seq1 = pF1KA0767.tfa, 1734 bp
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>pF1KA0767 1734
>gi568815576f:46526800_46777248 (Chr22)

1-162  (100001-100162)   100% ->
163-283  (111041-111161)   100% ->
284-404  (131388-131508)   100% ->
405-466  (134582-134643)   100% ->
467-599  (136241-136373)   99% ->
600-625  (137039-137064)   100% ->
626-717  (137227-137318)   100% ->
718-809  (138816-138907)   100% ->
810-858  (140026-140074)   100% ->
859-930  (141297-141368)   100% ->
931-974  (141890-141933)   100% ->
975-1084  (142000-142109)   100% ->
1085-1239  (146044-146198)   100% ->
1240-1384  (146871-147015)   100% ->
1385-1478  (147858-147951)   100% ->
1479-1563  (148669-148753)   100% ->
1564-1632  (149801-149869)   100% ->
1633-1734  (150348-150449)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAAGGAGGTTGGACAAAATCAGGTTCAGAGGTCACAAGAGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAAGGAGGTTGGACAAAATCAGGTTCAGAGGTCACAAGAGAGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTCGATCTAGCGGAGTCTCCAAATGCCTCGGACACCGAATGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTCGATCTAGCGGAGTCTCCAAATGCCTCGGACACCGAATGCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAAATCCCCCTGAAGGTACCGCGGACCTCGCCCCGGGACAGCGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAAATCCCCCTGAAGGTACCGCGGACCTCGCCCCGGGACAGCGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGAGGGACCCT         GCTGGTCCAGGGACCCTCATCATGGCCAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGAGGGACCCTGTG...TAGGCTGGTCCAGGGACCCTCATCATGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGAGTCCAGGACTTTAACCGGACAGAGTTTGATCGACTGAATGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111070 AGGAGTCCAGGACTTTAACCGGACAGAGTTTGATCGACTGAATGAGATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGGTCACCTGGAAATTGCCTTATTGGAAAAACATTTCTTAC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111120 AAGGTCACCTGGAAATTGCCTTATTGGAAAAACATTTCTTACGTG...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284  AGGAGGAGCTCCGGAAGCTGCGAGAAGAAACCAACGCGGAGATGCTGCG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131387 GAGGAGGAGCTCCGGAAGCTGCGAGAAGAAACCAACGCGGAGATGCTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGGAGCTGGACCGCGAGCGGCAGCGGCGGATGGAGCTGGAGCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131437 GCAGGAGCTGGACCGCGAGCGGCAGCGGCGGATGGAGCTGGAGCAGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCAGGAGGTGCTGAAGGCCAG         AACCGAGGAGCAGATGGCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 131487 TGCAGGAGGTGCTGAAGGCCAGGTA...AAGAACCGAGGAGCAGATGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGCAGCCCCCAAAAGGGCAGGCCCAGGCCAGCAATGGAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 134601 CAGCAGCCCCCAAAAGGGCAGGCCCAGGCCAGCAATGGAGCAGGTA...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    467   AGCGCCGGAGCCAGGGGCTGTCCTCGCGCCTGCAGAAGTGGTTCTACG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136239 AGAGCGCCGGAGCCAGGGGCTGTCCTCGCGCCTGCAGAAGTGGTTCTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCGGTTCGGGGAGTACGTGGAGGACTTCCGGTTCCAGCCCGAGGAGAAC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136289 AGCGGTTTGGGGAGTACGTGGAGGACTTCCGGTTCCAGCCCGAGGAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACTGTGGAGACAGAGGAACCCCTGAGCGCCCGCAG         GTTAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136339 ACTGTGGAGACAGAGGAACCCCTGAGCGCCCGCAGGTA...TAGGTTAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAAAATATGAGACGGCTCA         AGCGCGGTGCCAAGCCGGTCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 137045 TGAAAATATGAGACGGCTCAGTG...CAGAGCGCGGTGCCAAGCCGGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTAACTTTGTGAAGAACCTCTCTGCCTTATCCGACTGGTACTCCGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137248 CTAACTTTGTGAAGAACCTCTCTGCCTTATCCGACTGGTACTCCGTCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACGTCTGCCATTGCCTTCACC         GTGTACATGAATGCCGTGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 137298 ACGTCTGCCATTGCCTTCACCGTG...CAGGTGTACATGAATGCCGTGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCATGGCTGGGCCATCCCATTGTTCTTATTTCTAGCAATTCTGAGGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138836 GCATGGCTGGGCCATCCCATTGTTCTTATTTCTAGCAATTCTGAGGTTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCCTCAATTACCTCATCGCCAG         GGGGTGGCGGATACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 138886 CCCTCAATTACCTCATCGCCAGGTA...CAGGGGGTGGCGGATACAGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGCATCGTGCCCGAAGTGTCTGAGCCCGTG         GAACCTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 140045 AGCATCGTGCCCGAAGTGTCTGAGCCCGTGGTA...AAGGAACCTCCAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGAAGACCTGACTGTGTCTGAGAAGTTCCAGCTGGTGCTGGACGTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141308 GGAAGACCTGACTGTGTCTGAGAAGTTCCAGCTGGTGCTGGACGTCGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGAAAGCCCAG         AACCTTTTCGGGAAGATGGCTGACATCCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 141358 AGAAAGCCCAGGTA...CAGAACCTTTTCGGGAAGATGGCTGACATCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GAGAAGATCAAGAA         CTTGTTCATGTGGGTCCAGCCGGAGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 141920 GAGAAGATCAAGAAGTA...CAGCTTGTTCATGTGGGTCCAGCCGGAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CACACAGAAGCTGTATGTGGCGCTCTGGGCTGCCTTCCTGGCCTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142027 CACACAGAAGCTGTATGTGGCGCTCTGGGCTGCCTTCCTGGCCTCCTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TCTTCCCCTACCGCCTGGTGGGGCTTGCCGTGG         GACTCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 142077 TCTTCCCCTACCGCCTGGTGGGGCTTGCCGTGGGTA...CAGGACTCTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 GCTGGTATCAAGTTCTTCCTCATTGATTTCATCTTTAAACGCTGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146052 GCTGGTATCAAGTTCTTCCTCATTGATTTCATCTTTAAACGCTGCCCGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GCTGCGCGCCAAGTACGACACGCCCTATATCATCTGGAGGAGTCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146102 GCTGCGCGCCAAGTACGACACGCCCTATATCATCTGGAGGAGTCTCCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 CCGACCCGCAGCTCAAGGAGCGCTCCAGCGCCGCAGTCTCACGCAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 146152 CCGACCCGCAGCTCAAGGAGCGCTCCAGCGCCGCAGTCTCACGCAGGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1240       CTGCAGACGACCTCGTCACGGAGCTACGTACCCAGCGCACCGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146202 ...CAGCTGCAGACGACCTCGTCACGGAGCTACGTACCCAGCGCACCGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CGGCCTGGGTAAAGAGGAGGACGCCGGTCGCTTCCACAGCACCAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146915 CGGCCTGGGTAAAGAGGAGGACGCCGGTCGCTTCCACAGCACCAAGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GCAATTTCCACGAGATCTTCAATCTGACAGAAAACGAGCGTCCGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146965 GCAATTTCCACGAGATCTTCAATCTGACAGAAAACGAGCGTCCGCTGGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 G         TGTGCGAGAATGGCTGGCGCTGCTGCCTCATCAACAGGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147015 GGTA...TAGTGTGCGAGAATGGCTGGCGCTGCTGCCTCATCAACAGGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CCGGAAGATGCCCACGGACTACATCAGGAACGGGGTGCTCTACGTCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147898 CCGGAAGATGCCCACGGACTACATCAGGAACGGGGTGCTCTACGTCACGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AGAA         TTACTTGTGCTTCGAAAGCTCCAAATCTGGGTCCTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147948 AGAAGTG...CAGTTACTTGTGCTTCGAAAGCTCCAAATCTGGGTCCTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 AAGAGGAACAAAGTCATCAAGCTAGTGGACATCACGGACATCCAGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 148706 AAGAGGAACAAAGTCATCAAGCTAGTGGACATCACGGACATCCAGAAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1564        TACAAGGTCCTGTCTGTCCTCCCAGGCTCAGGCATGGGGATTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148756 T...CAGTACAAGGTCCTGTCTGTCCTCCCAGGCTCAGGCATGGGGATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CCGTGTCGACGCCATCCACCCAGAAA         CCGCTCGTGTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 149844 CCGTGTCGACGCCATCCACCCAGAAAGTA...CAGCCGCTCGTGTTTGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GCCATGGTGCACAGGGATGAGGCCTTCGAGACCATTCTCAGCCAGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150363 GCCATGGTGCACAGGGATGAGGCCTTCGAGACCATTCTCAGCCAGTACAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .
   1698 CAAGATCACCTCAGCGGCAGCGTCTGGCGGGGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150413 CAAGATCACCTCAGCGGCAGCGTCTGGCGGGGACAGC