seq1 = pF1KA0597.tfa, 2730 bp
seq2 = pF1KA0597/gi568815593f_10277796.tfa (gi568815593f:10277796_10533681), 255886 bp

>pF1KA0597 2730
>gi568815593f:10277796_10533681 (Chr5)

1-19  (76104-76122)   100% ->
20-116  (100003-100099)   100% ->
117-190  (100964-101037)   100% ->
191-334  (104005-104148)   100% ->
335-407  (109199-109271)   100% ->
408-576  (112537-112705)   100% ->
577-766  (113747-113936)   100% ->
767-828  (116287-116348)   100% ->
829-861  (116958-116990)   100% ->
862-913  (119498-119549)   100% ->
914-972  (122989-123047)   100% ->
973-1053  (124264-124344)   100% ->
1054-1122  (124589-124657)   100% ->
1123-1197  (124738-124812)   100% ->
1198-1332  (125612-125746)   100% ->
1333-1452  (127763-127882)   100% ->
1453-1553  (129307-129407)   100% ->
1554-1691  (132344-132481)   100% ->
1692-1896  (133538-133742)   100% ->
1897-1966  (136638-136707)   100% ->
1967-2148  (137693-137874)   100% ->
2149-2283  (139475-139609)   100% ->
2284-2373  (145940-146029)   100% ->
2374-2506  (148595-148727)   100% ->
2507-2642  (152098-152233)   100% ->
2643-2730  (155799-155886)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACCGCGGAGGAAG         ACATATGTAGAGTGTGTCGGTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  76104 ATGGACACCGCGGAGGAAGGTA...CAGACATATGTAGAGTGTGTCGGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGAAGGAACACCTGAGAAACCGCTTTATCATCCTTGTGTATGTACTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 AGAAGGAACACCTGAGAAACCGCTTTATCATCCTTGTGTATGTACTGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTATTAAGTTTATCCATCAAGAATG         CTTAGTTCAATGGCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100075 GTATTAAGTTTATCCATCAAGAATGGTA...CAGCTTAGTTCAATGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAACACAGTCGAAAAGAATACTGTGAATTATGCAAGCACAGATTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100980 AAACACAGTCGAAAAGAATACTGTGAATTATGCAAGCACAGATTTGCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TACACCAA         TTTATTCTCCAGATATGCCTTCACGGCTTCCAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101030 TACACCAAGTA...TAGTTTATTCTCCAGATATGCCTTCACGGCTTCCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTCAAGACATATTTGCTGGACTGGTTACAAGTATTGGCACTGCAATACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104038 TTCAAGACATATTTGCTGGACTGGTTACAAGTATTGGCACTGCAATACGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TATTGGTTTCATTATACACTTGTGGCCTTTGCATGGTTGGGAGTTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104088 TATTGGTTTCATTATACACTTGTGGCCTTTGCATGGTTGGGAGTTGTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTTACAGCAT         GCCGCATCTACAAGTGCTTGTTTACTGGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104138 TCTTACAGCATGTG...TAGGCCGCATCTACAAGTGCTTGTTTACTGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCGTGAGCTCACTACTGACGCTGCCATTAGATATGCTGTCAAC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 109229 CCGTGAGCTCACTACTGACGCTGCCATTAGATATGCTGTCAACGTG...T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    408   GGAAAATTTGTTGGCAGATTGTTTGCAGGGTTGTTTTGTGGTGACGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112535 AGGGAAAATTTGTTGGCAGATTGTTTGCAGGGTTGTTTTGTGGTGACGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACACTGTGTGCATTCATCAGCCTGGTGTGGTTGAGAGAGCAGATAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112585 CACACTGTGTGCATTCATCAGCCTGGTGTGGTTGAGAGAGCAGATAGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATGGGGGAGCACCAATTTGGTTGGAGCATGCTGCCCCACCGTTCAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112635 ATGGGGGAGCACCAATTTGGTTGGAGCATGCTGCCCCACCGTTCAATGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCGGGGCATCACCAAAATGAG         GCTCCAGCAGGAGGAAATGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 112685 GCGGGGCATCACCAAAATGAGGTA...TAGGCTCCAGCAGGAGGAAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGCAGAAAATGTTGCTGCTGATCAGCCTGCTAACCCACCAGCTGAGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113767 TGCAGAAAATGTTGCTGCTGATCAGCCTGCTAACCCACCAGCTGAGAACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAGTGGTGGGGGAAAACCCTGATGCCCAGGATGACCAGGCAGAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113817 CAGTGGTGGGGGAAAACCCTGATGCCCAGGATGACCAGGCAGAAGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGGAGGACAATGAGGAGGAAGATGACGCTGGTGTGGAGGATGCGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113867 GAGGAGGACAATGAGGAGGAAGATGACGCTGGTGTGGAGGATGCGGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCTAATAACGGAGCCCAGG         ATGACATGAATTGGAATGCTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113917 TGCTAATAACGGAGCCCAGGGTA...CAGATGACATGAATTGGAATGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TAGAATGGGACCGAGCTGCTGAAGAGCTTACATGGGAAAGA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116308 TAGAATGGGACCGAGCTGCTGAAGAGCTTACATGGGAAAGAGTA...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ATGCTAGGACTTGATGGATCACTAGTTTTTCTG         GAACATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 116958 ATGCTAGGACTTGATGGATCACTAGTTTTTCTGGTA...TAGGAACATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CTTCTGGGTGGTATCTTTAAATACACTGTTCATTCTTGTTTTTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119506 CTTCTGGGTGGTATCTTTAAATACACTGTTCATTCTTGTTTTTGGTA...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    914    CATTTTGCCCTTACCATATTGGTCATTTCTCCCTTGTTGGTTTGGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122986 TAGCATTTTGCCCTTACCATATTGGTCATTTCTCCCTTGTTGGTTTGGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TTTGAAGAACAC         GTCCAAGCATCTCATTTTGAAGGCCTAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 123036 TTTGAAGAACACGTG...CAGGTCCAAGCATCTCATTTTGAAGGCCTAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CACAACCATAGTTGGGTATATACTTTTAGCAATAACACTGATAATTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124293 CACAACCATAGTTGGGTATATACTTTTAGCAATAACACTGATAATTTGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 AT         GGCTTGGCAACTCTTGTGAAATTTCATAGATCTCGTCGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124343 ATGTA...TAGGGCTTGGCAACTCTTGTGAAATTTCATAGATCTCGTCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 TTACTGGGAGTCTGCTATATTGTTGTTAAG         GTCTCTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 124628 TTACTGGGAGTCTGCTATATTGTTGTTAAGGTA...AAGGTCTCTTTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 AGTGGTGGTAGAAATTGGAGTATTCCCTCTCATTTGTGGTTGGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124749 AGTGGTGGTAGAAATTGGAGTATTCCCTCTCATTTGTGGTTGGTGGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ATATCTGTTCCTTG         GAAATGTTTGATGCTACTCTGAAAGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 124799 ATATCTGTTCCTTGGTA...CAGGAAATGTTTGATGCTACTCTGAAAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225 CGAGAACTGAGCTTTCAGTCGGCTCCAGGTACTACCATGTTTCTGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125639 CGAGAACTGAGCTTTCAGTCGGCTCCAGGTACTACCATGTTTCTGCATTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 GCTAGTGGGAATGGTATATGTCTTCTACTTTGCCTCCTTCATTCTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125689 GCTAGTGGGAATGGTATATGTCTTCTACTTTGCCTCCTTCATTCTACTAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TGAGAGAG         GTACTTCGACCTGGTGTCCTGTGGTTTCTAAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125739 TGAGAGAGGTA...CAGGTACTTCGACCTGGTGTCCTGTGGTTTCTAAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 AATTTGAATGATCCAGATTTCAATCCAGTACAGGAAATGATCCATTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127796 AATTTGAATGATCCAGATTTCAATCCAGTACAGGAAATGATCCATTTGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 AATATATAGGCATCTCCGAAGATTTATTTTGTCAGTG         ATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 127846 AATATATAGGCATCTCCGAAGATTTATTTTGTCAGTGGTA...CAGATTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 TCTTTGGCTCCATTGTCCTCCTGATGCTTTGGCTTCCTATACGTATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129311 TCTTTGGCTCCATTGTCCTCCTGATGCTTTGGCTTCCTATACGTATAATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 AAGAGTGTGCTGCCTAATTTTCTTCCATACAATGTCATGCTCTACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 129361 AAGAGTGTGCTGCCTAATTTTCTTCCATACAATGTCATGCTCTACAGGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1554       TGATGCTCCAGTGAGTGAACTGTCCCTCGAGCTGCTTCTGCTTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129411 ...CAGTGATGCTCCAGTGAGTGAACTGTCCCTCGAGCTGCTTCTGCTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 AGGTTGTCTTGCCAGCATTACTCGAACAGGGACACACGAGGCAGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132388 AGGTTGTCTTGCCAGCATTACTCGAACAGGGACACACGAGGCAGTGGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 AAGGGGCTGGTGCGAGCGTGGACTGTGACCGCCGGATACTTGCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 132438 AAGGGGCTGGTGCGAGCGTGGACTGTGACCGCCGGATACTTGCTGTG...

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692    GGATCTTCATTCTTATTTATTGGGAGACCAGGAAGAAAATGAAAACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133535 CAGGGATCTTCATTCTTATTTATTGGGAGACCAGGAAGAAAATGAAAACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 GTGCAAATCAACAAGTTAACAATAATCAGCATGCTCGAAATAACAACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133585 GTGCAAATCAACAAGTTAACAATAATCAGCATGCTCGAAATAACAACGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 ATTCCTGTGGTGGGAGAAGGCCTTCATGCAGCCCACCAAGCCATACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133635 ATTCCTGTGGTGGGAGAAGGCCTTCATGCAGCCCACCAAGCCATACTCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 GCAGGGAGGGCCTGTTGGCTTTCAGCCTTACCGCCGACCTTTAAATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133685 GCAGGGAGGGCCTGTTGGCTTTCAGCCTTACCGCCGACCTTTAAATTTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 CACTCAGG         ATATTTCTGTTGATTGTCTTCATGTGTATAACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 133735 CACTCAGGGTA...CAGATATTTCTGTTGATTGTCTTCATGTGTATAACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 TTACTGATTGCCAGCCTCATCTGCCTTACTTTACCAG         TATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 136671 TTACTGATTGCCAGCCTCATCTGCCTTACTTTACCAGGTA...CAGTATT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 TGCTGGCCGTTGGTTAATGTCGTTTTGGACGGGGACTGCCAAAATCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137697 TGCTGGCCGTTGGTTAATGTCGTTTTGGACGGGGACTGCCAAAATCCATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 AGCTCTACACAGCTGCTTGTGGTCTCTATGTTTGCTGGCTAACCATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137747 AGCTCTACACAGCTGCTTGTGGTCTCTATGTTTGCTGGCTAACCATAAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 GCTGTGACGGTGATGGTGGCATGGATGCCTCAGGGACGCAGAGTGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137797 GCTGTGACGGTGATGGTGGCATGGATGCCTCAGGGACGCAGAGTGATCTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 CCAGAAGGTTAAAGAGTGGTCTCTCATG         ATCATGAAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 137847 CCAGAAGGTTAAAGAGTGGTCTCTCATGGTA...TAGATCATGAAGACTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 TGATAGTTGCGGTGCTGTTGGCTGGAGTTGTCCCTCTCCTTCTGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139488 TGATAGTTGCGGTGCTGTTGGCTGGAGTTGTCCCTCTCCTTCTGGGGCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 CTGTTTGAGCTGGTCATTGTGGCTCCCCTGAGGGTTCCCTTGGATCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139538 CTGTTTGAGCTGGTCATTGTGGCTCCCCTGAGGGTTCCCTTGGATCAGAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 TCCTCTTTTTTATCCATGGCAG         GACTGGGCACTTGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 139588 TCCTCTTTTTTATCCATGGCAGGTA...TAGGACTGGGCACTTGGAGTCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 TGCATGCCAAAATCATTGCAGCTATAACATTGATGGGTCCTCAGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145959 TGCATGCCAAAATCATTGCAGCTATAACATTGATGGGTCCTCAGTGGTGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 TTGAAAACTGTAATTGAACAG         GTTTACGCAAATGGCATCCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 146009 TTGAAAACTGTAATTGAACAGGTA...CAGGTTTACGCAAATGGCATCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2394 GAACATTGACCTTCACTATATTGTTCGTAAACTGGCAGCTCCCGTGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148615 GAACATTGACCTTCACTATATTGTTCGTAAACTGGCAGCTCCCGTGATCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2444 CTGTGCTGTTGCTTTCCCTGTGTGTACCTTATGTCATAGCTTCTGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148665 CTGTGCTGTTGCTTTCCCTGTGTGTACCTTATGTCATAGCTTCTGGTGTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2494 GTTCCTTTACTAG         GTGTTACTGCGGAAATGCAAAACTTAGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 148715 GTTCCTTTACTAGGTA...TAGGTGTTACTGCGGAAATGCAAAACTTAGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2535 CCATCGGCGGATTTATCCATTTTTACTGATGGTCGTGGTATTGATGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152126 CCATCGGCGGATTTATCCATTTTTACTGATGGTCGTGGTATTGATGGCAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2585 TTTTGTCCTTCCAAGTCCGCCAGTTTAAGCGCCTTTATGAACATATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152176 TTTTGTCCTTCCAAGTCCGCCAGTTTAAGCGCCTTTATGAACATATTAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2635 AATGACAA         GTACCTTGTGGGTCAACGACTCGTGAACTACGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 152226 AATGACAAGTA...TAGGTACCTTGTGGGTCAACGACTCGTGAACTACGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2676 ACGGAAATCTGGCAAACAAGGCTCATCTCCACCACCTCCACAGTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155832 ACGGAAATCTGGCAAACAAGGCTCATCTCCACCACCTCCACAGTCATCCC

   2950     .
   2726 AAGAA
        |||||
 155882 AAGAA