seq1 = pF1KA0751.tfa, 3564 bp
seq2 = pF1KA0751/gi568815590f_103719508.tfa (gi568815590f:103719508_104351817), 632310 bp

>pF1KA0751 3564
>gi568815590f:103719508_104351817 (Chr8)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-1048  (165791-166716)   100% ->
1049-1257  (190814-191022)   100% ->
1258-1377  (192546-192665)   100% ->
1378-1477  (195988-196087)   100% ->
1478-1601  (196907-197030)   100% ->
1602-1648  (198934-198980)   100% ->
1649-1761  (202165-202277)   100% ->
1762-1892  (211756-211886)   100% ->
1893-2064  (217044-217215)   100% ->
2065-2218  (223266-223419)   100% ->
2219-2287  (241558-241626)   100% ->
2288-2444  (255843-255999)   100% ->
2445-2561  (269798-269914)   100% ->
2562-2741  (293935-294114)   100% ->
2742-2851  (294999-295108)   100% ->
2852-2993  (525409-525550)   100% ->
2994-3106  (529194-529306)   100% ->
3107-3208  (529980-530081)   100% ->
3209-3348  (531517-531656)   100% ->
3349-3564  (532095-532310)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAATTTGAGACATTGCGCCAGGTCTGCAATTCTGTTTTATCTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAATTTGAGACATTGCGCCAGGTCTGCAATTCTGTTTTATCTCATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCATGGGGTTTTTTCATCCCCACCAAATATCTTACAAAATGAGCTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCATGGGGTTTTTTCATCCCCACCAAATATCTTACAAAATGAGCTTTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACAAACACTGAACAATGCAAG         GAAAAGAAGCCCATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 GACAAACACTGAACAATGCAAGGTG...TAGGAAAAGAAGCCCATCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCAGAGATCAGAATAGAAGATACGACCAAAGGGAAGAAAGAGAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165810 TCCAGAGATCAGAATAGAAGATACGACCAAAGGGAAGAAAGAGAGGAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCACAGTATGCTACTTCGGATACCGCAATGCCTAGATCTCCATCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165860 TTCACAGTATGCTACTTCGGATACCGCAATGCCTAGATCTCCATCAGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGCTGATAGGCGATCTCAACATGAACCTCAGTTTTATGAAGACTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165910 ATGCTGATAGGCGATCTCAACATGAACCTCAGTTTTATGAAGACTCTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATTTAAGTTATAGGGACTCCAACAGGAGAAGTCATAGGCATTCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165960 CATTTAAGTTATAGGGACTCCAACAGGAGAAGTCATAGGCATTCCAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATATATTGTAGATGATGAGGATGTGGAAAGCAGAGATGAATACGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166010 ATATATTGTAGATGATGAGGATGTGGAAAGCAGAGATGAATACGAAAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAAGGAGAGAGGAAGAGTACCAGTCACGCTACCGAAGTGATCCGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166060 AAAGGAGAGAGGAAGAGTACCAGTCACGCTACCGAAGTGATCCGAATTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCGTTATCCAGTAAAGCCACAACCCTATGAAGAACAAATGCGGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166110 GCCCGTTATCCAGTAAAGCCACAACCCTATGAAGAACAAATGCGGATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCTGAAGTGTCCCGAGCACGGCATGAGAGAAGGCATAGTGATGTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166160 TGCTGAAGTGTCCCGAGCACGGCATGAGAGAAGGCATAGTGATGTTTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGCAAATGCTGATCTGGAAGATTCCAGGATTTCTATGCTAAGGATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166210 TGGCAAATGCTGATCTGGAAGATTCCAGGATTTCTATGCTAAGGATGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGACCATCAAGGCAAAGATCTATATCAGAACGTAGAGCTGCCATGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166260 CGACCATCAAGGCAAAGATCTATATCAGAACGTAGAGCTGCCATGGAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCAGCGATCTTATTCAATGGAAAGAACTCGAGAGGCTCAGGGACCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166310 TCAGCGATCTTATTCAATGGAAAGAACTCGAGAGGCTCAGGGACCAAGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTTATGCACAAAGGACCACAAACCATAGTCCTCCTACCCCCAGGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166360 CTTATGCACAAAGGACCACAAACCATAGTCCTCCTACCCCCAGGAGGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCACTACCCATAGATAGACCAGACTTGAGGCGTACTGACTCACTACGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166410 CCACTACCCATAGATAGACCAGACTTGAGGCGTACTGACTCACTACGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACAGCACCACTTAGATCCTAGCTCTGCTGTAAGAAAAACAAAACGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166460 ACAGCACCACTTAGATCCTAGCTCTGCTGTAAGAAAAACAAAACGGGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AAATGGAAACAATGTTAAGGAATGATTCTCTCAGTTCAGACCAGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166510 AAATGGAAACAATGTTAAGGAATGATTCTCTCAGTTCAGACCAGTCAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCAGTGAGACCTCCACCACCAAAGCCTCATAAATCAAAGAAAGGCGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166560 TCAGTGAGACCTCCACCACCAAAGCCTCATAAATCAAAGAAAGGCGGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AATGCGCCAGATTTCGTTGAGCAGTTCAGAGGAGGAATTGGCTTCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166610 AATGCGCCAGATTTCGTTGAGCAGTTCAGAGGAGGAATTGGCTTCCACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTGAATATACAAGTTGTGATGATGTTGAGATTGAAAGTGAGAGTGTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166660 CTGAATATACAAGTTGTGATGATGTTGAGATTGAAAGTGAGAGTGTAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAAAAAG         GGGACAGTCAAAAGGGAAAAAGAAAAACTAGTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166710 GAAAAAGGTA...TAGGGGACAGTCAAAAGGGAAAAAGAAAAACTAGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCAGGCAGTTTTGTCGGACTCTAACACCAGGTCTGAGAGACAAAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190848 GCAGGCAGTTTTGTCGGACTCTAACACCAGGTCTGAGAGACAAAAGGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGATGTACTTTGGTGGCCACTCTTTGGAAGAGGATTTGGAATGGTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190898 TGATGTACTTTGGTGGCCACTCTTTGGAAGAGGATTTGGAATGGTCTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CCTCAGATTAAGGACTCTGGGGTAGATACGTGTAGTAGCACAACCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190948 CCTCAGATTAAGGACTCTGGGGTAGATACGTGTAGTAGCACAACCCTTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CGAGGAGCATAGCCATAGTGATAAG         CACCCTGTAACCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 190998 CGAGGAGCATAGCCATAGTGATAAGGTA...CAGCACCCTGTAACCTGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AACCATCTAAAGATGGAGATCGTTTAATTGGTCGCATTTTATTAAATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192562 AACCATCTAAAGATGGAGATCGTTTAATTGGTCGCATTTTATTAAATAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CGTCTAAAAGATGGAAGTGTACCTCGAGATTCAGGAGCAATGCTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192612 CGTCTAAAAGATGGAAGTGTACCTCGAGATTCAGGAGCAATGCTTGGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GAAG         GTTGTAGGAGGAAAGATGACTGAATCAGGTCGGCTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192662 GAAGGTA...CAGGTTGTAGGAGGAAAGATGACTGAATCAGGTCGGCTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GTGCATTTATTACTAAAGTAAAAAAAGGAAGTTTAGCTGATACTGTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196025 GTGCATTTATTACTAAAGTAAAAAAAGGAAGTTTAGCTGATACTGTAGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CATCTTAGACCAG         GTGATGAAGTATTAGAATGGAATGGAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 196075 CATCTTAGACCAGGTA...TAGGTGATGAAGTATTAGAATGGAATGGAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 ACTACTGCAAGGAGCCACATTTGAGGAAGTGTACAACATCATTCTAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196935 ACTACTGCAAGGAGCCACATTTGAGGAAGTGTACAACATCATTCTAGAAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CCAAACCTGAACCACAAGTAGAACTTGTAGTTTCAAGGCCTATTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 196985 CCAAACCTGAACCACAAGTAGAACTTGTAGTTTCAAGGCCTATTGGGTA.

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602      AGATATACCGCGAATACCTGATAGCACACATGCACAACTGGAGTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197035 ..CAGAGATATACCGCGAATACCTGATAGCACACATGCACAACTGGAGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CA         GTTCTAGCTCCTTTGAATCTCAAAAAATGGATCGTCCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198979 CAGTA...CAGGTTCTAGCTCCTTTGAATCTCAAAAAATGGATCGTCCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CTATTTCTGTTACCTCTCCCATGAGTCCTGGAATGTTGAGGGATGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202204 CTATTTCTGTTACCTCTCCCATGAGTCCTGGAATGTTGAGGGATGTCCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CAGTTCTTATCAGGACAACTTTCA         ATAAAACTATGGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 202254 CAGTTCTTATCAGGACAACTTTCAGTA...CAGATAAAACTATGGTTTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CAAGGTTGGTCACCAATTAATAGTTACAATTTTGGGAGCAAAAGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211773 CAAGGTTGGTCACCAATTAATAGTTACAATTTTGGGAGCAAAAGATCTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CTTCCAGGGAAGATGGGAGGCCAAGGAATCCTTATGTTAAAATTTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211823 CTTCCAGGGAAGATGGGAGGCCAAGGAATCCTTATGTTAAAATTTACTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CTTCCAGACAGAAG         TGATAAAAACAAGAGAAGAACTAAAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 211873 CTTCCAGACAGAAGGTA...TAGTGATAAAAACAAGAGAAGAACTAAAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 AGTAAAGAAAACATTGGAACCCAAATGGAACCAAACATTCATTTATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217071 AGTAAAGAAAACATTGGAACCCAAATGGAACCAAACATTCATTTATTCTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 CAGTCCACCGAAGAGAATTTCGGGAACGAATGCTAGAGATTACCCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217121 CAGTCCACCGAAGAGAATTTCGGGAACGAATGCTAGAGATTACCCTTTGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 GATCAAGCTCGTGTTCGAGAGGAAGAAAGTGAATTCTTAGGCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 217171 GATCAAGCTCGTGTTCGAGAGGAAGAAAGTGAATTCTTAGGCGAGGTA..

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065     ATTTTAATTGAATTAGAAACAGCATTATTAGATGATGAGCCACATT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217221 .TAGATTTTAATTGAATTAGAAACAGCATTATTAGATGATGAGCCACATT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 GGTACAAACTTCAGACGCATGATGTCTCTTCATTGCCACTTCCCCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223312 GGTACAAACTTCAGACGCATGATGTCTCTTCATTGCCACTTCCCCACCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 TCTCCATATATGCCACGAAGACAGCTCCATGGAGAGAGCCCAACACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223362 TCTCCATATATGCCACGAAGACAGCTCCATGGAGAGAGCCCAACACGGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 GTTGCAAA         GGTCAAAGAGAATAAGTGATAGTGAAGTCTCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 223412 GTTGCAAAGTA...TAGGGTCAAAGAGAATAAGTGATAGTGAAGTCTCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 ACTATGACTGTGATGATGGAATTGGTGTAGTATCAG         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 241591 ACTATGACTGTGATGATGGAATTGGTGTAGTATCAGGTA...TAGATTAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 CGACATGATGGTCGAGATCTTCAAAGCTCAACATTATCAGTGCCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255848 CGACATGATGGTCGAGATCTTCAAAGCTCAACATTATCAGTGCCAGAACA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 AGTAATGTCATCAAACCACTGTTCACCATCAGGGTCTCCTCATCGAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255898 AGTAATGTCATCAAACCACTGTTCACCATCAGGGTCTCCTCATCGAGTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 ATGTTATAGGAAGGACTAGATCATGGTCACCCAGTGTCCCTCCTCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255948 ATGTTATAGGAAGGACTAGATCATGGTCACCCAGTGTCCCTCCTCCACAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 AG         TCGGAATGTGGAACAGGGGCTTCGAGGGACCCGCACTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255998 AGGTA...TAGTCGGAATGTGGAACAGGGGCTTCGAGGGACCCGCACTAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 GACCGGACATTATAATACAATTAGCCGAATGGACAGACATCGTGTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269837 GACCGGACATTATAATACAATTAGCCGAATGGACAGACATCGTGTCATGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 ATGACCATTATTCTCCAGATAGAGACAG         GGATTGTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 269887 ATGACCATTATTCTCCAGATAGAGACAGGTA...CAGGGATTGTGAAGCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 GCAGATAGACAGCCATATCACAGATCCAGATCAACAGAACAACGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293948 GCAGATAGACAGCCATATCACAGATCCAGATCAACAGAACAACGGCCTCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 CCTTGAGCGGACCACCACCCGCTCCAGATCCACTGAACGTCCTGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293998 CCTTGAGCGGACCACCACCCGCTCCAGATCCACTGAACGTCCTGATACAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 ACCTCATGAGGTCGATGCCTTCATTAATGACTGGAAGATCTGCCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294048 ACCTCATGAGGTCGATGCCTTCATTAATGACTGGAAGATCTGCCCCTCCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 TCACCTGCCTTATCGAG         GTCTCATCCTCGTACTGGGTCTGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 294098 TCACCTGCCTTATCGAGGTG...TAGGTCTCATCCTCGTACTGGGTCTGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 CCAGACAAGCCCATCAAGTACTCCAGTCGCAGGACGAAGGGGCCGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295023 CCAGACAAGCCCATCAAGTACTCCAGTCGCAGGACGAAGGGGCCGACAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 TTCCACAGCTTCCACCAAAGGGAACGTTGGATAGAA         AAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 295073 TTCCACAGCTTCCACCAAAGGGAACGTTGGATAGAAGTA...CAGAAGCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 GGAGGTAAAAAACTAAGGAGCACTGTCCAAAGAAGTACAGAAACAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 525414 GGAGGTAAAAAACTAAGGAGCACTGTCCAAAGAAGTACAGAAACAGGCCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 GGCCGTGGAAATGAGGAACTGGATGACTCGACAGGCAAGCCGAGAGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 525464 GGCCGTGGAAATGAGGAACTGGATGACTCGACAGGCAAGCCGAGAGTCTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 CAGATGGTAGCATGAACAGCTACAGCTCAGAAGGAAA         TCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 525514 CAGATGGTAGCATGAACAGCTACAGCTCAGAAGGAAAGTG...CAGTCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 ATTTTCCCTGGTGTTCGCTTGGCCTCTGATAGCCAGTTCAGTGATTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529198 ATTTTCCCTGGTGTTCGCTTGGCCTCTGATAGCCAGTTCAGTGATTTCCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 GGATGGCCTTGGCCCTGCTCAGCTAGTGGGACGCCAGACTCTGGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529248 GGATGGCCTTGGCCCTGCTCAGCTAGTGGGACGCCAGACTCTGGCAACAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 CTGCAATGG         GTGACATTCAGGTAGGAATGATGGACAAAAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 529298 CTGCAATGGGTA...TAGGTGACATTCAGGTAGGAATGATGGACAAAAAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 GGACAGCTGGAGGTAGAAATCATCCGGGCCCGTGGCCTTGTTGTAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 530012 GGACAGCTGGAGGTAGAAATCATCCGGGCCCGTGGCCTTGTTGTAAAACC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 AGGTTCCAAGACACTGCCAG         CACCGTATGTAAAAGTGTATC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 530062 AGGTTCCAAGACACTGCCAGGTA...AAGCACCGTATGTAAAAGTGTATC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3230 TATTAGATAACGGAGTCTGCATAGCCAAAAAGAAAACAAAAGTGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531538 TATTAGATAACGGAGTCTGCATAGCCAAAAAGAAAACAAAAGTGGCAAGA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3280 AAAACGCTGGAACCCCTTTACCAGCAGCTATTATCTTTCGAAGAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 531588 AAAACGCTGGAACCCCTTTACCAGCAGCTATTATCTTTCGAAGAGAGTCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 ACAAGGAAAAGTTTTACAG         ATCATCGTCTGGGGAGATTATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 531638 ACAAGGAAAAGTTTTACAGGTA...CAGATCATCGTCTGGGGAGATTATG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3371 GCCGCATGGATCACAAATCTTTTATGGGAGTGGCCCAGATACTTTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 532117 GCCGCATGGATCACAAATCTTTTATGGGAGTGGCCCAGATACTTTTAGAT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3421 GAACTAGAGCTATCCAATATGGTGATTGGATGGTTCAAACTTTTCCCACC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 532167 GAACTAGAGCTATCCAATATGGTGATCGGATGGTTCAAACTTTTCCCACC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3471 TTCCTCCCTAGTAGATCCAACCTTGGCTCCTCTGACAAGAAGAGCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 532217 TTCCTCCCTAGTAGATCCAACCTTGGCCCCTCTGACAAGAAGAGCTTCCC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :
   3521 AATCATCTCTGGAAAGTTCAACTGGACCTTCTTACTCTCGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 532267 AATCATCTCTGGAAAGTTCAACTGGACCTTCTTACTCTCGTTCA