Result of SIM4 for
pF1KA0623
seq1 = pF1KA0623.tfa, 3108 bp
seq2 = pF1KA0623/gi568815581r_19676352.tfa (gi568815581r:19676352_19967417), 291066 bp
>pF1KA0623 3108
>gi568815581r:19676352_19967417 (Chr17)
(complement)
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91-183 (101590-101682) 100% ->
184-225 (102574-102615) 100% ->
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1998-2101 (171693-171796) 100% ->
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2640-2758 (186314-186432) 100% ->
2759-2916 (186789-186946) 99% ->
2917-3052 (189702-189837) 100% ->
3053-3108 (191011-191066) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACA
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100001 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACA
50 . : . : . : . : . :
51 CGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCGGGGGCGGCACCGCCAG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
100051 CGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCGGGGGCGGCACCGCCAGGTG...CAGA
100 . : . : . : . : . :
92 AAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101591 AAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCA
150 . : . : . : . : . :
142 AAATCACAAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
101641 AAATCACAAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGTA...TA
200 . : . : . : . : . :
184 GAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTTCAG
>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
102573 GGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTTCAGGTA...C
250 . : . : . : . : . :
226 GAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAG TATTGC
>>|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
117642 AGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGGTA...CAGTATTGC
300 . : . : . : . : . :
265 AATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAG CGAAAGGGAC
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
118019 AATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGGTA...CAGCGAAAGGGAC
350 . : . : . : . : . :
306 TCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120518 TCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCA
400 . : . : . : . : . :
356 TGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120568 TGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAG
450 . : . : . : . : . :
406 AACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120618 AACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTAT
500 . : . : . : . : . :
456 TCGCATCAAAATAG CGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTAC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
120668 TCGCATCAAAATAGGTA...TAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTAC
550 . : . : . : . : . :
497 ATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGATCCCCGATGTACATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
122068 ATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGTG
600 . : . : . : . : . :
544 GCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122118 ...CAGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGA
650 . : . : . : . : . :
588 CTTGTGGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124240 CTTGTGGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCAC
700 . : . : . : . : . :
638 CTTTTCAG GCCAATAGTCCTCAAGACTTAAGGATGTTTTAT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
124290 CTTTTCAGGTA...TAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTAAGGATGTTTTAT
750 . : . : . : . : . :
679 GAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAG TATTCCCAGAGAAAC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
125904 GAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGGTA...CAGTATTCCCAGAGAAAC
800 . : . : . : . : . :
720 ATCACCTTATTTGGCTAATCTCCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128850 ATCACCTTATTTGGCTAATCTCCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAA
850 . : . : . : . : . :
770 AAGATAGAATGGACTTTG AAGCGTTTTTTAGCCATCCTTTT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||| ||||||||||||||||||
128900 AAGATAGAATGGACTTTGGTA...CAGAAGCATTTTTTAGCCATCCTTTT
900 . : . : . : . : . :
811 CTTGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAAT CTTGCCCAGTTCCAGT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
141255 CTTGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATGTG...TAGCTTGCCCAGTTCCAGT
950 . : . : . : . : . :
852 GCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142252 GCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCCAT
1000 . : . : . : . : . :
902 CTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCA TCCCTTCCAGATATGCAG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
142302 CTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCAGTA...TAGTCCCTTCCAGATATGCAG
1050 . : . : . : . : . :
943 CATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150516 CATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTA
1100 . : . : . : . : . :
993 TCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150566 TCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTT
1150 . : . : . : . : . :
1043 GTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150616 GTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCAC
1200 . : . : . : . : . :
1093 TCAT GTGATATGCCAATGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTC
||||>>>...>>>||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
150666 TCATGTG...TAGGTGATATGCCAGTGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTC
1250 . : . : . : . : . :
1134 AAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGG GCAGTGTCAGCCTACTG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
157017 AAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGTA...CAGGCAGTGTCAGCCTACTG
1300 . : . : . : . : . :
1175 TGTCACCTCACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162605 TGTCACCTCACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGG
1350 . : . : . : . : . :
1225 AATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCAGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162655 AATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCAGGCAC
1400 . : . : . : . : . :
1275 AAATGTACATGGTTCTCCAAG ATCTGCAGTGGTACGAAGGT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
162705 AAATGTACATGGTTCTCCAAGGTA...CAGATCTGCAGTGGTACGAAGGT
1450 . : . : . : . : . :
1316 CCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165516 CCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTA
1500 . : . : . : . : . :
1366 CCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165566 CCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTC
1550 . : . : . : . : . :
1416 TAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGG TTGGTACCATTCCTG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
165616 TAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGGTA...TAGTTGGTACCATTCCTG
1600 . : . : . : . : . :
1457 AGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167858 AGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGG
1650 . : . : . : . : . :
1507 AGTAGAAACTCCTCAG GTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
167908 AGTAGAAACTCCTCAGGTA...TAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTC
1700 . : . : . : . : . :
1548 CCCACAGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169761 CCCACAGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCA
1750 . : . : . : . : . :
1598 CTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACTCTGACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169811 CTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACTCTGACCCC
1800 . : . : . : . : . :
1648 GTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169861 GTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAG
1850 . : . : . : . : . :
1698 TCGGCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169911 TCGGCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTC
1900 . : . : . : . : . :
1748 CACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAACAATCATTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169961 CACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAACAATCATTGGC
1950 . : . : . : . : . :
1798 TCTCCTACTAAG ACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAAC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
170011 TCTCCTACTAAGGTT...TAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAAC
2000 . : . : . : . : . :
1839 TCAAGCATCTTCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171165 TCAAGCATCTTCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTG
2050 . : . : . : . : . :
1889 AAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171215 AAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGCCTC
2100 . : . : . : . : . :
1939 TTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171265 TTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCAGCAGAGCAAGGCAGT
2150 . : . : . : . : . :
1989 GTTTGGCAG ATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAAC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
171315 GTTTGGCAGGTA...TAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAAC
2200 . : . : . : . : . :
2030 AAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171725 AAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAAT
2250 . : . : . : . : . :
2080 ACAGAACGACCAATGGATATAG CTCCGGCAGGAGCCTGTGG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
171775 ACAGAACGACCAATGGATATAGGTA...TAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGG
2300 . : . : . : . : . :
2121 TGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181351 TGGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCC
2350 . : . : . : . : . :
2171 TCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181401 TCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACC
2400 . : . : . : . : . :
2221 CACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAG TGGGGCCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
181451 CACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGGTA...TAGTGGGGCCCAG
2450 . : . : . : . : . :
2262 CAACTCCGGGGGCTCTCTTTGTGCCATGAGTGGCCGCGTGTGCGTGGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183523 CAACTCCGGGGGCTCTCTTTGTGCCATGAGTGGCCGCGTGTGCGTGGGGT
2500 . : . : . : . : . :
2312 CCCCGCCTGGCCCAGGCTTCGGCTCTTCCCCTCCAGGAGCAGAGGCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183573 CCCCGCCTGGCCCAGGCTTCGGCTCTTCCCCTCCAGGAGCAGAGGCAGCT
2550 . : . : . : . : . :
2362 CCCAGCCTGAGATACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCAGCCTAGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183623 CCCAGCCTGAGATACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCAGCCTAGAGGG
2600 . : . : . : . : . :
2412 GCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCTGATGGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
183673 GCTCATCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCTGATGGAGG
2650 . : . : . : . : . :
2461 CGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183723 TA...CAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTG
2700 . : . : . : . : . :
2503 ATGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185393 ATGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCC
2750 . : . : . : . : . :
2553 TGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185443 TGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCCTTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTGG
2800 . : . : . : . : . :
2603 TGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGG GCGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
185493 TGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGTG...CAGGCGG
2850 . : . : . : . : . :
2644 GTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186318 GTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTC
2900 . : . : . : . : . :
2694 TCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186368 TCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCA
2950 . : . : . : . : . :
2744 CAGCTGTGAAACAAG TTGTCAAGAATCTGAACGAACGATAT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
186418 CAGCTGTGAAACAAGGTA...CAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATAT
3000 . : . : . : . : . :
2785 AAATTCTGCATCACCATGCGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATT
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
186815 AAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATT
3050 . : . : . : . : . :
2835 CTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186865 CTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAG
3100 . : . : . : . : . :
2885 AGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATG GTTCAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
186915 AGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTA...CAGGTTCAGTCT
3150 . : . : . : . : . :
2926 GCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189711 GCAGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTA
3200 . : . : . : . : . :
2976 TCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189761 TCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAGGACC
3250 . : . : . : . : . :
3026 CTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAAT ATAAATGTAGTATT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
189811 CTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAATGTA...TAGATAAATGTAGTATT
3300 . : . : . : . :
3067 GAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
191025 GAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG