seq1 = pF1KA0791.tfa, 3996 bp
seq2 = pF1KA0791/gi568815593r_37191903.tfa (gi568815593r:37191903_37464364), 272462 bp

>pF1KA0791 3996
>gi568815593r:37191903_37464364 (Chr5)

(complement)

1-118  (100001-100118)   99% ->
119-215  (100381-100477)   100% ->
216-286  (106214-106284)   100% ->
287-379  (111536-111628)   100% ->
380-546  (113009-113175)   100% ->
547-652  (114100-114205)   100% ->
653-726  (115120-115193)   100% ->
727-818  (115769-115860)   100% ->
819-916  (121719-121816)   100% ->
917-1069  (123123-123275)   100% ->
1070-1170  (126447-126547)   100% ->
1171-1341  (130732-130902)   100% ->
1342-1452  (132570-132680)   100% ->
1453-1547  (134233-134327)   100% ->
1548-1636  (135087-135175)   100% ->
1637-1699  (135945-136007)   100% ->
1700-1847  (136589-136736)   100% ->
1848-1914  (138398-138464)   100% ->
1915-2030  (140258-140373)   100% ->
2031-2128  (146280-146377)   100% ->
2129-2259  (150037-150167)   100% ->
2260-2451  (153622-153813)   100% ->
2452-2590  (155098-155236)   100% ->
2591-2726  (156933-157068)   100% ->
2727-2880  (159155-159308)   100% ->
2881-2985  (159522-159626)   100% ->
2986-3140  (160951-161105)   100% ->
3141-3270  (161457-161586)   100% ->
3271-3384  (162815-162928)   100% ->
3385-3505  (164797-164917)   100% ->
3506-3616  (165387-165497)   100% ->
3617-3753  (169900-170036)   99% ->
3754-3860  (171380-171486)   100% ->
3861-3996  (172327-172462)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGATATGGATTATCCTTTACAAGGACCTGGTTTGCTGTCCGTACC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGATATGGATTATCCTTTGCAAGGACCTGGTTTGCTGTCCGTACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCTTCCAGAGATCAGTTCCATCCGAAGAGTTCCTCTCCCACCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCTTCCAGAGATCAGTTCCATCCGAAGAGTTCCTCTCCCACCTGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGTTGAGCAGTTTGGAC         ATATGCAGTGTAATTGCATGATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 TTGTTGAGCAGTTTGGACGTA...CAGATATGCAGTGTAATTGCATGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTGTGTTCCCTCCTATCAGCAGAGCTTGGCTCACAATTGACAGTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 GGTGTGTTCCCTCCTATCAGCAGAGCTTGGCTCACAATTGACAGTGATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTCATGTGGAACTATGAGGATGG         AGGAGACCTTGCCTATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100454 ATTCATGTGGAACTATGAGGATGGGTA...CAGAGGAGACCTTGCCTATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGATGGACTTAGTGAGACTATTCTTGCTGTGGGGCTTGTGAAGCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106231 TTGATGGACTTAGTGAGACTATTCTTGCTGTGGGGCTTGTGAAGCCAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAG         GCATCTTTCAACCTCATGTGCGACACCTCCTGGTTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106281 GCAGGTA...TAGGCATCTTTCAACCTCATGTGCGACACCTCCTGGTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCGACCCCTGTAGACATAGTAATTCTTGGACTCAGCTATGCTAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111573 GGCGACCCCTGTAGACATAGTAATTCTTGGACTCAGCTATGCTAATTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAACAG         GTTCTGGAGTTCTTAATGATAGTTTGTCTGGTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111623 AAACAGGTA...TAGGTTCTGGAGTTCTTAATGATAGTTTGTCTGGTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGCAGTTGCTTCCAGATCCTTTATATTCTCTTCCTACTGATAATACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113044 ATGCAGTTGCTTCCAGATCCTTTATATTCTCTTCCTACTGATAATACTTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTTTTAACAATAACTTCCACTGATAATGGCAGAATTTTCTTGGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113094 CCTTTTAACAATAACTTCCACTGATAATGGCAGAATTTTCTTGGCTGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGATGGCTGTTTATATGAAGTAGCCTACCAG         GCTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113144 AGGATGGCTGTTTATATGAAGTAGCCTACCAGGTA...AAGGCTGAAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGTGGTTTAGCCAAAGATGTAGGAAAATAAACCACTCAAAGAGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114109 GGGTGGTTTAGCCAAAGATGTAGGAAAATAAACCACTCAAAGAGCTCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTCTTTCCTTGTTCCTTCCTTGCTACAATTCACGTTCTCAGAAGATG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114159 TTCTTTCCTTGTTCCTTCCTTGCTACAATTCACGTTCTCAGAAGATGGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653       ATCCTATTCTTCAAATTGCAATTGATAATTCTAGAAATATTTTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114209 ...TAGATCCTATTCTTCAAATTGCAATTGATAATTCTAGAAATATTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATACACGATCTGAGAAAGGAGTAATACAG         GTGTATGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115164 TATACACGATCTGAGAAAGGAGTAATACAGGTT...CAGGTGTATGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGGACAAGATGGACAAGGAATGAGCAGAGTTGCCTCTGTGTCACAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115780 GGGACAAGATGGACAAGGAATGAGCAGAGTTGCCTCTGTGTCACAGAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCATTGTCTCTGCTGCTGGTAACATTGCTAG         GACCATCGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 115830 CCATTGTCTCTGCTGCTGGTAACATTGCTAGGTA...TAGGACCATCGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CGTTCTGTTTTTAAACCAATTGTCCAAATAGCAGTGATTGAAAATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121729 CGTTCTGTTTTTAAACCAATTGTCCAAATAGCAGTGATTGAAAATTCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ATCACTGGACTGTCAGTTATTGGCTGTCACACATGCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 121779 ATCACTGGACTGTCAGTTATTGGCTGTCACACATGCAGGTA...CAGGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTAGGTTATATTTTAGCACTTGTCCATTCAGACAGCCATTAGCACGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123126 TTAGGTTATATTTTAGCACTTGTCCATTCAGACAGCCATTAGCACGGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AATACACTGACGCTGGTTCATGTCCGCTTACCTCCTGGATTCTCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123176 AATACACTGACGCTGGTTCATGTCCGCTTACCTCCTGGATTCTCAGCATC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TTCAACCGTGGAAAAGCCTTCAAAAGTACATAGAGCTCTTTATAGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123226 TTCAACCGTGGAAAAGCCTTCAAAAGTACATAGAGCTCTTTATAGTAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070          GTATTCTATTGATGGCAGCCTCAGAAAATGAGGATAATGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123276 GTA...TAGGTATTCTATTGATGGCAGCCTCAGAAAATGAGGATAATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATTTTATGGTGTGTCAACCATGATACTTTTCCTTTCCAAAAGCCAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126488 ATTTTATGGTGTGTCAACCATGATACTTTTCCTTTCCAAAAGCCAATGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGAAACCCAG         ATGACAGCTGGTGTTGATGGTCATTCCTGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 126538 GGAAACCCAGGTA...TAGATGACAGCTGGTGTTGATGGTCATTCCTGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTCTTTCTGCGATAGATGAATTGAAAGTAGATAAAATAATTACACCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130763 CTCTTTCTGCGATAGATGAATTGAAAGTAGATAAAATAATTACACCTTTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AACAAGGATCATATTCCAATAACTGATTCACCAGTTGTTGTACAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130813 AACAAGGATCATATTCCAATAACTGATTCACCAGTTGTTGTACAGCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CATGTTACCTCCGAAGAAATTTGTTCTCCTCTCAGCACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 130863 CATGTTACCTCCGAAGAAATTTGTTCTCCTCTCAGCACAGGTG...TAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GGAGCCTTATGTTTCATAAACTTAGACCTGTAGATCAACTGAGGCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132571 GGAGCCTTATGTTTCATAAACTTAGACCTGTAGATCAACTGAGGCATCTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CTTGTGAGTAATGTGGGAGGAGATGGAGAAGAGATTGAAAGATTCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132621 CTTGTGAGTAATGTGGGAGGAGATGGAGAAGAGATTGAAAGATTCTTTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 ATTACATCAG         GAAGACCAGGCTTGTGCAACTTGCCTTATTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 132671 ATTACATCAGGTA...CAGGAAGACCAGGCTTGTGCAACTTGCCTTATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TTGCTTGCTCCACTGCTGCCTGTGATAGAGAAGTATCTGCCTGGGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134264 TTGCTTGCTCCACTGCTGCCTGTGATAGAGAAGTATCTGCCTGGGCTACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CGGGCTTTCTTTAG         GTATGGTGGTGAAGCACAGATGAGATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 134314 CGGGCTTTCTTTAGGTA...TAGGTATGGTGGTGAAGCACAGATGAGATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TCCAACCACTCTTCCGCCTCCAAGTAATGTTGGTCCCATCTTGGGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135114 TCCAACCACTCTTCCGCCTCCAAGTAATGTTGGTCCCATCTTGGGGTCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CTGTCTATTCTA         GTTCTCCTGTTCCTAGTGGTAGTCCCTAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 135164 CTGTCTATTCTAGTG...TAGGTTCTCCTGTTCCTAGTGGTAGTCCCTAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 CCAAATCCATCCTTTTTGGGAACACCGTCTCATG         GTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 135974 CCAAATCCATCCTTTTTGGGAACACCGTCTCATGGTA...AAGGTATACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GCCTCCTGCCATGTCAACTCCAGTGTGTGCTCTGGGAAACCCAGCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136596 GCCTCCTGCCATGTCAACTCCAGTGTGTGCTCTGGGAAACCCAGCAACTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGGCCACAAATATGAGTTGTGTGACTGGACCAGAGATTGTGTACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136646 AGGCCACAAATATGAGTTGTGTGACTGGACCAGAGATTGTGTACTCTGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 AAACACAATGGTATTTGCATTTACTTTTCTCGGATCATGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136696 AAACACAATGGTATTTGCATTTACTTTTCTCGGATCATGGGGTA...CAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 AAACATTTGGGATGCAAGCTTAGTTGTGGAGAGAATATTCAAGAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138398 AAACATTTGGGATGCAAGCTTAGTTGTGGAGAGAATATTCAAGAGTGGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 ACAGAGAGATCACTGCA         ATTGAAAGTAGTGTTCCCTGCCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 138448 ACAGAGAGATCACTGCAGTA...CAGATTGAAAGTAGTGTTCCCTGCCAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 CTGCTAGAGTCAGTGCTACAAGAACTAAAGGGTTTGCAGGAATTTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140282 CTGCTAGAGTCAGTGCTACAAGAACTAAAGGGTTTGCAGGAATTTCTAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 CAGAAACTCCCAGTTTGCAGGAGGACCATTAGGAAATCCAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 140332 CAGAAACTCCCAGTTTGCAGGAGGACCATTAGGAAATCCAAAGTA...CA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2031  TACTACTGCTAAAGTGCAGCAGAGGCTGATAGGATTCATGCGTCCTGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146279 GTACTACTGCTAAAGTGCAGCAGAGGCTGATAGGATTCATGCGTCCTGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 AACGGAAATCCCCAGCAAATGCAACAGGAACTGCAGAGGAAGTTTCATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 146329 AACGGAAATCCCCAGCAAATGCAACAGGAACTGCAGAGGAAGTTTCATGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129         AGGCTCAACTAAGTGAAAAGATTTCACTTCAGGCAATTCAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146379 TA...TAGAGGCTCAACTAAGTGAAAAGATTTCACTTCAGGCAATTCAGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 AGTTGGTTCGAAAATCATATCAGGCTCTGGCTTTATGGAAACTTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150079 AGTTGGTTCGAAAATCATATCAGGCTCTGGCTTTATGGAAACTTCTTTGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 GAACATCAATTCACTATCATTGTGGCAGAACTTCAGAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 150129 GAACATCAATTCACTATCATTGTGGCAGAACTTCAGAAGGTA...TAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 ACTTCAAGAGCAGCTGAAGATCACCACCTTTAAAGATCTTGTAATCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153624 ACTTCAAGAGCAGCTGAAGATCACCACCTTTAAAGATCTTGTAATCAGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 ACAAAGAACTCACAGGGGCATTAATTGCTTCTCTTATCAACTGCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153674 ACAAAGAACTCACAGGGGCATTAATTGCTTCTCTTATCAACTGCTACATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 AGAGATAATGCCGCTGTTGATGGCATTAGTTTACATTTACAGGATATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153724 AGAGATAATGCCGCTGTTGATGGCATTAGTTTACATTTACAGGATATCTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 CCCACTTCTATATAGCACTGATGATGCAATTTGTTCTAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 153774 CCCACTTCTATATAGCACTGATGATGCAATTTGTTCTAAGGTA...TAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 CAAATGAGCTTCTCCAGCGTTCCCGACAAGTTCAAAATAAGACTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155099 CAAATGAGCTTCTCCAGCGTTCCCGACAAGTTCAAAATAAGACTGAAAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 GAAAGAATGTTAAGGGAATCATTAAAGGAATATCAAAAAATTAGCAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155149 GAAAGAATGTTAAGGGAATCATTAAAGGAATATCAAAAAATTAGCAATCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2553 AGTGGACCTTTCCAATGTTTGTGCTCAGTATAGACAAG         TGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 155199 AGTGGACCTTTCCAATGTTTGTGCTCAGTATAGACAAGGTG...CAGTGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 GATTTTATGAGGGTGTGGTGGAACTTTCTCTTACGGCTGCAGAGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156936 GATTTTATGAGGGTGTGGTGGAACTTTCTCTTACGGCTGCAGAGAAAAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 GATCCTCAAGGTCTTGGGCTTCATTTCTATAAACATGGAGAACCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156986 GATCCTCAAGGTCTTGGGCTTCATTTCTATAAACATGGAGAACCAGAAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2694 AGACATAGTTGGACTTCAGGCCTTCCAAGAAAG         ATTAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 157036 AGACATAGTTGGACTTCAGGCCTTCCAAGAAAGGTG...CAGATTAAACA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2735 GTTACAAATGCATTACAGACACACTTCAAGAACTGGTAAATCAAAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159163 GTTACAAATGCATTACAGACACACTTCAAGAACTGGTAAATCAAAGTAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785 GCCGCTCCTCAGTCTCCCAGTGTACCCAAAAAACCTGGTCCTCCAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159213 GCCGCTCCTCAGTCTCCCAGTGTACCCAAAAAACCTGGTCCTCCAGTGTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2835 GTCATCTGATCCAAATATGCTGAGTAATGAAGAAGCAGGACATCAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 159263 GTCATCTGATCCAAATATGCTGAGTAATGAAGAAGCAGGACATCATGTA.

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2881      TTTGAACAAATGCTTAAATTGTCACAGCGATCCAAGGATGAGCTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159313 ..TAGTTTGAACAAATGCTTAAATTGTCACAGCGATCCAAGGATGAGCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2926 TTTAGTATTGCCCTTTATAATTGGCTAATACAAGTCGACCTTGCAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159567 TTTAGTATTGCCCTTTATAATTGGCTAATACAAGTCGACCTTGCAGATAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2976 GCTGCTACAG         GTTGCTTCTCCATTTCTGGAGCCACATCTAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 159617 GCTGCTACAGGTA...TAGGTTGCTTCTCCATTTCTGGAGCCACATCTAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3017 TCCGAATGGCCAAAGTTGATCAAAACAGAGTTCGTTATATGGATTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160982 TCCGAATGGCCAAAGTTGATCAAAACAGAGTTCGTTATATGGATTTACTC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3067 TGGCGGTATTACGAGAAGAACAGAAGTTTCAGTAATGCTGCTCGTGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161032 TGGCGGTATTACGAGAAGAACAGAAGTTTCAGTAATGCTGCTCGTGTACT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3117 GTCCAGACTGGCTGACATGCATAG         CACAGAAATTTCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 161082 GTCCAGACTGGCTGACATGCATAGGTA...TAGCACAGAAATTTCACTTC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3158 AGCAGCGACTAGAGTACATTGCTCGAGCCATTCTTAGTGCCAAAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161474 AGCAGCGACTAGAGTACATTGCTCGAGCCATTCTTAGTGCCAAAAGTTCC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3208 ACTGCCATTTCATCAATAGCTGCCGATGGTGAATTTCTTCATGAATTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161524 ACTGCCATTTCATCAATAGCTGCCGATGGTGAATTTCTTCATGAATTAGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3258 AGAAAAAATGGAG         GTTGCTAGGATCCAACTTCAGATACAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 161574 AGAAAAAATGGAGGTA...TAGGTTGCTAGGATCCAACTTCAGATACAGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3299 AGACACTACAAAGGCAGTATTCCCATCATTCTTCTGTACAGGATGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162843 AGACACTACAAAGGCAGTATTCCCATCATTCTTCTGTACAGGATGCAGTT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3349 TCTCAGCTGGATTCTGAGCTGATGGACATAACTAAG         CTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 162893 TCTCAGCTGGATTCTGAGCTGATGGACATAACTAAGGTA...CAGCTTTA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3390 TGGGGAATTTGCTGACCCATTTAAACTTGCAGAGTGCAAACTTGCAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164802 TGGGGAATTTGCTGACCCATTTAAACTTGCAGAGTGCAAACTTGCAATAA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3440 TTCATTGTGCCGGTTATTCAGACCCTATATTGGTGCAGACACTTTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164852 TTCATTGTGCCGGTTATTCAGACCCTATATTGGTGCAGACACTTTGGCAA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3490 GATATCATAGAGAAAG         AATTGAGTGACAGTGTGACATTGAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 164902 GATATCATAGAGAAAGGTA...CAGAATTGAGTGACAGTGTGACATTGAG

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3531 CTCCTCGGATAGAATGCATGCTCTTAGTCTCAAGATTGTTCTCCTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165412 CTCCTCGGATAGAATGCATGCTCTTAGTCTCAAGATTGTTCTCCTTGGCA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3581 AAATTTATGCTGGCACACCACGCTTCTTTCCTTTAG         ATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 165462 AAATTTATGCTGGCACACCACGCTTCTTTCCTTTAGGTA...CAGATTTT

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3622 ATTGTACAGTTTTTAGAACAGCAGGTTTGTACTTTGAACTGGGATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169905 ATTGTACAGTTTTTAGAACAGCAGGTTTGTACTTTGAACTGGGATGTGGG

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3672 CTTCGTAATACAGACAATGAATGAAATTGGAGTACCATTGCCTAGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 169955 CTTCGTAATACAGACAATGAATGAAATTGGAGTACCATTACCTAGACTAC

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3722 TAGAAGTTTATGATCAGTTGTTCAAATCACGG         GATCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 170005 TAGAAGTTTATGATCAGTTGTTCAAATCACGGGTA...TAGGATCCATTC

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3763 TGGAACAGAATGAAGAAGCCACTGCACCTTTTGGATTGTATACATGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171389 TGGAACAGAATGAAGAAGCCACTGCACCTTTTGGATTGTATACATGTATT

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3813 ATTGATAAGATATGTTGAGAATCCCAGCCAAGTTTTAAATTGTGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 171439 ATTGATAAGATATGTTGAGAATCCCAGCCAAGTTTTAAATTGTGAAAGGT

   4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3861        GAGAAGATTTACAAATCTCTGCCTGGATGCTGTTTGTGGTTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171489 A...TAGGAGAAGATTTACAAATCTCTGCCTGGATGCTGTTTGTGGTTAC

   4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3904 CTTGTTGAGCTCCAGTCTATGAGCTCGTCAGTAGCAGTACAAGCCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172370 CTTGTTGAGCTCCAGTCTATGAGCTCGTCAGTAGCAGTACAAGCCATCAC

   4250     .    :    .    :    .    :    .    :
   3954 TGGGAATTTTAAATCTCTTCAAGCTAAATTAGAACGGCTTCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172420 TGGGAATTTTAAATCTCTTCAAGCTAAATTAGAACGGCTTCAT