seq1 = pF1KA0739.tfa, 3213 bp
seq2 = pF1KA0739/gi568815586f_51303161.tfa (gi568815586f:51303161_51597175), 294015 bp

>pF1KA0739 3213
>gi568815586f:51303161_51597175 (Chr12)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-211  (137548-137629)   100% ->
212-358  (147716-147862)   100% ->
359-494  (148964-149099)   100% ->
495-655  (150379-150539)   100% ->
656-844  (154191-154379)   100% ->
845-936  (155399-155490)   100% ->
937-1094  (156791-156948)   100% ->
1095-1182  (158044-158131)   100% ->
1183-1329  (159150-159296)   100% ->
1330-1430  (160454-160554)   100% ->
1431-1605  (166454-166628)   100% ->
1606-1739  (167232-167365)   100% ->
1740-1985  (168127-168372)   100% ->
1986-2091  (171182-171287)   99% ->
2092-2253  (171885-172046)   100% ->
2254-2367  (182627-182740)   100% ->
2368-2529  (185539-185700)   100% ->
2530-2781  (186540-186791)   100% ->
2782-2850  (190544-190612)   100% ->
2851-3024  (191785-191958)   100% ->
3025-3213  (193827-194015)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAACAAGAACAACAGCAACAAACTCAGAAGCACTCCTCGCTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAACAAGAACAACAGCAACAAACTCAGAAGCACTCCTCGCTACCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGGAGACCCAGGATACCTAAACTTTACTGAGTTGGGGCCACTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGGGAGACCCAGGATACCTAAACTTTACTGAGTTGGGGCCACTCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAACAGAAGGATCAGTGGAGCCAACAT         AGACCAGATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 CTGAACAGAAGGATCAGTGGAGCCAACATGTG...CAGAGACCAGATGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGCTGTGGTGGATCAGGGTGGGACCAGTACAATTCTCAACATTCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137560 GAAGCTGTGGTGGATCAGGGTGGGACCAGTACAATTCTCAACATTCACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAAAAGAAGAGCTGGAAG         GTCACAGAACTCTGTATGTGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 137610 TGAAAAAGAAGAGCTGGAAGGTA...CAGGTCACAGAACTCTGTATGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGTTCGGATGCCGCTTGGCCGGCAGAGCCATCGGCATCACCGCACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147737 GAGTTCGGATGCCGCTTGGCCGGCAGAGCCATCGGCATCACCGCACTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCCAGAAGCACCGGAGACGAGGGCGGGGCAAAGGAGCCAGCCAGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147787 GGCCAGAAGCACCGGAGACGAGGGCGGGGCAAAGGAGCCAGCCAGGGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAGGCCTGGAAGCCCTGGCCCACG         ACACACCATCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 147837 GGAAGGCCTGGAAGCCCTGGCCCACGGTA...TAGACACACCATCTCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGTTCAGTTCATTCTTGGCACCGAGGAAGATGAAGAGCATGTGCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148979 GTGTTCAGTTCATTCTTGGCACCGAGGAAGATGAAGAGCATGTGCCTCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCTGTTTACAGAGCTGGATGAGATCTGTATGAAAGAGGGAGAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149029 GAGCTGTTTACAGAGCTGGATGAGATCTGTATGAAAGAGGGAGAAGATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGTGGAAGGAAACAGCCAG         GTGGCTGAAGTTTGAAGAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 149079 TGAGTGGAAGGAAACAGCCAGGTG...CAGGTGGCTGAAGTTTGAAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGTTGAAGATGGGGGAGAACGCTGGAGCAAGCCTTATGTGGCAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150399 ATGTTGAAGATGGGGGAGAACGCTGGAGCAAGCCTTATGTGGCAACCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCATTGCACAGCCTGTTTGAGCTAAGGAGCTGCCTTATTAATGGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150449 TCATTGCACAGCCTGTTTGAGCTAAGGAGCTGCCTTATTAATGGAACAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTCCTGGATATGCATGCAAATAGCATAGAAGAAATTTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 150499 CCTCCTGGATATGCATGCAAATAGCATAGAAGAAATTTCAGGTA...CAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCTGATCCTGGATCAGCAAGAACTGTCCAGTGACCTGAATGACAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154191 ACCTGATCCTGGATCAGCAAGAACTGTCCAGTGACCTGAATGACAGCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGGGTTAAAGTGCGGGAAGCCCTTCTCAAAAAGCATCATCATCAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154241 AGGGTTAAAGTGCGGGAAGCCCTTCTCAAAAAGCATCATCATCAGAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAAGAAGAGAAACAACCTCATTCCCATTGTTCGCTCCTTTGCTGAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154291 AAAGAAGAGAAACAACCTCATTCCCATTGTTCGCTCCTTTGCTGAGGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCAAGAAGCAGTCTGATCCTCATTTGATGGATAAACATG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 154341 GCAAGAAGCAGTCTGATCCTCATTTGATGGATAAACATGGTA...TAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAAACCGTGTCTCCTCAGTCTGTTCCAACTACAAATCTTGAAGTAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155401 CAAACCGTGTCTCCTCAGTCTGTTCCAACTACAAATCTTGAAGTAAAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGGAGTGAATTGTGAACATAGTCCTGTGGATTTAAGCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 155451 TGGAGTGAATTGTGAACATAGTCCTGTGGATTTAAGCAAGGTG...CAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TAGACCTTCATTTCATGAAAAAAATTCCTACTGGGGCCGAGGCCTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156792 TAGACCTTCATTTCATGAAAAAAATTCCTACTGGGGCCGAGGCCTCCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTCCTGGTTGGAGAGGTGGATATTTTGGACCGTCCCATTGTTGCCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156842 GTCCTGGTTGGAGAGGTGGATATTTTGGACCGTCCCATTGTTGCCTTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAGGCTGTCTCCAGCTGTTCTTCTCTCAGGCCTAACAGAAGTGCCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156892 GAGGCTGTCTCCAGCTGTTCTTCTCTCAGGCCTAACAGAAGTGCCAATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CAACAAG         ATTTTTGTTTATCTTATTGGGTCCAGTAGGGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156942 CAACAAGGTA...CAGATTTTTGTTTATCTTATTGGGTCCAGTAGGGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGTCAGCAGTACCATGAGATTGGCAGATCCATGGCCACCATCATGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158078 GGTCAGCAGTACCATGAGATTGGCAGATCCATGGCCACCATCATGACAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGAG         ATTTTTCATGACGTAGCATATAAGGCAAAAGAGCGAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158128 TGAGGTA...TAGATTTTTCATGACGTAGCATATAAGGCAAAAGAGCGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ATGATCTCCTGGCGGGGATTGATGAGTTCCTAGACCAGGTGACGGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159187 ATGATCTCCTGGCGGGGATTGATGAGTTCCTAGACCAGGTGACGGTGCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCTCCAGGAGAGTGGGATCCCTCCATTAGAATTGAGCCACCCAAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159237 CCTCCAGGAGAGTGGGATCCCTCCATTAGAATTGAGCCACCCAAAAATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CCCTTCCCAG         GAGAAAAGGAAAATGCCTGGAGTTCCAAATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 159287 CCCTTCCCAGGTA...AAGGAGAAAAGGAAAATGCCTGGAGTTCCAAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAAATGTTTGCCACATAGAACAGGAACCACATGGGGGTCACAGTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160485 GAAATGTTTGCCACATAGAACAGGAACCACATGGGGGTCACAGTGGGCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GAACTTCAGCGCACTGGGCG         GCTATTTGGGGGCTTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 160535 GAACTTCAGCGCACTGGGCGGTA...CAGGCTATTTGGGGGCTTGGTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGACATCAAGCGGAAGGCCCCCTGGTACTGGAGCGACTACCGAGATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166475 GGACATCAAGCGGAAGGCCCCCTGGTACTGGAGCGACTACCGAGATGCAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCAGCTTACAGTGTTTGGCTTCCTTTCTGTTCCTGTACTGTGCCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166525 TCAGCTTACAGTGTTTGGCTTCCTTTCTGTTCCTGTACTGTGCCTGCATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TCACCTGTCATCACCTTTGGGGGACTGCTTGGAGAAGCCACTGAGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166575 TCACCTGTCATCACCTTTGGGGGACTGCTTGGAGAAGCCACTGAGGGACG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CATA         AGTGCAATTGAATCCTTGTTTGGAGCTTCCATGACTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166625 CATAGTA...CAGAGTGCAATTGAATCCTTGTTTGGAGCTTCCATGACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGATTGCTTATTCCTTGTTTGCGGGACAGGCTCTCACCATCCTGGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167269 GGATTGCTTATTCCTTGTTTGCGGGACAGGCTCTCACCATCCTGGGAAGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ACTGGACCAGTGCTTGTGTTTGAAAAGATTTTGTTCAAATTCTGCAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 167319 ACTGGACCAGTGCTTGTGTTTGAAAAGATTTTGTTCAAATTCTGCAAGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1740       AGACTATGCTCTTTCATACCTCTCCCTGCGAGCTTGTATTGGAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167369 ...CAGAGACTATGCTCTTTCATACCTCTCCCTGCGAGCTTGTATTGGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TGTGGACCGCTTTCCTGTGTATTGTCCTTGTGGCAACTGATGCCAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168171 TGTGGACCGCTTTCCTGTGTATTGTCCTTGTGGCAACTGATGCCAGTTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CTTGTCTGCTACATTACCCGTTTCACTGAAGAAGCATTTGCCTCCCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168221 CTTGTCTGCTACATTACCCGTTTCACTGAAGAAGCATTTGCCTCCCTAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TTGCATTATTTTCATCTATGAAGCAATAGAAAAACTGATTCACCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168271 TTGCATTATTTTCATCTATGAAGCAATAGAAAAACTGATTCACCTGGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGACCTACCCCATCCACATGCACAGCCAGCTGGACCACCTTAGCCTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168321 AGACCTACCCCATCCACATGCACAGCCAGCTGGACCACCTTAGCCTCTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 TA         CTGCAGGTGTACTCTGCCAGAGAATCCAAACAATCACAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168371 TAGTA...CAGCTGCAGGTGTACTCTGCCAGAGAATCCAAACAATCACAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TCTCCAGTACTGGAAGGACCACAACATCGTGACAGCAGAAGTCCACTGGG
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171221 CCTCCAGTACTGGAAGGACCACAACATCGTGACAGCAGAAGTCCACTGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CTAACCTGACTGTCAGT         GAATGCCAGGAGATGCATGGAGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 171271 CTAACCTGACTGTCAGTGTA...CAGGAATGCCAGGAGATGCATGGAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 TTCATGGGATCTGCGTGCGGCCATCATGGACCCTACACTCCTGATGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171909 TTCATGGGATCTGCGTGCGGCCATCATGGACCCTACACTCCTGATGTCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTTTTGGTCCTGTATTCTCTTTTTCACCACCTTCATCCTCTCAAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171959 CTTTTGGTCCTGTATTCTCTTTTTCACCACCTTCATCCTCTCAAGCACCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TAAAGACGTTTAAGACGAGCCGTTATTTCCCAACCAGA         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 172009 TAAAGACGTTTAAGACGAGCCGTTATTTCCCAACCAGAGTA...CAGGTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CGCTCCATGGTGAGTGACTTTGCTGTTTTCCTCACTATCTTCACAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182630 CGCTCCATGGTGAGTGACTTTGCTGTTTTCCTCACTATCTTCACAATGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GATTATTGATTTTTTGATTGGAGTCCCATCACCAAAGCTTCAAGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182680 GATTATTGATTTTTTGATTGGAGTCCCATCACCAAAGCTTCAAGTTCCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 GTGTGTTCAAG         CCAACAAGGGATGATCGCGGATGGATTATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 182730 GTGTGTTCAAGGTA...TAGCCAACAAGGGATGATCGCGGATGGATTATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AATCCCATTGGCCCCAATCCCTGGTGGACTGTGATAGCTGCAATTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185569 AATCCCATTGGCCCCAATCCCTGGTGGACTGTGATAGCTGCAATTATCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 AGCTCTTCTCTGTACTATCTTGATATTCATGGATCAGCAGATCACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185619 AGCTCTTCTCTGTACTATCTTGATATTCATGGATCAGCAGATCACAGCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TCATTATTAACAGGAAGGAACATAAGCTCAAG         AAAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 185669 TCATTATTAACAGGAAGGAACATAAGCTCAAGGTA...CAGAAAGGCTGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 GGCTACCACCTGGACCTACTGATGGTGGCCATCATGCTGGGTGTCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186549 GGCTACCACCTGGACCTACTGATGGTGGCCATCATGCTGGGTGTCTGCTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CATCATGGGCCTGCCCTGGTTTGTAGCTGCAACTGTCTTGTCCATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186599 CATCATGGGCCTGCCCTGGTTTGTAGCTGCAACTGTCTTGTCCATCACAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 ATGTGAACAGCCTCAAGCTAGAATCTGAATGCTCTGCTCCTGGAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186649 ATGTGAACAGCCTCAAGCTAGAATCTGAATGCTCTGCTCCTGGAGAACAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 CCCAAGTTCCTGGGCATCCGAGAACAGAGAGTGACAGGCCTTATGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186699 CCCAAGTTCCTGGGCATCCGAGAACAGAGAGTGACAGGCCTTATGATCTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TGTGCTGATGGGCTGCTCAGTCTTCATGACGGCTATCTTAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 186749 TGTGCTGATGGGCTGCTCAGTCTTCATGACGGCTATCTTAAAGGTA...C

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2782   TTTATTCCAATGCCAGTACTCTACGGAGTTTTCCTTTACATGGGAGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190542 AGTTTATTCCAATGCCAGTACTCTACGGAGTTTTCCTTTACATGGGAGTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 TCTTCACTACAGGGAATTCAG         TTCTTTGATCGTCTAAAGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 190592 TCTTCACTACAGGGAATTCAGGTA...CAGTTCTTTGATCGTCTAAAGCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 CTTTGGGATGCCCGCAAAGCACCAGCCAGATTTCATCTACCTGCGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191805 CTTTGGGATGCCCGCAAAGCACCAGCCAGATTTCATCTACCTGCGGCATG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 TGCCGCTGCGCAAAGTGCACCTCTTCACCCTCATCCAGTTGACCTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191855 TGCCGCTGCGCAAAGTGCACCTCTTCACCCTCATCCAGTTGACCTGTCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 GTCCTGCTCTGGGTCATCAAGGCATCTCCAGCTGCCATTGTTTTCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191905 GTCCTGCTCTGGGTCATCAAGGCATCTCCAGCTGCCATTGTTTTCCCAAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GATG         GTTTTGGCCTTGGTCTTTGTCAGGAAAGTCATGGATC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191955 GATGGTG...CAGGTTTTGGCCTTGGTCTTTGTCAGGAAAGTCATGGATC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 TCTGTTTCTCTAAGCGAGAGCTGAGCTGGCTAGATGATCTCATGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193864 TCTGTTTCTCTAAGCGAGAGCTGAGCTGGCTAGATGATCTCATGCCTGAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 AGCAAAAAGAAGAAGTTGGATGATGCCAAAAAGAAGGCCAAGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193914 AGCAAAAAGAAGAAGTTGGATGATGCCAAAAAGAAGGCCAAGGAGGAAGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 GGTCATAGTCCTTGCACCAACTGTATACCTGGGGGCCTCAAATTACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193964 GGTCATAGTCCTTGCACCAACTGTATACCTGGGGGCCTCAAATTACAGAA

   3400 
   3212 CA
        ||
 194014 CA