seq1 = pF1KA0400.tfa, 3018 bp
seq2 = pF1KA0400/gi568815596f_9107105.tfa (gi568815596f:9107105_9503324), 396220 bp

>pF1KA0400 3018
>gi568815596f:9107105_9503324 (Chr2)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-199  (172213-172285)   100% ->
200-345  (190196-190341)   100% ->
346-420  (211420-211494)   100% ->
421-470  (213184-213233)   100% ->
471-600  (216017-216146)   100% ->
601-686  (220722-220807)   100% ->
687-762  (227634-227709)   100% ->
763-849  (227989-228075)   100% ->
850-953  (237428-237531)   100% ->
954-1023  (237627-237696)   100% ->
1024-1111  (243704-243791)   98% ->
1112-1160  (248943-248991)   100% ->
1161-1327  (249075-249241)   100% ->
1328-1461  (251652-251785)   100% ->
1462-1556  (261321-261415)   100% ->
1557-1746  (267651-267840)   100% ->
1747-1832  (269804-269889)   100% ->
1833-1948  (271840-271955)   100% ->
1949-2016  (273637-273704)   100% ->
2017-2130  (278141-278254)   100% ->
2131-2383  (281190-281442)   100% ->
2384-2518  (283958-284092)   100% ->
2519-2684  (286378-286543)   100% ->
2685-2734  (292919-292968)   100% ->
2735-2823  (293638-293726)   100% ->
2824-2946  (294170-294292)   100% ->
2947-3018  (296149-296220)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAGCTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAGCTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAG         GCTTTGGACGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 GGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGTG...TAGGCTTTGGACGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172228 CGGATGGTTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGGCTGG         CTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 172278 TGGGCTGGGTG...CAGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAGTACACCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190229 CTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACTGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190279 GGAAGTGCGTTCCTGAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTCAAAAACCTG         ATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 190329 TTTCAAAAACCTGGTA...TAGATTCAGAATATGAACAACATAATCTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 211448 TCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421       GATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211498 ...CAGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAAGCTTGGAAGGACTATGAAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAAAAT         AACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213228 AAAAATGTG...TAGAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216052 AGCTCCATGGGATGATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 216102 GAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGATGTGCGAGGTA..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601     TATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216152 .CAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 220768 TACTTCAGAATCTGATCAAATACTTTCATGCCCAATGCAAGTA...TAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227635 TTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AACGCTGTCTACGGATCTTCACACG         ATCAAACAGGCCCAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 227685 AACGCTGTCTACGGATCTTCACACGGTG...AAGATCAAACAGGCCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228005 ATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATATTTTGAAATCCGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTGCAGGTTGAACAGAAAGAG         GACTCCCAAATTCGTCAGAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 228055 TTGCAGGTTGAACAGAAAGAGGTG...TAGGACTCCCAAATTCGTCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237448 CACAGCTTATAGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG         GATCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 237498 AGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGGGTA...AAGGATCCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 AAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237634 AAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 ATCCCATGGTACC         GCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 237684 ATCCCATGGTACCGTA...CAGGCTAACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243732 TGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CTTATTTCAC         ATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA
        || |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 243782 CTCATTTCACGTA...CAGATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TGAACAGGAATGTCAAAT         ATGGATGTCTGTGCTGCAAAATA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 248974 TGAACAGGAATGTCAAATGTA...TAGATGGATGTCTGTGCTGCAAAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 GCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249098 GCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249148 GAAAATAACATCGTCCAAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 GAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 249198 GAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCGCCAGGTG...

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1328    ATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251649 CAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 TGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 251699 TGTTCCGGAATCCACCGAGAGCTGGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTG         CTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 251749 CCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGGTA...CAGCTCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261325 CCAAGAATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 261375 CCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCAGGCAGCGACATGTA...CAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 GAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267651 GAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267701 CAAGGAAGAAGCACGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267751 GCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAGCTTATGCTGATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 TGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACAT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 267801 TGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGTA...CAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 AGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269805 AGCCGGATGAAACGGCCCTCCACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 TCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAG         TGGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 269855 TCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGGTA...CAGTGGGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271846 CCTGGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 TGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271896 TGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGTTGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 ATCGAGATAG         CAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 271946 ATCGAGATAGGTG...TAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 TGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTG         CTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 273668 TGCCAAGCGCCTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGGTG...CAGCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 CCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278145 CCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGAATATGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 TGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278195 TGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 GAAATTGCAG         CCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 278245 GAAATTGCAGGTC...CAGCCCAGTCCCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 TCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281221 TCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAGGGCTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281271 TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGAGAAGCAGAGGGCTTTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 GCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281321 GCCCAGCATCTTGCAGAATGAGACTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 CACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281371 CACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCGCTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 CCTCCACGGAATGTTGGCAAAG         TTCAGACAGCCTCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 281421 CCTCCACGGAATGTTGGCAAAGGTA...CAGTTCAGACAGCCTCCTCTGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 TAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGTGTGGACGGTGGAAGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283977 TAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAAGTGTGGACGGTGGAAGCCGGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 AGCGATCTTCGTCAGATCCGCCAGCTGTCCATCCACCGCTGCCCCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284027 AGCGATCTTCGTCAGATCCGCCAGCTGTCCATCCACCGCTGCCCCCTCTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 CGCGTGACATCTACCA         ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 284077 CGCGTGACATCTACCAGTA...CAGATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 ACCCGTTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286403 ACCCGTTGCCAAGACGCCCAGCGTAATGGAAGCCTTGAGCCAGCCGAGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 AGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286453 AGCCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 CAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 286503 CAGCCGCCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGTA...TAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2685 GGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292919 GGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACCGAGAGGACCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2735          TGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 292969 GTA...CAGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2776 GCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 293679 GCTATGGTCCTGCAGCCCCCTGCACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2824        ACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293729 A...CAGACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2867 TGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294213 TGGCTGACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2917 GTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGG         ATTGGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 294263 GTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTGGGTG...CAGATTGGCCACAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2958 TGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296160 TGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACT

   3250     .    :
   3008 TTATCGCTGAC
        |||||||||||
 296210 TTATCGCTGAC