seq1 = pF1KA0571.tfa, 1914 bp
seq2 = pF1KA0571/gi568815587r_78119275.tfa (gi568815587r:78119275_78380862), 261588 bp

>pF1KA0571 1914
>gi568815587r:78119275_78380862 (Chr11)

(complement)

1-262  (100001-100262)   100% ->
263-506  (130463-130706)   100% ->
507-1093  (153812-154398)   100% ->
1094-1188  (155661-155755)   100% ->
1189-1453  (157187-157451)   100% ->
1454-1544  (158668-158758)   100% ->
1545-1647  (159084-159186)   100% ->
1648-1773  (160419-160544)   100% ->
1774-1914  (161448-161588)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGTGACCCAGATGTTCTGGAATACTACAAGAACGATCACTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGTGACCCAGATGTTCTGGAATACTACAAGAACGATCACTCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCCTCTGCGGATCATCAACCTGAACTTCTGTGAGCAGGTAGATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCCTCTGCGGATCATCAACCTGAACTTCTGTGAGCAGGTAGATGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGACCTTTAACAAGAAGGAGCTGCAGGATAGTTTTGTGTTTGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGACCTTTAACAAGAAGGAGCTGCAGGATAGTTTTGTGTTTGACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGACCAGTGAACGCACCTTTTACCTGGTGGCTGAGACAGAAGAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGACCAGTGAACGCACCTTTTACCTGGTGGCTGAGACAGAAGAGGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAATAAGTGGGTCCAGAGCATCTGCCAGATCTGTGGCTTCAATCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAATAAGTGGGTCCAGAGCATCTGCCAGATCTGTGGCTTCAATCAGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGAGCACAG         ACTCCCTGAGAAATGTTTCCTCAGCCGGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGAGCACAGGTA...CAGACTCCCTGAGAAATGTTTCCTCAGCCGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATGGCCCCCGCTCTTCTCCAGCTGAGCTCAGCAGCTCTAGCCAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130492 CATGGCCCCCGCTCTTCTCCAGCTGAGCTCAGCAGCTCTAGCCAGCACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCTCCGAGAGCGCAAGTCCTCAGCCCCATCACACTCCAGCCAGCCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130542 TCTCCGAGAGCGCAAGTCCTCAGCCCCATCACACTCCAGCCAGCCAACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTTCACGTTTGAACCCCCTGTGTCAAACCACATGCAGCCCACCTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130592 TGTTCACGTTTGAACCCCCTGTGTCAAACCACATGCAGCCCACCTTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCAGCGCACCTCAGGAGTATCTCTACTTGCACCAGTGCATAAGCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130642 ACCAGCGCACCTCAGGAGTATCTCTACTTGCACCAGTGCATAAGCCGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGCAGAAAATGCAAG         GAGTGCCAGCTTCTCTCAGGGCACCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130692 AGCAGAAAATGCAAGGTA...TAGGAGTGCCAGCTTCTCTCAGGGCACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAGCCTCTTTTCTCATGAGGAGTGACACAGCTGTACAAAAACTTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153838 GAGCCTCTTTTCTCATGAGGAGTGACACAGCTGTACAAAAACTTGCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCAATGGACACTGTGTCAACGGGATCAGTGGTCAAGTCCATGGCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153888 GGCAATGGACACTGTGTCAACGGGATCAGTGGTCAAGTCCATGGCTTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TAGCCTTCCCAAGCCGAGCCGGCACAATACAGAATTCAGAGACAGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153938 TAGCCTTCCCAAGCCGAGCCGGCACAATACAGAATTCAGAGACAGTACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGACCTCCCCCGCAGCCTGGCCTCCCATGGCCACACCAAGGGCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153988 ACGACCTCCCCCGCAGCCTGGCCTCCCATGGCCACACCAAGGGCAGCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACAGGCTCCGAGACAGATAATGAGGATGTGTACACCTTCAAGACGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154038 ACAGGCTCCGAGACAGATAATGAGGATGTGTACACCTTCAAGACGCCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAACACCCTGTGCAGGGAGTTCGGGGACCTCCTGGTAGACAATATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154088 CAACACCCTGTGCAGGGAGTTCGGGGACCTCCTGGTAGACAATATGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TTCCGGCCACCCCACTCTCAGCCTACCAGATCCCTAGGACATTCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154138 TTCCGGCCACCCCACTCTCAGCCTACCAGATCCCTAGGACATTCACTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GACAAAAACCACAATGCCATGACAGTGGCCACTCCTGGGGACTCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154188 GACAAAAACCACAATGCCATGACAGTGGCCACTCCTGGGGACTCAGCCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGCTCCCCCACCCCGCCCCCCCAAGCCAAGTCAGGCAGAAACACCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154238 AGCTCCCCCACCCCGCCCCCCCAAGCCAAGTCAGGCAGAAACACCTCGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GGGGCAGTCCTCAGCAGAGACCGCCAATCAGTGAAAATAGCAGATCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154288 GGGGCAGTCCTCAGCAGAGACCGCCAATCAGTGAAAATAGCAGATCTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCTGCCACCATCCCCAGACGCAACACCCTCCCTGCAATGGACAACAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154338 GCTGCCACCATCCCCAGACGCAACACCCTCCCTGCAATGGACAACAGCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ACTTCACCGAG         CTTCTTCCTGTGAGACCTACGAGTACCCAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 154388 ACTTCACCGAGGTC...CAGCTTCTTCCTGTGAGACCTACGAGTACCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGCGTGGTGGAGAGAGTGCAGGCCGGTCTGCTGAATCCATGAGTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155691 AGCGTGGTGGAGAGAGTGCAGGCCGGTCTGCTGAATCCATGAGTGATGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GTTGGCTCTTTCCTG         CCAGGGAAAATGATTGTGGGCCGATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 155741 GTTGGCTCTTTCCTGGTG...TAGCCAGGGAAAATGATTGTGGGCCGATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGACAGCACCAATTCTGAAGACAACTATGTGCCCATGAATCCAGGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157213 GGACAGCACCAATTCTGAAGACAACTATGTGCCCATGAATCCAGGTTCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CCACCCTGTTGGCCATGGAACGAGCAGGTGATAATTCCCAGAGCGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157263 CCACCCTGTTGGCCATGGAACGAGCAGGTGATAATTCCCAGAGCGTCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ATCCCAATGAGCCCAGGGGCCCATCACTTTGACTCACTTGGCTACCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157313 ATCCCAATGAGCCCAGGGGCCCATCACTTTGACTCACTTGGCTACCCATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AACAACCCTTCCTGTGCACCGAGGCCCCAGCAGAGGAAGTGAGATTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157363 AACAACCCTTCCTGTGCACCGAGGCCCCAGCAGAGGAAGTGAGATTCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CACCCCCTGTCAACCGCAACCTCAAACCTGATCGGAAAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 157413 CACCCCCTGTCAACCGCAACCTCAAACCTGATCGGAAAGGTA...CAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AAGCCAACACCACTTGACCTGAGGAACAACACCGTCATCGATGAACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158670 AAGCCAACACCACTTGACCTGAGGAACAACACCGTCATCGATGAACTCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTTCAAGTCACCTATCACCAAGTCTTGGTCTAGGGCCAA         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 158720 CTTCAAGTCACCTATCACCAAGTCTTGGTCTAGGGCCAAGTA...CAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ACACCTTCAACTCCAGCTCCTCCCAGTACTGCCGCCCCATCTCCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159086 ACACCTTCAACTCCAGCTCCTCCCAGTACTGCCGCCCCATCTCCACCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AGCATCACCAGCACAGACTCAGGAGACAGCGAAGAGAACTATGTCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159136 AGCATCACCAGCACAGACTCAGGAGACAGCGAAGAGAACTATGTCCCTAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 G         CAAAACCCAGTGTCTGCATCTCCCGTTCCCAGTGGCACGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159186 GGTG...CAGCAAAACCCAGTGTCTGCATCTCCCGTTCCCAGTGGCACGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ACAGTCCTGCCCCTAAGAAGAGCACCGGCAGCGTTGATTATCTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160459 ACAGTCCTGCCCCTAAGAAGAGCACCGGCAGCGTTGATTATCTGGCCCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GACTTCCAGCCGAGCTCCCCAAGCCCCCACCGCAAG         CCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 160509 GACTTCCAGCCGAGCTCCCCAAGCCCCCACCGCAAGGTG...CAGCCATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TACTTCATCCGTCACCTCTGATGAGAAGGTGGACTACGTTCAGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161453 TACTTCATCCGTCACCTCTGATGAGAAGGTGGACTACGTTCAGGTGGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AGGAGAAGACCCAGGCCCTGCAGAACACCATGCAGGAGTGGACAGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161503 AGGAGAAGACCCAGGCCCTGCAGAACACCATGCAGGAGTGGACAGACGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .
   1879 CGGCAGTCCTCAGAGCCTTCCAAGGGTGCCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161553 CGGCAGTCCTCAGAGCCTTCCAAGGGTGCCAAGCTG