seq1 = pF1KA0706.tfa, 3309 bp
seq2 = pF1KA0706/gi568815581f_4900247.tfa (gi568815581f:4900247_5124148), 223902 bp

>pF1KA0706 3309
>gi568815581f:4900247_5124148 (Chr17)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-183  (100526-100602)   100% ->
184-363  (100976-101155)   99% ->
364-429  (101813-101878)   100% ->
430-608  (102218-102396)   100% ->
609-720  (102485-102596)   100% ->
721-798  (103366-103443)   100% ->
799-864  (103605-103670)   100% ->
865-940  (103752-103827)   100% ->
941-1019  (104321-104399)   100% ->
1020-1165  (104609-104754)   100% ->
1166-1335  (106669-106838)   100% ->
1336-1415  (107017-107096)   100% ->
1416-1491  (107221-107296)   100% ->
1492-1571  (113407-113486)   100% ->
1572-1666  (114497-114591)   100% ->
1667-1750  (119750-119833)   100% ->
1751-1937  (120246-120432)   100% ->
1938-2010  (120560-120632)   100% ->
2011-2628  (121846-122463)   100% ->
2629-3309  (123222-123902)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGTGCCTCGGTGAAAGTGGCAGTGAGGGTTCGGCCCTTTAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGTGCCTCGGTGAAAGTGGCAGTGAGGGTTCGGCCCTTTAACGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGTGAGACCAGCCAGGATGCCAAGTGTGTGGTCAGCATGCAGGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGTGAGACCAGCCAGGATGCCAAGTGTGTGGTCAGCATGCAGGGCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCT         CCATCATCAATCCTAAACAGAGCAAGGATGCCCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCTGTG...CAGCCATCATCAATCCTAAACAGAGCAAGGATGCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAGCTTCACCTTTGACTACTCCTACTGGTCACACACTTCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100561 AAAAGCTTCACCTTTGACTACTCCTACTGGTCACACACTTCGGTG...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  ACGGAGGACCCCCAGTTTGCATCTCAGCAGCAAGTGTATCGGGACATCG
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100975 GACGGAGGACCCCCAGTTTGCATCTCAGCAGCAAGTGTATCGGGACATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGAAGAGATGCTGCTCCACGCCTTTGAAGGCTACAACGTGTGCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101025 GAGAAGAGATGCTGCTCCACGCCTTTGAAGGCTACAACGTGTGCATCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCTATGGGCAGACCGGGGCTGGGAAATCCTATACCATGATGGGGCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101075 GCCTATGGGCAGACCGGGGCTGGGAAATCCTATACCATGATGGGGCGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGCCAGGGCAGCAGGGCATCGTGCCCCAG         CTCTGTGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101125 GGAGCCAGGGCAGCAGGGCATCGTGCCCCAGGTA...CAGCTCTGTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCTCTTCTCTCGCGTTAGTGAGAACCAGAGTGCTCAGCTATCCTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101823 ACCTCTTCTCTCGCGTTAGTGAGAACCAGAGTGCTCAGCTATCCTACTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGAG         GTGAGCTATATGGAGATCTACTGTGAGCGGGTACG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 GTGGAGGTA...CAGGTGAGCTATATGGAGATCTACTGTGAGCGGGTACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGACCTCTTGAACCCCAAGAGTCGGGGTTCTCTGCGGGTCCGGGAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102253 AGACCTCTTGAACCCCAAGAGTCGGGGTTCTCTGCGGGTCCGGGAGCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCATCCTGGGCCCGTACGTGCAGGACCTGTCCAAATTGGCTGTGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102303 CCATCCTGGGCCCGTACGTGCAGGACCTGTCCAAATTGGCTGTGACCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACGCAGACATTGCTGACCTCATGGACTGTGGAAATAAAGCACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102353 TACGCAGACATTGCTGACCTCATGGACTGTGGAAATAAAGCACGGTG...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    609    GACTGTGGCTGCCACCAACATGAATGAGACCAGCAGCCGTTCCCATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102482 AAGGACTGTGGCTGCCACCAACATGAATGAGACCAGCAGCCGTTCCCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCGTCTTTACCATCGTCTTCACACAGCGCTGCCATGACCAGCTCACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102532 CCGTCTTTACCATCGTCTTCACACAGCGCTGCCATGACCAGCTCACGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGACTCGGAGAAG         GTCAGTAAGATCAGTTTGGTGGACCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102582 CTGGACTCGGAGAAGGTG...CAGGTCAGTAAGATCAGTTTGGTGGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCTGGGAGTGAGCGAGCCGACTCCTCAGGGGCCCGGGGCATGCGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103392 TGCTGGGAGTGAGCGAGCCGACTCCTCAGGGGCCCGGGGCATGCGCCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AG         GAAGGAGCCAACATCAATAAGTCCCTGACTACACTAGGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103442 AGGTG...CAGGAAGGAGCCAACATCAATAAGTCCCTGACTACACTAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAAGTGATCTCGGCCCTTGCAGATATG         CAATCAAAGAAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103644 AAAGTGATCTCGGCCCTTGCAGATATGGTG...CAGCAATCAAAGAAGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAAGTCGGATTTTATCCCCTACAGGGACTCTGTGCTCACCTGGCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103766 AAAGTCGGATTTTATCCCCTACAGGGACTCTGTGCTCACCTGGCTGCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGAAAATTTGG         GGGGGAACTCACGCACAGCCATGATTGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103816 AGGAAAATTTGGGTG...CAGGGGGGAACTCACGCACAGCCATGATTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GCCCTGAGCCCTGCTGACATCAATTACGAGGAGACTCTCAGCACCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104350 GCCCTGAGCCCTGCTGACATCAATTACGAGGAGACTCTCAGCACCCTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020          GTATGCTGACCGCACCAAGCAAATCCGCTGCAATGCCATCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104400 GTG...CAGGTATGCTGACCGCACCAAGCAAATCCGCTGCAATGCCATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCAACGAGGACCCTAATGCCCGGCTGATTAGAGAGCTGCAGGAGGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104650 TCAACGAGGACCCTAATGCCCGGCTGATTAGAGAGCTGCAGGAGGAAGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCCGGCTGCGGGAACTGCTGATGGCTCAGGGACTGTCAGCCTCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104700 GCCCGGCTGCGGGAACTGCTGATGGCTCAGGGACTGTCAGCCTCTGCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGAAG         GCCTGAAGACGGAAGAAGGGAGTGTCAGAGGCGCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104750 GGAAGGTC...CAGGCCTGAAGACGGAAGAAGGGAGTGTCAGAGGCGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGCCAGCTGTGTCATCTCCCCCAGCTCCAGTTTCACCCTCATCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106705 TGCCAGCTGTGTCATCTCCCCCAGCTCCAGTTTCACCCTCATCACCCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ACACATAATGGGGAGCTGGAGCCGTCATTCTCCCCCAACACGGAGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106755 ACACATAATGGGGAGCTGGAGCCGTCATTCTCCCCCAACACGGAGTCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GATTGGGCCTGAGGAAGCCATGGAGAGGCTGCAG         GAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106805 GATTGGGCCTGAGGAAGCCATGGAGAGGCTGCAGGTG...CAGGAGACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGAAGATTATAGCTGAGCTGAACGAGACATGGGAGGAGAAGCTACGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107024 AGAAGATTATAGCTGAGCTGAACGAGACATGGGAGGAGAAGCTACGCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ACAGAAGCCCTGAGGATGGAGAG         AGAAGCATTGCTGGCTGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107074 ACAGAAGCCCTGAGGATGGAGAGGTG...CAGAGAAGCATTGCTGGCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GATGGGGGTGGCCGTCCGGGAGGATGGGGGAACTGTGGGCGTCTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107239 GATGGGGGTGGCCGTCCGGGAGGATGGGGGAACTGTGGGCGTCTTCTCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CAAAGAAG         ACTCCCCACCTGGTGAACCTGAACGAAGACCCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107289 CAAAGAAGGTG...TAGACTCCCCACCTGGTGAACCTGAACGAAGACCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CTGATGTCTGAGTGTCTGCTCTACCACATCAAAGATGGCGTCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113440 CTGATGTCTGAGTGTCTGCTCTACCACATCAAAGATGGCGTCACCAGGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1572       GGTCGGCCAAGTAGATATGGACATCAAGCTGACCGGACAGTTCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113490 ...CAGGGTCGGCCAAGTAGATATGGACATCAAGCTGACCGGACAGTTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TTCGGGAGCAACACTGTCTGTTCCGGAGCATCCCCCAGCCAGATGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114541 TTCGGGAGCAACACTGTCTGTTCCGGAGCATCCCCCAGCCAGATGGAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 G         TGGTGGTCACTCTGGAGCCTTGTGAAGGAGCTGAGACATA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114591 GGTA...CAGTGGTGGTCACTCTGGAGCCTTGTGAAGGAGCTGAGACATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 TGTGAATGGGAAGCTTGTGACGGAGCCGCTGGTGCTGAAGTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119790 TGTGAATGGGAAGCTTGTGACGGAGCCGCTGGTGCTGAAGTCAGGTA...

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751    GGAATAGGATTGTGATGGGCAAGAACCACGTTTTCCGCTTCAACCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120243 TAGGGAATAGGATTGTGATGGGCAAGAACCACGTTTTCCGCTTCAACCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 CCGGAGCAGGCAAGGCTGGAACGGGAACGAGGGGTCCCCCCACCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120293 CCGGAGCAGGCAAGGCTGGAACGGGAACGAGGGGTCCCCCCACCCCCAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 ACCGCCCTCTGAGCCAGTCGACTGGAACTTTGCCCAGAAGGAACTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120343 ACCGCCCTCTGAGCCAGTCGACTGGAACTTTGCCCAGAAGGAACTGCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 AGCAGCAAGGCATCGACATAAAGCTGGAAATGGAGAAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 120393 AGCAGCAAGGCATCGACATAAAGCTGGAAATGGAGAAGAGGTG...CAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 CTGCAGGATCTGGAGAATCAGTACCGGAAAGAAAAGGAAGAAGCCGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120561 CTGCAGGATCTGGAGAATCAGTACCGGAAAGAAAAGGAAGAAGCCGATCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 TCTGCTGGAGCAGCAGCGACTG         TATGCAGACTCGGACAGCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 120611 TCTGCTGGAGCAGCAGCGACTGGTG...CAGTATGCAGACTCGGACAGCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 GGGATGACTCTGACAAGCGCTCTTGTGAAGAGAGCTGGAGGCTCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121865 GGGATGACTCTGACAAGCGCTCTTGTGAAGAGAGCTGGAGGCTCATCTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 TCCTTGCGGGAGCAGCTGCCGCCCACCACGGTCCAGACCATTGTCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121915 TCCTTGCGGGAGCAGCTGCCGCCCACCACGGTCCAGACCATTGTCAAACG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 CTGTGGTCTGCCCAGCAGTGGCAAGCGCAGGGCCCCTCGCAGGGTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121965 CTGTGGTCTGCCCAGCAGTGGCAAGCGCAGGGCCCCTCGCAGGGTTTATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 AGATCCCCCAGCGACGCAGGCTGCAGGGCAAAGACCCCCGCTGGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122015 AGATCCCCCAGCGACGCAGGCTGCAGGGCAAAGACCCCCGCTGGGCCACC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 ATGGCTGACCTGAAGATGCAGGCGGTGAAGGAGATCTGCTACGAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122065 ATGGCTGACCTGAAGATGCAGGCGGTGAAGGAGATCTGCTACGAGGTGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CCTGGCTGACTTCCGCCACGGGCGGGCTGAGATTGAGGCCCTGGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122115 CCTGGCTGACTTCCGCCACGGGCGGGCTGAGATTGAGGCCCTGGCCGCCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 TCAAGATGCGGGAGCTGTGTCGCACCTATGGCAAGCCAGACGGCCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122165 TCAAGATGCGGGAGCTGTGTCGCACCTATGGCAAGCCAGACGGCCCCGGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GACGCCTGGAGGGCTGTGGCCCGGGATGTCTGGGACACTGTAGGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122215 GACGCCTGGAGGGCTGTGGCCCGGGATGTCTGGGACACTGTAGGCGAGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GGAAGGAGGTGGAGCTGGCAGTGGTGGTGGCAGTGAGGAGGGAGCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122265 GGAAGGAGGTGGAGCTGGCAGTGGTGGTGGCAGTGAGGAGGGAGCCCGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GGGCGGAGGTGGAGGACCTCCGGGCCCACATCGACAAGCTGACGGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122315 GGGCGGAGGTGGAGGACCTCCGGGCCCACATCGACAAGCTGACGGGGATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CTGCAGGAGGTGAAGCTGCAGAACAGCAGCAAGGACCGGGAGCTGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122365 CTGCAGGAGGTGAAGCTGCAGAACAGCAGCAAGGACCGGGAGCTGCAGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCTGCGGGACCGCATGCTCCGCATGGAGAGGGTCATCCCCCTGGCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122415 CCTGCGGGACCGCATGCTCCGCATGGAGAGGGTCATCCCCCTGGCCCAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629         GATCATGAGGATGAGAATGAAGAAGGTGGTGAGGTCCCCTGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122465 TA...CAGGATCATGAGGATGAGAATGAAGAAGGTGGTGAGGTCCCCTGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GCCCCGCCTGAAGGATCAGAGGCAGCAGAGGAGGCAGCCCCCAGTGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123264 GCCCCGCCTGAAGGATCAGAGGCAGCAGAGGAGGCAGCCCCCAGTGACCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 CATGCCGTCAGCCCGGCCCCCCTCGCCACCACTGTCAAGCTGGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123314 CATGCCGTCAGCCCGGCCCCCCTCGCCACCACTGTCAAGCTGGGAGCGGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 TGTCACGGCTCATGGAGGAGGACCCTGCCTTCCGTCGTGGTCGTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123364 TGTCACGGCTCATGGAGGAGGACCCTGCCTTCCGTCGTGGTCGTCTTCGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 TGGCTCAAGCAGGAGCAGCTACGGCTGCAGGGACTGCAGGGCTCTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123414 TGGCTCAAGCAGGAGCAGCTACGGCTGCAGGGACTGCAGGGCTCTGGGGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 CCGGGGCGGGGGGCTGCGCAGGCCCCCAGCCCGCTTTGTGCCCCCTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123464 CCGGGGCGGGGGGCTGCGCAGGCCCCCAGCCCGCTTTGTGCCCCCTCACG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 ACTGCAAGCTACGCTTCCCCTTCAAGAGCAACCCCCAGCACCGGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123514 ACTGCAAGCTACGCTTCCCCTTCAAGAGCAACCCCCAGCACCGGGAGTCT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 TGGCCAGGGATGGGGAGCGGGGAGGCTCCAACTCCGCTCCAACCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123564 TGGCCAGGGATGGGGAGCGGGGAGGCTCCAACTCCGCTCCAACCCCCTGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GGAGGTCACTCCCCATCCAGCCACCCCTGCCCGCCGGCCTCCGAGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123614 GGAGGTCACTCCCCATCCAGCCACCCCTGCCCGCCGGCCTCCGAGTCCCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 GAAGGTCCCACCATCCCCGCAGGAACTCCCTGGATGGAGGGGGCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123664 GAAGGTCCCACCATCCCCGCAGGAACTCCCTGGATGGAGGGGGCCGATCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 CGGGGAGCGGGTTCTGCACAGCCTGAACCCCAGCACTTCCAGCCCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123714 CGGGGAGCGGGTTCTGCACAGCCTGAACCCCAGCACTTCCAGCCCAAAAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 GCACAACTCTTATCCCCAGCCACCCCAACCCTACCCAGCCCAGCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123764 GCACAACTCTTATCCCCAGCCACCCCAACCCTACCCAGCCCAGCGGCCCC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 CAGGGCCCCGCTACCCCCCATACACTACTCCCCCACGAATGAGACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123814 CAGGGCCCCGCTACCCCCCATACACTACTCCCCCACGAATGAGACGGCAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .
   3271 CGTTCTGCCCCTGACCTCAAGGAGAGTGGGGCAGCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123864 CGTTCTGCCCCTGACCTCAAGGAGAGTGGGGCAGCTGTG