seq1 = pF1KA0852.tfa, 2910 bp
seq2 = pF1KA0852/gi568815576r_30826806.tfa (gi568815576r:30826806_31050416), 223611 bp

>pF1KA0852 2910
>gi568815576r:30826806_31050416 (Chr22)

(complement)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-131  (100575-100665)   100% ->
132-240  (103968-104076)   99% ->
241-400  (108146-108305)   100% ->
401-512  (108415-108526)   100% ->
513-638  (108859-108984)   100% ->
639-718  (109580-109659)   100% ->
719-801  (110376-110458)   100% ->
802-887  (110711-110796)   100% ->
888-1028  (112212-112352)   100% ->
1029-1183  (112448-112602)   100% ->
1184-1312  (112706-112834)   99% ->
1313-1418  (113380-113485)   100% ->
1419-1551  (113774-113906)   100% ->
1552-1626  (115095-115169)   100% ->
1627-2007  (115256-115636)   100% ->
2008-2139  (116226-116357)   100% ->
2140-2194  (116897-116951)   100% ->
2195-2336  (117387-117528)   100% ->
2337-2561  (117648-117872)   100% ->
2562-2655  (117965-118058)   100% ->
2656-2844  (122210-122398)   100% ->
2845-2910  (123546-123611)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTTGCTTTTTGGATGATGGAGCAGGAATGGATCCAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGCTTTGCTTTTTGGATGATGGAGCAGGAATGGATCCAAGTA...CAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGATGCTGCCAGTGTGATCCAGTTTGGGAAGTCGGCCAAGCGAACACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100576 TGATGCTGCCAGTGTGATCCAGTTTGGGAAGTCGGCCAAGCGAACACCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTCTACTCAGATTGGGCAGTACGGGAATGGGTTAAAATC         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100626 AGTCTACTCAGATTGGGCAGTACGGGAATGGGTTAAAATCGTA...CAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GGCTCAATGCGCATTGGGAAGGATTTTATCCTGTTCACCAAGAAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103969 GGCTCAATGCGCATTGGGAAGGATTTTATCCTGTTCACCAAGAAGGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACCATGACGTGCCTCTTCCTGTCTCGCACGTTTCATGAGGAAGAAGGCA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104019 CACCATGACCTGCCTCTTCCTGTCTCGCACGTTTCATGAGGAAGAAGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGATGAA         GTGATAGTCCCACTGCCCACCTGGAATGCTCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104069 TTGATGAAGTA...CAGGTGATAGTCCCACTGCCCACCTGGAATGCTCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACCCGGGAACCTGTCACAGACAATGTAGAGAAATTTGCCATTGAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108179 ACCCGGGAACCTGTCACAGACAATGTAGAGAAATTTGCCATTGAGACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACTCATCTATAAGTACTCTCCATTCCGCACTGAGGAGGAAGTGATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108229 ACTCATCTATAAGTACTCTCCATTCCGCACTGAGGAGGAAGTGATGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTTTATGAAGATTCCTGGGGACAGCG         GAACATTGGTGATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108279 AGTTTATGAAGATTCCTGGGGACAGCGGTA...CAGGAACATTGGTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCTTCAATCTCAAACTCATGGATAATGGAGAGCCAGAACTAGACATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108429 ATCTTCAATCTCAAACTCATGGATAATGGAGAGCCAGAACTAGACATAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCAAATCCAAGAGATATCCAGATGGCAGAGACGTCCCCAGAGGGCAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108479 CTCAAATCCAAGAGATATCCAGATGGCAGAGACGTCCCCAGAGGGCACGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    513        GAAGCCAGAGCGGCGCTCGTTCCGTGCCTATGCCGCTGTGCTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108529 G...CAGGAAGCCAGAGCGGCGCTCGTTCCGTGCCTATGCCGCTGTGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TATATTGATCCCCGGATGAGGATCTTCATCCATGGGCACAAGGTGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108902 TATATTGATCCCCGGATGAGGATCTTCATCCATGGGCACAAGGTGCAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAAGAGGCTCTCCTGCTGCCTGTACAAGCCCAG         GATGTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108952 CAAGAGGCTCTCCTGCTGCCTGTACAAGCCCAGGTA...CAGGATGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTACACGTCAAGCCGTTTCAAGACCCGTGCGGAGCAGGAGGTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 AGTACACGTCAAGCCGTTTCAAGACCCGTGCGGAGCAGGAGGTGAAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCAGAGCACGTAGCAAGGATTG         CTGAAGAGAAGGCGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109638 GCAGAGCACGTAGCAAGGATTGGTA...CAGCTGAAGAGAAGGCGCGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGCAGAGAGCAAAGCTCGGACATTAGAAGTACGCCTAGGTGGAGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110395 GGCAGAGAGCAAAGCTCGGACATTAGAAGTACGCCTAGGTGGAGACCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CGCGGGACTCCAGG         GTGATGTTGCGACAGGTCCAGAACAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110445 CGCGGGACTCCAGGGTA...CAGGTGATGTTGCGACAGGTCCAGAACAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCCATCACTCTGCGCAGAGAAGCCGATGTCAAGAAGAGGATCAAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110738 GCCATCACTCTGCGCAGAGAAGCCGATGTCAAGAAGAGGATCAAGGAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAAGCAGCG         AGCACTTAAAGAACCTAAGGAACTGAATTTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110788 CAAGCAGCGGTG...TAGAGCACTTAAAGAACCTAAGGAACTGAATTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTTTTGGTGTCAACATTGAACACCGGGATCTGGATGGCATGTTCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112244 TTTTTGGTGTCAACATTGAACACCGGGATCTGGATGGCATGTTCATCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AACTGTAGCCGACTGATCAAAATGTATGAGAAAGTGGGCCCACAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112294 AACTGTAGCCGACTGATCAAAATGTATGAGAAAGTGGGCCCACAGCTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGGGGGCAT         GGCATGTGGCGGGGTTGTTGGGGTTGTTGATG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112344 AGGGGGCATGTG...TAGGGCATGTGGCGGGGTTGTTGGGGTTGTTGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGCCCTACCTGGTCCTGGAGCCTACACACAACAAACAGGACTTTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112480 TGCCCTACCTGGTCCTGGAGCCTACACACAACAAACAGGACTTTGCTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCAAGGAGTACCGGCACCTGCTCCGAGCAATGGGGGAGCACCTGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112530 GCCAAGGAGTACCGGCACCTGCTCCGAGCAATGGGGGAGCACCTGGCGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GTATTGGAAGGATATTGCCATCG         CCCAGAGGGGAATCATCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112580 GTATTGGAAGGATATTGCCATCGGTA...CAGCCCAGAGGGGAATCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AGTTCTGGGATGAGTTTGGCTACCTCTCTGCCAACTGGAACCAGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 112724 AGTTCTGGGATGAGTTTGGCTACCTCTCTGCCAACTGGAACCAGCCCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCCAGTGAGCTGCGTTACAAACGCCGGAGAGCTATGGAAATCCCCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112774 TCCAGTGAGCTGCGTTACAAACGCCGGAGAGCTATGGAAATCCCCACCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CATCCAGTGCG         ATTTGTGTCTGAAATGGAGAACCCTCCCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 112824 CATCCAGTGCGGTG...CAGATTTGTGTCTGAAATGGAGAACCCTCCCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCCAGCTGAGTTCTGTGGAAAAAGATTACCCTGACACCTGGGTTTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113410 TCCAGCTGAGTTCTGTGGAAAAAGATTACCCTGACACCTGGGTTTGCTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATGAACCCTGATCCTGAACAGGACCG         GTGTGAGGCTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 113460 ATGAACCCTGATCCTGAACAGGACCGGTG...CAGGTGTGAGGCTTCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 ACAAAAGCAGAAGGTTCCCCTGGGAACATTCAGAAAGGACATGAAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113789 ACAAAAGCAGAAGGTTCCCCTGGGAACATTCAGAAAGGACATGAAGACGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AGGAAGAGAAGCAGAAACAACTGACAGAGAAAATTCGCCAGCAGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113839 AGGAAGAGAAGCAGAAACAACTGACAGAGAAAATTCGCCAGCAGCAGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAGCTGGAGGCCCTTCAG         AAAACCACACCCATCCGCTCCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113889 AAGCTGGAGGCCCTTCAGGTA...CAGAAAACCACACCCATCCGCTCCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 AGCAGACCTGAAGAAATTGCCCTTGGAAGTGACCACCAGACCTTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115118 AGCAGACCTGAAGAAATTGCCCTTGGAAGTGACCACCAGACCTTCCACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AG         GAACCTGTGCGTAGACCTCAGCGTCCTCGGTCGCCCCCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115168 AGGTG...TAGGAACCTGTGCGTAGACCTCAGCGTCCTCGGTCGCCCCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TTACCTGCTGTGATCAGGAACGCCCCCAGCAGACCCCCTTCTTTGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115295 TTACCTGCTGTGATCAGGAACGCCCCCAGCAGACCCCCTTCTTTGCCAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TCCTAGACCAGCCAGCCAGCCCCGAAAGGCTCCTGTCATCAGCAGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115345 TCCTAGACCAGCCAGCCAGCCCCGAAAGGCTCCTGTCATCAGCAGTACCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CAAAGCTCCCTGCTTTGGCAGCCCGGGAGGAGGCCAGCACATCTAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115395 CAAAGCTCCCTGCTTTGGCAGCCCGGGAGGAGGCCAGCACATCTAGGCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTCCAGCCACCTGAGGCACCCCGAAAGCCTGCCAACACTCTCGTCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115445 CTCCAGCCACCTGAGGCACCCCGAAAGCCTGCCAACACTCTCGTCAAGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGCATCCCGACCTGCCCCTCTGGTGCAGCAACTGTCACCATCTTTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115495 TGCATCCCGACCTGCCCCTCTGGTGCAGCAACTGTCACCATCTTTACTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CCAACTCCAAGAGCCCTCGGGAGGTTCCTTCTCCCAAAGTCATCAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115545 CCAACTCCAAGAGCCCTCGGGAGGTTCCTTCTCCCAAAGTCATCAAGACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CCAGTGGTGAAGAAGACAGAGTCACCCATCAAACTCTCCCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 115595 CCAGTGGTGAAGAAGACAGAGTCACCCATCAAACTCTCCCCGGTG...TA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2008  GCTACCCCTAGTCGGAAGCGGAGTGTCGCAGTTTCTGATGAGGAAGAAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116225 GGCTACCCCTAGTCGGAAGCGGAGTGTCGCAGTTTCTGATGAGGAAGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TTGAGGAGGAAGCTGAGAGGAGGAAGGAGAGGTGCAAGCGGGGCAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116275 TTGAGGAGGAAGCTGAGAGGAGGAAGGAGAGGTGCAAGCGGGGCAGATTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GTTGTGAAGGAGGAAAAGAAGGACTCGAATGAG         CTCTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116325 GTTGTGAAGGAGGAAAAGAAGGACTCGAATGAGGTG...CAGCTCTCAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CAGTGCTGGGGAAGAGGACTCGGCTGACCTCAAGAGAGCTCAGAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116905 CAGTGCTGGGGAAGAGGACTCGGCTGACCTCAAGAGAGCTCAGAAAGGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2195       ATAAAGGGCTGCACGTGGAGGTGCGTGTGAACAGGGAGTGGTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116955 ...CAGATAAAGGGCTGCACGTGGAGGTGCGTGTGAACAGGGAGTGGTAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 ACGGGCCGTGTCACAGCCGTGGAGGTGGGCAAGCATGTGGTGCGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117431 ACGGGCCGTGTCACAGCCGTGGAGGTGGGCAAGCATGTGGTGCGGTGGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGTGAAGTTTGACTACGTGCCCACAGACACGACACCAAGAGACCGCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 117481 GGTGAAGTTTGACTACGTGCCCACAGACACGACACCAAGAGACCGCTGGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2337        GGTGGAGAAAGGCAGTGAGGATGTGCGGCTGATGAAACCCCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117531 A...CAGGGTGGAGAAAGGCAGTGAGGATGTGCGGCTGATGAAACCCCCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 TCTCCGGAACATCAGAGCCTTGATACACAACAGGAGGGCGGGGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117691 TCTCCGGAACATCAGAGCCTTGATACACAACAGGAGGGCGGGGAGGAGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GGTGGGCCCTGTGGCCCAGCAGGCCATAGCTGTCGCAGAGCCCTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117741 GGTGGGCCCTGTGGCCCAGCAGGCCATAGCTGTCGCAGAGCCCTCCACTT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 CCGAATGCCTCCGCATTGAGCCTGACACCACTGCCCTGAGCACCAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117791 CCGAATGCCTCCGCATTGAGCCTGACACCACTGCCCTGAGCACCAATCAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GAGACCATCGACCTGCTTGTCCAGATCCTCCG         GAATTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 117841 GAGACCATCGACCTGCTTGTCCAGATCCTCCGGTA...TAGGAATTGTTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 ACGGTACTTCCTGCCTCCAAGTTTCCCCATCTCCAAGAAGCAGCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117974 ACGGTACTTCCTGCCTCCAAGTTTCCCCATCTCCAAGAAGCAGCTGAGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CTATGAATTCAGATGAGCTAATATCTTTTCCTCTG         AAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 118024 CTATGAATTCAGATGAGCTAATATCTTTTCCTCTGGTG...CAGAAGGAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 TACTTCAAGCAATATGAAGTAGGGCTCCAAAACCTGTGCAATTCCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122216 TACTTCAAGCAATATGAAGTAGGGCTCCAAAACCTGTGCAATTCCTACCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 GAGCCGTGCTGACTCCCGGGCCAAGGCCTCCGAGGAAAGCCTGCGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122266 GAGCCGTGCTGACTCCCGGGCCAAGGCCTCCGAGGAAAGCCTGCGCACCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 CCGAGAGGAAGCTCCGCGAGACGGAGGAGAAGCTGCAGAAGCTGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122316 CCGAGAGGAAGCTCCGCGAGACGGAGGAGAAGCTGCAGAAGCTGAGGACC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 AACATCGTGGCACTCCTGCAAAAGGTGCAGGAG         GACATAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122366 AACATCGTGGCACTCCTGCAAAAGGTGCAGGAGGTG...CAGGACATAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 CATCAACACAGATGATGAGCTGGACGCCTACATTGAGGACCTCATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123554 CATCAACACAGATGATGAGCTGGACGCCTACATTGAGGACCTCATCACCA

   3100     .
   2903 AGGGGGAC
        ||||||||
 123604 AGGGGGAC