seq1 = pF1KA0750.tfa, 3372 bp
seq2 = pF1KA0750/gi568815587f_12062156.tfa (gi568815587f:12062156_12362517), 300362 bp

>pF1KA0750 3372
>gi568815587f:12062156_12362517 (Chr11)

1-264  (100001-100264)   100% ->
265-472  (142095-142302)   99% ->
473-589  (145868-145984)   100% ->
590-691  (147342-147443)   100% ->
692-847  (151100-151255)   100% ->
848-948  (154064-154164)   100% ->
949-1206  (158046-158303)   100% ->
1207-1322  (159489-159604)   100% ->
1323-1455  (160462-160592)   97% ->
1456-1540  (161262-161346)   100% ->
1541-1688  (162518-162665)   100% ->
1689-1888  (164016-164215)   100% ->
1889-1995  (164870-164976)   100% ->
1996-2064  (174022-174090)   100% ->
2065-2214  (177281-177430)   100% ->
2215-2337  (178885-179007)   100% ->
2338-2556  (180059-180277)   100% ->
2557-2658  (180516-180617)   100% ->
2659-2784  (181832-181957)   99% ->
2785-2847  (187029-187091)   100% ->
2848-2955  (193488-193595)   100% ->
2956-3142  (194630-194816)   100% ->
3143-3231  (196313-196401)   100% ->
3232-3334  (197640-197742)   100% ->
3335-3372  (200325-200362)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAAAACGAGGATGAGAAGCAGGCCCAGGCGGGGCAGGTTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAAAACGAGGATGAGAAGCAGGCCCAGGCGGGGCAGGTTTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACTTTGTCCAGGCATCCACGTGCAAAGGTACCCTCCAGGCCTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACTTTGTCCAGGCATCCACGTGCAAAGGTACCCTCCAGGCCTTCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTCACACGACACCTGGACCTAGACCCTCTGGACCACAGAAACTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCTCACACGACACCTGGACCTAGACCCTCTGGACCACAGAAACTTTTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAAGCTCAAGTCCAAGGTGACCACCTGGAAAGCCAAAGCCCTGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAAGCTCAAGTCCAAGGTGACCACCTGGAAAGCCAAAGCCCTGTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAATTGGATAAGCGTGGTTCCCACAAAGAGTATAAGCGAGGGAAGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAATTGGATAAGCGTGGTTCCCACAAAGAGTATAAGCGAGGGAAGTCGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCACGAACACCAAG         TGTCTCATAGTTGGGGGAGGACCCTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCACGAACACCAAGGTA...CAGTGTCTCATAGTTGGGGGAGGACCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCTTGCGCACTGCCATTGAACTTGCCTACCTGGGAGCCAAAGTGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142122 GGCTTGCGCACTGCCATTGAACTTGCCTACCTGGGAGCCAAAGTGGTCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGGAGAAGAGGGACTCCTTCTCCCGGAACAACGTGCTACACCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142172 GGTGGAGAAGAGGGACTCCTTCTCCCGGAACAACGTGCTACACCTCTGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTTTCACCATCCATGACCTTCGGGGCCTGGGAGCCAAGAAGTTCTATGGG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 142222 CTTTCACCATCCATGACCTTCGTGGCCTGGGAGCCAAGAAGTTCTATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTTCTGTGCTGGCTCCATCGACCATATCA         GTATTCGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 142272 AAGTTCTGTGCTGGCTCCATCGACCATATCAGTG...CAGGTATTCGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTACAGCTCATCCTATTCAAGGTGGCCCTGATGCTGGGAGTTGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145878 ACTACAGCTCATCCTATTCAAGGTGGCCCTGATGCTGGGAGTTGAAATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGTGAATGTGGAGTTCGTGAAGGTTCTAGAGCCTCCTGAAGATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145928 ATGTGAATGTGGAGTTCGTGAAGGTTCTAGAGCCTCCTGAAGATCAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AATCAAA         AAATTGGCTGGCGGGCAGAATTTCTCCCTACAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145978 AATCAAAGTA...TAGAAATTGGCTGGCGGGCAGAATTTCTCCCTACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCATTCTCTGTCGGAGTTTGAGTTTGACGTCATCATTGGTGCCGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147376 CCATTCTCTGTCGGAGTTTGAGTTTGACGTCATCATTGGTGCCGATGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCAGGAACACCCTGGAAG         GGTTCAGAAGAAAAGAATTCCGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 147426 GCAGGAACACCCTGGAAGGTG...CAGGGTTCAGAAGAAAAGAATTCCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGAAGCTGGCGATTGCCATCACCGCCAACTTCATAAACAGAAACAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151123 GGGAAGCTGGCGATTGCCATCACCGCCAACTTCATAAACAGAAACAGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGCGGAAGCCAAGGTGGAAGAGATTAGTGGTGTGGCTTTCATCTTCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151173 AGCGGAAGCCAAGGTGGAAGAGATTAGTGGTGTGGCTTTCATCTTCAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAAATTTTTTCAGGACCTTAAAGAAGAAACAG         GCATAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 151223 AGAAATTTTTTCAGGACCTTAAAGAAGAAACAGGTG...CAGGCATAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTGAGAACATTGTTTACTACAAGGACTGCACCCACTATTTTGTAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154072 CTTGAGAACATTGTTTACTACAAGGACTGCACCCACTATTTTGTAATGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGCCAAGAAGCAGAGCCTGCTCGACAAAGGTGTCATCATTAAC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 154122 AGCCAAGAAGCAGAGCCTGCTCGACAAAGGTGTCATCATTAACGTA...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    949   GACTACATCGACACAGAGATGCTGCTGTGTGCGGAGAACGTGAACCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158044 AGGACTACATCGACACAGAGATGCTGCTGTGTGCGGAGAACGTGAACCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GACAACCTGCTATCCTATGCCCGGGAAGCTGCAGACTTTGCCACCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158094 GACAACCTGCTATCCTATGCCCGGGAAGCTGCAGACTTTGCCACCAACTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCAGCTGCCATCCTTAGACTTTGCCATGAACCACTATGGGCAGCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158144 CCAGCTGCCATCCTTAGACTTTGCCATGAACCACTATGGGCAGCCTGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGCCATGTTTGACTTTACCTGCATGTATGCCTCAGAGAACGCGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158194 TGGCCATGTTTGACTTTACCTGCATGTATGCCTCAGAGAACGCGGCCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTGCGGGAGCGGCAGGCGCACCAGCTGCTCGTGGCCCTTGTGGGTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158244 GTGCGGGAGCGGCAGGCGCACCAGCTGCTCGTGGCCCTTGTGGGTGACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTTGCTTGAG         CCATTTTGGCCCATGGGTACAGGCTGTGCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 158294 CTTGCTTGAGGTA...CAGCCATTTTGGCCCATGGGTACAGGCTGTGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GTGGCTTCCTGGCAGCCTTTGACACGGCATGGATGGTGAAGAGCTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159520 GTGGCTTCCTGGCAGCCTTTGACACGGCATGGATGGTGAAGAGCTGGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CAGGGCACCCCTCCCCTGGAGCTGCTGGCTGAAAG         GGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 159570 CAGGGCACCCCTCCCCTGGAGCTGCTGGCTGAAAGGTG...CAGGGAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TCTCTACCGGCTGTTACCTCAGACAACCCCGGAGAACATCAACAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160468 TCTCTACCGGCTGTTACCTCAGACAACCCCGGAGAACATCAACAAGAACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TTGAGCAGTACACGTTGGACCCAGGGACACGGTACCCAAACCTCAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160518 TTGAGCAGTACACGTTGGACCCAGGGACACGGTACCCAAACCTCAACTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACTGTGTCAGGCCCCATCAGGTGAAG         CATTTGTATATCAC
        |||||||||||||||||||||| -||->>>...>>>||||||||||||||
 160568 CACTGTGTCAGGCCCCATCAGGC AA GTC...AAGCATTTGTATATCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TAAGGAGCTGGAGCACTACCCTCTCGAGAGACTGGGCTCGGTGAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161276 TAAGGAGCTGGAGCACTACCCTCTCGAGAGACTGGGCTCGGTGAGGAGAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTGTCAACCTCTCCAGGAAGG         AGTCAGATATCCGGCCCAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 161326 CTGTCAACCTCTCCAGGAAGGGTA...CAGAGTCAGATATCCGGCCCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AAGCTCCTGACCTGGTGCCAGCAGCAGACAGAGGGCTACCAGCATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162538 AAGCTCCTGACCTGGTGCCAGCAGCAGACAGAGGGCTACCAGCATGTCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CGTCACCGACCTGACCACATCCTGGCGCAGTGGGTTGGCCCTGTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162588 CGTCACCGACCTGACCACATCCTGGCGCAGTGGGTTGGCCCTGTGTGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCATCCACCGCTTCCGGCCTGAGCTCAT         CAACTTTGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 162638 TCATCCACCGCTTCCGGCCTGAGCTCATGTG...TAGCAACTTTGACTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TTGAATGAAGATGATGCTGTGGAGAACAACCAGCTCGCATTTGATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164029 TTGAATGAAGATGATGCTGTGGAGAACAACCAGCTCGCATTTGATGTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CGAGCGAGAGTTTGGGATCCCTCCAGTGACCACGGGCAAAGAGATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164079 CGAGCGAGAGTTTGGGATCCCTCCAGTGACCACGGGCAAAGAGATGGCAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CTGCCCAGGAGCCTGACAAGCTCAGCATGGTCATGTACCTCTCCAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164129 CTGCCCAGGAGCCTGACAAGCTCAGCATGGTCATGTACCTCTCCAAGTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TACGAGCTCTTCCGGGGCACCCCACTGAGGCCCGTGG         ATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 164179 TACGAGCTCTTCCGGGGCACCCCACTGAGGCCCGTGGGTA...CAGATTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TTGGCGCAAAAACTATGGAGAAAATGCTGACCTCAGCTTGGCCAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164874 TTGGCGCAAAAACTATGGAGAAAATGCTGACCTCAGCTTGGCCAAATCAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CCATTTCTAATAACTATCTCAACCTCACATTTCCAAGGAAGAGGACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164924 CCATTTCTAATAACTATCTCAACCTCACATTTCCAAGGAAGAGGACTCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CGG         GTGGATGGTCAAACCGGAGAGAATGACATGAACAAACG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164974 CGGGTA...CAGGTGGATGGTCAAACCGGAGAGAATGACATGAACAAACG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GAGACGGAAGGGCTTCACCAACCTGGACGAG         CCTTCAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 174060 GAGACGGAAGGGCTTCACCAACCTGGACGAGGTT...CAGCCTTCAAACT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TTTCCAGCCGTAGCTTGGGCTCCAATCAAGAGTGTGGGAGCAGTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177291 TTTCCAGCCGTAGCTTGGGCTCCAATCAAGAGTGTGGGAGCAGTAAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GGTGGAAATCAGAACAAAGTCAAGTCCATGGCGAATCAGCTGCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177341 GGTGGAAATCAGAACAAAGTCAAGTCCATGGCGAATCAGCTGCTGGCCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GTTTGAGGAGAGCACTCGGAACCCCTCACTCATGAAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 177391 GTTTGAGGAGAGCACTCGGAACCCCTCACTCATGAAGCAGGTG...CAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 AACGCCGTGTCTCAGGGATAGGTAAGCCGGTCCTGTGCTCTTCCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178886 AACGCCGTGTCTCAGGGATAGGTAAGCCGGTCCTGTGCTCTTCCTCCGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CCTCCTGTTCACTCTTGCTGCCCCAAGCCGGAGGAGGCCACACCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178936 CCTCCTGTTCACTCTTGCTGCCCCAAGCCGGAGGAGGCCACACCCAGCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 ATCACCTCCTCTGAAAAGGCAG         TTCCCCTCTGTGGTCGTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 178986 ATCACCTCCTCTGAAAAGGCAGGTA...CAGTTCCCCTCTGTGGTCGTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CGGGGCACGTGCTCAGAGAGCTCAAGCAAGTGTCTGCTGGCAGTGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180078 CGGGGCACGTGCTCAGAGAGCTCAAGCAAGTGTCTGCTGGCAGTGAGTGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CTGAGCAGACCTTGGAGAGCCAGAGCCAAGTCTGACCTACAGCTGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180128 CTGAGCAGACCTTGGAGAGCCAGAGCCAAGTCTGACCTACAGCTGGGTGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GACAGAAAATTTCGCTACCCTGCCTTCTACCCGCCCGAGGGCGCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180178 GACAGAAAATTTCGCTACCCTGCCTTCTACCCGCCCGAGGGCGCAGGCTC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TTTCCGGGGTGCTGTGGCGGCTGCAGCAAGTGGAGGAAAAGATTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180228 TTTCCGGGGTGCTGTGGCGGCTGCAGCAAGTGGAGGAAAAGATTCTCCAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557          AAGAGGGCTCAGAACTTGGCCAACAGGGAATTTCACACAAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180278 GTG...CAGAAGAGGGCTCAGAACTTGGCCAACAGGGAATTTCACACAAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 GAACATTAAGGAGAAGGCGGCTCACCTTGCCTCCATGTTTGGACACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180557 GAACATTAAGGAGAAGGCGGCTCACCTTGCCTCCATGTTTGGACACGGGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 ATTTCCCGCAG         AATAAACTGCTCTCTAAAGGCCTGTCTCAT
        |||||||||||>>>...>>>|||||||| |||||||||||||||||||||
 180607 ATTTCCCGCAGGTA...CAGAATAAACTACTCTCTAAAGGCCTGTCTCAT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 ACTCATCCTCCATCTCCTCCCTCTCGCCTTCCGTCTCCTGATCCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181862 ACTCATCCTCCATCTCCTCCCTCTCGCCTTCCGTCTCCTGATCCAGCTGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TTCTTCCTCTCCATCAACTGTTGACTCTGCTTCTCCTGCCAGAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 181912 TTCTTCCTCTCCATCAACTGTTGACTCTGCTTCTCCTGCCAGAAAGGTA.

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2785      GAAAAGAAGTCACCTTCAGGGTTCCATTTTCATCCCAGCCATTTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181962 ..AAGGAAAAGAAGTCACCTTCAGGGTTCCATTTTCATCCCAGCCATTTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 AGAACAGTGCATCCTCAG         CTGACGGTAGGGAAAGTGTCCAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 187074 AGAACAGTGCATCCTCAGGTG...TAGCTGACGGTAGGGAAAGTGTCCAG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 CGGAATAGGGGCTGCAGCTGAAGTCCTGGTCAATCTGTACATGAATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193511 CGGAATAGGGGCTGCAGCTGAAGTCCTGGTCAATCTGTACATGAATGATC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 ACAGACCTAAGGCCCAGGCCACCTCTCCAGACCTG         GAATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 193561 ACAGACCTAAGGCCCAGGCCACCTCTCCAGACCTGGTA...CAGGAATCT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2962 ATGCGAAAGTCATTTCCCCTTAACCTGGGAGGCAGCGACACGTGTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194636 ATGCGAAAGTCATTTCCCCTTAACCTGGGAGGCAGCGACACGTGTTACTT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 CTGTAAGAAACGTGTGTACGTGATGGAACGGCTGAGCGCCGAGGGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194686 CTGTAAGAAACGTGTGTACGTGATGGAACGGCTGAGCGCCGAGGGCCACT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 TCTTCCACCGGGAGTGTTTCCGCTGCAGCATCTGTGCCACCACCTTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194736 TCTTCCACCGGGAGTGTTTCCGCTGCAGCATCTGTGCCACCACCTTGCGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 CTGGCCGCCTACACCTTTGACTGCGATGAAG         GCAAATTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 194786 CTGGCCGCCTACACCTTTGACTGCGATGAAGGTA...CAGGCAAATTTTA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 CTGCAAGCCTCACTTCATTCACTGTAAAACCAATAGCAAACAACGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196323 CTGCAAGCCTCACTTCATTCACTGTAAAACCAATAGCAAACAACGGAAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 GACGGGCAGAGTTGAAGCAACAAAGAGAG         GAGGAGGCAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 196373 GACGGGCAGAGTTGAAGCAACAAAGAGAGGTA...CAGGAGGAGGCAACA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3244 TGGCAAGAGCAGGAAGCCCCTCGGAGAGACACTCCCACCGAAAGTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197652 TGGCAAGAGCAGGAAGCCCCTCGGAGAGACACTCCCACCGAAAGTTCTTG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3294 CGCAGTGGCCGCCATTGGCACCCTGGAAGGCAGCCCCCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 197702 CGCAGTGGCCGCCATTGGCACCCTGGAAGGCAGCCCCCCAGGTA...CAG

   3550     .    :    .    :    .    :    .
   3335 TTCATTTCAGCCTTCCAGTGCTACACCCACTTCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200325 TTCATTTCAGCCTTCCAGTGCTACACCCACTTCTTGGC