seq1 = pF1KA0584.tfa, 1878 bp
seq2 = pF1KA0584/gi568815597r_183838764.tfa (gi568815597r:183838764_184137357), 298594 bp

>pF1KA0584 1878
>gi568815597r:183838764_184137357 (Chr1)

(complement)

1-263  (100001-100263)   100% ->
264-374  (158838-158948)   100% ->
375-492  (162144-162261)   100% ->
493-627  (163608-163742)   100% ->
628-832  (167885-168089)   100% ->
833-952  (173338-173457)   100% ->
953-1029  (182520-182596)   100% ->
1030-1136  (186245-186351)   100% ->
1137-1269  (191794-191926)   100% ->
1270-1397  (193035-193162)   100% ->
1398-1604  (196571-196777)   100% ->
1605-1878  (198321-198594)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGCGCCCTGCTGCCACCCTCGCCTGGTCGCTACTGCTCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCGCGCCCTGCTGCCACCCTCGCCTGGTCGCTACTGCTCCTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGCCCTGCTCCGCGAAGGCTGCCGAGCGCGCTTCGTCGCCGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGCCCTGCTCCGCGAAGGCTGCCGAGCGCGCTTCGTCGCCGAGCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCGGAGGACGACGGAGAGGAGCCGGTGGTTTTCCCGGAGTCGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTCGGAGGACGACGGAGAGGAGCCGGTGGTTTTCCCGGAGTCGCCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAGCCCCACGGTGCTCGTGGCGGTCCTCGCCCGCAACGCGGCGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAGCCCCACGGTGCTCGTGGCGGTCCTCGCCCGCAACGCGGCGCACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCCGCACTTCCTCGGCTGCCTGGAGCGGCTGGACTACCCCAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCCGCACTTCCTCGGCTGCCTGGAGCGGCTGGACTACCCCAAGAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGATGGCCATCTG         GGCAGCCACTGATCACAATGTGGATAAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGATGGCCATCTGGTG...CAGGGCAGCCACTGATCACAATGTGGATAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACAACAGAAATATTCAGGGAGTGGTTGAAAAATGTACAGAGACTCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158866 ACAACAGAAATATTCAGGGAGTGGTTGAAAAATGTACAGAGACTCTATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTATGTGGAGTGGAGGCCTATGGATGAACCAGA         GTCTTACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 158916 CTATGTGGAGTGGAGGCCTATGGATGAACCAGAGTG...TAGGTCTTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGATGAAATTGGACCAAAGCACTGGCCAACCTCCCGGTTTGCCCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162152 CTGATGAAATTGGACCAAAGCACTGGCCAACCTCCCGGTTTGCCCATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGAAACTACGACAGGCAGCCCTTCGAACTGCGAGGGAAAAATGGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162202 ATGAAACTACGACAGGCAGCCCTTCGAACTGCGAGGGAAAAATGGTCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTACATTCTG         TTCATAGATGTTGACAATTTCCTGACTAATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 162252 CTACATTCTGGTA...TAGTTCATAGATGTTGACAATTTCCTGACTAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CACAGACCCTCAATCTACTGATTGCAGAAAACAAAACTATTGTGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163639 CACAGACCCTCAATCTACTGATTGCAGAAAACAAAACTATTGTGGCCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATGCTGGAGTCTCGGGGCCTGTATTCTAATTTCTGGTGCGGAATCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163689 ATGCTGGAGTCTCGGGGCCTGTATTCTAATTTCTGGTGCGGAATCACCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAAG         GGCTTCTATAAGAGGACCCCAGACTACGTTCAGATTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163739 TAAGGCA...CAGGGCTTCTATAAGAGGACCCCAGACTACGTTCAGATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGAATGGAAGAGGACAGGCTGCTTCCCCGTCCCCATGGTCCACTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167922 GAGAATGGAAGAGGACAGGCTGCTTCCCCGTCCCCATGGTCCACTCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCCTAATTGACCTCAGGAAGGAGGCCTCGGACAAGCTGACTTTCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167972 TTCCTAATTGACCTCAGGAAGGAGGCCTCGGACAAGCTGACTTTCTACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCCACACCAGGACTACACCTGGACCTTTGATGACATCATTGTCTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168022 CCCACACCAGGACTACACCTGGACCTTTGATGACATCATTGTCTTTGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCTCCAGCAGGCAAGCAG         GCATCCAGATGTACCTCTGCAAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 168072 TCTCCAGCAGGCAAGCAGGTA...CAGGCATCCAGATGTACCTCTGCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGAGAGCACTATGGCTACCTGCCCATCCCCCTGAAGCCCCATCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173361 AGAGAGCACTATGGCTACCTGCCCATCCCCCTGAAGCCCCATCAGACACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCAGGAAGACATCGAGAACCTCATCCATGTGCAGATTGAAGCAATGA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 173411 GCAGGAAGACATCGAGAACCTCATCCATGTGCAGATTGAAGCAATGAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    953       TTGACCGTCCTCCAATGGAACCCTCCCAGTATGTCTCAGTTGTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173461 ...CAGTTGACCGTCCTCCAATGGAACCCTCCCAGTATGTCTCAGTTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCTAAATATCCAGACAAGATGGGATTTGATGAG         ATTTTCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 182564 CCTAAATATCCAGACAAGATGGGATTTGATGAGGTA...TAGATTTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GATAAACCTCAAACGCAGAAAGGACAGGCGGGACCGGATGCTGCGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186253 GATAAACCTCAAACGCAGAAAGGACAGGCGGGACCGGATGCTGCGCACAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGTATGAACAGGAGATTGAGGTCAAGATTGTCGAGGCTGTGGATGGAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 186303 TGTATGAACAGGAGATTGAGGTCAAGATTGTCGAGGCTGTGGATGGAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1137         GGCACTCAACACAAGCCAGCTGAAGGCACTGAATATTGAAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186353 TG...CAGGGCACTCAACACAAGCCAGCTGAAGGCACTGAATATTGAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCTGCCTGGCTATCGAGATCCCTATTCCTCCAGGCCTCTAACAAGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191836 GCTGCCTGGCTATCGAGATCCCTATTCCTCCAGGCCTCTAACAAGGGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAATCGGCTGCTTTCTCAGCCACTACTCAGTCTGGAAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 191886 AAATCGGCTGCTTTCTCAGCCACTACTCAGTCTGGAAAGAGGTA...CAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTAATTGATCGAGAGCTAGAGAAGACTCTTGTAATTGAAGACGATGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193035 GTAATTGATCGAGAGCTAGAGAAGACTCTTGTAATTGAAGACGATGTGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TTTTGAGCATCAGTTTAAGAAGAAGCTGATGAAGCTGATGGATAACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193085 TTTTGAGCATCAGTTTAAGAAGAAGCTGATGAAGCTGATGGATAACATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ACCAGGCTCAGCTGGACTGGGAACTGAT         TTATATTGGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 193135 ACCAGGCTCAGCTGGACTGGGAACTGATGTG...CAGTTATATTGGTAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAGAGGATGCAAGTAAAGGAGCCAGAGAAAGCAGTGCCCAATGTGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196584 AAGAGGATGCAAGTAAAGGAGCCAGAGAAAGCAGTGCCCAATGTGGCAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CCTGGTCGAAGCCGACTATTCCTACTGGACCCTGGGCTACGTCATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196634 CCTGGTCGAAGCCGACTATTCCTACTGGACCCTGGGCTACGTCATCTCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGGAAGGAGCACAGAAGCTGGTTGGAGCCAATCCTTTTGGGAAGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196684 TGGAAGGAGCACAGAAGCTGGTTGGAGCCAATCCTTTTGGGAAGATGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCAGTGGATGAGTTTCTGCCAGTCATGTACAACAAGCATCCCGT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 196734 CCAGTGGATGAGTTTCTGCCAGTCATGTACAACAAGCATCCCGTGTG...

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1605    AGCCGAGTACAAGGAGTATTATGAATCCAGGGACCTGAAAGCCTTCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198318 CAGAGCCGAGTACAAGGAGTATTATGAATCCAGGGACCTGAAAGCCTTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CTGCAGAACCCTTGCTCATCTACCCTACGCACTACACAGGCCAGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198368 CTGCAGAACCCTTGCTCATCTACCCTACGCACTACACAGGCCAGCCGGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TACCTGAGTGACACGGAGACCTCCACCATCTGGGACAATGAGACAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198418 TACCTGAGTGACACGGAGACCTCCACCATCTGGGACAATGAGACAGTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CACCGACTGGGATAGGACACATGCCTGGAAGTCCCGGAAGCAAAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198468 CACCGACTGGGATAGGACACATGCCTGGAAGTCCCGGAAGCAAAGCCGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TCTACAGCAATGCCAAGAACACAGAGGCCCTGCCACCGCCAACCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198518 TCTACAGCAATGCCAAGAACACAGAGGCCCTGCCACCGCCAACCTCCCTG

   1950     .    :    .    :    .
   1852 GACACTGTGCCTTCAAGGGATGAGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||
 198568 GACACTGTGCCTTCAAGGGATGAGCTA