seq1 = pF1KA0651.tfa, 3240 bp
seq2 = pF1KA0651/gi568815597r_155847945.tfa (gi568815597r:155847945_156089330), 241386 bp

>pF1KA0651 3240
>gi568815597r:155847945_156089330 (Chr1)

(complement)

1-96  (100001-100097)   97% ->
97-214  (103882-103999)   100% ->
215-254  (104898-104937)   100% ->
255-348  (106131-106224)   100% ->
349-493  (120031-120175)   100% ->
494-561  (122444-122511)   100% ->
562-625  (122852-122915)   100% ->
626-755  (123571-123700)   100% ->
756-865  (123919-124028)   100% ->
866-1006  (124203-124343)   100% ->
1007-1257  (126148-126398)   100% ->
1258-1383  (126613-126738)   100% ->
1384-1501  (127109-127226)   100% ->
1502-1750  (127422-127670)   100% ->
1751-1827  (130935-131011)   100% ->
1828-1997  (131449-131618)   100% ->
1998-2065  (134362-134429)   100% ->
2066-2266  (136503-136703)   100% ->
2267-2386  (137096-137215)   100% ->
2387-2454  (137345-137412)   100% ->
2455-2490  (137555-137590)   100% ->
2491-2541  (137798-137848)   100% ->
2542-2985  (138059-138502)   100% ->
2986-3169  (138849-139032)   100% ->
3170-3240  (141316-141386)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAGGCCCCAAGGAGGCCCTCTTCCTGCAGATCCGAGAAGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAGGCCCCAAGGAGGCCCTCTTCCTGCAGATCCGAGAAGGACTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACACCTTTCTGGGACTGGA CACCAGGGTGGCTACGCCTCCCGGCTG   
        ||||||||||||||||| |-|||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 ACACCTTTCTGGGACTGCAGCACCAGGGTGGCTACGCCTCCCGGCTGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97       GATCAGGATTCCTGTCATCCATCTGCTGGCCCTTTGGACCACTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGGATCAGGATTCCTGTCATCCATCTGCTGGCCCTTTGGACCACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 GGCCACTGGCATGCTTTCCAAGTCTGTACCCGTGAGTGGCATCAACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103926 GGCCACTGGCATGCTTTCCAAGTCTGTACCCGTGAGTGGCATCAACTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 TCTTGGACCGTTCGGATACAGATG         GGAATGTATCCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103976 TCTTGGACCGTTCGGATACAGATGGTG...CAGGGAATGTATCCCAGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 TCTGCCATTGACCTCAGGAAACG         CTGCAGCCAGCTGGAAGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104915 TCTGCCATTGACCTCAGGAAACGGTG...CAGCTGCAGCCAGCTGGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 ACATTCAGGTACCCGGGTAGGCTCCTCCCTGCGACAGACCTTCAGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106149 ACATTCAGGTACCCGGGTAGGCTCCTCCCTGCGACAGACCTTCAGCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 TCTCGGGCATGACCGGAAAGGCCAAG         ACCCGGGAAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106199 TCTCGGGCATGACCGGAAAGGCCAAGGTA...CAGACCCGGGAAAAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    364 AAGATGAAGGAAGCCAAGGATGCCCGCTATACCAATGGGCACCTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120046 AAGATGAAGGAAGCCAAGGATGCCCGCTATACCAATGGGCACCTCTTCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414 CACCATTTCAGTTTCAGGCATGACCATGTGCTATGCCTGTAACAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120096 CACCATTTCAGTTTCAGGCATGACCATGTGCTATGCCTGTAACAAGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464 TCACAGCCAAGGAAGCCCTCATCTGCCCAA         CCTGCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120146 TCACAGCCAAGGAAGCCCTCATCTGCCCAAGTA...CAGCCTGCAATGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    505 ACTATCCACAACCGCTGTAAAGACACCCTCGCCAACTGTACCAAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122455 ACTATCCACAACCGCTGTAAAGACACCCTCGCCAACTGTACCAAGGTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    555 GCAGAAG         CAACAGAAAGCGGCCCTGCTGAAGAACAACACCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122505 GCAGAAGGTG...CAGCAACAGAAAGCGGCCCTGCTGAAGAACAACACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    596 CCTTGCAGTCCGTTTCTCTTCGAAGTAAGA         CAACCATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 122886 CCTTGCAGTCCGTTTCTCTTCGAAGTAAGAGTG...CAGCAACCATCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637 GAGCGGCCAAGCTCGGCCATCTACCCCTCCGACAGCTTCCGGCAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123582 GAGCGGCCAAGCTCGGCCATCTACCCCTCCGACAGCTTCCGGCAGTCCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    687 CCTGGGCTCCCGCCGTGGCCGCTCCTCCTTGTCTTTAGCCAAGAGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123632 CCTGGGCTCCCGCCGTGGCCGCTCCTCCTTGTCTTTAGCCAAGAGTGTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737 CTACCACCAACATTGCTGG         ACATTTCAATGATGAGTCTCCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 123682 CTACCACCAACATTGCTGGGTG...CAGACATTTCAATGATGAGTCTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    778 CTGGGGCTGCGCCGGATCCTCTCACAGTCCACAGACTCCCTCAACATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123941 CTGGGGCTGCGCCGGATCCTCTCACAGTCCACAGACTCCCTCAACATGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828 GAACCGAACCCTATCCGTGGAATCCCTCATTGACGAAG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 123991 GAACCGAACCCTATCCGTGGAATCCCTCATTGACGAAGGTG...CAGAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    869 TAATCTACAGTGAGCTGATGAGTGACTTTGAGATGGATGAGAAGGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124206 TAATCTACAGTGAGCTGATGAGTGACTTTGAGATGGATGAGAAGGACTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    919 GCAGCTGACTCTTGGAGTCTTGCTGTGGACAGCAGCTTCCTGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124256 GCAGCTGACTCTTGGAGTCTTGCTGTGGACAGCAGCTTCCTGCAGCAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    969 TAAAAAGGAGGTGATGAAGCAGCAAGATGTCATCTATG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 124306 TAAAAAGGAGGTGATGAAGCAGCAAGATGTCATCTATGGTA...CAGAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1010 TAATCCAGACAGAGCTGCACCATGTGAGGACACTGAAGATCATGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126151 TAATCCAGACAGAGCTGCACCATGTGAGGACACTGAAGATCATGACCCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1060 CTCTTCCGCACGGGGATGCTGGAAGAGCTACACTTGGAGCCAGGAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126201 CTCTTCCGCACGGGGATGCTGGAAGAGCTACACTTGGAGCCAGGAGTGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1110 CCAGGGCCTGTTCCCCTGCGTGGACGAGCTCAGTGACATCCATACACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126251 CCAGGGCCTGTTCCCCTGCGTGGACGAGCTCAGTGACATCCATACACGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1160 TCCTCAGCCAGCTATTAGAACGCCGACGCCAGGCCCTGTGCCCTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126301 TCCTCAGCCAGCTATTAGAACGCCGACGCCAGGCCCTGTGCCCTGGCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1210 ACCCGGAACTTTGTCATCCATCGCTTGGGTGATCTGCTCATCAGCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 126351 ACCCGGAACTTTGTCATCCATCGCTTGGGTGATCTGCTCATCAGCCAGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1258        TTCTCAGGTCCTAGTGCGGAGCAGATGTGTAAGACCTACTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126401 G...TAGTTCTCAGGTCCTAGTGCGGAGCAGATGTGTAAGACCTACTCGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGTTCTGCAGCCGCCACAGCAAGGCCTTAAAGCTCTATAAGGAGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126656 AGTTCTGCAGCCGCCACAGCAAGGCCTTAAAGCTCTATAAGGAGCTGTAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCCGAGACAAACGCTTCCAGCAATTCATCCGG         AAAGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126706 GCCCGAGACAAACGCTTCCAGCAATTCATCCGGGTG...TAGAAAGTGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCGCCCCGCCGTGCTCAAGCGGCACGGGGTACAGGAGTGCATCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127117 CCGCCCCGCCGTGCTCAAGCGGCACGGGGTACAGGAGTGCATCCTGCTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TGACTCAGCGCATCACCAAGTACCCGTTACTCATCAGCCGCATCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127167 TGACTCAGCGCATCACCAAGTACCCGTTACTCATCAGCCGCATCCTGCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CATTCCCACG         GGATCGAGGAGGAGCGCCAGGACCTGACCAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127217 CATTCCCACGGTG...CAGGGATCGAGGAGGAGCGCCAGGACCTGACCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 AGCACTGGGGCTAGTGAAGGAGCTGCTGTCCAATGTGGACGAGGGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127453 AGCACTGGGGCTAGTGAAGGAGCTGCTGTCCAATGTGGACGAGGGTATTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 ATCAGCTGGAGAAAGGGGCCCGTCTGCAGGAGATCTACAACCGCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127503 ATCAGCTGGAGAAAGGGGCCCGTCTGCAGGAGATCTACAACCGCATGGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CCTCGGGCCCAAACCCCAGTGCCTGGCAAGGGCCCCTTTGGCCGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127553 CCTCGGGCCCAAACCCCAGTGCCTGGCAAGGGCCCCTTTGGCCGAGAGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 ACTTCTGAGGCGCAAACTCATCCACGATGGCTGCCTGCTCTGGAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127603 ACTTCTGAGGCGCAAACTCATCCACGATGGCTGCCTGCTCTGGAAGACAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 CGACGGGGCGCTTCAAAG         ATGTGCTAGTGCTGCTGATGACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 127653 CGACGGGGCGCTTCAAAGGTC...CAGATGTGCTAGTGCTGCTGATGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GATGTACTGGTGTTTCTCCAGGAAAAGGACCAGAAGTACATCTTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130958 GATGTACTGGTGTTTCTCCAGGAAAAGGACCAGAAGTACATCTTTCCTAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CCTG         GACAAGCCTTCAGTGGTATCGCTGCAGAATCTAATCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131008 CCTGGTG...CAGGACAAGCCTTCAGTGGTATCGCTGCAGAATCTAATCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TACGAGACATTGCCAACCAGGAGAAAGGGATGTTTCTGATCAGCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131486 TACGAGACATTGCCAACCAGGAGAAAGGGATGTTTCTGATCAGCGCAGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 CCACCTGAGATGTACGAGGTGCACACAGCATCCCGGGATGACCGGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131536 CCACCTGAGATGTACGAGGTGCACACAGCATCCCGGGATGACCGGAGCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CTGGATCCGGGTCATTCAGCAGAGCGTGCGCAC         ATGCCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 131586 CTGGATCCGGGTCATTCAGCAGAGCGTGCGCACGTG...CAGATGCCCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CCAGGGAGGACTTCCCCCTGATTGAGACAGAGGATGAGGCTTACCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134370 CCAGGGAGGACTTCCCCCTGATTGAGACAGAGGATGAGGCTTACCTGCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 CGAATTAAGA         TGGAGTTGCAGCAGAAGGACCGGGCACTGGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 134420 CGAATTAAGAGTA...CAGTGGAGTTGCAGCAGAAGGACCGGGCACTGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 GGAGCTGCTGCGAGAGAAGGTCGGGCTGTTTGCTGAGATGACCCATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136534 GGAGCTGCTGCGAGAGAAGGTCGGGCTGTTTGCTGAGATGACCCATTTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 AGGCCGAAGAGGATGGTGGCAGTGGGATGGCCCTGCCCACCCTGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136584 AGGCCGAAGAGGATGGTGGCAGTGGGATGGCCCTGCCCACCCTGCCCAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 GGCCTTTTCCGCTCTGAGTCCCTTGAGTCCCCTCGTGGCGAGCGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136634 GGCCTTTTCCGCTCTGAGTCCCTTGAGTCCCCTCGTGGCGAGCGGCTGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 GCAGGATGCCATCCGTGAGG         TGGAGGGTCTGAAAGACCTGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 136684 GCAGGATGCCATCCGTGAGGGTG...CAGTGGAGGGTCTGAAAGACCTGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 TGGTGGGGCCAGGAGTGGAACTGCTCTTGACACCCCGAGAGCCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137117 TGGTGGGGCCAGGAGTGGAACTGCTCTTGACACCCCGAGAGCCAGCCCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 CCCTTGGAACCAGACAGCGGTGGTAACACGAGTCCTGGGGTCACTGCCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 137167 CCCTTGGAACCAGACAGCGGTGGTAACACGAGTCCTGGGGTCACTGCCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2387         ATGGTGAGGCCAGAACCTTCAATGGCTCCATTGAACTCTGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137217 TG...CAGATGGTGAGGCCAGAACCTTCAATGGCTCCATTGAACTCTGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 GAGCTGACTCAGACTCTAGCCAGAGG         GATCGAAATGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 137387 GAGCTGACTCAGACTCTAGCCAGAGGGTA...CAGGATCGAAATGGAAAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 CAGCTGAGATCACCGCAAGAG         GAGGCGTTACAGCGATTGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 137570 CAGCTGAGATCACCGCAAGAGGTG...CAGGAGGCGTTACAGCGATTGGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 CAATCTCTATGGACTTCTACATGGCCTACAG         GCAGCTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 137818 CAATCTCTATGGACTTCTACATGGCCTACAGGTC...CAGGCAGCTGTGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 CCCAGCAGGACACTCTGATGGAAGCCCGGTTCCCTGAGGGCCCTGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138069 CCCAGCAGGACACTCTGATGGAAGCCCGGTTCCCTGAGGGCCCTGAGCGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 CGGGAGAAGCTGTGCCGAGCCAACTCTCGGGATGGGGAGGCTGGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138119 CGGGAGAAGCTGTGCCGAGCCAACTCTCGGGATGGGGAGGCTGGCAGGGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 TGGGGCTGCCCCTGTGGCCCCTGAAAAGCAGGCCACGGAACTGGCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138169 TGGGGCTGCCCCTGTGGCCCCTGAAAAGCAGGCCACGGAACTGGCATTAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 TGCAGCGGCAACATGCGCTGCTGCAGGAGGAGCTACGGCGCTGCCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138219 TGCAGCGGCAACATGCGCTGCTGCAGGAGGAGCTACGGCGCTGCCGGCGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 CTAGGTGAAGAACGGGCAACCGAAGCTGGCAGCCTGGAGGCCCGGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138269 CTAGGTGAAGAACGGGCAACCGAAGCTGGCAGCCTGGAGGCCCGGCTCCG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 GGAGAGTGAGCAGGCCCGGGCACTGCTGGAGCGTGAGGCCGAAGAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138319 GGAGAGTGAGCAGGCCCGGGCACTGCTGGAGCGTGAGGCCGAAGAGGCTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 GAAGGCAGCTGGCCGCCCTGGGCCAGACCGAGCCACTCCCAGCTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138369 GAAGGCAGCTGGCCGCCCTGGGCCAGACCGAGCCACTCCCAGCTGAGGCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 CCCTGGGCCCGCAGACCTGTGGATCCTCGGCGGCGCAGCCTCCCCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138419 CCCTGGGCCCGCAGACCTGTGGATCCTCGGCGGCGCAGCCTCCCCGCAGG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 CGATGCCCTGTACTTGAGTTTCAACCCCCCACAG         CCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 138469 CGATGCCCTGTACTTGAGTTTCAACCCCCCACAGGTA...CAGCCCAGCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993 GAGGCACTGACCGCCTGGATCTACCTGTCACTACTCGCTCTGTCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138856 GAGGCACTGACCGCCTGGATCTACCTGTCACTACTCGCTCTGTCCATCGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3043 AACTTTGAGGACCGAGAGAGGCAGGAACTGGGGAGCCCCGAAGAGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138906 AACTTTGAGGACCGAGAGAGGCAGGAACTGGGGAGCCCCGAAGAGCGGCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3093 GCAAGACAGCAGTGACCCTGACACTGGCAGCGAGGAGGAAGGTAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138956 GCAAGACAGCAGTGACCCTGACACTGGCAGCGAGGAGGAAGGTAGCAGCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3143 GTCTGTCTCCGCCCCACAGTCCACGAG         ACTTTACCAGAATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 139006 GTCTGTCTCCGCCCCACAGTCCACGAGGTG...CAGACTTTACCAGAATG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3184 CAGGACATCCCGGAGGAGACGGAGAGCCGCGACGGGGAGGCTGTAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141330 CAGGACATCCCGGAGGAGACGGAGAGCCGCGACGGGGAGGCTGTAGCCTC

   3450     .
   3234 CGAGAGC
        |||||||
 141380 CGAGAGC