seq1 = pF1KA0627.tfa, 3882 bp
seq2 = pF1KA0627/gi568815595r_33398634.tfa (gi568815595r:33398634_33744904), 346271 bp

>pF1KA0627 3882
>gi568815595r:33398634_33744904 (Chr3)

(complement)

1-16  (85916-85931)   100% ->
17-163  (100002-100148)   100% ->
164-243  (112534-112613)   100% ->
244-336  (117825-117917)   100% ->
337-482  (122625-122770)   100% ->
483-618  (125167-125302)   100% ->
619-689  (132834-132904)   100% ->
690-749  (136279-136338)   100% ->
750-827  (137444-137521)   100% ->
828-995  (138147-138314)   100% ->
996-1051  (140696-140751)   100% ->
1052-1225  (141780-141953)   100% ->
1226-1249  (148171-148194)   100% ->
1250-1267  (149937-149954)   100% ->
1268-1369  (152409-152510)   100% ->
1370-1540  (159985-160155)   100% ->
1541-1648  (162977-163084)   100% ->
1649-1711  (167641-167703)   100% ->
1712-1818  (168630-168736)   100% ->
1819-2063  (171551-171795)   100% ->
2064-2130  (174115-174182)   95% ->
2131-2294  (183934-184097)   100% ->
2295-2373  (185520-185598)   100% ->
2374-2517  (193510-193653)   100% ->
2518-2661  (200064-200207)   100% ->
2662-2768  (201366-201472)   100% ->
2769-2922  (205963-206116)   100% ->
2923-3151  (209444-209672)   100% ->
3152-3345  (227731-227924)   100% ->
3346-3474  (228754-228882)   100% ->
3475-3681  (234141-234347)   100% ->
3682-3798  (243137-243253)   100% ->
3799-3882  (246188-246271)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTATGGGAGATG         ATAAAAGCTTCGATGATGAAGAATC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  85916 ATGGCTATGGGAGATGGTG...CAGATAAAAGCTTCGATGATGAAGAATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGTGGATGGAAATAGGCCATCATCAGCTGCATCAGCCTTCAAGGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 AGTGGATGGAAATAGGCCATCATCAGCTGCATCAGCCTTCAAGGTTCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCTAAAACATCCGGAAATCCTGCCAACAGTGCAAGGAAGCCTGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100077 CACCTAAAACATCCGGAAATCCTGCCAACAGTGCAAGGAAGCCTGGTTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGGTGGCCCTAAGGTTGGAG         GTGCTTCTAAGGAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100127 GCAGGTGGCCCTAAGGTTGGAGGTA...CAGGTGCTTCTAAGGAAGGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTGGAGCAGTTGATGAAGATGATTTTATAAAAGCTTTTACAGATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112553 TGCTGGAGCAGTTGATGAAGATGATTTTATAAAAGCTTTTACAGATGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTCTATTCAG         ATTTATTCTAGTCGAGAACTCGAAGAAACA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 112603 CTTCTATTCAGGTA...AAGATTTATTCTAGTCGAGAACTCGAAGAAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTAAATAAAATCAGGGAAATTTTGTCAGATGATAAACATGACTGGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117855 TTAAATAAAATCAGGGAAATTTTGTCAGATGATAAACATGACTGGGATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCGTGCCAATGCA         CTGAAGAAAATTCGATCACTGCTTGTTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117905 GCGTGCCAATGCAGTA...CAGCTGAAGAAAATTCGATCACTGCTTGTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTGGAGCTGCACAGTATGATTGCTTTTTTCAACATTTACGATTGTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122653 CTGGAGCTGCACAGTATGATTGCTTTTTTCAACATTTACGATTGTTGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGAGCACTTAAACTTTCAGCTAAGGATCTTAGATCCCAGGTGGTTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122703 GGAGCACTTAAACTTTCAGCTAAGGATCTTAGATCCCAGGTGGTTAGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGCTTGTATTACTGTAGC         CCACCTTTCAACAGTTTTGGGAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122753 AGCTTGTATTACTGTAGCGTA...TAGCCACCTTTCAACAGTTTTGGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACAAGTTTGATCATGGCGCTGAAGCCATTGTACCTACACTTTTTAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125190 ACAAGTTTGATCATGGCGCTGAAGCCATTGTACCTACACTTTTTAATCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTCCCCAATAGTGCAAAAGTCATGGCAACTTCTGGATGTGCAGCAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125240 GTCCCCAATAGTGCAAAAGTCATGGCAACTTCTGGATGTGCAGCAATCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATTTATCATTCGG         CATACTCATGTACCCAGACTTATACCTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 125290 ATTTATCATTCGGGTA...CAGCATACTCATGTACCCAGACTTATACCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TAATAACAAGCAATTGCACATCAAAATCAGTTCCCGTGAGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 132862 TAATAACAAGCAATTGCACATCAAAATCAGTTCCCGTGAGGAGGTA...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    690   ACGTTCATTTGAATTTTTAGATTTATTGTTGCAAGAGTGGCAGACTCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136277 AGACGTTCATTTGAATTTTTAGATTTATTGTTGCAAGAGTGGCAGACTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTCATTGGAAAG         ACATGCAGCCGTCTTGGTTGAAACTATTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 136327 TTCATTGGAAAGGTA...TAGACATGCAGCCGTCTTGGTTGAAACTATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AAAAGGGAATTCATGATGCTGACGCTGAGGCCAGAGTGGAGGCAAGAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 137473 AAAAGGGAATTCATGATGCTGACGCTGAGGCCAGAGTGGAGGCAAGAAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    828         GACATACATGGGTCTTAGAAACCACTTTCCTGGTGAAGCTGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137523 TA...CAGGACATACATGGGTCTTAGAAACCACTTTCCTGGTGAAGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 AACATTATATAATTCCCTTGAGCCATCTTATCAGAAGAGTCTTCAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138189 AACATTATATAATTCCCTTGAGCCATCTTATCAGAAGAGTCTTCAAACTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACTTAAAGAGTTCTGGCAGTGTAGCATCTCTTCCACAATCAGACAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138239 ACTTAAAGAGTTCTGGCAGTGTAGCATCTCTTCCACAATCAGACAGGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCATCCAGCTCACAGGAAAGTCTCAA         TCGCCCTTTTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 138289 TCATCCAGCTCACAGGAAAGTCTCAAGTA...CAGTCGCCCTTTTTCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CAAATGGTCTACAGCAAATCCATCAACTGTGGCTGGAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 140711 CAAATGGTCTACAGCAAATCCATCAACTGTGGCTGGAAGAGGTA...TAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TATCAGCAGGCAGCAGCAAAGCCAGTTCCCTTCCAGGAAGCCTGCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141780 TATCAGCAGGCAGCAGCAAAGCCAGTTCCCTTCCAGGAAGCCTGCAGCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TCACGAAGTGACATTGATGTGAATGCTGCTGCAGGTGCCAAGGCACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141830 TCACGAAGTGACATTGATGTGAATGCTGCTGCAGGTGCCAAGGCACATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGCTGCTGGACAGTCTGTGCGAAGCGGGCGCTTAGGTGCAGGTGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141880 TGCTGCTGGACAGTCTGTGCGAAGCGGGCGCTTAGGTGCAGGTGCCCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATGCAGGTTCCTATGCGTCACTAG         AGGATACTTCTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 141930 ATGCAGGTTCCTATGCGTCACTAGGTA...AAGAGGATACTTCTGACAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTGGATG         GAACAGCATCTGAAGATG         GCCGGGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 148188 CTGGATGGTA...TAGGAACAGCATCTGAAGATGGTA...CAGGCCGGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 GAGAGCAAAACTTTCAGCACCACTTGCTGGCATGGGAAATGCCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152416 GAGAGCAAAACTTTCAGCACCACTTGCTGGCATGGGAAATGCCAAGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 ATTCTAGAGGAAGAAGTCGAACAAAAATGGTGTCTCAATCACAGC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 152466 ATTCTAGAGGAAGAAGTCGAACAAAAATGGTGTCTCAATCACAGCGTA..

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370     CTGGTAGCCGGTCTGGGTCTCCAGGAAGAGTTCTGACCACAACAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152516 .CAGCTGGTAGCCGGTCTGGGTCTCCAGGAAGAGTTCTGACCACAACAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CCTGTCCACTGTGAGCTCTGGTGTTCAAAGAGTCCTGGTCAATTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160031 CCTGTCCACTGTGAGCTCTGGTGTTCAAAGAGTCCTGGTCAATTCAGCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CAGCACAAAAAAGAAGCAAGATACCACGGAGCCAGGGCTGTAGCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160081 CAGCACAAAAAAGAAGCAAGATACCACGGAGCCAGGGCTGTAGCAGAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 GCTAGTCCATCTAGGCTTTCAGTGG         CCCGAAGCAGTCGTAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 160131 GCTAGTCCATCTAGGCTTTCAGTGGGTA...CAGCCCGAAGCAGTCGTAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 TCCTCGACCAAGTGTGAGTCAAGGATGCAGCCGGGAAGCTAGTCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162993 TCCTCGACCAAGTGTGAGTCAAGGATGCAGCCGGGAAGCTAGTCGGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 GCAGCAGAGACACAAGTCCTGTTCGCTCTTTTCAGCCCCTCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 163043 GCAGCAGAGACACAAGTCCTGTTCGCTCTTTTCAGCCCCTCGGTA...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1649  CCTCCAGACACCATTCCAGATCAACTGGTGCCCTCTACGCCCCCGAAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167640 GCCTCCAGACACCATTCCAGATCAACTGGTGCCCTCTACGCCCCCGAAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 GTATGGGGCCTCAG         GTCCAGGTTATGGGATCAGCCAATCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 167690 GTATGGGGCCTCAGGTG...TAGGTCCAGGTTATGGGATCAGCCAATCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 GTCGACTGTCGTCTTCTGTTAGTGCCATGCGAGTCCTGAACACAGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168657 GTCGACTGTCGTCTTCTGTTAGTGCCATGCGAGTCCTGAACACAGGTTCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GATGTGGAGGAGGCGGTGGCAGATGCCTTG         AAAAAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 168707 GATGTGGAGGAGGCGGTGGCAGATGCCTTGGTA...CAGAAAAAACCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 TCGAAGAAGATATGAATCATATGGAATGCATTCAGATGATGACGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171562 TCGAAGAAGATATGAATCATATGGAATGCATTCAGATGATGACGCCAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 GCGATGCATCTAGTGCTTGTTCAGAACGCTCCTATAGTTCTCGAAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171612 GCGATGCATCTAGTGCTTGTTCAGAACGCTCCTATAGTTCTCGAAATGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 AGTATTCCTACATATATGAGGCAGACGGAAGATGTGGCAGAAGTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171662 AGTATTCCTACATATATGAGGCAGACGGAAGATGTGGCAGAAGTCCTCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 TAGATGTGCTAGTTCCAATTGGTCAGAAAGGAAAGAAGGCCTCCTAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171712 TAGATGTGCTAGTTCCAATTGGTCAGAAAGGAAAGAAGGCCTCCTAGGTC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 TGCAGAACTTATTAAAAAATCAGAGAACACTAAG         TCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 171762 TGCAGAACTTATTAAAAAATCAGAGAACACTAAGGTG...CAGTCGAGTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 GAACTGAAAAGATTATGTGAAATTTTCACAAGAATGTTTGCTGACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174122 GAACTGAAAAGATTATGTGAAATTTTCACAAGAATGTTTGCTGACCCTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 TGGCAAGAGA          GTATTCAGCATGTTTTTGGAGACTCTAGTG
        |||||||  |->>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 174172 TGGCAAGGTATGTT...TAGGTATTCAGCATGTTTTTGGAGACTCTAGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 GATTTCATACAAGTCCACAAAGATGATCTTCAAGATTGGTTGTTTGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183964 GATTTCATACAAGTCCACAAAGATGATCTTCAAGATTGGTTGTTTGTACT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 GCTGACACAACTACTAAAAAAAATGGGTGCTGATTTGCTTGGATCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184014 GCTGACACAACTACTAAAAAAAATGGGTGCTGATTTGCTTGGATCTGTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 AGGCAAAAGTTCAGAAAGCCCTTGATGTTACAAG         AGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 184064 AGGCAAAAGTTCAGAAAGCCCTTGATGTTACAAGGTA...CAGAGAGTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2302 TTTCCAAATGATCTTCAGTTCAATATTCTAATGAGATTTACAGTTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185527 TTTCCAAATGATCTTCAGTTCAATATTCTAATGAGATTTACAGTTGATCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 GACCCAGACACCAAGCTTAAAG         GTGAAGGTTGCTATCCTTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 185577 GACCCAGACACCAAGCTTAAAGGTA...CAGGTGAAGGTTGCTATCCTTA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 AATACATAGAAACTCTGGCCAAACAGATGGATCCAGGAGATTTTATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193529 AATACATAGAAACTCTGGCCAAACAGATGGATCCAGGAGATTTTATAAAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 TCCAGTGAAACTCGCCTAGCAGTGTCTCGGGTCATCACTTGGACAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193579 TCCAGTGAAACTCGCCTAGCAGTGTCTCGGGTCATCACTTGGACAACAGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 ACCCAAAAGTTCTGATGTTCGGAAG         GCAGCACAGTCAGTGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 193629 ACCCAAAAGTTCTGATGTTCGGAAGGTA...TAGGCAGCACAGTCAGTGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TGATTTCATTATTTGAACTCAATACCCCAGAGTTTACAATGTTATTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200080 TGATTTCATTATTTGAACTCAATACCCCAGAGTTTACAATGTTATTAGGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 GCTTTACCAAAAACTTTTCAGGATGGTGCTACCAAGCTTCTTCATAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200130 GCTTTACCAAAAACTTTTCAGGATGGTGCTACCAAGCTTCTTCATAATCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 CCTTCGAAACACTGGCAATGGAACCCAG         AGTTCCATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 200180 CCTTCGAAACACTGGCAATGGAACCCAGGTA...CAGAGTTCCATGGGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 GTCCTTTGACAAGACCAACACCACGATCACCAGCTAACTGGTCCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201379 GTCCTTTGACAAGACCAACACCACGATCACCAGCTAACTGGTCCAGTCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 CTTACTTCTCCTACCAATACATCACAGAATACTTTATCTCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 201429 CTTACTTCTCCTACCAATACATCACAGAATACTTTATCTCCAAGGTA...

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2769    TGCATTTGATTATGACACAGAAAATATGAACTCTGAAGATATTTATA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205960 TAGTGCATTTGATTATGACACAGAAAATATGAACTCTGAAGATATTTATA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 GCTCTCTTAGAGGTGTCACTGAAGCAATCCAGAATTTCAGCTTCCGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206010 GCTCTCTTAGAGGTGTCACTGAAGCAATCCAGAATTTCAGCTTCCGTAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 CAAGAAGATATGAATGAGCCATTGAAAAGGGATTCTAAAAAAGATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206060 CAAGAAGATATGAATGAGCCATTGAAAAGGGATTCTAAAAAAGATGATGG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 CGATTCA         ATGTGTGGTGGTCCTGGGATGTCTGACCCAAGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206110 CGATTCAGTA...TAGATGTGTGGTGGTCCTGGGATGTCTGACCCAAGAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 CAGGAGGTGATGCTACTGACTCAAGTCAAACAGCTCTTGATAATAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209478 CAGGAGGTGATGCTACTGACTCAAGTCAAACAGCTCTTGATAATAAAGCT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 TCATTGCTCCATTCAATGCCTACTCACTCCTCTCCACGCTCTCGAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209528 TCATTGCTCCATTCAATGCCTACTCACTCCTCTCCACGCTCTCGAGACTA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 TAATCCATATAACTATTCAGATAGCATCAGTCCCTTCAACAAGTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209578 TAATCCATATAACTATTCAGATAGCATCAGTCCCTTCAACAAGTCTGCCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3107 TCAAGGAAGCCATGTTTGATGATGATGCTGACCAGTTTCCTGACG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 209628 TCAAGGAAGCCATGTTTGATGATGATGCTGACCAGTTTCCTGACGGTA..

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3152     ATCTTTCCCTAGATCATTCTGACCTAGTTGCAGAGTTGTTGAAGGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209678 .CAGATCTTTCCCTAGATCATTCTGACCTAGTTGCAGAGTTGTTGAAGGA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 GCTGTCTAACCATAATGAGCGTGTAGAAGAAAGAAAAATTGCCCTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227777 GCTGTCTAACCATAATGAGCGTGTAGAAGAAAGAAAAATTGCCCTCTATG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 AACTTATGAAACTGACACAGGAAGAATCTTTTAGTGTTTGGGATGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227827 AACTTATGAAACTGACACAGGAAGAATCTTTTAGTGTTTGGGATGAACAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3298 TTCAAAACAATATTGCTTTTATTGCTTGAAACGCTTGGAGATAAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 227877 TTCAAAACAATATTGCTTTTATTGCTTGAAACGCTTGGAGATAAAGAGGT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3346        CCTACAATCAGGGCTTTGGCATTAAAGGTTTTAAGAGAAATCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227927 A...TAGCCTACAATCAGGGCTTTGGCATTAAAGGTTTTAAGAGAAATCC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 TAAGGCATCAACCAGCAAGATTTAAAAACTATGCAGAATTGACTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228797 TAAGGCATCAACCAGCAAGATTTAAAAACTATGCAGAATTGACTGTCATG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 AAAACATTGGAAGCACATAAAGATCCTCATAAGGAG         GTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 228847 AAAACATTGGAAGCACATAAAGATCCTCATAAGGAGGTA...TAGGTGGT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3480 GAGATCTGCTGAGGAAGCGGCATCAGTGTTGGCCACTTCAATTAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234146 GAGATCTGCTGAGGAAGCGGCATCAGTGTTGGCCACTTCAATTAGTCCAG

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3530 AGCAGTGCATCAAAGTGCTTTGTCCTATCATTCAAACTGCAGACTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234196 AGCAGTGCATCAAAGTGCTTTGTCCTATCATTCAAACTGCAGACTACCCA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3580 ATTAATCTGGCTGCAATCAAAATGCAAACAAAAGTGATAGAGAGAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234246 ATTAATCTGGCTGCAATCAAAATGCAAACAAAAGTGATAGAGAGAGTGTC

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3630 CAAGGAAACCCTAAACCTGCTTTTGCCAGAGATTATGCCAGGTCTAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234296 CAAGGAAACCCTAAACCTGCTTTTGCCAGAGATTATGCCAGGTCTAATAC

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3680 AG         GGTTATGATAATTCAGAGAGCAGTGTTCGGAAAGCTTGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234346 AGGTA...TAGGGTTATGATAATTCAGAGAGCAGTGTTCGGAAAGCTTGT

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3721 GTCTTCTGCCTGGTGGCTGTTCATGCGGTAATTGGTGATGAACTAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243176 GTCTTCTGCCTGGTGGCTGTTCATGCGGTAATTGGTGATGAACTAAAACC

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3771 ACATCTCAGTCAACTTACTGGCAGTAAA         ATGAAGCTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 243226 ACATCTCAGTCAACTTACTGGCAGTAAAGTA...CAGATGAAGCTACTGA

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3812 ATCTTTACATCAAACGTGCACAAACAGGTTCTGGAGGAGCTGATCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246201 ATCTTTACATCAAACGTGCACAAACAGGTTCTGGAGGAGCTGATCCCACT

   4150     .    :    .    :
   3862 ACTGATGTTTCTGGACAAAGT
        |||||||||||||||||||||
 246251 ACTGATGTTTCTGGACAAAGT