Result of SIM4 for
pF1KA0365
seq1 = pF1KA0365.tfa, 3246 bp
seq2 = pF1KA0365/gi568815579r_18894369.tfa (gi568815579r:18894369_19131071), 236703 bp
>pF1KA0365 3246
>gi568815579r:18894369_19131071 (Chr19)
(complement)
1-121 (100001-100121) 100% ->
122-1729 (104846-106453) 100% ->
1730-1850 (111843-111963) 100% ->
1851-2338 (120730-121217) 100% ->
2339-2450 (122644-122755) 100% ->
2451-2929 (126426-126904) 100% ->
2930-2991 (129398-129459) 100% ->
2992-3128 (135792-135928) 100% ->
3129-3246 (136586-136703) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCAGCCAGACGAATTACACAGGAGACTTTTGATGCTGTATTACAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCAGCCAGACGAATTACACAGGAGACTTTTGATGCTGTATTACAAGA
50 . : . : . : . : . :
51 AAAAGCCAAACGATATCACATGGATGCCAGTGGTGAGGCTGTAAGCGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 AAAAGCCAAACGATATCACATGGATGCCAGTGGTGAGGCTGTAAGCGAAA
100 . : . : . : . : . :
101 CTCTTCAGTTTAAAGCTCAAG ATCTCTTAAGGGCAGTCCCA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
100101 CTCTTCAGTTTAAAGCTCAAGGTA...CAGATCTCTTAAGGGCAGTCCCA
150 . : . : . : . : . :
142 AGATCCAGAGCAGAGATGTATGATGACGTCCACAGCGATGGCAGATACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104866 AGATCCAGAGCAGAGATGTATGATGACGTCCACAGCGATGGCAGATACTC
200 . : . : . : . : . :
192 CCTCAGTGGATCTGTAGCTCACTCTAGAGATGCCGGAAGAGAAGGCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104916 CCTCAGTGGATCTGTAGCTCACTCTAGAGATGCCGGAAGAGAAGGCCTGA
250 . : . : . : . : . :
242 GAAGTGACGTATTTCCAGGGCCTTCCTTCAGATCAAGCAACCCTTCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104966 GAAGTGACGTATTTCCAGGGCCTTCCTTCAGATCAAGCAACCCTTCCATC
300 . : . : . : . : . :
292 AGTGATGACAGCTACTTTCGCAAAGAATGTGGCCGGGATCTGGAATTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105016 AGTGATGACAGCTACTTTCGCAAAGAATGTGGCCGGGATCTGGAATTTTC
350 . : . : . : . : . :
342 TCACTCTGATTCTCGGGACCAGGTCATTGGCCACCGGAAATTGGGGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105066 TCACTCTGATTCTCGGGACCAGGTCATTGGCCACCGGAAATTGGGGCATT
400 . : . : . : . : . :
392 TCCGTTCTCAGGACTGGAAATTTGCGCTCCGTGGTTCTTGGGAACAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105116 TCCGTTCTCAGGACTGGAAATTTGCGCTCCGTGGTTCTTGGGAACAAGAC
450 . : . : . : . : . :
442 TTTGGCCATCCAGTTTCTCAAGAGTCCTCTTGGTCACAGGAGTATAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105166 TTTGGCCATCCAGTTTCTCAAGAGTCCTCTTGGTCACAGGAGTATAGTTT
500 . : . : . : . : . :
492 TGGTCCCTCTGCAGTTTTGGGGGACTTTGGATCTTCCAGGCTGATTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105216 TGGTCCCTCTGCAGTTTTGGGGGACTTTGGATCTTCCAGGCTGATTGAGA
550 . : . : . : . : . :
542 AAGAGTGTTTGGAGAAGGAGAGTCGGGATTATGACGTGGACCATCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105266 AAGAGTGTTTGGAGAAGGAGAGTCGGGATTATGACGTGGACCATCCTGGG
600 . : . : . : . : . :
592 GAGGCTGACTCTGTGCTTAGGGGCGGCAGTCAAGTCCAGGCCAGAGGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105316 GAGGCTGACTCTGTGCTTAGGGGCGGCAGTCAAGTCCAGGCCAGAGGTCG
650 . : . : . : . : . :
642 AGCTCTAAACATCGTTGACCAGGAAGGTTCCCTCCTAGGAAAGGGGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105366 AGCTCTAAACATCGTTGACCAGGAAGGTTCCCTCCTAGGAAAGGGGGAGA
700 . : . : . : . : . :
692 CTCAGGGCCTGCTCACAGCTAAGGGGGGTGTTGGGAAACTTGTCACATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105416 CTCAGGGCCTGCTCACAGCTAAGGGGGGTGTTGGGAAACTTGTCACATTG
750 . : . : . : . : . :
742 AGAAATGTGAGCACAAAAAAAATACCCACCGTGAATCGTATTACTCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105466 AGAAATGTGAGCACAAAAAAAATACCCACCGTGAATCGTATTACTCCCAA
800 . : . : . : . : . :
792 AACTCAGGGCACTAACCAAATCCAGAAAAACACTCCAAGTCCTGATGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105516 AACTCAGGGCACTAACCAAATCCAGAAAAACACTCCAAGTCCTGATGTGA
850 . : . : . : . : . :
842 CCCTGGGGACAAACCCAGGGACAGAAGATATCCAGTTCCCCATTCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105566 CCCTGGGGACAAACCCAGGGACAGAAGATATCCAGTTCCCCATTCAGAAG
900 . : . : . : . : . :
892 ATCCCTCTGGGGCTGGATCTGAAGAATCTTCGGCTCCCCAGAAGAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105616 ATCCCTCTGGGGCTGGATCTGAAGAATCTTCGGCTCCCCAGAAGAAAGAT
950 . : . : . : . : . :
942 GAGCTTTGACATCATAGATAAGTCTGATGTTTTTTCAAGATTTGGGATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105666 GAGCTTTGACATCATAGATAAGTCTGATGTTTTTTCAAGATTTGGGATAG
1000 . : . : . : . : . :
992 AAATAATCAAATGGGCAGGATTCCACACCATAAAAGATGATATTAAATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105716 AAATAATCAAATGGGCAGGATTCCACACCATAAAAGATGATATTAAATTT
1050 . : . : . : . : . :
1042 TCCCAACTTTTCCAGACTCTCTTTGAACTTGAAACAGAAACCTGTGCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105766 TCCCAACTTTTCCAGACTCTCTTTGAACTTGAAACAGAAACCTGTGCTAA
1100 . : . : . : . : . :
1092 AATGCTTGCCTCATTCAAATGTTCCTTAAAACCAGAGCACAGAGATTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105816 AATGCTTGCCTCATTCAAATGTTCCTTAAAACCAGAGCACAGAGATTTTT
1150 . : . : . : . : . :
1142 GCTTTTTTACTATCAAATTTTTAAAGCACTCTGCTTTGAAAACACCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105866 GCTTTTTTACTATCAAATTTTTAAAGCACTCTGCTTTGAAAACACCCAGA
1200 . : . : . : . : . :
1192 GTTGATAATGAGTTTTTAAACATGCTTTTAGACAAAGGTGCTGTGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105916 GTTGATAATGAGTTTTTAAACATGCTTTTAGACAAAGGTGCTGTGAAGAC
1250 . : . : . : . : . :
1242 CAAAAATTGCTTTTTTGAAATCATAAAGCCTTTTGACAAGTACATAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105966 CAAAAATTGCTTTTTTGAAATCATAAAGCCTTTTGACAAGTACATAATGA
1300 . : . : . : . : . :
1292 GACTTCAAGACCGGCTTCTGAAGAGTGTCACACCTTTGCTTATGGCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106016 GACTTCAAGACCGGCTTCTGAAGAGTGTCACACCTTTGCTTATGGCCTGC
1350 . : . : . : . : . :
1342 AATGCCTACGAGCTAAGTGTCAAGATGAAGACCCTCAGTAACCCCCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106066 AATGCCTACGAGCTAAGTGTCAAGATGAAGACCCTCAGTAACCCCCTGGA
1400 . : . : . : . : . :
1392 CTTGGCTCTTGCCCTAGAAACCACCAACTCTCTCTGCCGGAAGTCTTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106116 CTTGGCTCTTGCCCTAGAAACCACCAACTCTCTCTGCCGGAAGTCTTTGG
1450 . : . : . : . : . :
1442 CCCTTTTGGGACAGACATTTTCCTTGGCCTCTTCTTTCCGGCAGGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106166 CCCTTTTGGGACAGACATTTTCCTTGGCCTCTTCTTTCCGGCAGGAGAAA
1500 . : . : . : . : . :
1492 ATCTTAGAAGCTGTCGGCCTGCAAGATATAGCTCCCTCACCTGCTGCGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106216 ATCTTAGAAGCTGTCGGCCTGCAAGATATAGCTCCCTCACCTGCTGCGTT
1550 . : . : . : . : . :
1542 TCCAAACTTCGAAGACTCCACTTTGTTTGGGCGAGAGTACATAGACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106266 TCCAAACTTCGAAGACTCCACTTTGTTTGGGCGAGAGTACATAGACCACC
1600 . : . : . : . : . :
1592 TGAAGGCCTGGCTAGTCAGCAGCGGATGTCCCCTCCAGGTTAAGAAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106316 TGAAGGCCTGGCTAGTCAGCAGCGGATGTCCCCTCCAGGTTAAGAAAGCC
1650 . : . : . : . : . :
1642 GAACCAGAGCCGATGCGAGAGGAGGAGAAAATGATTCCTCCTACGAAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106366 GAACCAGAGCCGATGCGAGAGGAGGAGAAAATGATTCCTCCTACGAAACC
1700 . : . : . : . : . :
1692 TGAAATTCAGGCCAAGGCTCCAAGTAGTCTGAGTGATG CTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
106416 TGAAATTCAGGCCAAGGCTCCAAGTAGTCTGAGTGATGGTA...CAGCTG
1750 . : . : . : . : . :
1733 TCCCCCAGCGAGCAGATCACAGGGTAGTGGGCACCATCGACCAGCTTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111846 TCCCCCAGCGAGCAGATCACAGGGTAGTGGGCACCATCGACCAGCTTGTG
1800 . : . : . : . : . :
1783 AAACGTGTCATCGAAGGCAGCCTGTCTCCCAAAGAGAGAACTCTTCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111896 AAACGTGTCATCGAAGGCAGCCTGTCTCCCAAAGAGAGAACTCTTCTCAA
1850 . : . : . : . : . :
1833 AGAGGACCCTGCTTACTG GTTTTTGTCTGATGAAAATAGTC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
111946 AGAGGACCCTGCTTACTGGTA...TAGGTTTTTGTCTGATGAAAATAGTC
1900 . : . : . : . : . :
1874 TGGAGTATAAATATTACAAGCTGAAGTTGGCAGAAATGCAGCGGATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120753 TGGAGTATAAATATTACAAGCTGAAGTTGGCAGAAATGCAGCGGATGAGC
1950 . : . : . : . : . :
1924 GAGAACTTGCGAGGAGCCGACCAGAAGCCGACCTCAGCAGACTGTGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120803 GAGAACTTGCGAGGAGCCGACCAGAAGCCGACCTCAGCAGACTGTGCAGT
2000 . : . : . : . : . :
1974 GAGGGCCATGCTGTACTCCCGGGCTGTCCGCAACCTCAAGAAGAAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120853 GAGGGCCATGCTGTACTCCCGGGCTGTCCGCAACCTCAAGAAGAAACTCC
2050 . : . : . : . : . :
2024 TTCCGTGGCAGCGGCGGGGGCTCCTCCGTGCTCAAGGGCTCCGGGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120903 TTCCGTGGCAGCGGCGGGGGCTCCTCCGTGCTCAAGGGCTCCGGGGCTGG
2100 . : . : . : . : . :
2074 AAGGCGAGGAGAGCGACCACCGGGACCCAGACCCTCCTATCCTCAGGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120953 AAGGCGAGGAGAGCGACCACCGGGACCCAGACCCTCCTATCCTCAGGCAC
2150 . : . : . : . : . :
2124 CAGGCTGAAACACCACGGCCGGCAGGCTCCAGGCCTCTCACAGGCAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121003 CAGGCTGAAACACCACGGCCGGCAGGCTCCAGGCCTCTCACAGGCAAAAC
2200 . : . : . : . : . :
2174 CATCCCTGCCAGACAGAAATGATGCTGCCAAGGACTGCCCGCCAGACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121053 CATCCCTGCCAGACAGAAATGATGCTGCCAAGGACTGCCCGCCAGACCCA
2250 . : . : . : . : . :
2224 GTTGGACCTTCTCCTCAGGACCCCAGCTTAGAAGCCTCAGGCCCATCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121103 GTTGGACCTTCTCCTCAGGACCCCAGCTTAGAAGCCTCAGGCCCATCCCC
2300 . : . : . : . : . :
2274 CAAGCCAGCAGGAGTGGACATCTCTGAAGCACCTCAGACCTCTTCTCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121153 CAAGCCAGCAGGAGTGGACATCTCTGAAGCACCTCAGACCTCTTCTCCCT
2350 . : . : . : . : . :
2324 GCCCATCTGCTGACA TTGACATGAAGACAATGGAGACTGCA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
121203 GCCCATCTGCTGACAGTG...TAGTTGACATGAAGACAATGGAGACTGCA
2400 . : . : . : . : . :
2365 GAGAAACTGGCTAGATTTGTTGCTCAGGTGGGACCAGAGATCGAACAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122670 GAGAAACTGGCTAGATTTGTTGCTCAGGTGGGACCAGAGATCGAACAATT
2450 . : . : . : . : . :
2415 CAGCATAGAAAACAGCACCGATAACCCTGACCTGTG GTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
122720 CAGCATAGAAAACAGCACCGATAACCCTGACCTGTGGTA...CAGGTTTC
2500 . : . : . : . : . :
2456 TACATGACCAAAATAGTTCTGCTTTCAAATTCTATCGAAAGAAAGTGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126431 TACATGACCAAAATAGTTCTGCTTTCAAATTCTATCGAAAGAAAGTGTTT
2550 . : . : . : . : . :
2506 GAACTATGTCCATCAATTTGTTTCACGTCATCTCCGCACAACCTTCACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126481 GAACTATGTCCATCAATTTGTTTCACGTCATCTCCGCACAACCTTCACAC
2600 . : . : . : . : . :
2556 TGGTGGTGGTGACACCACGGGTTCTCAGGAGAGCCCCGTGGACCTCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126531 TGGTGGTGGTGACACCACGGGTTCTCAGGAGAGCCCCGTGGACCTCATGG
2650 . : . : . : . : . :
2606 AAGGGGAAGCAGAGTTTGAAGACGAGCCCCCTCCGCGGGAGGCTGAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126581 AAGGGGAAGCAGAGTTTGAAGACGAGCCCCCTCCGCGGGAGGCTGAGCTG
2700 . : . : . : . : . :
2656 GAGAGCCCAGAGGTGATGCCTGAGGAGGAGGACGAGGACGATGAGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126631 GAGAGCCCAGAGGTGATGCCTGAGGAGGAGGACGAGGACGATGAGGATGG
2750 . : . : . : . : . :
2706 GGGAGAGGAGGCCCCCGCTCCTGGAGGGGCGGGCAAGTCTGAGGGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126681 GGGAGAGGAGGCCCCCGCTCCTGGAGGGGCGGGCAAGTCTGAGGGCAGCA
2800 . : . : . : . : . :
2756 CCCCTGCCGACGGCCTTCCCGGCGAGGCTGCCGAGGACGACCTGGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126731 CCCCTGCCGACGGCCTTCCCGGCGAGGCTGCCGAGGACGACCTGGCTGGA
2850 . : . : . : . : . :
2806 GCACCTGCCTTGTCACAGGCCTCCTCAGGTACCTGCTTCCCTCGGAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126781 GCACCTGCCTTGTCACAGGCCTCCTCAGGTACCTGCTTCCCTCGGAAGAG
2900 . : . : . : . : . :
2856 GATCAGCAGCAAGTCATTGAAGGTTGGCATGATTCCAGCTCCCAAGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126831 GATCAGCAGCAAGTCATTGAAGGTTGGCATGATTCCAGCTCCCAAGAGAG
2950 . : . : . : . : . :
2906 TGTGTCTCATCCAGGAGCCAAAAG TCCATGAACCAGTTCGA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
126881 TGTGTCTCATCCAGGAGCCAAAAGGTG...TAGTCCATGAACCAGTTCGA
3000 . : . : . : . : . :
2947 ATTGCCTATGACAGGCCTCGGGGTCGTCCCATGTCCAAAAAGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
129415 ATTGCCTATGACAGGCCTCGGGGTCGTCCCATGTCCAAAAAGAAGGTG..
3050 . : . : . : . : . :
2992 AAACCCAAGGACTTGGACTTCGCCCAGCAGAAGCTGACCGATAAGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129465 .CAGAAACCCAAGGACTTGGACTTCGCCCAGCAGAAGCTGACCGATAAGA
3100 . : . : . : . : . :
3038 ACCTGGGCTTCCAGATGCTGCAGAAGATGGGCTGGAAGGAGGGCCATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135838 ACCTGGGCTTCCAGATGCTGCAGAAGATGGGCTGGAAGGAGGGCCATGGC
3150 . : . : . : . : . :
3088 CTGGGCTCCCTCGGAAAGGGCATCAGGGAGCCGGTCAGCGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
135888 CTGGGCTCCCTCGGAAAGGGCATCAGGGAGCCGGTCAGCGTGTA...TAG
3200 . : . : . : . : . :
3129 GGGAACCCCCTCGGAAGGGGAAGGGTTGGGTGCTGACGGGCAGGAGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136586 GGGAACCCCCTCGGAAGGGGAAGGGTTGGGTGCTGACGGGCAGGAGCACA
3250 . : . : . : . : . :
3179 AAGAAGACACATTCGATGTGTTCCGACAGAGGATGATGCAGATGTACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136636 AAGAAGACACATTCGATGTGTTCCGACAGAGGATGATGCAGATGTACAGA
3300 . : .
3229 CACAAGCGGGCCAACAAA
||||||||||||||||||
136686 CACAAGCGGGCCAACAAA