1104128 TGGCCACACATCAGTGATGACAGGAAGTTTGCTGGATGACCACCACTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    830 ATTCTGTGGTCATTGAGCGCCAGGGGCGGAGCATTAACCTCACTCTGGAC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1104178 ACTCTGTGGTCATTGAGCGCCAGGGGCGGAGCATTAACCTCACTCTGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    880 AGGAGCATGCAGCACTTCCGTACCAATGGAGAGTTTGACTACCTGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1104228 AGGAGCATGCAGCACTTCCGTACCAATGGAGAGTTTGACTACCTGGACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    930 GGACTATGAG         ATAACCTTTGGAGGCATCCCTTTCTCTGGCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
1104278 GGACTATGAGGTA...AAGATAACCTTTGGAGGCATCCCTTTCTCTGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    971 AGCCCAGCTCCAGCAGTAGAAAGAATTTCAAAGGCTGCATGGAAAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1111848 AGCCCAGCTCCAGCAGTAGAAAGAATTTCAAAGGCTGCATGGAAAGCATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1021 AACTACAATGGCGTCAACATTACTGATCTTGCCAGAAGGAAGAAATTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1111898 AACTACAATGGCGTCAACATTACTGATCTTGCCAGAAGGAAGAAATTAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1071 GCCCTCAAATGTG         GGAAATTTGAGCTTTTCTTGTGTGGAAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
1111948 GCCCTCAAATGTGGTA...CAGGGAAATTTGAGCTTTTCTTGTGTGGAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1112 CCTATACGGTGCCTGTCTTTTTCAACGCTACAAGTTACCTGGAGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1115397 CCTATACGGTGCCTGTCTTTTTCAACGCTACAAGTTACCTGGAGGTGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1162 GGACGGCTTAACCAGGACCTGTTCTCAGTCAGTTTCCAGTTTAGGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1115447 GGACGGCTTAACCAGGACCTGTTCTCAGTCAGTTTCCAGTTTAGGACATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1212 GAACCCCAATGGTCTCCTGGTCTTCAGTCACTTTGCGGATAATTTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1115497 GAACCCCAATGGTCTCCTGGTCTTCAGTCACTTTGCGGATAATTTGGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1262 ATGTGGAGATTGACCTCACTGAAAGCAAAGTGGGTGTTCACATCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1115547 ATGTGGAGATTGACCTCACTGAAAGCAAAGTGGGTGTTCACATCAACATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1312 ACACAGACCAAGATGAGCCAAATCGATATTTCCTCAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1115597 ACACAGACCAAGATGAGCCAAATCGATATTTCCTCAGGT

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 AGGTTTTCTGAACCAGATGAATAACTCAAGTCACTCTGTCCTTCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1378731 AGGTTTTCTGAACCAGATGAATAACTCAAGTCACTCTGTCCTTCAGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CATTCCAAGGATGCATGCAGCTCATTCAAGTGGACGATCAACTTGTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1378781 CATTCCAAGGATGCATGCAGCTCATTCAAGTGGACGATCAACTTGTAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 TTATACGAAGTGGCACAAAGGAAGCCGGGAAGTTTCGCGAATGTCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1378831 TTATACGAAGTGGCACAAAGGAAGCCGGGAAGTTTCGCGAATGTCAGCAT

    150     .    :    .    :
   1647 TGACATGTGTGCAATCATAGACAG
        |||||||||||| |||||||||||
1378881 TGACATGTGTGCGATCATAGACAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1894 ACAGAGGACAAAGTGTGGACCATAGTGTCTCATGACTTGCAGATGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1622226 ACAGAGGACAAAGTGTGGACCATAGTGTCTCATGACTTGCAGATGCAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1944 GCCTGTGGTCGGCTACAACCCAGAAAAATACTCAGTGACACAGCTCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1622276 GCCTGTGGTCGGCTACAACCCAGAAAAATACTCAGTGACACAGCTCGTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1994 ACAGCGCCTCCATGGACCAGATAAGTGCCATCACTGACAGTGCCGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1622326 ACAGCGCCTCCATGGACCAGATAAGTGCCATCACTGACAGTGCCGAGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2044 TGCGAGCAGTATGTCTCCTATTTCTGCAAGATGTCAAGATTGTTGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1622376 TGCGAGCAGTATGTCTCCTATTTCTGCAAGATGTCAAGATTGTTGAACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2094 CCCAG         ATGGAAGCCCTTACACTTGGTGGGTTGGCAAAGCCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1622426 CCCAGGTA...TAGATGGAAGCCCTTACACTTGGTGGGTTGGCAAAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2135 ACGAGAAGCACTACTACTGGGGAGGCTCTGGGCCTGGAATCCAGAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1886725 ACGAGAAGCACTACTACTGGGGAGGCTCTGGGCCTGGAATCCAGAAATGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2185 GCCTGCGGCATCGAACGCAACTGCACAGATCCCAAGTACTACTGTAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1886775 GCCTGCGGCATCGAACGCAACTGCACAGATCCCAAGTACTACTGTAACTG

    350     .    :    .    :
   2235 CGACGCGGACTACAAGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||
1886825 CGACGCGGACTACAAGCAATGG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 GGAATTATTGGAATGCCGCCTCTTTCCCAAACCCATCCTCCTACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101242 GGAATTATTGGAATGCCGCCTCTTTCCCAAACCCATCCTCCTACCTGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 TTCTCTACTTTCCAAGGGGAAACTAGCGCTGACATTTCTTTCTACTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101292 TTCTCTACTTTCCAAGGGGAAACTAGCGCTGACATTTCTTTCTACTTCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 AACATTAACCCCCTGGGGAGTGTTTCTTGAAAATATGGGAAAGGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2101342 AACATTAACCCCCTGGGGAGTGTTTCTTGAAAATATGGGAAAGGAAGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TCATCAAGCTGGAGCTGAAGT         CTGCCACAGAAGTGTCCTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
2101392 TCATCAAGCTGGAGCTGAAGTGTG...CAGCTGCCACAGAAGTGTCCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 TCATTTGATGTGGGAAATGGGCCAGTAGAGATTGTAGTGAGGTCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2130635 TCATTTGATGTGGGAAATGGGCCAGTAGAGATTGTAGTGAGGTCACCAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 CCCTCTCAACGATGACCAGTGGCACCGGGTCACTGCAGAGAGGAATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2130685 CCCTCTCAACGATGACCAGTGGCACCGGGTCACTGCAGAGAGGAATGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 AGCAGGCCAGCCTACAGGTGGACCGGCTACCGCAGCAGATCCGCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2130735 AGCAGGCCAGCCTACAGGTGGACCGGCTACCGCAGCAGATCCGCAAGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 CCAACAGAAGGCCACACCCGCCTGGAGCTCTACAGCCAGTTATTTGTGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
2130785 CCAACAGAAGGCCACACCCGCCTGGAGCTCTACAGCCAGTTATTTGTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2774         GTGGTGCTGGGGGCCAGCAGGGCTTCCTGGGCTGCATCCGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2130835 TA...CAGGTGGTGCTGGGGGCCAGCAGGGCTTCCTGGGCTGCATCCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 CCTTGAGGATGAATGGGGTGACACTTGACCTGGAGGAAAGAGCAAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2155408 CCTTGAGGATGAATGGGGTGACACTTGACCTGGAGGAAAGAGCAAAGGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 ACATCTGGGTTCATATCCGGATGCTCGGGCCATTGCACCAGCTATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2155458 ACATCTGGGTTCATATCCGGATGCTCGGGCCATTGCACCAGCTATGGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 AAACTGTGAAAATGGAGGCAAATGCCTAGAGAGATACCACGGTTACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2155508 AAACTGTGAAAATGGAGGCAAATGCCTAGAGAGATACCACGGTTACTCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2966 GCGATTGCTCTAATACTGCATATGATGGAACATTTTGCAACAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
2155558 GCGATTGCTCTAATACTGCATATGATGGAACATTTTGCAACAAAGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3011     ATGTTGGTGCATTTTTTGAAGAAGGGATGTGGCTACGATATAACTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2155608 .CAGATGTTGGTGCATTTTTTGAAGAAGGGATGTGGCTACGATATAACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 TCAGGCACCAGCAACAAATGCCAGAGACTCCAGCAGCAGAGTAGACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2200458 TCAGGCACCAGCAACAAATGCCAGAGACTCCAGCAGCAGAGTAGACAACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3107 CTCCCGACCAGCAGAACTCCCACCCGGACCTGGCACAGGAGGAGATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2200508 CTCCCGACCAGCAGAACTCCCACCCGGACCTGGCACAGGAGGAGATCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3157 TTCAGCTTCAGCACCACCAAGGCGCCCTGCATTCTCCTCTACATCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2200558 TTCAGCTTCAGCACCACCAAGGCGCCCTGCATTCTCCTCTACATCAGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3207 CTTCACCACAGACTTCTTGGCAGTCCTCGTCAAACCCACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
2200608 CTTCACCACAGACTTCTTGGCAGTCCTCGTCAAACCCACTGGTA...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 GAAGCTTACAGATTCGATACAACCTGGGTGGCACCCGAGAGCCATACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2212770 GAAGCTTACAGATTCGATACAACCTGGGTGGCACCCGAGAGCCATACAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3298 ATTGACGTAGACCACAGGAACATGGCCAATGGACAGCCCCACAGTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2212820 ATTGACGTAGACCACAGGAACATGGCCAATGGACAGCCCCACAGTGTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3348 CATCACCCGCCACGAGAAGACCATCTTTCTCAAG         CTCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
2212870 CATCACCCGCCACGAGAAGACCATCTTTCTCAAGGTA...CAGCTCGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 ATTATCCTTCTGTGAGTTACCATCTGCCAAGTTCATCCGACACCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2250164 ATTATCCTTCTGTGAGTTACCATCTGCCAAGTTCATCCGACACCCTCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 AATTCTCCCAAGTCGCTCTTTCTGGGAAAAGTTATAG         AAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
2250214 AATTCTCCCAAGTCGCTCTTTCTGGGAAAAGTTATAGGTA...TAGAAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3480 AGGGAAAATTGACCAAGAGATTCACAAATACAACACCCCAGGATTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2366777 AGGGAAAATTGACCAAGAGATTCACAAATACAACACCCCAGGATTCACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3530 GTTGCCTCTCCAGAGTCCAGTTCAACCAGATCGCCCCTCTCAAGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2366827 GTTGCCTCTCCAGAGTCCAGTTCAACCAGATCGCCCCTCTCAAGGCCGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3580 TTGAGGCAGACAAACGCCTCGGCTCACGTCCACATCCAGGGCGAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2366877 TTGAGGCAGACAAACGCCTCGGCTCACGTCCACATCCAGGGCGAGCTGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3630 GGAGTCCAACTGCGGGGCCTCGCCGCTGACCCTCTCCCCCATGTCGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2366927 GGAGTCCAACTGCGGGGCCTCGCCGCTGACCCTCTCCCCCATGTCGTCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3680 CCACCGACCCCTGGCACCTGGATCACCTGGATTCAG         CCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
2366977 CCACCGACCCCTGGCACCTGGATCACCTGGATTCAGGTA...CAGCCAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3721 GCGGATTTTCCATATAATCCAGGACAAGGCCAAGCTATAAGAAATGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2392520 GCGGATTTTCCATATAATCCAGGACAAGGCCAAGCTATAAGAAATGGAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3771 CAACAGAAACTCGGCTATCATTGGAG         GCGTCATTGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
2392570 CAACAGAAACTCGGCTATCATTGGAGGTA...CAGGCGTCATTGCTGTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3812 TGATTTTCACCATCCTGTGCACCCTGGTCTTCCTGATCCGGTACATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2398556 TGATTTTCACCATCCTGTGCACCCTGGTCTTCCTGATCCGGTACATGTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3862 CGCCACAAGGGCACCTACCATACCAACGAAGCAAAGGGGGCGGAGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2398606 CGCCACAAGGGCACCTACCATACCAACGAAGCAAAGGGGGCGGAGTCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3912 AGAGAGCGCGGACGCCGCCATCATGAACAACGACCCCAACTTCACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2398656 AGAGAGCGCGGACGCCGCCATCATGAACAACGACCCCAACTTCACAGAGA

   1650     .    :    .    :    .    :
   3962 CCATTGATGAAAGCAAAAAGGAATGGCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
2398706 CCATTGATGAAAGCAAAAAGGAATGGCTCATT