seq1 = pF1KA0395.tfa, 2868 bp
seq2 = pF1KA0395/gi568815578r_41102057.tfa (gi568815578r:41102057_41304916), 202860 bp

>pF1KA0395 2868
>gi568815578r:41102057_41304916 (Chr20)

(complement)

1-2866  (100001-102865)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCAAGAGGAAATCCACCACACCATGCATGATCCCAGTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCAAGAGGAAATCCACCACACCATGCATGATCCCAGTGAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGTGTTGCAAGATGCCAGCATGGAGGCCCAGCCCGCTGAGACCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGTGTTGCAAGATGCCAGCATGGAGGCCCAGCCCGCTGAGACCTTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAAGGACCCCAGCAGGATCTGCCCCCAGAAGCATCTGCTGCCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAAGGACCCCAGCAGGATCTGCCCCCAGAAGCATCTGCTGCCAGCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCAGCACAGAACCCCAGCAGTACTGATGGCTCTACACTGGCCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCAGCACAGAACCCCAGCAGTACTGATGGCTCTACACTGGCCAATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCATCGGAGCACTTTAGATGGCTATTTATATTCCTGTAAATACTGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCATCGGAGCACTTTAGATGGCTATTTATATTCCTGTAAATACTGCGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAGATCCCATGACATGACCCAATTTGTGGGACATATGAACTCAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAGATCCCATGACATGACCCAATTTGTGGGACATATGAACTCAGAGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACAGACTTTAATAAAGACCCAACCTTTGTATGCAGTGGGTGCAGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACAGACTTTAATAAAGACCCAACCTTTGTATGCAGTGGGTGCAGTTTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCAAAAACCCCTGAGGGGCTTTCCTTGCACAATGCCACATGTCACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCAAAAACCCCTGAGGGGCTTTCCTTGCACAATGCCACATGTCACTCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGAAGCCAGCTTTGTGTGGAACGTGGCCAAGCCAGACAATCATGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGAAGCCAGCTTTGTGTGGAACGTGGCCAAGCCAGACAATCATGTGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGAGCAGAGCATCCCTGAGAGCACCAGCACTCCTGACCTAGCGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGAGCAGAGCATCCCTGAGAGCACCAGCACTCCTGACCTAGCGGGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCCAGTGCTGAAGGGGCTGATGGACAGGCAGAAATCATCATTACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCCAGTGCTGAAGGGGCTGATGGACAGGCAGAAATCATCATTACCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCCAATCATGAAGATAATGAAAGGCAAAGCTGAAGCCAAAAAAATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCCAATCATGAAGATAATGAAAGGCAAAGCTGAAGCCAAAAAAATTCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACACTCAAGGAGAATGTCCCTAGCCAGCCTGTGGGTGAGGCCTTACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACACTCAAGGAGAATGTCCCTAGCCAGCCTGTGGGTGAGGCCTTACCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGTCGACTGGAGAAATGGAGGTGAGAGAGGGGGACCATTCCTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGTCGACTGGAGAAATGGAGGTGAGAGAGGGGGACCATTCCTTCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGGGGCAGTTCCAGTCAGCCAGGCATCTGCCAGCTCTGCAAAAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGGGGCAGTTCCAGTCAGCCAGGCATCTGCCAGCTCTGCAAAAAACCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CATGCCGCCAACGGGCCCCTGATAGGAACAGTGCCAGTTTTGCCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CATGCCGCCAACGGGCCCCTGATAGGAACAGTGCCAGTTTTGCCAGCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATAGCACAGTTCCTCTCCCTCCAGCAGCAGCCCCCAGTGCATGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATAGCACAGTTCCTCTCCCTCCAGCAGCAGCCCCCAGTGCATGCCCAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCATGTCCACCAGCCACTGCCCACGGCCAAGGCCCTTCCCAAAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCATGTCCACCAGCCACTGCCCACGGCCAAGGCCCTTCCCAAAGTGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCCCCCTGAGCAGCATTCCAACGTACAATGCAGCCATGGACTCTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCCCCCTGAGCAGCATTCCAACGTACAATGCAGCCATGGACTCTAACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCCTGAAGAACTCCTTCCACAAGTTCCCCTACCCCACCAAAGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCCTGAAGAACTCCTTCCACAAGTTCCCCTACCCCACCAAAGCCGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTGCTATTTGACTGTGGTGACCAAGTATCCAGAAGAACAGCTCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTGCTATTTGACTGTGGTGACCAAGTATCCAGAAGAACAGCTCAAGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGGTTCACAGCCCAAAGGCTGAAGCAGGGGATCAGCTGGTCCCCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGGTTCACAGCCCAAAGGCTGAAGCAGGGGATCAGCTGGTCCCCTGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATTGAGGATGCCCGGAAAAAGATGTTCAATACAGTCATCCAGTCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATTGAGGATGCCCGGAAAAAGATGTTCAATACAGTCATCCAGTCTGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTCAGCCCACAATTACGGTTCTAAATACCCCACTCGTCGCCAGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTCAGCCCACAATTACGGTTCTAAATACCCCACTCGTCGCCAGTGCTGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AATGTCCAGCATCTCATCCAGGCCGCTCTTCCAGGTCACGTTGTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AATGTCCAGCATCTCATCCAGGCCGCTCTTCCAGGTCACGTTGTGGGGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCCAGAGGGTACAGGAGGGGGACTTCTGGTCACTCAGCCATTGATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCCAGAGGGTACAGGAGGGGGACTTCTGGTCACTCAGCCATTGATGGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGGGTTGCAAGCAACAAGTTCCCCTCTCCCCCTCACGGTGACATCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGGGTTGCAAGCAACAAGTTCCCCTCTCCCCCTCACGGTGACATCCGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCAAGCAGCCAGGTGTGGCACCCATTAACACTGTGTGTTCAAATACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCAAGCAGCCAGGTGTGGCACCCATTAACACTGTGTGTTCAAATACAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GTCAGCTGTGAAGGTGGTCAATGCGGCCCAGTCGCTCCTCACGGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GTCAGCTGTGAAGGTGGTCAATGCGGCCCAGTCGCTCCTCACGGCCTGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAGCATAACCTCCCAAGCCTTCCTTGATGCTAGCATCTACAAAAATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCAGCATAACCTCCCAAGCCTTCCTTGATGCTAGCATCTACAAAAATAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AAATCTCATGAACAGCTGTCAGCTCTGAAAGGGAGCTTCTGTCGGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AAATCTCATGAACAGCTGTCAGCTCTGAAAGGGAGCTTCTGTCGGAACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTTCCCAGGGCAGAGCGAAGTTGAACATCTCACAAAAGTGACGGGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTTCCCAGGGCAGAGCGAAGTTGAACATCTCACAAAAGTGACGGGCCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GTACCAGAGAGGTGCGGAAATGGTTCAGTGATCGTAGATACCACTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GTACCAGAGAGGTGCGGAAATGGTTCAGTGATCGTAGATACCACTGCCGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AACTTGAAGGGCTCCAGAGCGATGATACCTGGAGATCACAGTTCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AACTTGAAGGGCTCCAGAGCGATGATACCTGGAGATCACAGTTCCATCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CATTGACTCTGTGCCAGAGGTGTCCTTCTCCCCATCGTCCAAGGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CATTGACTCTGTGCCAGAGGTGTCCTTCTCCCCATCGTCCAAGGTCCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGGTAACCTGCATTCCGACAACAGCCACACTAGCAACCCACCCTTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGTAACCTGCATTCCGACAACAGCCACACTAGCAACCCACCCTTCTGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AAACGACAATCTTGGCACCAGACTCCTGACTTCACACCAACCAAATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AAACGACAATCTTGGCACCAGACTCCTGACTTCACACCAACCAAATACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGAGAGAGCCCCTGAGCAGCTCAGAGCCCTGGAGAGCAGTTTTGCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGAGAGAGCCCCTGAGCAGCTCAGAGCCCTGGAGAGCAGTTTTGCACAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACCCTCTTCCTCTTGATGAGGAACTGGACCGCCTGAGAAGTGAAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACCCTCTTCCTCTTGATGAGGAACTGGACCGCCTGAGAAGTGAAACCAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 ATGACCCGACGAGAAATTGATAGCTGGTTTTCAGAGAGACGGAAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 ATGACCCGACGAGAAATTGATAGCTGGTTTTCAGAGAGACGGAAAAAAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GAATGCTGAGGAGACCAAGAAGGCTGAGGAGAATGCCTCTCAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GAATGCTGAGGAGACCAAGAAGGCTGAGGAGAATGCCTCTCAGGAGGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AGGAGGCTGCTGAGGATGAGGGTGGAGAAGAGGATTTGGCCAGTGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AGGAGGCTGCTGAGGATGAGGGTGGAGAAGAGGATTTGGCCAGTGAGCTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 AGGGTCTCTGGTGAAAATGGCTCTCTGGAAATGCCCAGCAGCCATATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 AGGGTCTCTGGTGAAAATGGCTCTCTGGAAATGCCCAGCAGCCATATCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GGCAGAGCGCAAAGTCAGCCCCATTAAAATCAACCTGAAGAACCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GGCAGAGCGCAAAGTCAGCCCCATTAAAATCAACCTGAAGAACCTGAGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 TCACTGAAGCCAATGGCAGGAACGAGATTCCAGGGCTGGGTGCCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 TCACTGAAGCCAATGGCAGGAACGAGATTCCAGGGCTGGGTGCCTGTGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 CCTGAGGATGATGAGTCAAACAAACTGGCAGAGCAGCTCCCAGGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CCTGAGGATGATGAGTCAAACAAACTGGCAGAGCAGCTCCCAGGCAAAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 GAGCTGCAAAAAGACTGCCCAGCAGCGGCACTTGCTGCGGCAGCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 GAGCTGCAAAAAGACTGCCCAGCAGCGGCACTTGCTGCGGCAGCTCTTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 TCCAGACACAGTGGCCAAGCAACCAGGACTATGACTCCATCATGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 TCCAGACACAGTGGCCAAGCAACCAGGACTATGACTCCATCATGGCCCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 ACGGGTCTGCCACGGCCAGAGGTGGTGCGCTGGTTTGGAGATAGCAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 ACGGGTCTGCCACGGCCAGAGGTGGTGCGCTGGTTTGGAGATAGCAGGTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 CGCACTGAAGAACGGCCAACTCAAATGGTACGAAGACTATAAGCGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 CGCACTGAAGAACGGCCAACTCAAATGGTACGAAGACTATAAGCGAGGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 ACTTCCCACCAGGGCTACTGGTCATTGCCCCTGGCAACCGGGAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 ACTTCCCACCAGGGCTACTGGTCATTGCCCCTGGCAACCGGGAGCTCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 CAGGACTATTACATGACACACAAGATGCTGTATGAAGAGGACCTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 CAGGACTATTACATGACACACAAGATGCTGTATGAAGAGGACCTGCAGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 CCTCTGTGACAAGACCCAGATGAGCTCCCAGCAGGTCAAGCAGTGGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 CCTCTGTGACAAGACCCAGATGAGCTCCCAGCAGGTCAAGCAGTGGTTTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 CTGAGAAAATGGGGGAGGAGACCAGAGCCGTGGCAGACACAGGCAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 CTGAGAAAATGGGGGAGGAGACCAGAGCCGTGGCAGACACAGGCAGTGAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 GACCAGGGCCCTGGTACTACTGAGCTCACAGCAGTTCACAAAGGGATGGG
        ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 GACCAGGGCCCTGGTACTGGTGAGCTCACAGCAGTTCACAAAGGGATGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 TGACACCTATTCAGAGGTGTCTGAGAACAGTGAGTCGTGGGAGCCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 TGACACCTATTCAGAGGTGTCTGAGAACAGTGAGTCGTGGGAGCCCCGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 TCCCTGAGGCCAGCTCAGAGCCCTTTGACACATCGAGTCCCCAGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 TCCCTGAGGCCAGCTCAGAGCCCTTTGACACATCGAGTCCCCAGGCTGGA

   2850     .    :    .
   2851 CGTCAGCTCGAAACAG
        ||||||||||  |-||
 102851 CGTCAGCTCGGTA AG