seq1 = pF1KA0512.tfa, 1896 bp
seq2 = pF1KA0512/gi568815575r_101555693.tfa (gi568815575r:101555693_101757588), 201896 bp

>pF1KA0512 1896
>gi568815575r:101555693_101757588 (ChrX)

(complement)

1-1896  (100001-101896)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCGCGTTCGGGATGCTGGCTGTGTAGCGGCGGGGATAGTGATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCGCGTTCGGGATGCTGGCTGTGTAGCGGCGGGGATAGTGATAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGTGCCTGGTACTGTGTCTACAAATACACCAGGGGGAGAGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGTGCCTGGTACTGTGTCTACAAATACACCAGGGGGAGAGACCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGAAGAGAATGGCCAAGCCCAAAAACCGGGCTGTGGCTGGGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGAAGAGAATGGCCAAGCCCAAAAACCGGGCTGTGGCTGGGACTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAGGGCTAGAGCTGGGCTAAGAGCCGGATTCACAATCGACCTTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAGGGCTAGAGCTGGGCTAAGAGCCGGATTCACAATCGACCTTGGGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGATTCAGTCCCCCAACCCCAGTCCGTGCTGAAGCAGAGGACAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGATTCAGTCCCCCAACCCCAGTCCGTGCTGAAGCAGAGGACAGGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGATGAAGCCTCTGCTCTGGACACAGTTGGAGCTGAGGCAGTGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGATGAAGCCTCTGCTCTGGACACAGTTGGAGCTGAGGCAGTGGCCCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTGCATCCAGCGCTGAGGCTCAGAGTGGGGCAGGCAGTCAGGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTGCATCCAGCGCTGAGGCTCAGAGTGGGGCAGGCAGTCAGGCCCAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCAGATGGAGCCGGGGTTGGGCCTAAGGCCGAATCAGTAGTTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCAGATGGAGCCGGGGTTGGGCCTAAGGCCGAATCAGTAGTTGGGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAATGGCTTCTGCAATAGCACCACCTCCCGGGGTGACAGAGGCCCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAATGGCTTCTGCAATAGCACCACCTCCCGGGGTGACAGAGGCCCTTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGCAGAAGCCCCTGCAATGGCAGGGGCTCCCAAAGTGGCAGAAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGCAGAAGCCCCTGCAATGGCAGGGGCTCCCAAAGTGGCAGAAGCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGAGAAGCGGAGACTTCCAGGGCAGCGGTGCCTCCTGGGACAGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGAGAAGCGGAGACTTCCAGGGCAGCGGTGCCTCCTGGGACAGTGGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTACCGAAGCGGCAGCACCCACTGAGGTGACCGAGGGTCCTGGGGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTACCGAAGCGGCAGCACCCACTGAGGTGACCGAGGGTCCTGGGGTAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCACCTACCAAGGTAGCTGAAGCTCCCGGGGTGGCATCGCCTACCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCACCTACCAAGGTAGCTGAAGCTCCCGGGGTGGCATCGCCTACCGAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGCTGAGGCTCCTGTGCCCGCAACGCCTACTGGGGCTGCAGCACCTACTG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGCTGAGGCTCCTGTGCCGGCAACGCCTACTGGGGCTGCAGCACCTACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGCTGCAGAGTCTCCTGGAACTTCTGGTTCCCCTAGAACAGCGGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGCTGCAGAGTCTCCTGGAACTTCTGGTTCCCCTAGAACAGCGGTGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTGGAACATCAGCTGCCAAGAAAGCAACCCCTGGGGCTCACACTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTGGAACATCAGCTGCCAAGAAAGCAACCCCTGGGGCTCACACTGGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATACCGAAAGCCACATCAGCGACTGGAGCGGTACCCAAAGGTGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATACCGAAAGCCACATCAGCGACTGGAGCGGTACCCAAAGGTGGAGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGGTGTAACCAGGTCCCGGAATGGGGGCAAGGGCAAGGGCAAGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGGGTGTAACCAGGTCCCGGAATGGGGGCAAGGGCAAGGGCAAGAAAAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAGTTGAAGTAGACGAACTGGGGATGGGCTTCCGTCCTGGAGATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAGTTGAAGTAGACGAACTGGGGATGGGCTTCCGTCCTGGAGATGGGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCAGCAGCTGCTGCAGCCTCTGCTAATGGCGGACAGGCTTTCCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCAGCAGCTGCTGCAGCCTCTGCTAATGGCGGACAGGCTTTCCTGGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGTCCCTGATTCTGAGGAAGGGGAGTCCGGGTGGACTGACACAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGTCCCTGATTCTGAGGAAGGGGAGTCCGGGTGGACTGACACAGAGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GATTCAGACTCTGAGCCCGAGACCCAGCGCAGAGGGAGGGGAAGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GATTCAGACTCTGAGCCCGAGACCCAGCGCAGAGGGAGGGGAAGAAGACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGTTGCCATGCAGAAGCGCCCCTTTCCTTATGAAATTGATGAGATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGTTGCCATGCAGAAGCGCCCCTTTCCTTATGAAATTGATGAGATTCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTGTCCGCGATCTCAGGAAGGTCCTTGCCTTGCTTCAGAAATCTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTGTCCGCGATCTCAGGAAGGTCCTTGCCTTGCTTCAGAAATCTGATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCTTTCATCCAACAGGTAGCTTTGCTCACTCTGAGCAACAATGCCAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCTTTCATCCAACAGGTAGCTTTGCTCACTCTGAGCAACAATGCCAATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTCATGCAATCAAGAGACAATCCGCAAATTGGGAGGCCTCCCAATTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTCATGCAATCAAGAGACAATCCGCAAATTGGGAGGCCTCCCAATTATTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CAAACATGATCAACAAAACTGATCCACACATTAAGGAAAAAGCCTTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAAACATGATCAACAAAACTGATCCACACATTAAGGAAAAAGCCTTAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCATGAATAACCTGAGTGAGAATTATGAAAATCAGGGCCGGCTTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCATGAATAACCTGAGTGAGAATTATGAAAATCAGGGCCGGCTTCAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GTACATGAATAAAGTGATGGATGATATCATGGCCTCTAACCTGAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GTACATGAATAAAGTGATGGATGATATCATGGCCTCTAACCTGAACTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CAGTTCAAGTAGTTGGACTAAAATTTCTAACAAACATGACTATTACTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CAGTTCAAGTAGTTGGACTAAAATTTCTAACAAACATGACTATTACTAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GACTACCAACACCTGCTTGTCAATTCCATTGCAAACTTTTTCCGTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GACTACCAACACCTGCTTGTCAATTCCATTGCAAACTTTTTCCGTTTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ATCTCAGGGAGGTGGAAAAATCAAGGTTGAGATTTTGAAAATCCTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 ATCTCAGGGAGGTGGAAAAATCAAGGTTGAGATTTTGAAAATCCTTTCGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATTTTGCTGAAAATCCAGATATGTTGAAGAAACTTCTCAGTACCCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATTTTGCTGAAAATCCAGATATGTTGAAGAAACTTCTCAGTACCCAAGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CCAGCATCATTTAGTTCCCTCTATAATTCTTACGTGGAATCAGAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CCAGCATCATTTAGTTCCCTCTATAATTCTTACGTGGAATCAGAAATCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TATTAATGCCCTTACTCTATTTGAGATTATCTATGACAATCTCAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TATTAATGCCCTTACTCTATTTGAGATTATCTATGACAATCTCAGAGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AAGTGTTTAACTATAGAGAATTCAATAAAGGTTCCCTTTTTTACTTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AAGTGTTTAACTATAGAGAATTCAATAAAGGTTCCCTTTTTTACTTATGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACTACATCTGGAGTGTGTGTTAAGAAAATTAGAGCCTTAGCAAATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACTACATCTGGAGTGTGTGTTAAGAAAATTAGAGCCTTAGCAAATCACCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1851 TGACCTCTTAGTGAAAGTGAAAGTTATAAAACTAGTGAACAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TGACCTCTTAGTGAAAGTGAAAGTTATAAAACTAGTGAACAAATTC