seq1 = pF1KA0837.tfa, 2166 bp
seq2 = pF1KA0837/gi568815593r_131854237.tfa (gi568815593r:131854237_132111553), 257317 bp

>pF1KA0837 2166
>gi568815593r:131854237_132111553 (Chr5)

(complement)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-270  (117303-117523)   100% ->
271-385  (120587-120701)   100% ->
386-450  (121390-121454)   100% ->
451-552  (122046-122147)   100% ->
553-652  (122650-122749)   100% ->
653-831  (123328-123506)   100% ->
832-864  (124700-124732)   100% ->
865-916  (126096-126147)   100% ->
917-990  (134833-134906)   100% ->
991-1068  (136584-136661)   100% ->
1069-1203  (138154-138288)   100% ->
1204-1338  (138696-138830)   100% ->
1339-1434  (139909-140004)   100% ->
1435-1507  (141354-141426)   100% ->
1508-1596  (143526-143614)   100% ->
1597-1713  (145022-145138)   100% ->
1714-1857  (148876-149019)   100% ->
1858-1959  (150933-151034)   100% ->
1960-2031  (151947-152018)   100% ->
2032-2166  (157183-157317)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGACCTTCTTCCTCGTGTCGGGGGGCTCCCTCTGGCTATTCGTAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGCTGACCTTCTTCCTCGTGTCGGGGGGCTCCCTCTGGCTATTCGTAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         AGTTTGTCCTCTCACTTCTGGAGAAGATGCAGACACAGGAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGAGTTTGTCCTCTCACTTCTGGAGAAGATGCAGACACAGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCTGAGGATACTGCGACTGCCTGAGCTAGGTGACTTGGGACAGTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117345 TCCTGAGGATACTGCGACTGCCTGAGCTAGGTGACTTGGGACAGTTTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCAGCCTCTCGGCCACCACCCTCGTGAGTATGGGTGCCCTGGCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117395 CGCAGCCTCTCGGCCACCACCCTCGTGAGTATGGGTGCCCTGGCTGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTTGCCTACTGGTTCACTCACCGGCCAAAGGCCTTGCAGCCGCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117445 CCTTGCCTACTGGTTCACTCACCGGCCAAAGGCCTTGCAGCCGCCATGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCTCCTGATGCAGTCAGAAGAAGTAGAG         GACAGTGGCGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117495 ACCTCCTGATGCAGTCAGAAGAAGTAGAGGTG...TAGGACAGTGGCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCACGGCGATCTGTGATTGGGTCTGGCCCTCAGCTACTTACCCACTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120599 GCACGGCGATCTGTGATTGGGTCTGGCCCTCAGCTACTTACCCACTACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATGATGCCCGGACCATGTACCAGGTGTTCCGCCGTGGGCTTAGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120649 TGATGATGCCCGGACCATGTACCAGGTGTTCCGCCGTGGGCTTAGCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAG         GGAATGGGCCCTGTCTTGGTTTCAGGAAGCCTAAGCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120699 CAGGTG...CAGGGAATGGGCCCTGTCTTGGTTTCAGGAAGCCTAAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTTACCAGTGGCTGTCCTACCAGGAG         GTGGCCGACAGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 121428 CCTTACCAGTGGCTGTCCTACCAGGAGGTG...CAGGTGGCCGACAGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAATTTCTGGGGTCCGGACTTCTCCAGCACAATTGTAAAGCATGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122060 TGAATTTCTGGGGTCCGGACTTCTCCAGCACAATTGTAAAGCATGCACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCAGTTTATTGGTGTTTTTGCACAAAATCGGCCAGAG         TGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 122110 ATCAGTTTATTGGTGTTTTTGCACAAAATCGGCCAGAGGTG...CAGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATCATTGTGGAGCTGGCCTGCTACACATATTCCATGGTGGTGGTCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122653 ATCATTGTGGAGCTGGCCTGCTACACATATTCCATGGTGGTGGTCCCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTATGACACCCTGGGCCCTGGGGCTATCCGCTACATCATCAATACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 122703 CTATGACACCCTGGGCCCTGGGGCTATCCGCTACATCATCAATACAGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653       CGGACATCAGCACCGTGATTGTGGACAAACCTCAGAAGGCTGTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122753 ...CAGCGGACATCAGCACCGTGATTGTGGACAAACCTCAGAAGGCTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTTCTGCTAGAGCATGTGGAGAGGAAGGAGACTCCAGGCCTCAAGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123372 CTTCTGCTAGAGCATGTGGAGAGGAAGGAGACTCCAGGCCTCAAGCTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATCCTCATGGACCCATTCGAAGAAGCCCTGAAAGAGAGAGGGCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123422 CATCCTCATGGACCCATTCGAAGAAGCCCTGAAAGAGAGAGGGCAGAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCGGGGTGGTCATTAAGTCCATGCAGGCCGTGGAG         GACTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123472 GCGGGGTGGTCATTAAGTCCATGCAGGCCGTGGAGGTG...CAGGACTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGCCAAGAGAATCACCAGGCTCCTGTG         CCCCCGCAGCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 124706 GGCCAAGAGAATCACCAGGCTCCTGTGGTA...CAGCCCCCGCAGCCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGACCTCTCCATTGTGTGTTTCACAAGCGGCACGACAG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 126110 TGACCTCTCCATTGTGTGTTTCACAAGCGGCACGACAGGTA...TAGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACCCAAAAGGTGCGATGCTCACCCATGGGAACGTGGTGGCTGATTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134836 ACCCAAAAGGTGCGATGCTCACCCATGGGAACGTGGTGGCTGATTTCTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGCTTTCTGAAAGTGACAGAG         AAAGTGATCTTTCCGAGACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 134886 GGCTTTCTGAAAGTGACAGAGGTG...CAGAAAGTGATCTTTCCGAGACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GGACGATGTGCTCATCTCCTTCCTGCCTCTGGCTCACATGTTTGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136604 GGACGATGTGCTCATCTCCTTCCTGCCTCTGGCTCACATGTTTGAGAGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TAATCCAG         TCTGTCGTCTATTGCCACGGAGGGCGTGTTGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 136654 TAATCCAGGTA...TAGTCTGTCGTCTATTGCCACGGAGGGCGTGTTGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TTCTTCCAGGGAGATATCCGCCTTCTCTCAGATGACATGAAGGCTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138187 TTCTTCCAGGGAGATATCCGCCTTCTCTCAGATGACATGAAGGCTCTATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CCCCACCATCTTCCCTGTGGTCCCACGACTGCTGAACCGGATGTACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138237 CCCCACCATCTTCCCTGTGGTCCCACGACTGCTGAACCGGATGTACGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 AG         ATCTTCAGCCAGGCAAACACACCATTAAAGCGCTGGCTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138287 AGGTA...CAGATCTTCAGCCAGGCAAACACACCATTAAAGCGCTGGCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTGGAGTTTGCAGCAAAGCGTAAGCAAGCCGAGGTCCGGAGTGGAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138735 CTGGAGTTTGCAGCAAAGCGTAAGCAAGCCGAGGTCCGGAGTGGAATCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CAGGAATGATAGTATCTGGGATGAACTCTTCTTTAATAAGATTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 138785 CAGGAATGATAGTATCTGGGATGAACTCTTCTTTAATAAGATTCAGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339      GCCAGTCTTGGTGGGTGTGTGCGGATGATTGTTACTGGAGCAGCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138835 ..CAGGCCAGTCTTGGTGGGTGTGTGCGGATGATTGTTACTGGAGCAGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CCAGCATCACCAACAGTTCTGGGATTTCTCCGGGCAGCTCTAGGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139954 CCAGCATCACCAACAGTTCTGGGATTTCTCCGGGCAGCTCTAGGGTGCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 G         GTTTATGAAGGTTATGGCCAAACTGAGTGCACAGCTGGAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140004 GGTA...AAGGTTTATGAAGGTTATGGCCAAACTGAGTGCACAGCTGGAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 GTACCTTCACCACTCCTGGCGACTGGACCTCAG         GGCACGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 141394 GTACCTTCACCACTCCTGGCGACTGGACCTCAGGTA...CAGGGCACGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GGGGCGCCACTTCCCTGCAATCATATCAAGCTCGTTGATGTTGAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143534 GGGGCGCCACTTCCCTGCAATCATATCAAGCTCGTTGATGTTGAGGAACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GAACTACTGGGCCTGCAAAGGAGAGGGAGAG         ATATGTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 143584 GAACTACTGGGCCTGCAAAGGAGAGGGAGAGGTA...TAGATATGTGTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 GAGGACCAAATGTGTTCAAAGGCTACTTGAAAGATCCAGACAGGACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145032 GAGGACCAAATGTGTTCAAAGGCTACTTGAAAGATCCAGACAGGACGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GAGGCCCTGGACAGCGATGGCTGGCTTCACACTGGAGACATCGGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145082 GAGGCCCTGGACAGCGATGGCTGGCTTCACACTGGAGACATCGGAAAATG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GCTGCCG         GCAGGAACTCTTAAAATTATTGATCGGAAAAAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145132 GCTGCCGGTG...CAGGCAGGAACTCTTAAAATTATTGATCGGAAAAAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 ATATATTTAAACTTGCTCAGGGAGAATATGTTGCACCCGAGAAGATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148910 ATATATTTAAACTTGCTCAGGGAGAATATGTTGCACCCGAGAAGATTGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 AACATCTACATCCGGAGCCAACCTGTGGCGCAAATCTATGTCCATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148960 AACATCTACATCCGGAGCCAACCTGTGGCGCAAATCTATGTCCATGGGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 CAGCTTAAAG         GCCTTTTTGGTAGGCATTGTTGTGCCTGACC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 149010 CAGCTTAAAGGTG...CAGGCCTTTTTGGTAGGCATTGTTGTGCCTGACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CTGAAGTTATGCCCTCCTGGGCCCAGAAGAGAGGAATTGAAGGAACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150964 CTGAAGTTATGCCCTCCTGGGCCCAGAAGAGAGGAATTGAAGGAACATAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 GCAGATCTCTGCACAAATAAG         GATCTGAAGAAAGCCATTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 151014 GCAGATCTCTGCACAAATAAGGTT...CAGGATCTGAAGAAAGCCATTTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 GGAAGATATGGTGAGGTTAGGAAAAGAAAGTGGACTCCATTCTTTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151967 GGAAGATATGGTGAGGTTAGGAAAAGAAAGTGGACTCCATTCTTTTGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 AG         GTTAAAGCCATTCACATCCATTCTGACATGTTCTCAGTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152017 AGGTA...TAGGTTAAAGCCATTCACATCCATTCTGACATGTTCTCAGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 CAAAATGGCTTGCTGACACCAACACTAAAAGCTAAGAGACCTGAGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157222 CAAAATGGCTTGCTGACACCAACACTAAAAGCTAAGAGACCTGAGCTGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2121 AGAGTACTTCAAAAAACAAATAGAAGAGCTTTACTCAATCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157272 AGAGTACTTCAAAAAACAAATAGAAGAGCTTTACTCAATCTCCATG