seq1 = pF1KA0405.tfa, 1980 bp
seq2 = pF1KA0405/gi568815584f_85521515.tfa (gi568815584f:85521515_85723494), 201980 bp

>pF1KA0405 1980
>gi568815584f:85521515_85723494 (Chr14)

1-1980  (100001-101980)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCTACAGACCACAAAGTGGCCCAGCCATGGGGCTTTTTTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCTACAGACCACAAAGTGGCCCAGCCATGGGGCTTTTTTCCTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCTTGGCTTATCATTTCCCTGGGGCTCTACTCACAGGTGTCCAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCTTGGCTTATCATTTCCCTGGGGCTCTACTCACAGGTGTCCAAACTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCTGCCCTAGTGTGTGCCGCTGCGACAGGAACTTTGTCTACTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCTGCCCTAGTGTGTGCCGCTGCGACAGGAACTTTGTCTACTGTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCGAAGCTTGACCTCAGTGCCTCTTGGGATCCCGGAGGGCGTAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 GAGCGAAGCTTGACCTCAGTGCCTCTTGGGATCCCGGAGGGCGTAACTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTCTACCTCCACAACAACCAAATTAATAATGCTGGATTTCCTGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTCTACCTCCACAACAACCAAATTAATAATGCTGGATTTCCTGCAGAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCACAATGTACAGTCGGTGCACACGGTCTACCTGTATGGCAACCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCACAATGTACAGTCGGTGCACACGGTCTACCTGTATGGCAACCAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACGAATTCCCCATGAACCTTCCCAAGAATGTCAGAGTTCTCCATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACGAATTCCCCATGAACCTTCCCAAGAATGTCAGAGTTCTCCATTTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAAAACAATATTCAGACCATTTCACGGGCTGCTCTTGCCCAGCTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAAAACAATATTCAGACCATTTCACGGGCTGCTCTTGCCCAGCTCTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTTGAAGAGCTGCACCTGGATGACAACTCCATATCCACAGTGGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTTGAAGAGCTGCACCTGGATGACAACTCCATATCCACAGTGGGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAGACGGGGCCTTCCGGGAGGCTATTAGCCTCAAATTGTTGTTTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAGACGGGGCCTTCCGGGAGGCTATTAGCCTCAAATTGTTGTTTTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAAGAATCACCTGAGCAGTGTGCCTGTTGGGCTTCCTGTGGACTTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAAGAATCACCTGAGCAGTGTGCCTGTTGGGCTTCCTGTGGACTTGCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCTGAGAGTGGATGAAAATCGAATTGCTGTCATATCCGACATGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCTGAGAGTGGATGAAAATCGAATTGCTGTCATATCCGACATGGCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGAATCTCACGAGCTTGGAGCGTCTTATTGTGGACGGGAACCTCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGAATCTCACGAGCTTGGAGCGTCTTATTGTGGACGGGAACCTCCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACAAGGGTATCGCCGAGGGCACCTTCAGCCATCTCACCAAGCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACAAGGGTATCGCCGAGGGCACCTTCAGCCATCTCACCAAGCTCAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AATTTTCAATTGTACGTAATTCGCTGTCCCACCCTCCTCCCGATCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AATTTTCAATTGTACGTAATTCGCTGTCCCACCCTCCTCCCGATCTCCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTACGCATCTGATCAGGCTCTATTTGCAGGACAACCAGATAAACCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTACGCATCTGATCAGGCTCTATTTGCAGGACAACCAGATAAACCACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCCTTTGACAGCCTTCTCAAATCTGCGTAAGCTGGAACGGCTGGATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCCTTTGACAGCCTTCTCAAATCTGCGTAAGCTGGAACGGCTGGATATAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAACAACCAACTGCGGATGCTGACTCAAGGGGTTTTTGATAATCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAACAACCAACTGCGGATGCTGACTCAAGGGGTTTTTGATAATCTCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCTGAAGCAGCTCACTGCTCGGAATAACCCTTGGTTTTGTGACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCTGAAGCAGCTCACTGCTCGGAATAACCCTTGGTTTTGTGACTGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TATTAAATGGGTCACAGAATGGCTCAAATATATCCCTTCATCTCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TATTAAATGGGTCACAGAATGGCTCAAATATATCCCTTCATCTCTCAACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCGGGGTTTCATGTGCCAAGGTCCTGAACAAGTCCGGGGGATGGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCGGGGTTTCATGTGCCAAGGTCCTGAACAAGTCCGGGGGATGGCCGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AGGGAATTAAATATGAATCTTTTGTCCTGTCCCACCACGACCCCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGGGAATTAAATATGAATCTTTTGTCCTGTCCCACCACGACCCCCGGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCCTCTCTTCACCCCAGCCCCAAGTACAGCTTCTCCGACCACTCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCCTCTCTTCACCCCAGCCCCAAGTACAGCTTCTCCGACCACTCAGCCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CCACCCTCTCTATTCCAAACCCTAGCAGAAGCTACACGCCTCCAACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CCACCCTCTCTATTCCAAACCCTAGCAGAAGCTACACGCCTCCAACTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCACATCGAAACTTCCCACGATTCCTGACTGGGATGGCAGAGAAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCACATCGAAACTTCCCACGATTCCTGACTGGGATGGCAGAGAAAGAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GACCCCACCTATTTCTGAACGGATCCAGCTCTCTATCCATTTTGTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GACCCCACCTATTTCTGAACGGATCCAGCTCTCTATCCATTTTGTGAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATACTTCCATTCAAGTCAGCTGGCTCTCTCTCTTCACCGTGATGGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATACTTCCATTCAAGTCAGCTGGCTCTCTCTCTTCACCGTGATGGCATAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAACTCACATGGGTGAAAATGGGCCACAGTTTAGTAGGGGGCATCGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAACTCACATGGGTGAAAATGGGCCACAGTTTAGTAGGGGGCATCGTTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGAGCGCATAGTCAGCGGTGAGAAGCAACACCTGAGCCTGGTTAACTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGAGCGCATAGTCAGCGGTGAGAAGCAACACCTGAGCCTGGTTAACTTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGCCCCGATCCACCTATCGGATTTGTTTAGTGCCACTGGATGCTTTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGCCCCGATCCACCTATCGGATTTGTTTAGTGCCACTGGATGCTTTTAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TACCGCGCGGTAGAAGACACCATTTGTTCAGAGGCCACCACCCATGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TACCGCGCGGTAGAAGACACCATTTGTTCAGAGGCCACCACCCATGCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTATCTGAACAACGGCAGCAACACAGCGTCCAGCCATGAGCAGACGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTATCTGAACAACGGCAGCAACACAGCGTCCAGCCATGAGCAGACGACGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCCACAGCATGGGCTCCCCCTTTCTGCTGGCGGGCTTGATCGGGGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCCACAGCATGGGCTCCCCCTTTCTGCTGGCGGGCTTGATCGGGGGCGCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GTGATATTTGTGCTGGTGGTCTTGCTCAGCGTCTTTTGCTGGCATATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GTGATATTTGTGCTGGTGGTCTTGCTCAGCGTCTTTTGCTGGCATATGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CAAAAAGGGGCGCTACACCTCCCAGAAGTGGAAATACAACCGGGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CAAAAAGGGGCGCTACACCTCCCAGAAGTGGAAATACAACCGGGGCCGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GGAAAGATGATTATTGCGAGGCAGGCACCAAGAAGGACAACTCCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GGAAAGATGATTATTGCGAGGCAGGCACCAAGAAGGACAACTCCATCCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GAGATGACAGAAACCAGTTTTCAGATCGTCTCCTTAAATAACGATCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GAGATGACAGAAACCAGTTTTCAGATCGTCTCCTTAAATAACGATCAACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CCTTAAAGGAGATTTCAGACTGCAGCCCATTTACACCCCAAATGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CCTTAAAGGAGATTTCAGACTGCAGCCCATTTACACCCCAAATGGGGGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TTAATTACACAGACTGCCATATCCCCAACAACATGCGATACTGCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TTAATTACACAGACTGCCATATCCCCAACAACATGCGATACTGCAACAGC

   1950     .    :    .    :    .    :
   1951 AGCGTGCCAGACCTGGAGCACTGCCATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AGCGTGCCAGACCTGGAGCACTGCCATACG