seq1 = pF1KA0737.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KA0737/gi568815584f_21377494.tfa (gi568815584f:21377494_21596603), 219110 bp

>pF1KA0737 1863
>gi568815584f:21377494_21596603 (Chr14)

1-75  (99997-100071)   96% ->
76-318  (109958-110200)   100% ->
319-579  (111097-111357)   100% ->
580-810  (111680-111910)   100% ->
811-891  (114803-114883)   100% ->
892-1641  (115015-115764)   99% ->
1642-1805  (117736-117899)   100% ->
1806-1863  (119053-119110)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTTTCCCGGAGGAAATGACAATTACCTGACGATCACAGGGCCTTC
         |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 TTCCAGTTTCCCGGAGGAAATGACAATTACCTGACGATCACAGGGCCTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACCCCTTCCTGTCAGGGGCCGAG         ACATTCCATACACCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100047 GCACCCCTTCCTGTCAGGGGCCGAGGTG...CAGACATTCCATACACCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTTGGGTGATGAGGAATTTGAAATCCCACCTATCTCCTTGGATTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109974 GCTTGGGTGATGAGGAATTTGAAATCCCACCTATCTCCTTGGATTCTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTCATTGGCTGTCTCAGATGTGGTTGGCCACTTTGATGACCTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110024 CCCTCATTGGCTGTCTCAGATGTGGTTGGCCACTTTGATGACCTGGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTTCCTCTTCACAGGATGGCAGTTTTTCAGCCCAGTATGGGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110074 CCCTTCCTCTTCACAGGATGGCAGTTTTTCAGCCCAGTATGGGGTCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTGGACATGCCTGTGGGCATGACCCATGGCTTGATGGAGCAGGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110124 CATTGGACATGCCTGTGGGCATGACCCATGGCTTGATGGAGCAGGGCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGCTCCTGAGTGGGGGCTTGACCATG         GACTTGGACCACTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 110174 GGGCTCCTGAGTGGGGGCTTGACCATGGTA...CAGGACTTGGACCACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TATAGGAACTCAGTATAGTGCCAACCCACCTGTTACAATTGATGTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111111 TATAGGAACTCAGTATAGTGCCAACCCACCTGTTACAATTGATGTACCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGACAGACATGACATCTGGCTTGATGGGGCATAGCCAGTTGACCACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111161 TGACAGACATGACATCTGGCTTGATGGGGCATAGCCAGTTGACCACCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATCAGTCAGAACTGAGTTCCCAGCTGGGTTTGAGCCTAGGGGGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111211 GATCAGTCAGAACTGAGTTCCCAGCTGGGTTTGAGCCTAGGGGGTGGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCCTGCCACCTGCCCAGTCACCTGAAGATCGTCTTTCAACCACCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111261 CATCCTGCCACCTGCCCAGTCACCTGAAGATCGTCTTTCAACCACCCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CACCTACTAGTTCACTTCACGAGGATGGTGTTGAGGATTTCCGGAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111311 CACCTACTAGTTCACTTCACGAGGATGGTGTTGAGGATTTCCGGAGGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    580       CAACTTCCCAGCCAGAAGACAGTCGTGGTGGAAGCAGGGAAAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111361 ...CAGCAACTTCCCAGCCAGAAGACAGTCGTGGTGGAAGCAGGGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCAGAAGGCCCCAAAGAAGAGAAAAAAGAAAGATCCTAATGAACCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111724 GCAGAAGGCCCCAAAGAAGAGAAAAAAGAAAGATCCTAATGAACCTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AACCAGTTTCAGCATATGCTTTATTCTTTCGTGATACACAGGCTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111774 AACCAGTTTCAGCATATGCTTTATTCTTTCGTGATACACAGGCTGCCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAGGGACAGAATCCTAATGCCACTTTTGGTGAGGTTTCAAAAATTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111824 AAGGGACAGAATCCTAATGCCACTTTTGGTGAGGTTTCAAAAATTGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTCCATGTGGGATAGTCTTGGAGAGGAGCAAAAACAG         GTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111874 CTCCATGTGGGATAGTCTTGGAGAGGAGCAAAAACAGGTG...CAGGTAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATAAGAGGAAAACTGAGGCTGCCAAGAAAGAGTATCTGAAGGCACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114807 ATAAGAGGAAAACTGAGGCTGCCAAGAAAGAGTATCTGAAGGCACTGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCTTACAAAGACAACCAGGAGTGTCAG         GCCACTGTGGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114857 GCTTACAAAGACAACCAGGAGTGTCAGGTA...TAGGCCACTGTGGAAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGTGGAATTGGATCCAGCACCACCATCACAAACTCCTTCTCCACCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115029 AGTGGAATTGGATCCAGCACCACCATCACAAACTCCTTCTCCACCTCCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGCTACTGTTGACCCAGCATCTCCAGCACCAGCTTCAATAGAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115079 TGGCTACTGTTGACCCAGCATCTCCAGCACCAGCTTCAATAGAGCCCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCCCTGTCCCCATCCATTGTTGTTAACTCCACCCTCTCATCCTATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 115129 GCCCTGTCCCCATCCATTGTTGTTAACTCCACCCTTTCATCCTATGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AAACCAGGCATCTTCTGGAGCTGGGGGTCAGCCCAATATCACCAAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115179 AAACCAGGCATCTTCTGGAGCTGGGGGTCAGCCCAATATCACCAAGTTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TTATTACCAAACAAATGTTGCCCTCTTCTATTACTATGTCTCAAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115229 TTATTACCAAACAAATGTTGCCCTCTTCTATTACTATGTCTCAAGGAGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 ATGGTTACTGTTATCCCAGCCACAGTGGTGACCTCCCGAGGGCTCCAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 115279 ATGGTTACTGTTATCCCAGCCACAGTGGTGACCTCCCGGGGGCTCCAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AGGCCAAACCAGTACAGCTACTATCCAGCCCAGTCAACAAGCCCAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115329 AGGCCAAACCAGTACAGCTACTATCCAGCCCAGTCAACAAGCCCAGATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCACTCGGTCAGTGTTGCAGGCAGCAGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115379 TCACTCGGTCAGTGTTGCAGGCAGCAGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ATGCAACTGCCTCCACCCCGACTACAGCCCCCTCCATTACAACAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115429 ATGCAACTGCCTCCACCCCGACTACAGCCCCCTCCATTACAACAGATGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 ACAGCCCCCGACTCAGCAGCAAGTTACCATTCTGCAGCAGCCTCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115479 ACAGCCCCCGACTCAGCAGCAAGTTACCATTCTGCAGCAGCCTCCTCCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCCAGGCCATGCAACAGCCTCCACCTCAGAAAGTTCGAATCAATTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115529 TCCAGGCCATGCAACAGCCTCCACCTCAGAAAGTTCGAATCAATTTACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CAACAGCCTCCTCCTCTGCAGATCAAGAGTGTGCCTCTACCCACTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115579 CAACAGCCTCCTCCTCTGCAGATCAAGAGTGTGCCTCTACCCACTTTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AATGCAGACTACCTTAGTCCCACCAACTGTGGAAAGTAGTCCTGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115629 AATGCAGACTACCTTAGTCCCACCAACTGTGGAAAGTAGTCCTGAGCGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 CTATGAACAACAGCCCTGAGGCCCATACAGTGGAGGCACCTTCTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115679 CTATGAACAACAGCCCTGAGGCCCATACAGTGGAGGCACCTTCTCCTGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ACTATCTGTGAGATGATCACAGATGTAGTTCCTGAG         GTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115729 ACTATCTGTGAGATGATCACAGATGTAGTTCCTGAGGTG...CAGGTTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GTCTCCTTCTCAGATGGATGTTGAATTGGTGAGTGGGTCTCCTGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117741 GTCTCCTTCTCAGATGGATGTTGAATTGGTGAGTGGGTCTCCTGTGGCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TCTCACCCCAGCCTCGATGTGTGAGGTCTGGTTGTGAGAACCCTCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117791 TCTCACCCCAGCCTCGATGTGTGAGGTCTGGTTGTGAGAACCCTCCCATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GTGAGTAAGGACTGGGACAATGAATACTGCAGCAATGAGTGTGTGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117841 GTGAGTAAGGACTGGGACAATGAATACTGCAGCAATGAGTGTGTGGTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 GCACTGCAG         GGATGTATTCTTGGCCTGGGTAGCCTCTAGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 117891 GCACTGCAGGTG...TAGGGATGTATTCTTGGCCTGGGTAGCCTCTAGAA

   1900     .    :    .    :    .
   1838 ATTCAAACACAGTGGTGTTTGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 119085 ATTCAAACACAGTGGTGTTTGTGAAA