Result of SIM4 for
pF1KA0700
seq1 = pF1KA0700.tfa, 3390 bp
seq2 = pF1KA0700/gi568815579f_16729421.tfa (gi568815579f:16729421_16978724), 249304 bp
>pF1KA0700 3390
>gi568815579f:16729421_16978724 (Chr19)
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0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGCACGCTGGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGCCGGCGGCCCCGC
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100001 ATGGCGCACGCTGGCGGTGGCAGCGGTGGCAGCGGTGCCGGCGGCCCCGC
50 . : . : . : . : . :
51 GGGCCGGGGGCTGAGCGGCGCCCGCTGGGGTCGCTCGGGCTCCGCAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGGCCGGGGGCTGAGCGGCGCCCGCTGGGGTCGCTCGGGCTCCGCAGGCC
100 . : . : . : . : . :
101 ACGAGAAGCTGCCGGTGCAC GTAGAAGACGCCCTCACCTAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
100101 ACGAGAAGCTGCCGGTGCACGTG...CAGGTAGAAGACGCCCTCACCTAT
150 . : . : . : . : . :
142 CTGGACCAGGTGAAGATCCGCTTTGGCAGCGACCCTGCCACCTACAACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100392 CTGGACCAGGTGAAGATCCGCTTTGGCAGCGACCCTGCCACCTACAACGG
200 . : . : . : . : . :
192 CTTCCTGGAGATCATGAAGGAGTTCAAAAGCCAGAG CATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
100442 CTTCCTGGAGATCATGAAGGAGTTCAAAAGCCAGAGGTA...TAGCATCG
250 . : . : . : . : . :
233 ATACTCCTGGAGTCATCAGACGTGTCTCGCAGCTCTTCCACGAGCACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102079 ATACTCCTGGAGTCATCAGACGTGTCTCGCAGCTCTTCCACGAGCACCCT
300 . : . : . : . : . :
283 GACCTCATTGTTGGATTCAACGCTTTTCTTCCCCTCGGATATAGAATAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102129 GACCTCATTGTTGGATTCAACGCTTTTCTTCCCCTCGGATATAGAATAGA
350 . : . : . : . : . :
333 CATTCCCAAGAATGGCAAGTTAAACATACAGTCGCCTCTGACAAGCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
102179 CATTCCCAAGAATGGCAAGTTAAACATACAGTCGCCTCTGACAAGCCAGG
400 . : . : . : . : . :
382 GAGAATTCGCACAACCACGGGGACGGTGCAGAGGACTTCAAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102229 TA...CAGGAGAATTCGCACAACCACGGGGACGGTGCAGAGGACTTCAAG
450 . : . : . : . : . :
424 CAGCAGGTGCCGTATAAAGAGGACAAACCCCAGGTGCCCCTGGAGTCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112390 CAGCAGGTGCCGTATAAAGAGGACAAACCCCAGGTGCCCCTGGAGTCCGA
500 . : . : . : . : . :
474 TTCCGTGGAATTCAACAACGCCATCAGCTATGTGAATAAGATTAAAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112440 TTCCGTGGAATTCAACAACGCCATCAGCTATGTGAATAAGATTAAAACCC
550 . : . : . : . : . :
524 GCTTCCTAGACCACCCAGAAATCTACAGGTCATTCCTGGAGATCCTGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112490 GCTTCCTAGACCACCCAGAAATCTACAGGTCATTCCTGGAGATCCTGCAC
600 . : . : . : . : . :
574 ACGTACCAG AAGGAGCAGCTGAACACGAGGGGCCGGCCATT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
112540 ACGTACCAGGTA...CAGAAGGAGCAGCTGAACACGAGGGGCCGGCCATT
650 . : . : . : . : . :
615 CCGAGGCATGTCTGAAGAGGAGGTGTTCACCGAGGTGGCCAACCTCTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117582 CCGAGGCATGTCTGAAGAGGAGGTGTTCACCGAGGTGGCCAACCTCTTCC
700 . : . : . : . : . :
665 GGGGCCAGGAGGACCTGCTCTCAGAGTTTGGACAGTTCCTGCCCGAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117632 GGGGCCAGGAGGACCTGCTCTCAGAGTTTGGACAGTTCCTGCCCGAAGCC
750 . : . : . : . : . :
715 AAGCGGTCTCTG TTCACAGGAAACGGGCCGTGCGAGATGCA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
117682 AAGCGGTCTCTGGTG...TAGTTCACAGGAAACGGGCCGTGCGAGATGCA
800 . : . : . : . : . :
756 CAGCGTGCAGAAGAACGAGCACGACAAGACCCCGGAGCACAGCAGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122021 CAGCGTGCAGAAGAACGAGCACGACAAGACCCCGGAGCACAGCAGGAAGC
850 . : . : . : . : . :
806 GCTCCCGGCCCTCGCTCCTCCGCCCCGTGTCTGCACCCGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
122071 GCTCCCGGCCCTCGCTCCTCCGCCCCGTGTCTGCACCCGCCAAGGTA...
900 . : . : . : . : . :
850 AAAAAAATGAAACTTCGTGGTACCAAAGACCTGTCCATCGCTGCAGT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123646 CAGAAAAAAATGAAACTTCGTGGTACCAAAGACCTGTCCATCGCTGCAGT
950 . : . : . : . : . :
897 GGGGAAGTACGGGACTCTGCAGGAATTTTCTTTCTTTGACAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
123696 GGGGAAGTACGGGACTCTGCAGGAATTTTCTTTCTTTGACAAGGTG...C
1000 . : . : . : . : . :
940 GTCCGCCGGGTGCTGAAGAGCCAGGAGGTGTATGAAAACTTCCTCCGC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124721 AGGTCCGCCGGGTGCTGAAGAGCCAGGAGGTGTATGAAAACTTCCTCCGC
1050 . : . : . : . : . :
988 TGCATCGCACTCTTCAACCAGGAGCTGGTGTCTGGCTCTGAGCTCCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124771 TGCATCGCACTCTTCAACCAGGAGCTGGTGTCTGGCTCTGAGCTCCTGCA
1100 . : . : . : . : . :
1038 GCTCGTCAGCCCATTTCTGGG GAAATTTCCAGAACTCTTTG
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
124821 GCTCGTCAGCCCATTTCTGGGGTG...AAGGAAATTTCCAGAACTCTTTG
1150 . : . : . : . : . :
1079 CACAGTTCAAGTCCTTCCTGGGGGTAAAAGAGCTGTCCTTCGCGCCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132952 CACAGTTCAAGTCCTTCCTGGGGGTAAAAGAGCTGTCCTTCGCGCCACCC
1200 . : . : . : . : . :
1129 ATGAGCGACAGATCCGGGGACGGGATAAGCCGGGAAATTGATTATGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133002 ATGAGCGACAGATCCGGGGACGGGATAAGCCGGGAAATTGATTATGCATC
1250 . : . : . : . : . :
1179 CTGCAAGCGCATAGGATCCAGCTACCGGGCACTCCCCAAAACCTACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133052 CTGCAAGCGCATAGGATCCAGCTACCGGGCACTCCCCAAAACCTACCAGC
1300 . : . : . : . : . :
1229 AGCCCAAGTGCAGTGGGAGGACAGCCATCTGCAAGGAG GTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
133102 AGCCCAAGTGCAGTGGGAGGACAGCCATCTGCAAGGAGGTA...CAGGTA
1350 . : . : . : . : . :
1270 CTGAACGACACCTGGGTCTCCTTCCCTTCCTGGTCTGAGGACTCCACGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134263 CTGAACGACACCTGGGTCTCCTTCCCTTCCTGGTCTGAGGACTCCACGTT
1400 . : . : . : . : . :
1320 CGTCAGCTCCAAGAAGACACCGTACGAGGAGCAGCTTCACCGCTGTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134313 CGTCAGCTCCAAGAAGACACCGTACGAGGAGCAGCTTCACCGCTGTGAGG
1450 . : . : . : . : . :
1370 ACGAGCGCTTCGAG TTAGACGTTGTCCTGGAGACGAACCTG
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
134363 ACGAGCGCTTCGAGGTG...TAGTTAGACGTTGTCCTGGAGACGAACCTG
1500 . : . : . : . : . :
1411 GCCACAATCCGTGTGTTGGAAAGTGTGCAGAAGAAGCTGTCTCGGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136017 GCCACAATCCGTGTGTTGGAAAGTGTGCAGAAGAAGCTGTCTCGGATGGC
1550 . : . : . : . : . :
1461 GCCGGAAGACCAGGAGAAGTTCCGGCTGGACGACTCCCTGGGAGGCACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136067 GCCGGAAGACCAGGAGAAGTTCCGGCTGGACGACTCCCTGGGAGGCACGT
1600 . : . : . : . : . :
1511 CGGAGGTGATCCAGCGCCGTGCCATTTATCGCATCTATGGCGACAAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136117 CGGAGGTGATCCAGCGCCGTGCCATTTATCGCATCTATGGCGACAAGGCC
1650 . : . : . : . : . :
1561 CCGGAGATCATCGAGAGCCTCAAGAAGAACCCTGTCACCGCTGTCCCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136167 CCGGAGATCATCGAGAGCCTCAAGAAGAACCCTGTCACCGCTGTCCCCGT
1700 . : . : . : . : . :
1611 TGTCCTGAAAAG ACTGAAGGCCAAGGAAGAGGAGTGGCGGG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
136217 TGTCCTGAAAAGGTG...CAGACTGAAGGCCAAGGAAGAGGAGTGGCGGG
1750 . : . : . : . : . :
1652 AGGCCCAGCAGGGCTTCAACAAGATCTGGCGGGAGCAGTATGAGAAGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136982 AGGCCCAGCAGGGCTTCAACAAGATCTGGCGGGAGCAGTATGAGAAGGCG
1800 . : . : . : . : . :
1702 TACCTCAAGTCCCTTGACCACCAGGCTGTGAACTTCAAGCAGAACGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137032 TACCTCAAGTCCCTTGACCACCAGGCTGTGAACTTCAAGCAGAACGACAC
1850 . : . : . : . : . :
1752 CAAGGCCCTGCGCTCCAAGAGCTTGCTCAACGAGATCGAGAGCGTCTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137082 CAAGGCCCTGCGCTCCAAGAGCTTGCTCAACGAGATCGAGAGCGTCTACG
1900 . : . : . : . : . :
1802 ACGAG CACCAGGAGCAGCACTCGGAGGGCCGCAGTGCCCCC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137132 ACGAGGTA...CAGCACCAGGAGCAGCACTCGGAGGGCCGCAGTGCCCCC
1950 . : . : . : . : . :
1843 TCTAGCGAGCCGCACCTCATCTTTGTGTACGAGGACCGGCAGATCCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140076 TCTAGCGAGCCGCACCTCATCTTTGTGTACGAGGACCGGCAGATCCTGGA
2000 . : . : . : . : . :
1893 GGACGCAGCAGCGCTCATCAGCTACTACGTGAAGCGGCAGCCGGCCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140126 GGACGCAGCAGCGCTCATCAGCTACTACGTGAAGCGGCAGCCGGCCATCC
2050 . : . : . : . : . :
1943 AGAAGGAGGACCAGGGCACCATCCACCAGCTGCTGCACCAGTTCGTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140176 AGAAGGAGGACCAGGGCACCATCCACCAGCTGCTGCACCAGTTCGTGCCC
2100 . : . : . : . : . :
1993 AGCCTCTTCTTCTCTCAGCAGCTGGACCTGGGCGCCTCCGAGGAGTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140226 AGCCTCTTCTTCTCTCAGCAGCTGGACCTGGGCGCCTCCGAGGAGTCAGC
2150 . : . : . : . : . :
2043 TGATGAGGACCGGGACAGCCCCCAGGGGCAGACCACAGACCCCAGTGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140276 TGATGAGGACCGGGACAGCCCCCAGGGGCAGACCACAGACCCCAGTGAGC
2200 . : . : . : . : . :
2093 GGAAGAAGCCGGCGCCAGGACCCCACAGTAGCCCCCCAGAGGAGAAGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140326 GGAAGAAGCCGGCGCCAGGACCCCACAGTAGCCCCCCAGAGGAGAAGGGG
2250 . : . : . : . : . :
2143 GCCTTCGGGGATGCCCCGGCCACTGAGCAGCCACCCCTGCCGCCCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140376 GCCTTCGGGGATGCCCCGGCCACTGAGCAGCCACCCCTGCCGCCCCCAGC
2300 . : . : . : . : . :
2193 CCCGCACAAGCCCCTGGACGATGTCTACAGCCTATTTTTTGCCAACAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140426 CCCGCACAAGCCCCTGGACGATGTCTACAGCCTATTTTTTGCCAACAACA
2350 . : . : . : . : . :
2243 ACTGGTACTTCTTCCTGCGCCTGCACCAGACCCTGTGCTCCAGGCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140476 ACTGGTACTTCTTCCTGCGCCTGCACCAGACCCTGTGCTCCAGGCTGCTG
2400 . : . : . : . : . :
2293 AAGATCTACCGCCAGGCGCAGAAGCAGCTTCTGGAGTATCGGACCGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140526 AAGATCTACCGCCAGGCGCAGAAGCAGCTTCTGGAGTATCGGACCGAGAA
2450 . : . : . : . : . :
2343 GGAGCGGGAGAAGCTGCTGTGTGAGGGCCGCAGGGAGAAGGGCAGCGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140576 GGAGCGGGAGAAGCTGCTGTGTGAGGGCCGCAGGGAGAAGGGCAGCGACC
2500 . : . : . : . : . :
2393 CCGCCATGGAGCTGCGGCTGAAGCAGCCCA GTGAAGTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
140626 CCGCCATGGAGCTGCGGCTGAAGCAGCCCAGTA...CAGGTGAAGTGGAG
2550 . : . : . : . : . :
2434 CTGGAGGAGTACTACCCGGCCTTCCTGGACATGGTGCGGAGCCTGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141820 CTGGAGGAGTACTACCCGGCCTTCCTGGACATGGTGCGGAGCCTGCTGGA
2600 . : . : . : . : . :
2484 GGGCAGCATCGACCCCACGCAGTACGAGGACACCCTACGCGAGATGTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141870 GGGCAGCATCGACCCCACGCAGTACGAGGACACCCTACGCGAGATGTTCA
2650 . : . : . : . : . :
2534 CCATCCATGCCTACGTGGGCTTCACCATGGACAAGCTGGTGCAGAACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141920 CCATCCATGCCTACGTGGGCTTCACCATGGACAAGCTGGTGCAGAACATT
2700 . : . : . : . : . :
2584 GCGCGGCAG CTGCACCACCTCGTGAGCGATGACGTCTGCCT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
141970 GCGCGGCAGGTG...CAGCTGCACCACCTCGTGAGCGATGACGTCTGCCT
2750 . : . : . : . : . :
2625 GAAGGTGGTGGAGCTCTACCTGAACGAGAAGAAGCGGGGTGCCGCTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146667 GAAGGTGGTGGAGCTCTACCTGAACGAGAAGAAGCGGGGTGCCGCTGGTG
2800 . : . : . : . : . :
2675 GGAACCTGTCCTCCCGCTGCGTCCGCGCTGCTAGGGAGACCAGCTACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146717 GGAACCTGTCCTCCCGCTGCGTCCGCGCTGCTAGGGAGACCAGCTACCAG
2850 . : . : . : . : . :
2725 TGGAAGGCTGAGCGCTGCATGGCCGACGAGAACTGCTTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
146767 TGGAAGGCTGAGCGCTGCATGGCCGACGAGAACTGCTTCAAGGTG...CA
2900 . : . : . : . : . :
2767 GTGATGTTCCTGCAGCGCAAAGGGCAGGTGATCATGACCATCGAGCTCC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147065 GGTGATGTTCCTGCAGCGCAAAGGGCAGGTGATCATGACCATCGAGCTCC
2950 . : . : . : . : . :
2816 TGGACACCGAGGAGGCCCAGACGGAGGACCCTGTGGAGGTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
147115 TGGACACCGAGGAGGCCCAGACGGAGGACCCTGTGGAGGTCCAGGTG...
3000 . : . : . : . : . :
2860 CACCTGGCTCGGTACGTGGAGCAGTATGTGGGGACCGAGGGCGCGTC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148122 CAGCACCTGGCTCGGTACGTGGAGCAGTATGTGGGGACCGAGGGCGCGTC
3050 . : . : . : . : . :
2907 CAGCTCGCCCACTGAGGGCTTCCTCCTGAAACCTGTGTTCCTGCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
148172 CAGCTCGCCCACTGAGGGCTTCCTCCTGAAACCTGTGTTCCTGCAGAGGT
3100 . : . : . : . : . :
2955 GAACCTCAAGAAGTTCCGCCGCCGGTGGCAGAGCGAGCAGGCG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148222 A...CAGGAACCTCAAGAAGTTCCGCCGCCGGTGGCAGAGCGAGCAGGCG
3150 . : . : . : . : . :
2998 CGGGCCCTGCGCGGTGAGGCCAGGAGCTCCTGGAAGCGGCTGGTGGGCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148806 CGGGCCCTGCGCGGTGAGGCCAGGAGCTCCTGGAAGCGGCTGGTGGGCGT
3200 . : . : . : . : . :
3048 GGAGAGCGCCTGCGACGTGGACTGCCGCTTCAAGCTCAGCACTCACAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148856 GGAGAGCGCCTGCGACGTGGACTGCCGCTTCAAGCTCAGCACTCACAAGA
3250 . : . : . : . : . :
3098 TGGTGTTCATCGTGAACTCCGAGGACTACATGTACCGTCGCGGGACCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148906 TGGTGTTCATCGTGAACTCCGAGGACTACATGTACCGTCGCGGGACCCTC
3300 . : . : . : . : . :
3148 TGCCGGGCCAAGCAG GTGCAGCCCCTGGTCCTGCTCCGCCA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
148956 TGCCGGGCCAAGCAGGTG...CAGGTGCAGCCCCTGGTCCTGCTCCGCCA
3350 . : . : . : . : . :
3189 CCACCAGCACTTTGAGGAGTGGCACAGCCGCTGGCTGGAGGACAATGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149103 CCACCAGCACTTTGAGGAGTGGCACAGCCGCTGGCTGGAGGACAATGTGA
3400 . : . : . : . : . :
3239 CGGTGGAGGCGGCTAGCCTGGTGCAGGACTGGCTGATGGGTGAGGAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149153 CGGTGGAGGCGGCTAGCCTGGTGCAGGACTGGCTGATGGGTGAGGAGGAC
3450 . : . : . : . : . :
3289 GAGGACATGGTACCCTGCAAGACGCTGTGTGAGACAGTGCACGTGCACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149203 GAGGACATGGTACCCTGCAAGACGCTGTGTGAGACAGTGCACGTGCACGG
3500 . : . : . : . : . :
3339 CCTGCCCGTGACCCGCTACCGCGTGCAGTACAGCCGCCGCCCGGCCTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149253 CCTGCCCGTGACCCGCTACCGCGTGCAGTACAGCCGCCGCCCGGCCTCGC
3550
3389 CC
||
149303 CC