seq1 = pF1KA0720.tfa, 3186 bp
seq2 = pF1KA0720/gi568815597r_6367824.tfa (gi568815597r:6367824_6596570), 228747 bp

>pF1KA0720 3186
>gi568815597r:6367824_6596570 (Chr1)

(complement)

1-81  (100000-100078)   97% ->
82-211  (118913-119042)   100% ->
212-317  (120535-120640)   100% ->
318-378  (121049-121109)   100% ->
379-470  (121433-121524)   100% ->
471-607  (121984-122120)   100% ->
608-759  (122407-122558)   100% ->
760-963  (123117-123320)   99% ->
964-1152  (123397-123585)   100% ->
1153-1248  (123949-124044)   100% ->
1249-1299  (124763-124813)   100% ->
1300-1449  (124934-125083)   100% ->
1450-1560  (125471-125581)   100% ->
1561-1710  (125687-125836)   100% ->
1711-1848  (125928-126065)   100% ->
1849-1968  (126216-126335)   100% ->
1969-2101  (126895-127027)   100% ->
2102-2217  (127121-127236)   100% ->
2218-2417  (127330-127529)   100% ->
2418-3186  (127985-128752)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGACCAGAGCCCCGCTGAAAAGAAGGGACTGCGCTGTCAGAACCC
        |-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A G ACGACCAGAGCCCCGCTGAAAAGAAGGGACTGCGCTGTCAGAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCTGCATGGACAAGGGGCGGGCGGCCAAG         GTATGTCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100048 CGCCTGCATGGACAAGGGGCGGGCGGCCAAGGTA...CAGGTATGTCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGCCGACTGCCAGCAGCTGCACCGCCGGGGGCCCCTCAACCTCTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118923 ACGCCGACTGCCAGCAGCTGCACCGCCGGGGGCCCCTCAACCTCTGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCTGTGACAGCAAGTTCCACAGCACCATGCATTATGATGGGCATGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118973 GCCTGTGACAGCAAGTTCCACAGCACCATGCATTATGATGGGCATGTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCGACCTTCCCCCACAAG         GCTCTGTGCTGGCCCGGAACG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 119023 CTTCGACCTTCCCCCACAAGGTG...AAGGCTCTGTGCTGGCCCGGAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTCCACCCGGTCATGCCCGCCGCGCACCAGCCCCGCAGTGGACTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120556 TGTCCACCCGGTCATGCCCGCCGCGCACCAGCCCCGCAGTGGACTTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGAGGAGGAGGAGAGCTCTGTGGATGGCAAAGG         GGACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 120606 GAGGAGGAGGAGGAGAGCTCTGTGGATGGCAAAGGGTA...CAGGGACCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGAGCACAGGCCTGAAACTCTCCAAGAAGAAAGCAAGGAGGAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121055 GAAGAGCACAGGCCTGAAACTCTCCAAGAAGAAAGCAAGGAGGAGACACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGAT         GACCCAAGCAAGGAATGCTTCACTCTGAAATTTGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121105 CGGATGTG...CAGGACCCAAGCAAGGAATGCTTCACTCTGAAATTTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGAATGTGGACATTGAGACAGAGATCGTCCCAGCCATGAAGAAGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121469 CTGAATGTGGACATTGAGACAGAGATCGTCCCAGCCATGAAGAAGAAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACTGGG         GGAGGTGCTGCTGCCTGTATTTGAAAGGAAGGGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121519 ACTGGGGTA...CAGGGAGGTGCTGCTGCCTGTATTTGAAAGGAAGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGCGCTGGGCAAAGTGGACATCTACCTGGACCAGTCCAACACACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122019 TTGCGCTGGGCAAAGTGGACATCTACCTGGACCAGTCCAACACACCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCCCTCACCTTCGAGGCCTACAGGTTCGGGGGACACTACCTTCGTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122069 TCCCTCACCTTCGAGGCCTACAGGTTCGGGGGACACTACCTTCGTGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AG         CCCCAGCCAAGCCTGGAGATGAGGGCAAGGTGGAGCAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122119 AGGTG...CAGCCCCAGCCAAGCCTGGAGATGAGGGCAAGGTGGAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCATGAAGGACTCCAAGTCCCTGAGTTTGCCGATTCTGCGGCCAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122446 GCATGAAGGACTCCAAGTCCCTGAGTTTGCCGATTCTGCGGCCAGCTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACCGGGCCCCCCGCCCTGGAGCGTGTGGACGCCCAGAGCCGCCGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122496 ACCGGGCCCCCCGCCCTGGAGCGTGTGGACGCCCAGAGCCGCCGGGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTGGACATCTTG         GCCCCTGGCCGCCGCCGCAAGAACATGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 122546 CCTGGACATCTTGGTG...CAGGCCCCTGGCCGCCGCCGCAAGAACATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CGGAGTTCCTGGGGGAGGCGAGCATCCCCGGGCAGGAGCCCCCCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123145 CGGAGTTCCTGGGGGAGGCGAGCATCCCCGGGCAGGAGCCCCCCACGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCCAGCTGCTCTCTGCCCAGCGGCAGCAGTGGCAGCACCAACAGTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 123195 TCCAGCTGCTCTCTGCCCAGCGGCAGCAGTGGCAGCACCAACACTGGCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAGCTGGAAGAACCGGGCGGCCAGTCGCTTCAGCGGCTTTTTCAGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123245 CAGCTGGAAGAACCGGGCGGCCAGTCGCTTCAGCGGCTTTTTCAGCTCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCCCCAGCACCAGCGCCTTTGGCCGG         GAGGTAGACAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 123295 GCCCCAGCACCAGCGCCTTTGGCCGGGTA...CAGGAGGTAGACAAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGCAGCTGGAGGGCAAGCTGCACACCTACAGCCTCTTCGGGCTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123412 GAGCAGCTGGAGGGCAAGCTGCACACCTACAGCCTCTTCGGGCTGCCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCTGCCCCGGGGGCTGCGCTTCGACCATGACTCCTGGGAGGAGGAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123462 GCTGCCCCGGGGGCTGCGCTTCGACCATGACTCCTGGGAGGAGGAGTACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATGAAGACGAGGATGAGGACAATGCCTGCCTGAGGCTGGAGGACAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123512 ATGAAGACGAGGATGAGGACAATGCCTGCCTGAGGCTGGAGGACAGCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGGGAGCTCATTGATGGGCATGAG         AAGCTGACCCGGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 123562 CGGGAGCTCATTGATGGGCATGAGGTG...TAGAAGCTGACCCGGCGGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTGCCACCAGCAGGAGGCGGTGTGGGAGCTGCTGCACACGGAGGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123966 GTGCCACCAGCAGGAGGCGGTGTGGGAGCTGCTGCACACGGAGGCCTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACATCAGGAAACTGCGGGTGATCATCAAC         CTGTTCCTGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124016 ACATCAGGAAACTGCGGGTGATCATCAACGTG...CAGCTGTTCCTGTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TGCCTCCTGAACCTGCAAGAGTCAGGGCTGCTGTGTGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 124775 TGCCTCCTGAACCTGCAAGAGTCAGGGCTGCTGTGTGAGGTG...CAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGAGGCGGAGCGCCTGTTCAGCAACATCCCGGAGATCGCGCAGCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124936 GGAGGCGGAGCGCCTGTTCAGCAACATCCCGGAGATCGCGCAGCTGCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GCAGGCTGTGGGCTAGCGTGATGGCGCCGGTGCTGGAGAAGGCGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124986 GCAGGCTGTGGGCTAGCGTGATGGCGCCGGTGCTGGAGAAGGCGCGGCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACGCGAGCGCTGCTACAGCCCGGGGACTTCCTCAAAGGCTTCAAGATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 125036 ACGCGAGCGCTGCTACAGCCCGGGGACTTCCTCAAAGGCTTCAAGATGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1450        TTCGGCTCGCTCTTCAAGCCCTACATCCGCTACTGCATGGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125086 A...CAGTTCGGCTCGCTCTTCAAGCCCTACATCCGCTACTGCATGGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AGGAGGGCTGCATGGAGTACATGCGCGGCCTGCTGCGCGACAACGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125514 AGGAGGGCTGCATGGAGTACATGCGCGGCCTGCTGCGCGACAACGACCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TTCCGGGCCTACATCACG         TGGGCGGAGAAGCACCCACAGTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 125564 TTCCGGGCCTACATCACGGTG...CAGTGGGCGGAGAAGCACCCACAGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CCAGAGGCTGAAGCTGAGCGACATGCTGGCCAAACCCCACCAGCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125710 CCAGAGGCTGAAGCTGAGCGACATGCTGGCCAAACCCCACCAGCGGCTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CCAAGTACCCGCTGCTGCTCAAGTCGGTGCTGAGGAAGACCGAGGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125760 CCAAGTACCCGCTGCTGCTCAAGTCGGTGCTGAGGAAGACCGAGGAGCCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CGCGCCAAGGAGGCCGTCGTCGCCATG         ATCGGCTCCGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125810 CGCGCCAAGGAGGCCGTCGTCGCCATGGTA...TAGATCGGCTCCGTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GCGCTTCATCCACCACGTGAACGCGTGCATGCGGCAGCGGCAGGAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125942 GCGCTTCATCCACCACGTGAACGCGTGCATGCGGCAGCGGCAGGAGCGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AGCGGCTGGCGGCCGTGGTGAGCCGCATCGACGCCTACGAGGTGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125992 AGCGGCTGGCGGCCGTGGTGAGCCGCATCGACGCCTACGAGGTGGTGGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AGCAGCAGCGACGAAGTGGACAAG         CTCCTGAAGGAATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 126042 AGCAGCAGCGACGAAGTGGACAAGGTG...CAGCTCCTGAAGGAATTTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GCACCTGGACTTGACAGCGCCCATCCCTGGCGCCTCCCCGGAGGAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126233 GCACCTGGACTTGACAGCGCCCATCCCTGGCGCCTCCCCGGAGGAGACGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GGCAGCTGCTGCTGGAGGGGAGCCTGAGGATGAAGGAGGGGAAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126283 GGCAGCTGCTGCTGGAGGGGAGCCTGAGGATGAAGGAGGGGAAGGACAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AAG         ATGGATGTGTACTGCTTCCTCTTCACGGATCTGCTGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126333 AAGGTG...CAGATGGATGTGTACTGCTTCCTCTTCACGGATCTGCTGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GGTGACCAAAGCAGTGAAGAAGGCAGAGAGGACCAGGGTCATCAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126933 GGTGACCAAAGCAGTGAAGAAGGCAGAGAGGACCAGGGTCATCAGGCCAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CCCTGCTCGTGGACAAGATTGTGTGCCGGGAGCTACGGGACCCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 126983 CCCTGCTCGTGGACAAGATTGTGTGCCGGGAGCTACGGGACCCTGGTA..

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102     GGTCCTTCCTCCTTATCTACCTGAATGAGTTTCACAGTGCTGTAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127033 .CAGGGTCCTTCCTCCTTATCTACCTGAATGAGTTTCACAGTGCTGTAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GGCCTACACGTTCCAGGCCAGTGGCCAGGCCTTGTGCCGTGGCTGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127167 GGCCTACACGTTCCAGGCCAGTGGCCAGGCCTTGTGCCGTGGCTGGGTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 ACACCATTTACAATGCCCAG         AACCAGCTGCAACAGCTGCGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 127217 ACACCATTTACAATGCCCAGGTG...CAGAACCAGCTGCAACAGCTGCGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GCACAGGAGCCCCCAGGCAGTCAGCAGCCCCTGCAGAGCCTGGAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127351 GCACAGGAGCCCCCAGGCAGTCAGCAGCCCCTGCAGAGCCTGGAAGAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GGAGGATGAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127401 GGAGGATGAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 GCGAGGACAGTGGCACTTCAGCTGCCAGCTCCCCTACCATCATGCGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127451 GCGAGGACAGTGGCACTTCAGCTGCCAGCTCCCCTACCATCATGCGGAAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 AGCAGCGGCAGCCCCGACTCTCAGCACTG         TGCCTCAGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 127501 AGCAGCGGCAGCCCCGACTCTCAGCACTGGTA...CAGTGCCTCAGATGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 CTCCACGGAGACCCTGGCCATGGTTGTGGTAGAGCCTGGGGACACGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127997 CTCCACGGAGACCCTGGCCATGGTTGTGGTAGAGCCTGGGGACACGCTGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 CCTCCCCCGAGTTCGACAGCGGTCCTTTCAGCTCCCAGTCTGATGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128047 CCTCCCCCGAGTTCGACAGCGGTCCTTTCAGCTCCCAGTCTGATGAGACC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 TCTCTCAGCACCACTGCCTCATCTGCCACGCCCACCAGTGAGCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128097 TCTCTCAGCACCACTGCCTCATCTGCCACGCCCACCAGTGAGCTGCTGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCTGGGTCCGGTGGACGGCCGCTCCTGCTCCATGGACTCTGCCTACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128147 CCTGGGTCCGGTGGACGGCCGCTCCTGCTCCATGGACTCTGCCTACGGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 CCCTCTCCCCAACCTCCTTACAAGACTTTGTGGCCCCAGGCCCAATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128197 CCCTCTCCCCAACCTCCTTACAAGACTTTGTGGCCCCAGGCCCAATGGCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 GAGCTAGTGCCTCGGGCCCCAGAGTCCCCACGAGTTCCTTCCCCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128247 GAGCTAGTGCCTCGGGCCCCAGAGTCCCCACGAGTTCCTTCCCCTCCACC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CTCGCCCCGTCTCCGCCGCCGCACCCCTGTCCAGCTGTTGAGCTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128297 CTCGCCCCGTCTCCGCCGCCGCACCCCTGTCCAGCTGTTGAGCTGCCCGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 CCCACCTGCTCAAGTCTAAGTCCGAGGCCAGCCTCCTCCAGCTGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128347 CCCACCTGCTCAAGTCTAAGTCCGAGGCCAGCCTCCTCCAGCTGCTGGCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GGGGCTGGCACCCATGGGACACCCTCTGCCCCCAGCCGCAGCCTGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128397 GGGGCTGGCACCCATGGGACACCCTCTGCCCCCAGCCGCAGCCTGTCAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 GCTCTGCCTGGCTGTTCCAGCCCCAGGTATTAGGACTCAGGGCTCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128447 GCTCTGCCTGGCTGTTCCAGCCCCAGGTATTAGGACTCAGGGCTCCCCTC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 AGGAAGCTGGGCCCAGCTGGGATTGCCGAGGGGCCCCTAGCCCTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128497 AGGAAGCTGGGCCCAGCTGGGATTGCCGAGGGGCCCCTAGCCCTGGCAGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 GGTCCTGGGCTAGTCGGCTGCCTGGCCGGGGAACCTGCAGGCTCCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128547 GGTCCTGGGCTAGTCGGCTGCCTGGCCGGGGAACCTGCAGGCTCCCACAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 GAAGAGGTGTGGAGACCTGCCCTCGGGGGCCTCTCCCAGGGTCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128597 GAAGAGGTGTGGAGACCTGCCCTCGGGGGCCTCTCCCAGGGTCCAGCCTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 AGCCCCCACCAGGGGTCTCTGCCCAGCACAGGAAGCTGACCCTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128647 AGCCCCCACCAGGGGTCTCTGCCCAGCACAGGAAGCTGACCCTGGCCCAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3130 CTCTACCGAATCAGGACCACCCTGCTGCTTAACTCCACGCTCACTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128697 CTCTACCGAATCAGGACCACCCTGCTGCTTAACTCCACGCTCACTGCCTC

   3350     .
   3180 G GAGGTC
        |-|||-|-
 128747 GTGAG T