seq1 = pF1KA0594.tfa, 3303 bp
seq2 = pF1KA0594/gi568815589f_70159079.tfa (gi568815589f:70159079_70452328), 293250 bp

>pF1KA0594 3303
>gi568815589f:70159079_70452328 (Chr9)

1-185  (100001-100185)   100% ->
186-327  (105226-105367)   100% ->
328-380  (108845-108897)   100% ->
381-543  (118232-118394)   100% ->
544-678  (119413-119547)   100% ->
679-819  (121681-121821)   100% ->
820-981  (123344-123505)   99% ->
982-1053  (127122-127193)   100% ->
1054-1309  (138888-139143)   100% ->
1310-1464  (140968-141122)   100% ->
1465-1578  (146169-146282)   100% ->
1579-1673  (155664-155758)   100% ->
1674-1806  (156368-156500)   100% ->
1807-1980  (159436-159609)   100% ->
1981-2150  (159716-159885)   100% ->
2151-2274  (164405-164528)   100% ->
2275-2397  (164943-165065)   100% ->
2398-2523  (185066-185191)   100% ->
2524-2568  (187527-187571)   97% ->
2569-2664  (187988-188083)   100% ->
2665-2769  (188535-188639)   100% ->
2770-2889  (188841-188960)   100% ->
2890-3069  (191036-191215)   100% ->
3070-3165  (191298-191393)   100% ->
3166-3303  (193113-193250)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTCCGAGCAAGAAGACGTCAACTCCAAGCCCCCAGCCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACTCCGAGCAAGAAGACGTCAACTCCAAGCCCCCAGCCTTCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGAGCTCTCCCGAGAGACCCTTCGTCGGAGGTCCCGAGCAAGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGAGCTCTCCCGAGAGACCCTTCGTCGGAGGTCCCGAGCAAGAGGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTCGGCCCCGCAGCTGCCGCTGTTGCAGTCGTCCGGGCCTTTCGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTCGGCCCCGCAGCTGCCGCTGTTGCAGTCGTCCGGGCCTTTCGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTCTATCGTCCGCATCTCGATGGAGAACTTCCT         AACATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100151 GGCTCTATCGTCCGCATCTCGATGGAGAACTTCCTGTA...CAGAACATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATATTTGTGAAGTATCTCCTGGACCCCACTTGAATATGATCGTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105232 TGATATTTGTGAAGTATCTCCTGGACCCCACTTGAATATGATCGTTGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAATGGAACAGGGAAGTCGAGCATTGTGTGTGCCATTTGCCTTGGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105282 CCAATGGAACAGGGAAGTCGAGCATTGTGTGTGCCATTTGCCTTGGTTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGAAAACCTGCTTTCATGGGACGAGCAGATAAG         GTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105332 GCTGGAAAACCTGCTTTCATGGGACGAGCAGATAAGGTG...TAGGTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTTTTTGTGAAGAGAGGATGTTCTAGAGGCATGGTTGAAATTGAATT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108850 GTTTTTTGTGAAGAGAGGATGTTCTAGAGGCATGGTTGAAATTGAATTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        GTTCAGGGCTTCTGGAAATCTTGTAATCACCCGTGAGATTGAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108900 A...TAGGTTCAGGGCTTCTGGAAATCTTGTAATCACCCGTGAGATTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGGCAAAAAATCAGTCCTTTTGGTTCATCAACAAAAAATCTACAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118275 GTGGCAAAAAATCAGTCCTTTTGGTTCATCAACAAAAAATCTACAACCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAAATAGTGGAAGAGAAAGTTGCAGCCTTAAATATTCAAGTGGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118325 GAAAATAGTGGAAGAGAAAGTTGCAGCCTTAAATATTCAAGTGGGGAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTGCCAGTTTCTCCCTCAG         GACAAAGTTGGAGAATTTGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118375 TTTGCCAGTTTCTCCCTCAGGTA...TAGGACAAAGTTGGAGAATTTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAACTCAGCAAAATTGAACTCCTCGAAGCCACTGAAAAGTCAATTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119434 AAACTCAGCAAAATTGAACTCCTCGAAGCCACTGAAAAGTCAATTGGTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCAGAAATGCACAAATATCACTGTGAACTCAAAAACTTAAGGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119484 CCCAGAAATGCACAAATATCACTGTGAACTCAAAAACTTAAGGGAGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAAACAGCTCGAG         ACCTCATGCAAAGAGAAAACTGAGTAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 119534 AAAAACAGCTCGAGGTA...TAGACCTCATGCAAAGAGAAAACTGAGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTACAGAAAATGGTTCAGAGGAATGAAAGATATAAACAAGATGTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121708 CTACAGAAAATGGTTCAGAGGAATGAAAGATATAAACAAGATGTGGAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTTCTATGAACGGAAGCGACATTTAGATTTAATTGAGATGCTTGAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121758 GTTCTATGAACGGAAGCGACATTTAGATTTAATTGAGATGCTTGAAGCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAAGGCCATGGGTG         GAATATGAAAATGTTCGTCAGGAATAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 121808 AAAGGCCATGGGTGGTA...AAGGAATATGAAAATGTTCGTCAGGAATAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAGAAGTAAAACTAGTTCGTGACCGAGTGAAGGAAGAGGTCAGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123371 GAAGAAGTAAAACTAGTTCGTGACCGAGTGAAGGAAGAGGTCAGAAAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TAAAGAAGGGCAGATTCCTATAACATGTCGAATTGAAGAAATGGAAAACG
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 123421 TAAAGAAGGGCAGATTCCTGTAACATGTCGAATTGAAGAAATGGAAAACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGCGTCACAATTTGGAGGCTCGAATCAAAGAAAAG         GCAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 123471 AGCGTCACAATTTGGAGGCTCGAATCAAAGAAAAGGTA...CAGGCAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GATATTAAGGAGGCATCTCAAAAATGCAAACAGAAGCAAGATGTTATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127128 GATATTAAGGAGGCATCTCAAAAATGCAAACAGAAGCAAGATGTTATAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAGGAAAGATAAACAT         ATTGAGGAACTTCAGCAGGCTTTAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127178 AAGGAAAGATAAACATGTA...TAGATTGAGGAACTTCAGCAGGCTTTAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TAGTAAAGCAAAATGAAGAGCTTGACCGACAGAGGAGAATAGGTAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138913 TAGTAAAGCAAAATGAAGAGCTTGACCGACAGAGGAGAATAGGTAATACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGCAAAATGATAGAGGATTTGCAAAATGAACTAAAGACCACGGAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138963 CGCAAAATGATAGAGGATTTGCAAAATGAACTAAAGACCACGGAAAACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGAGAATCTTCAGCCCCAGATTGATGCCATTACAAATGATCTGAGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139013 CGAGAATCTTCAGCCCCAGATTGATGCCATTACAAATGATCTGAGACGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTCAGGATGAAAAGGCATTATGTGAAGGCGAAATAATTGATAAGCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139063 TTCAGGATGAAAAGGCATTATGTGAAGGCGAAATAATTGATAAGCGAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGAGGGAAACTCTAGAGAAGGAGAAAAAGA         GTGTGGACGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 139113 GAGAGGGAAACTCTAGAGAAGGAGAAAAAGAGTA...TAGGTGTGGACGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TCATATTGTACGTTTTGACAATCTTATGAATCAGAAGGAAGATAAGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140978 TCATATTGTACGTTTTGACAATCTTATGAATCAGAAGGAAGATAAGCTAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GACAGAGATTCCGTGACACGTATGATGCTGTTTTATGGCTAAGAAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141028 GACAGAGATTCCGTGACACGTATGATGCTGTTTTATGGCTAAGAAATAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AGAGACAAATTTAAACAAAGAGTCTGTGAGCCCATAATGCTCACG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 141078 AGAGACAAATTTAAACAAAGAGTCTGTGAGCCCATAATGCTCACGGTA..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465     ATCAATATGAAAGATAATAAAAATGCCAAATATATTGAAAATCATA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141128 .TAGATCAATATGAAAGATAATAAAAATGCCAAATATATTGAAAATCATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTCCATCAAATGACTTAAGAGCCTTTGTATTTGAAAGTCAAGAAGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146215 TTCCATCAAATGACTTAAGAGCCTTTGTATTTGAAAGTCAAGAAGATATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GAGGTTTTCCTCAAAGAG         GTTCGTGACAATAAAAAATTAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 146265 GAGGTTTTCCTCAAAGAGGCA...CAGGTTCGTGACAATAAAAAATTAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGTAAATGCTGTTATTGCTCCCAAGAGTTCATATGCAGACAAAGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155687 AGTAAATGCTGTTATTGCTCCCAAGAGTTCATATGCAGACAAAGCACCTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CAAGATCTTTGAATGAACTTAA         ACAATACGGATTTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 155737 CAAGATCTTTGAATGAACTTAAGTA...CAGACAATACGGATTTTTCTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TATTTGAGAGAATTATTTGATGCACCTGATCCTGTAATGAGTTACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156387 TATTTGAGAGAATTATTTGATGCACCTGATCCTGTAATGAGTTACCTTTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CTGTCAGTATCATATTCATGAAGTTCCTGTAGGAACTGAAAAGACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156437 CTGTCAGTATCATATTCATGAAGTTCCTGTAGGAACTGAAAAGACCAGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAAGAATTGAACGG         GTAATACAAGAAACCCGATTAAAACAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 156487 AAAGAATTGAACGGGTA...TAGGTAATACAAGAAACCCGATTAAAACAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ATTTATACAGCAGAAGAAAAGTATGTGGTGAAAACTTCTTTTTATTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159463 ATTTATACAGCAGAAGAAAAGTATGTGGTGAAAACTTCTTTTTATTCAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CAAAGTTATTTCTAGTAACACATCTCTAAAAGTAGCGCAGTTTCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159513 CAAAGTTATTTCTAGTAACACATCTCTAAAAGTAGCGCAGTTTCTCACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TCACTGTGGACCTAGAGCAGAGAAGACACTTAGAAGAACAGCTAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 159563 TCACTGTGGACCTAGAGCAGAGAAGACACTTAGAAGAACAGCTAAAGGTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1981       GAAATTCATAGAAAATTGCAAGCAGTGGATTCAGGGTTGATTGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159613 ...TAGGAAATTCATAGAAAATTGCAAGCAGTGGATTCAGGGTTGATTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTTACGTGAAACAAGCAAACATCTGGAGCACAAAGACAATGAACTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159760 CTTACGTGAAACAAGCAAACATCTGGAGCACAAAGACAATGAACTTAGAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AAAAGAAGAAGGAGCTTCTTGAGAGAAAAACCAAGAAAAGACAACTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159810 AAAAGAAGAAGGAGCTTCTTGAGAGAAAAACCAAGAAAAGACAACTGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CAAAAAATCAGTTCCAAACTAGGAAG         TTTAAAGCTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 159860 CAAAAAATCAGTTCCAAACTAGGAAGGTA...CAGTTTAAAGCTGATGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 ACAGGATACTTGCAATCTTGAAGAGGAAGAGCGAAAAGCAAGTACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164420 ACAGGATACTTGCAATCTTGAAGAGGAAGAGCGAAAAGCAAGTACCAAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TCAAAGAAATAAATGTTCAAAAAGCGAAACTTGTTACCGAATTAACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164470 TCAAAGAAATAAATGTTCAAAAAGCGAAACTTGTTACCGAATTAACAAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CTAATAAAG         ATTTGTACTTCTTTGCATATACAAAAAGTAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 164520 CTAATAAAGGTA...TAGATTTGTACTTCTTTGCATATACAAAAAGTAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TTTAATTCTCCAAAATACTACAGTGATCTCTGAGAAGAACAAATTAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164975 TTTAATTCTCCAAAATACTACAGTGATCTCTGAGAAGAACAAATTAGAAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CAGATTATATGGCCGCATCTTCACAACTCCGTCTTACAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 165025 CAGATTATATGGCCGCATCTTCACAACTCCGTCTTACAGAGGTA...TAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CAACATTTCATTGAATTGGATGAAAATAGACAGAGATTATTGCAGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185066 CAACATTTCATTGAATTGGATGAAAATAGACAGAGATTATTGCAGAAATG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CAAGGAACTTATGAAAAGAGCTAGGCAAGTATGTAACCTGGGTGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185116 CAAGGAACTTATGAAAAGAGCTAGGCAAGTATGTAACCTGGGTGCAGAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 AGACTCTTCCTCAAGAATACCAGACA         CAAGTACCCACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| |||
 185166 AGACTCTTCCTCAAGAATACCAGACAGTA...CAGCAAGTACCCACCATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 CCAAATGGACACAACTCCTCACTCCCCATG         GTTTTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 187542 CCAAATGGACACAACTCCTCACTCCCCATGGTA...TAGGTTTTCCAAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCTTCCAAACACATTGGATGAAATTGATGCTTTATTAACTGAAGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187999 CCTTCCAAACACATTGGATGAAATTGATGCTTTATTAACTGAAGAAAGAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 CAAGAGCTTCCTGCTTCACGGGACTGAATCCTACA         ATTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 188049 CAAGAGCTTCCTGCTTCACGGGACTGAATCCTACAGTA...CAGATTGTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 CAGGAATATACAAAAAGAGAAGAAGAAATAGAACAGTTAACTGAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188541 CAGGAATATACAAAAAGAGAAGAAGAAATAGAACAGTTAACTGAGGAACT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 AAAGGGAAAGAAAGTTGAACTAGATCAATACAGGGAAAACATTTCACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 188591 AAAGGGAAAGAAAGTTGAACTAGATCAATACAGGGAAAACATTTCACAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770         GTAAAAGAAAGGTGGCTTAATCCTTTAAAAGAGCTGGTAGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188641 TA...TAGGTAAAAGAAAGGTGGCTTAATCCTTTAAAAGAGCTGGTAGAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 AAAATTAATGAAAAATTCAGCAATTTTTTTAGTTCCATGCAGTGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188883 AAAATTAATGAAAAATTCAGCAATTTTTTTAGTTCCATGCAGTGTGCTGG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 TGAAGTTGATCTCCATACAGAAAATGAG         GAAGATTATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 188933 TGAAGTTGATCTCCATACAGAAAATGAGGTA...TAGGAAGATTATGATA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 AATATGGAATTCGAATTAGAGTCAAATTTCGAAGTAGTACTCAACTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191049 AATATGGAATTCGAATTAGAGTCAAATTTCGAAGTAGTACTCAACTGCAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 GAATTAACTCCTCATCATCAAAGTGGAGGTGAAAGAAGTGTTTCTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191099 GAATTAACTCCTCATCATCAAAGTGGAGGTGAAAGAAGTGTTTCTACCAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 GTTATACTTGATGGCACTTCAGGAGCTAAATAGATGTCCATTCAGAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191149 GTTATACTTGATGGCACTTCAGGAGCTAAATAGATGTCCATTCAGAGTAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 TTGATGAAATCAATCAG         GGAATGGACCCAATCAATGAACGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 191199 TTGATGAAATCAATCAGGTA...TAGGGAATGGACCCAATCAATGAACGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 AGAGTGTTTGAAATGGTTGTAAATACTGCCTGTAAAGAAAATACATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191322 AGAGTGTTTGAAATGGTTGTAAATACTGCCTGTAAAGAAAATACATCTCA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3144 ATACTTTTTCATAACACCAAAG         CTCCTGCAAAATCTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 191372 ATACTTTTTCATAACACCAAAGGTA...CAGCTCCTGCAAAATCTTCCTT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 ATTCTGAAAAGATGACAGTTTTGTTTGTCTACAATGGCCCTCATATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193132 ATTCTGAAAAGATGACAGTTTTGTTTGTCTACAATGGCCCTCATATGCTG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3235 GAACCAAACACATGGAATTTAAAGGCTTTCCAAAGGCGGCGGCGCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193182 GAACCAAACACATGGAATTTAAAGGCTTTCCAAAGGCGGCGGCGCCGTAT

   3500     .    :    .
   3285 TACATTCACTCAACCTTCT
        |||||||||||||||||||
 193232 TACATTCACTCAACCTTCT