seq1 = pF1KA0318.tfa, 3156 bp
seq2 = pF1KA0318/gi568815586r_130299679.tfa (gi568815586r:130299679_130579013), 279335 bp

>pF1KA0318 3156
>gi568815586r:130299679_130579013 (Chr12)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-307  (122314-122518)   100% ->
308-453  (127674-127819)   100% ->
454-530  (128738-128814)   100% ->
531-640  (133745-133854)   100% ->
641-1453  (136354-137166)   100% ->
1454-1605  (140498-140649)   100% ->
1606-2055  (141723-142172)   99% ->
2056-2202  (144134-144280)   100% ->
2203-2361  (150677-150835)   100% ->
2362-2470  (156453-156561)   100% ->
2471-2652  (164708-164889)   100% ->
2653-2821  (166227-166395)   100% ->
2822-2925  (171185-171288)   100% ->
2926-2997  (172771-172842)   100% ->
2998-3132  (179201-179335)   99% ->
3133-3156  (179853-179876)   95%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGAGAGGCGGCTGAACGGCGGCAGCAGCTGCAGTTGGAGCATGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGAGAGGCGGCTGAACGGCGGCAGCAGCTGCAGTTGGAGCATGACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCTGGCTGTTCTCAGTGCCAAGCAGCAGGAAATTGACCTTCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCTGGCTGTTCTCAGTGCCAAGCAGCAGGAAATTGACCTTCTGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         TCCAAGGTTCGAGAGCTGGAAGAGAAATGCCGGACTCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTA...CAGTCCAAGGTTCGAGAGCTGGAAGAGAAATGCCGGACTCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTGAGCAGTTCAACCTGCTGTCCCGGGACCTGGAGAAGTTCCGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122353 AGTGAGCAGTTCAACCTGCTGTCCCGGGACCTGGAGAAGTTCCGGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCTGGCAAGATTGACCTGCTGGGTGGCAGCGCGGTGGCCCCCCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122403 CGCTGGCAAGATTGACCTGCTGGGTGGCAGCGCGGTGGCCCCCCTGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCCACGGCCCCCAGCAAGCCTTTCCCACAGTTCATGAATGGCCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122453 TCTCCACGGCCCCCAGCAAGCCTTTCCCACAGTTCATGAATGGCCTAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCTCCCTCGGCAAAG         GTCAGGAGAGCGCTATTGGAGGCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122503 ACCTCCCTCGGCAAAGGTA...CAGGTCAGGAGAGCGCTATTGGAGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTCTGCGATCGGTGAATATATCCGGCCCCTTCCGCAGCCTGGTGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127699 CTCTGCGATCGGTGAATATATCCGGCCCCTTCCGCAGCCTGGTGACAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGGAGCCTCTGTCCGCCAAGCCCACCTTCCTGTCGAGATCCGGTAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127749 CGGAGCCTCTGTCCGCCAAGCCCACCTTCCTGTCGAGATCCGGTAGCGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGATGCAGATCTGAGTCAGAC         ATGGAGAATGAACGGAATTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127799 AGATGCAGATCTGAGTCAGACGTG...CAGATGGAGAATGAACGGAATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAATACCTCCAAGCAGAGATACTCGGGGAAGGTCCACCTCTGTGTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128758 CAATACCTCCAAGCAGAGATACTCGGGGAAGGTCCACCTCTGTGTTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTATAG         TTACAACCCCTTCGATGGACCGAACGAGAACCCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128808 GCTATAGGTA...CAGTTACAACCCCTTCGATGGACCGAACGAGAACCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAAGCTGAGCTGCCCCTCACGGCGGGAAAATACCTCTACGTCTATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133779 GAAGCTGAGCTGCCCCTCACGGCGGGAAAATACCTCTACGTCTATGGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATGGATGAGGATGGGTTCTATGAAG         GAGAGCTCCTCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 133829 CATGGATGAGGATGGGTTCTATGAAGGTC...CAGGAGAGCTCCTCGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCCAGAGGGGTCTGGTGCCCTCCAACTTCGTGGACTTTGTGCAGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136369 GCCAGAGGGGTCTGGTGCCCTCCAACTTCGTGGACTTTGTGCAGGACAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGTCGCGGTTGGCAAGCACGCTGGGGAACGAGCAGGATCAGAACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136419 GAGTCGCGGTTGGCAAGCACGCTGGGGAACGAGCAGGATCAGAACTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAACCATTCCGGCATCGGCCTGGAGGGAGAGCACATCCTGGACCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136469 CAACCATTCCGGCATCGGCCTGGAGGGAGAGCACATCCTGGACCTCCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCCCAACCCACATAGATGCGGGCATCACCGACAACAGTGCCGGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136519 CCCCAACCCACATAGATGCGGGCATCACCGACAACAGTGCCGGGACCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACGTGAACATCGACGACATCGGAGAAGACATCGTGCCTTACCCTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136569 GACGTGAACATCGACGACATCGGAGAAGACATCGTGCCTTACCCTAGAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AATCACCCTCATCAAACAACTCGCCAAAAGTGTTATTGTGGGCTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136619 AATCACCCTCATCAAACAACTCGCCAAAAGTGTTATTGTGGGCTGGGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCCGGCGGTGCCACCAGGATGGGGAACGGTGAGCAGCTACAACGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136669 CCCCGGCGGTGCCACCAGGATGGGGAACGGTGAGCAGCTACAACGTCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GTGGACAAGGAGACACGCATGAACCTCACGCTGGGGAGCAGAACTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136719 GTGGACAAGGAGACACGCATGAACCTCACGCTGGGGAGCAGAACTAAAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCTCATCGAGAAGCTCAACATGGCAGCCTGCACCTACCGCATCTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136769 CCTCATCGAGAAGCTCAACATGGCAGCCTGCACCTACCGCATCTCCGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGTGCGTCACCAGCAGGGGCAGCTCGGATGAGCTGCAGTGCACGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136819 AGTGCGTCACCAGCAGGGGCAGCTCGGATGAGCTGCAGTGCACGCTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTGGGCAAGGACGTGGTGGTGGCCCCCTCCCACCTGCGGGTGGACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136869 GTGGGCAAGGACGTGGTGGTGGCCCCCTCCCACCTGCGGGTGGACAACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CACGCAGATCTCCGCCCAGCTCTCCTGGCTACCCACCAACAGCAACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136919 CACGCAGATCTCCGCCCAGCTCTCCTGGCTACCCACCAACAGCAACTACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCCACGTCATCTTCCTCAACGAGGAGGAGTTCGACATCGTCAAGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136969 GCCACGTCATCTTCCTCAACGAGGAGGAGTTCGACATCGTCAAGGCCGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AGGTACAAGTACCAGTTCTTCAATCTCAGGCCCAACATGGCCTATAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137019 AGGTACAAGTACCAGTTCTTCAATCTCAGGCCCAACATGGCCTATAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GAAGGTTCTGGCCAAACCCCACCAGATGCCGTGGCAGCTCCCGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137069 GAAGGTTCTGGCCAAACCCCACCAGATGCCGTGGCAGCTCCCGCTGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AAAGGGAGAAGAAGGAGGCCTTTGTGGAGTTCTCCACGTTGCCTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137119 AAAGGGAGAAGAAGGAGGCCTTTGTGGAGTTCTCCACGTTGCCTGCAGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1454        GACCCCCAGCACCCCCACAAGATGTTACCGTCCAGGCTGGGGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137169 G...CAGGACCCCCAGCACCCCCACAAGATGTTACCGTCCAGGCTGGGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GACCCCCGCCACCATCCGGGTCTCCTGGAGACCACCTGTGCTGACGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140541 GACCCCCGCCACCATCCGGGTCTCCTGGAGACCACCTGTGCTGACGCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CCGGGCTGTCCAATGGCGCAAACGTTACCGGCTACGGCGTGTATGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140591 CCGGGCTGTCCAATGGCGCAAACGTTACCGGCTACGGCGTGTATGCCAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GGGCAGAGG         GTGGCTGAAGTCATCTTCCCCACGGCAGACAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 140641 GGGCAGAGGGTG...CAGGTGGCTGAAGTCATCTTCCCCACGGCAGACAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CACGGCCGTGGAGCTTGTGCGGCTGCGGAGCCTGGAGGCCAAGGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141755 CACGGCCGTGGAGCTTGTGCGGCTGCGGAGCCTGGAGGCCAAGGGCGTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CCGTGCGGACCCTCTCCGCCCAGGGCGAGTCCGTGGACTCTGCAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141805 CCGTGCGGACCCTCTCCGCCCAGGGCGAGTCCGTGGACTCTGCAGTTGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GCCGTTCCCCCCGAGCTCCTGGTGCCTCCTACCCCCCACCCGAGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141855 GCCGTTCCCCCCGAGCTCCTGGTGCCTCCTACCCCCCACCCGAGACCTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 ACCCCAATCAAAGCCATTAGCAAGTTCTGGAGTCCCCGAAACCAAAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141905 ACCCCAATCAAAGCCATTAGCAAGTTCTGGAGTCCCCGAAACCAAAGACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 AGCACCTGGGTCCCCACGCCAGGATGGATGAGGCCTGGGAGCAGAGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141955 AGCACCTGGGTCCCCACGCCAGGATGGATGAGGCCTGGGAGCAGAGCCGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 GCACCTGGCCCTGTGCATGGGCACATGCTGGAGCCGCCCGTGGGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142005 GCACCTGGCCCTGTGCATGGGCACATGCTGGAGCCGCCCGTGGGCCCCGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 AAGGCGGTCGCCCTCACCCAGCCGCATCCTGCCGCAGCCACAGGGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 142055 AAGGCGGTCGCCCTCACCCAGCCGCATCCTGCCACAGCCACAGGGCACCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 CGGTGTCCACCACCGTCGCCAAGGCCATGGCCCGGGAGGCCGCGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142105 CGGTGTCCACCACCGTCGCCAAGGCCATGGCCCGGGAGGCCGCGCAGAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 GTGGCCGAGAGCAGCAGG         TTAGAGAAAAGGAGCGTCTTCCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 142155 GTGGCCGAGAGCAGCAGGGTA...AAGTTAGAGAAAAGGAGCGTCTTCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 AGAGAGAAGCAGCGCGGGGCAGTACGCCGCCTCAGACGAGGAGGACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144157 AGAGAGAAGCAGCGCGGGGCAGTACGCCGCCTCAGACGAGGAGGACGCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 ATGACTCTCCAGACTTCAAGAGGAGGGGCGCCTCGGTGGACGACTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144207 ATGACTCTCCAGACTTCAAGAGGAGGGGCGCCTCGGTGGACGACTTCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 AAAGGCTCTGAACTTGGCAAGCAG         CCGCACTGTTGCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 144257 AAAGGCTCTGAACTTGGCAAGCAGGTG...CAGCCGCACTGTTGCCATGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 AGACGAGTACCACACAGAGAGCAGCCGGGGGTCTGACCTCTCAGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150694 AGACGAGTACCACACAGAGAGCAGCCGGGGGTCTGACCTCTCAGACATCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 TGGAGGAGGACGAGGAGGAGCTGTATTCTGAAATGCAGCTGGAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150744 TGGAGGAGGACGAGGAGGAGCTGTATTCTGAAATGCAGCTGGAAGATGGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 GGAAGGAGGCGGCCCAGCGGCACGTCCCACAATGCCCTCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 150794 GGAAGGAGGCGGCCCAGCGGCACGTCCCACAATGCCCTCAAGGTG...TA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362  ATTTTAGGGAACCCAGCCTCTGCAGGACGGGTGGATCACATGGGCCGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156452 GATTTTAGGGAACCCAGCCTCTGCAGGACGGGTGGATCACATGGGCCGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 GGTTTCCCCGTGGCAGCGCTGGTCCTCAGAGGTCCCGGCCCGTGACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156502 GGTTTCCCCGTGGCAGCGCTGGTCCTCAGAGGTCCCGGCCCGTGACAGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 CCATCCATCG         ACGATTACGGGCGAGACCGCCTTTCTCCAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 156552 CCATCCATCGGTT...CAGACGATTACGGGCGAGACCGCCTTTCTCCAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 CTTCTATGAAGAGTCAGAAACTGACCCTGGTGCCGAAGAGCTCCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164739 CTTCTATGAAGAGTCAGAAACTGACCCTGGTGCCGAAGAGCTCCCGGCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 GGATCTTTGTGGCTCTCTTTGACTACGACCCGCTCACCATGTCCCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164789 GGATCTTTGTGGCTCTCTTTGACTACGACCCGCTCACCATGTCCCCAAAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 CCAGATGCTGCAGAGGAGGAGCTTCCCTTTAAAGAAGGCCAGATCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164839 CCAGATGCTGCAGAGGAGGAGCTTCCCTTTAAAGAAGGCCAGATCATCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 G         GTTTATGGTGATAAAGACGCTGATGGATTCTACCGTGGGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164889 GGTG...TAGGTTTATGGTGATAAAGACGCTGATGGATTCTACCGTGGGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2693 AAACCTGTGCCCGGCTTGGCCTTATTCCTTGTAACATGGTCTCTGAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166267 AAACCTGTGCCCGGCTTGGCCTTATTCCTTGTAACATGGTCTCTGAGATA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2743 CAAGCAGATGATGAGGAGATGATGGATCAGCTTCTTAGACAGGGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166317 CAAGCAGATGATGAGGAGATGATGGATCAGCTTCTTAGACAGGGCTTTCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2793 CCCTCTGAATACACCTGTGGAGAAAATAG         AGAGAAGCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 166367 CCCTCTGAATACACCTGTGGAGAAAATAGGTA...CAGAGAGAAGCAGGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2834 GAAGTGGCAGGCGTCATTCGGTATCGACGCGGAGAATGGTGGCCCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171197 GAAGTGGCAGGCGTCATTCGGTATCGACGCGGAGAATGGTGGCCCTGTAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2884 GACTACGACCCCAGAGAAAGCTCGCCCAACGTCGATGTCGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 171247 GACTACGACCCCAGAGAAAGCTCGCCCAACGTCGATGTCGAGGTA...CA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2926  GCCGAACTTACATTTTGCACAGGAGATATTATTACAGTTTTTGGTGAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172770 GGCCGAACTTACATTTTGCACAGGAGATATTATTACAGTTTTTGGTGAAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2975 TTGATGAAGATGGATTTTATTAT         GGGGAGCTGAACGGGCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| ||||||
 172820 TTGATGAAGATGGATTTTATTATGTA...TAGGGGGAGCTGAATGGGCAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3016 AAAGGCCTTGTGCCCTCAAACTTCTTGGAAGAAGTGCCTGATGACGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179219 AAAGGCCTTGTGCCCTCAAACTTCTTGGAAGAAGTGCCTGATGACGTAGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3066 AGTCTATCTTTCTGATGCTCCATCCCACTACTCTCAAGATACGCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179269 AGTCTATCTTTCTGATGCTCCATCCCACTACTCTCAAGATACGCCAATGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3116 GCTCAAAGGCAAAAAGG         AAGAAGAGTGTTCATTTCATACCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| ||||
 179319 GCTCAAAGGCAAAAAGGGTA...CAGAAGAAGAGTGTTCATTTCACACCT