seq1 = pF1KA0740.tfa, 2088 bp
seq2 = pF1KA0740/gi568815588r_60771485.tfa (gi568815588r:60771485_61011542), 240058 bp

>pF1KA0740 2088
>gi568815588r:60771485_61011542 (Chr10)

(complement)

1-192  (100001-100192)   100% ->
193-296  (100553-100656)   100% ->
297-482  (118548-118733)   100% ->
483-1456  (122358-123331)   100% ->
1457-1575  (125313-125431)   100% ->
1576-1726  (133485-133635)   100% ->
1727-1815  (136501-136589)   100% ->
1816-1921  (139253-139358)   100% ->
1922-2088  (139892-140058)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGTGGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGTGGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100151 CCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTA...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  GTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGATGAAGTGAGTGTTTCTCTCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100552 GGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGATGAAGTGAGTGTTTCTCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100602 GGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCAG         GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100652 GGCAGGTA...TAGGTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATCCAGAAATCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118584 TCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATCCAGAAATCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118634 ACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGCTATGCCGACCTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118684 CGCTATGCCGACCTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483          GCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAAAGGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118734 GTA...CAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAAAGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122399 GAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACCAGTTTGGTATCAAGGATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122449 GACCAGTTTGGTATCAAGGATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAGAAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122499 GATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAGAAAGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122549 AGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTCATCAAAATTCCAGAGTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122599 GTCATCAAAATTCCAGAGTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCCTTCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122649 TTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCCTTCAGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122699 AGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTTTATGATCTGTTTTTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122749 TTTTATGATCTGTTTTTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCAGGGGCGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122799 AGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCAGGGGCGGATAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122849 TGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CAGGCCGACCAGTGGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122899 CAGGCCGACCAGTGGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACTTTGACCGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122949 GCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACTTTGACCGGATGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122999 GTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAGCGGATGGGGCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123049 AAGCGGATGGGGCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATACGGGACAACTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123099 AGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATACGGGACAACTGGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123149 AAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATGTTCGATTTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123199 ATGTTCGATTTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGTAAGGAAAGCCAATCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123249 CATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGTAAGGAAAGCCAATCGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGG         ACGTGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123299 TAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGGTG...CAGACGTGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 TTTAAATTGGACGATGGAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125321 TTTAAATTGGACGATGGAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTTGTGGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125371 TAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTTGTGGAAAGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CCAACAGTGAG         GTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 125421 CCAACAGTGAGGTA...CAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ATGCAAGCAGTATTGGATTATCTCTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133515 ATGCAAGCAGTATTGGATTATCTCTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133565 GGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CACACTTGGTTGCACTTGCAG         AACAGCATGCCGTTCAGGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 133615 CACACTTGGTTGCACTTGCAGGTA...CAGAACAGCATGCCGTTCAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGCATTGACGGAGAAGTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136521 TTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGCATTGACGGAGAAGTGCTCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TTACTTGGAATTGGCTCAG         TTTCACAATGCCCACCAGTTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 136571 TTACTTGGAATTGGCTCAGGTT...CAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 CCGCCTGGTGTTTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139275 CCGCCTGGTGTTTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAG         ACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139325 AAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGGTG...CAGACAACCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139899 GGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 AAGATCACTACCAGCGTGTGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139949 AAGATCACTACCAGCGTGTGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 CTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139999 CTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTCATCTCC

   2150     .    :
   2079 AGCAGTGGCC
        ||||||||||
 140049 AGCAGTGGCC