seq1 = pF1KA0721.tfa, 1242 bp
seq2 = pF1KA0721/gi568815592r_116152767.tfa (gi568815592r:116152767_116354008), 201242 bp

>pF1KA0721 1242
>gi568815592r:116152767_116354008 (Chr6)

(complement)

1-1242  (100001-101242)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGCCTGGATGGGGGCAACAAGCTCCCTCTCGCCCAAACCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGCCTGGATGGGGGCAACAAGCTCCCTCTCGCCCAAACCGGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCTGCTCCCGACCATGCCTCAGGAGATCCGGACCGAGACCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGCTGCTCCCGACCATGCCTCAGGAGATCCGGACCGAGACCAGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGGCTCCGTGAAGAAACCGAGGCGACACAGGTGATGGCGAACACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGGCTCCGTGAAGAAACCGAGGCGACACAGGTGATGGCGAACACAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGGGCAGCCTGGAGACCGTTGCGGAGGGGGGTGCATCCCAGGATCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGGGCAGCCTGGAGACCGTTGCGGAGGGGGGTGCATCCCAGGATCCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACTGTGGCCCCGCGCTCCGCGTCCCAGTTGCCGGGAGTCGCGGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACTGTGGCCCCGCGCTCCGCGTCCCAGTTGCCGGGAGTCGCGGCGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGCGACCAAAGCCGGGCAGGAGGATGCTCCACCTTCTACGAAAGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGCGACCAAAGCCGGGCAGGAGGATGCTCCACCTTCTACGAAAGGTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAGCAGCCTCTGCCGCCGAGGCTGCTGACAGCAGCCAGAAAAATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAGCAGCCTCTGCCGCCGAGGCTGCTGACAGCAGCCAGAAAAATGGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGCTTGGAGAGCCCCGTGGCCCTGCTGGGCAGAAGGCTCTAGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCAGCTTGGAGAGCCCCGTGGCCCTGCTGGGCAGAAGGCTCTAGAAGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGGCGCAGGGGGCTTGGGGTCTCAGATGATACCGGGGAAGAAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGGCGCAGGGGGCTTGGGGTCTCAGATGATACCGGGGAAGAAGGCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAGTGACGACTAAAAAACGCGCCATCTCGGCAGCAGTGGAAAAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAGTGACGACTAAAAAACGCGCCATCTCGGCAGCAGTGGAAAAGGAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAGCAGGGGCGGCGATGGAGGAAAAGAAGGTAGTGCAGAAGGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAGCAGGGGCGGCGATGGAGGAAAAGAAGGTAGTGCAGAAGGAAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGTGGCAGGAGGGGTGAAAGAGGAGACACGGCCCAGGGCCCCGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGTGGCAGGAGGGGTGAAAGAGGAGACACGGCCCAGGGCCCCGAAGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATAACTGCATGGACTCACTGGAGGCCATCGATCAAGAGTTGTCAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATAACTGCATGGACTCACTGGAGGCCATCGATCAAGAGTTGTCAAACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAATGCCCAGGCTGACAGGGCCTTCCTTCAGCTTGAGCGCAAGTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAATGCCCAGGCTGACAGGGCCTTCCTTCAGCTTGAGCGCAAGTTTGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATGCGAAGGCTCCACATGCAGCGCAGAAGTTTCATTATCCAGAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATGCGAAGGCTCCACATGCAGCGCAGAAGTTTCATTATCCAGAATATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCAGGTTTCTGGGTTACTGCCTTTCGAAACCACCCCCAGCTGTCACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCAGGTTTCTGGGTTACTGCCTTTCGAAACCACCCCCAGCTGTCACCTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATCAGTGGCCAAGATGAAGACATGCTGAGGTACATGATCAATTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATCAGTGGCCAAGATGAAGACATGCTGAGGTACATGATCAATTTGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGAGGAGCTTAAACACCCCAGAGCAGGCTGCAAATTCAAGTTCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGAGGAGCTTAAACACCCCAGAGCAGGCTGCAAATTCAAGTTCATCTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGGGCAACCCCTACTTCCGAAATGAGGGGCTTGTCAAGGAATATGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGGGCAACCCCTACTTCCGAAATGAGGGGCTTGTCAAGGAATATGAACG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGATCCTCTGGCCGGGTGGTGTCTCTTTCCACTCCAATCCGCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGATCCTCTGGCCGGGTGGTGTCTCTTTCCACTCCAATCCGCTGGCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAGGCCAAGACCCCCAGGCTCATATCCACAGAAACCGGGAAGGGAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAGGCCAAGACCCCCAGGCTCATATCCACAGAAACCGGGAAGGGAACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATCCCTAGTTTCTTCAACTGGTTTTCAGACCACAGCCTTCTAGAATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATCCCTAGTTTCTTCAACTGGTTTTCAGACCACAGCCTTCTAGAATTCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAGAATTGCAGAGATTATCAAAGGAGAACTGTGGCCCAATCCCCTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAGAATTGCAGAGATTATCAAAGGAGAACTGTGGCCCAATCCCCTACAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACTACCTGATGGGTGAAGGGCCCCGTAGAGGAATTCGAGGCCCACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACTACCTGATGGGTGAAGGGCCCCGTAGAGGAATTCGAGGCCCACCAAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CAGCCAGTGGAGAGCGCCAGATCCTTCAGGTTCCAGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CAGCCAGTGGAGAGCGCCAGATCCTTCAGGTTCCAGTCTGGC