seq1 = pF1KA0773.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KA0773/gi568815591r_143256553.tfa (gi568815591r:143256553_143460150), 203598 bp

>pF1KA0773 1080
>gi568815591r:143256553_143460150 (Chr7)

(complement)

1-28  (97548-97575)   100% ->
29-138  (100002-100111)   100% ->
139-174  (100384-100419)   100% ->
175-268  (100732-100825)   100% ->
269-466  (101127-101324)   100% ->
467-610  (102728-102871)   100% ->
611-1080  (103129-103598)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCATCGGCTCCCGGACTGTGG         GGAATGAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  97548 ATGGGCTGCATCGGCTCCCGGACTGTGGGTG...CAGGGAATGAGGTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGCAGTGGATTGGAAGGGCCTGAAGGATGTCGATCAAATCAACATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 TGCAGTGGATTGGAAGGGCCTGAAGGATGTCGATCAAATCAACATGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCACCAGCTCACTGCACGGGAGCAGCCTCCATCGGCCATCGACTGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100065 GCACCAGCTCACTGCACGGGAGCAGCCTCCATCGGCCATCGACTGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    139       CAAACTCGAACTGATTTCTCCTGGGACGGCATCAAC        
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100115 ...CAGCAAACTCGAACTGATTTCTCCTGGGACGGCATCAACGTG...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    175  CTCTCCATGGAGGACACCACTTCCATTCTTCCGAAGCTTAAGCGAAACT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100731 GCTCTCCATGGAGGACACCACTTCCATTCTTCCGAAGCTTAAGCGAAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CTAACGCCTATGGCATTGGGGCCCTGGCCAAGTCATCATTCTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100781 CTAACGCCTATGGCATTGGGGCCCTGGCCAAGTCATCATTCTCAGGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    269     GGATCTCACGGAGCATGAAGGACCATGTGACAAAGCCCACAGCCAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100831 .TAGGGATCTCACGGAGCATGAAGGACCATGTGACAAAGCCCACAGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGGGCAAGGCCGGGTGGCCCACATGATTGAGTGGCAGGGCTGGGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101173 GGGGCAAGGCCGGGTGGCCCACATGATTGAGTGGCAGGGCTGGGGGAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CACCAGCTGTTCAGCCACAACACAGCCATGAGTCCGTGCGCAGGGATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101223 CACCAGCTGTTCAGCCACAACACAGCCATGAGTCCGTGCGCAGGGATACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATGCCTACTCCGACCTCAGCGATGGCGAGAAGGAGGCACGTTTTCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101273 GATGCCTACTCCGACCTCAGCGATGGCGAGAAGGAGGCACGTTTTCTAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AG         GCGTCATGGAGCAGTTTGCTATCTCTGAGGCCACACTCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101323 AGGTA...CAGGCGTCATGGAGCAGTTTGCTATCTCTGAGGCCACACTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGCCTGGTCTTCCATGGATGGTGAGGACATGAGTGTGAACTCCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102767 TGGCCTGGTCTTCCATGGATGGTGAGGACATGAGTGTGAACTCCACCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGCCATTGGGCTGCAACTACAGTGACAACTACCAGGAACTGATGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102817 GAGCCATTGGGCTGCAACTACAGTGACAACTACCAGGAACTGATGGACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCAGG         ATGCCCTGGCTCAAGCACCCATGGATGGATGGCCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102867 TCAGGGTG...CAGATGCCCTGGCTCAAGCACCCATGGATGGATGGCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACTCTTACGTGTCCCAGGGTATGTACTGTCTGGGGTCGTCAGATGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103165 ACTCTTACGTGTCCCAGGGTATGTACTGTCTGGGGTCGTCAGATGCCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAAGCCAGCGATCAGTCCCTCATTGCCTCTCCGGCCACAGGATCCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103215 GAAGCCAGCGATCAGTCCCTCATTGCCTCTCCGGCCACAGGATCCTATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGGCCTGCATTTGATGACTCACAACCCAGCTTGCATGAAATGGGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103265 TGGGCCTGCATTTGATGACTCACAACCCAGCTTGCATGAAATGGGACCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCCAACCAGCTTCAGGATACTCTGCTCTGGAGCCTCCACCTTTGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103315 CCCAACCAGCTTCAGGATACTCTGCTCTGGAGCCTCCACCTTTGCTGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGAGACACTGACTGGGCTCCGGGGGTAGGCGCAGTGGACCTGGCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103365 GGAGACACTGACTGGGCTCCGGGGGTAGGCGCAGTGGACCTGGCAAGGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCCTGCTGAGGAGGAGAAGAGGCCATTGGCACCTGAGGAGGAAGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103415 CCCTGCTGAGGAGGAGAAGAGGCCATTGGCACCTGAGGAGGAAGAGGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGGGATGCCGGGACCTGGAGTCACTTTCCCCACGAGAAGACCCTGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103465 CGGGATGCCGGGACCTGGAGTCACTTTCCCCACGAGAAGACCCTGAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCTACCGCTCTCAGCCGGAAGGTGTCTGACGTCACATCCTCAGGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103515 TCTACCGCTCTCAGCCGGAAGGTGTCTGACGTCACATCCTCAGGTGTGCA

   1100     .    :    .    :    .    :
   1047 GTCCTTTGATGAGGAGGAAGGCGAGGCCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103565 GTCCTTTGATGAGGAGGAAGGCGAGGCCAACAAC