seq1 = pF1KA0354.tfa, 2031 bp
seq2 = pF1KA0354/gi568815589r_37340521.tfa (gi568815589r:37340521_37542551), 202031 bp

>pF1KA0354 2031
>gi568815589r:37340521_37542551 (Chr9)

(complement)

1-2031  (100001-102031)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTTTCCTGGTCACTTTGAACAAATCTTCCAGCAGCTGAACTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTTTCCTGGTCACTTTGAACAAATCTTCCAGCAGCTGAACTACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGACTTCATGGCCAGCTCTGTGATTGTGTCATTGTAGTGGGGAATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGACTTCATGGCCAGCTCTGTGATTGTGTCATTGTAGTGGGGAATAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTTAAAGCCCACCGCTCCGTGCTGGCAGCATGCAGCACGCATTTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTTAAAGCCCACCGCTCCGTGCTGGCAGCATGCAGCACGCATTTCCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCTGTTCTCAGTGGCAGAAGGAGATCAGACCATGAACATGATCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCTGTTCTCAGTGGCAGAAGGAGATCAGACCATGAACATGATCCAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATAGCGAGGTGGTGACAGCAGAGGCCTTTGCTGCACTGATTGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGATAGCGAGGTGGTGACAGCAGAGGCCTTTGCTGCACTGATTGACATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTATACCTCCACCCTCATGCTGGGGGAGAGCAATGTAATGGATGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTATACCTCCACCCTCATGCTGGGGGAGAGCAATGTAATGGATGTCTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGCAGCCTCTCACCTGCATTTGAACTCTGTTGTTAAGGCATGTAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGCAGCCTCTCACCTGCATTTGAACTCTGTTGTTAAGGCATGTAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTACTTAACGACAAGGACGCTGCCCATGTCTCCCCCCAGTGAGCGCGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTACTTAACGACAAGGACGCTGCCCATGTCTCCCCCCAGTGAGCGCGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAGCAGAGCGCCCGCATGCAGCGCTCCTTTATGCTACAGCAGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGCAGAGCGCCCGCATGCAGCGCTCCTTTATGCTACAGCAGCTGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTAAGCATCGTGAGCTCAGCCCTCAATTCCAGCCAGAATGGCGAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTAAGCATCGTGAGCTCAGCCCTCAATTCCAGCCAGAATGGCGAGGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCAGCCCCCATGAGCTCTTCCATGCGCAGTAACCTGGATCAGCGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCAGCCCCCATGAGCTCTTCCATGCGCAGTAACCTGGATCAGCGCACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTTCCCCATGAGACGCCTTCATAAGCGCAAGCAGTCTGCAGAGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTTCCCCATGAGACGCCTTCATAAGCGCAAGCAGTCTGCAGAGGAGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCAGGCAGCGCCTCCGACCCTCCATAGATGAGTCTGCCATTTCAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCAGGCAGCGCCTCCGACCCTCCATAGATGAGTCTGCCATTTCAGATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TACACCGGAGAATGGGCCTTCAGGGGTTCATTCTCGGGAGGAGTTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TACACCGGAGAATGGGCCTTCAGGGGTTCATTCTCGGGAGGAGTTCTTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CACCAGATTCTCTGAAAATTGTGGATAATCCTAAAGCTGACGGAATGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100701 CACCAGATTCTCTGAAAATTGTGGATAATCCTAAAGCTGATGGAATGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATAACCAGGAAGATAGTGCGATCATGTTTGATCAGTCTTTTGGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATAACCAGGAAGATAGTGCGATCATGTTTGATCAGTCTTTTGGCACTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGAAGATGCCCAGGTGCCCAGCCAGTCTGATAACAGTGCTGGCAACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGAAGATGCCCAGGTGCCCAGCCAGTCTGATAACAGTGCTGGCAACATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACAGTTGTCCATGGCCTCTCGTGCAACTCAGGTTGAGACTAGTTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACAGTTGTCCATGGCCTCTCGTGCAACTCAGGTTGAGACTAGTTTTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGGAAGCTGCACCTGAGAAAAGTAGTTTTCAGTGTGAAAACCCTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGGAAGCTGCACCTGAGAAAAGTAGTTTTCAGTGTGAAAACCCTGAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCCTTGGTGAGAAGGAGCACATGAGAGTGGTGGTTAAATCTGAGCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100951 TGGCCTTGGTGAGAAGGAGCACATGAGAGTGGTGGTTAAATCTGAGCCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAGCTCACCTGAGCCTCAGGATGAAGTGAGCGATGTGACCTCACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAGCTCACCTGAGCCTCAGGATGAAGTGAGCGATGTGACCTCACAAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAGGCAGCGAGTCTGTGGAAGTGGAAGGAGTTGTGGTCAGTGCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAGGCAGCGAGTCTGTGGAAGTGGAAGGAGTTGTGGTCAGTGCCGAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATAGACCTCAGCCCTGAAAGCAGTGATCGGAGTTTTTCAGATCCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATAGACCTCAGCCCTGAAAGCAGTGATCGGAGTTTTTCAGATCCCCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTAGCACAGACAGGGTAGGTGATATCCATATTTTGGAAGTCACAAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTAGCACAGACAGGGTAGGTGATATCCATATTTTGGAAGTCACAAATAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTAGAGCATAAGTCCACTTTTAGTATTTCGAATTTTCTTAACAAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTAGAGCATAAGTCCACTTTTAGTATTTCGAATTTTCTTAACAAGAGCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AGGAAATAACTTTACTGCAAATCAGAACAATGATGATAATATTCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGGAAATAACTTTACTGCAAATCAGAACAATGATGATAATATTCCAAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCACTAGTGACTGCAGGCTGGAGAGTGAGGCCCCCTATTTGTTGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCACTAGTGACTGCAGGCTGGAGAGTGAGGCCCCCTATTTGTTGAGTCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAGGCTGGGCCTGCAGGTGGGCCCTCCTCTGCCCCTGGCTCCCATGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GAGGCTGGGCCTGCAGGTGGGCCCTCCTCTGCCCCTGGCTCCCATGTAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GAACCCATTTAGTGAACCTGCAGACTCCCACTTCGTCAGGCCTATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GAACCCATTTAGTGAACCTGCAGACTCCCACTTCGTCAGGCCTATGCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGTGATGGGCCTGCCGTGTGTGCAGACTTCAGGCTACCAAGGAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGTGATGGGCCTGCCGTGTGTGCAGACTTCAGGCTACCAAGGAGGAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGTTTGGGATGGACTTTTCCAGGTCTGGTTTGGGCCTCCACTCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGTTTGGGATGGACTTTTCCAGGTCTGGTTTGGGCCTCCACTCCTCCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CTCCAGGGTAATGATAGGTTCCCCAAGGGGAGGAGCCAGTAACTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CTCCAGGGTAATGATAGGTTCCCCAAGGGGAGGAGCCAGTAACTTTCCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ACTACCGCCGCATAGCTCCCAAAATGCCAGTTGTAACTTCCGTCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ACTACCGCCGCATAGCTCCCAAAATGCCAGTTGTAACTTCCGTCAGGAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TCACAGATCCCAGAAAACTCTACCAGTTCTCAGCTAATGATGAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TCACAGATCCCAGAAAACTCTACCAGTTCTCAGCTAATGATGAATGGAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TACGTCCTCATTTGAAAATGGCCATCCTTCCCAGCCTGGCCCTCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TACGTCCTCATTTGAAAATGGCCATCCTTCCCAGCCTGGCCCTCCACAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TGACCAGGGCATCTGCAGATGTTCTGTCAAAGTGCAAGAAGGCCTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TGACCAGGGCATCTGCAGATGTTCTGTCAAAGTGCAAGAAGGCCTTATCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GAGCACAATGTTTTGGTTGTAGAGGGAGCTCGCAAGTATGCCTGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GAGCACAATGTTTTGGTTGTAGAGGGAGCTCGCAAGTATGCCTGCAAAAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CTGCTGCAAAACTTTTCTGACTTTGACAGATTGCAAGAAGCACATCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CTGCTGCAAAACTTTTCTGACTTTGACAGATTGCAAGAAGCACATCCGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TTCACACAGGTGAAAAGCCTTACGCCTGCCTGAAGTGTGGCAAGAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TTCACACAGGTGAAAAGCCTTACGCCTGCCTGAAGTGTGGCAAGAGGTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AGTCAGTCCAGCCACCTGTATAAGCACTCAAAGACTACCTGCCTGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AGTCAGTCCAGCCACCTGTATAAGCACTCAAAGACTACCTGCCTGCGCTG

   2000     .    :    .    :    .    :
   2001 GCAGAGCAGCAATCTTCCCAGCACTTTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GCAGAGCAGCAATCTTCCCAGCACTTTGCTC