seq1 = pF1KA0266.tfa, 2298 bp
seq2 = pF1KA0266/gi568815585f_51928805.tfa (gi568815585f:51928805_52131102), 202298 bp

>pF1KA0266 2298
>gi568815585f:51928805_52131102 (Chr13)

1-2298  (100001-102298)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGTGAACCAGGTTGCAGAGAATCTGGCTTTGAGCCACCAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGTGAACCAGGTTGCAGAGAATCTGGCTTTGAGCCACCAGGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTAGTGGATTTGCCAAAAAACTACCCCTTGAGTGAAAATGAAGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTAGTGGATTTGCCAAAAAACTACCCCTTGAGTGAAAATGAAGATGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGACAGTGATGGAGAGAGAAAGCATCAAAAGCTTCTGGAAGCAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGACAGTGATGGAGAGAGAAAGCATCAAAAGCTTCTGGAAGCAATCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTTGATGGAAAGAATAGGCGGAAATTGGCTGAGAGGTCTGAGGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCTTGATGGAAAGAATAGGCGGAAATTGGCTGAGAGGTCTGAGGCTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGAAAGTGTCAGAGTTCAGTGTCAGTTCTGAAGGATCAGGAGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGAAAGTGTCAGAGTTCAGTGTCAGTTCTGAAGGATCAGGAGAAAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGCCTTGCAGATCTGCTTGAGCCCGTTAAAACTTCATCTTCTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGCCTTGCAGATCTGCTTGAGCCCGTTAAAACTTCATCTTCTTTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTGTAAAAAAGCAACTGAATAGAGTCAAATCAAAGAAGGTGGTGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTGTAAAAAAGCAACTGAATAGAGTCAAATCAAAGAAGGTGGTGGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACCTCTTAACAAAGAAAAAATTGAACAGATCCACAGAGAAGTAGCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACCTCTTAACAAAGAAAAAATTGAACAGATCCACAGAGAAGTAGCATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTAAAACCTCACAGGTCCTCTCCAAATGGGACCCTATCATCCTGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTAAAACCTCACAGGTCCTCTCCAAATGGGACCCTATCATCCTGAAGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCAGGCAGAGCAGCTGGTTTTTCCCCTGGGGAAGGAGCAGCCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCAGGCAGAGCAGCTGGTTTTTCCCCTGGGGAAGGAGCAGCCAGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTCCCATTGAACATGCGCTCAGTGGCTGGAAGGCAAGAACTCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCTCCCATTGAACATGCGCTCAGTGGCTGGAAGGCAAGAACTCCCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCAGGAAATTTTTAACCTCCTCCATAAGAACAAGCAGCCAGTGACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCAGGAAATTTTTAACCTCCTCCATAAGAACAAGCAGCCAGTGACAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCTTTACTGACTCCCATGGAAAAGGCCTCTCTCCAAGCCATGAGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCTTTACTGACTCCCATGGAAAAGGCCTCTCTCCAAGCCATGAGCCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGGCAAAGATGCACCGAGCAGAGCTTCAGAGGGCTCGGGCTCTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAGGCAAAGATGCACCGAGCAGAGCTTCAGAGGGCTCGGGCTCTGCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTACTATGAGGCCAAGGCTCGAAAAGAGAAGAAAATCAAAAGTAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTACTATGAGGCCAAGGCTCGAAAAGAGAAGAAAATCAAAAGTAAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATCACAAAGTCGTGAAGAAAGGAAAGGCCAAGAAAGCCTTAAAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATCACAAAGTCGTGAAGAAAGGAAAGGCCAAGAAAGCCTTAAAAGAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAGCAGCTACAGAAGGTTAATCCAACTGTGGCACTGGAAGAAATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAGCAGCTACAGAAGGTTAATCCAACTGTGGCACTGGAAGAAATGGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAATTGAAAATGCCAGAATGATGGAAAGAATGAGCCTTAAGCACCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAATTGAAAATGCCAGAATGATGGAAAGAATGAGCCTTAAGCACCAAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGTGGGAAATGGGCCAAGTCAAAGGCAATTATGGCCAAATATGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGTGGGAAATGGGCCAAGTCAAAGGCAATTATGGCCAAATATGACCTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGCTCGCCAAGCTATGCAGGAACAGTTGGCCAAGAACAAAGAACTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGCTCGCCAAGCTATGCAGGAACAGTTGGCCAAGAACAAAGAACTGACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAAACTCCAGGTAGCCTCTGAGAGTGAGGAAGAGGAGGGAGGCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAAACTCCAGGTAGCCTCTGAGAGTGAGGAAGAGGAGGGAGGCACAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGGAAGAACTCCTTGTCCCTCATGTAGCGAATGAAGTGCAGATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTGGAAGAACTCCTTGTCCCTCATGTAGCGAATGAAGTGCAGATGAATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACGGACCGAATCCCTGGATGTTCAGGAGCTGCACCAGTGACACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGACGGACCGAATCCCTGGATGTTCAGGAGCTGCACCAGTGACACCAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGCTGCAACACAGGAGGACCCTGAGCAAGTGCCAGAGCTTGCAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGCTGCAACACAGGAGGACCCTGAGCAAGTGCCAGAGCTTGCAGCTCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGGTTTCTGCAAGTGAGGCAGAAGAAAGACCAGTGGCAGAGGAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAGGTTTCTGCAAGTGAGGCAGAAGAAAGACCAGTGGCAGAGGAAGAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTTGTTGAGAGAATTTGAGGAAAGGCAATCCCTTAGAAAAAGATCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTTGTTGAGAGAATTTGAGGAAAGGCAATCCCTTAGAAAAAGATCTGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCAACCAGGATGCTGAGCCAGCAAGCAGTCAAGAAACAAAAGATTCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TCAACCAGGATGCTGAGCCAGCAAGCAGTCAAGAAACAAAAGATTCTAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AGCCAGGAGGTGCTGTCCGAATTGAGGGCACTATCTCAGAAATTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AGCCAGGAGGTGCTGTCCGAATTGAGGGCACTATCTCAGAAATTGAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AAAACATCAGTCCAGGAAGCAAAAAGCAAGTTCAGAGGGGACTGTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AAAACATCAGTCCAGGAAGCAAAAAGCAAGTTCAGAGGGGACTGTTCCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGTCCAGAGAGAGGAACCTGCCCCAGAAGAAGCGGAACCCCTATTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGTCCAGAGAGAGGAACCTGCCCCAGAAGAAGCGGAACCCCTATTGCTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CAGAGGTCAGAGAGAGTACAAACTCTGGAAGAGCTAGAAGAGCTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CAGAGGTCAGAGAGAGTACAAACTCTGGAAGAGCTAGAAGAGCTGGGAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGAAGATTGTTTTCAAAATAAGGAGCTTCCCAGACCTGTGTTAGAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGAAGATTGTTTTCAAAATAAGGAGCTTCCCAGACCTGTGTTAGAAGGAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGCAGTCAGAGAGGACCCCAAATAATCGGCCTGATGCCCCTAAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGCAGTCAGAGAGGACCCCAAATAATCGGCCTGATGCCCCTAAGGAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AAAGAGAAGGAGCAACTGATCAACCTACAGAACTTCCTGACCACACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AAAGAGAAGGAGCAACTGATCAACCTACAGAACTTCCTGACCACACAGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TCCTTCCGTGAGGTCTTTGGCAGTTCCCACAATAATAGAGGAGCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TCCTTCCGTGAGGTCTTTGGCAGTTCCCACAATAATAGAGGAGCTGGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ATGAAGAGGAGAGAGACCAAAGGCAGATGATAAAGGAAGCTTTTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ATGAAGAGGAGAGAGACCAAAGGCAGATGATAAAGGAAGCTTTTGCTGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GATGATGTCATCAGAGATTTCTTGAAAGAGAAGAGGGAAGCTGTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GATGATGTCATCAGAGATTTCTTGAAAGAGAAGAGGGAAGCTGTGGAGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GAGTAAGCCAAAGGACGTGGACCTGACACTACCTGGCTGGGGCGAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GAGTAAGCCAAAGGACGTGGACCTGACACTACCTGGCTGGGGCGAGTGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GTGGTGTGGGCCTAAAGCCCAGTGCCAAGAAAAGACGCCAGTTTCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 GTGGTGTGGGCCTAAAGCCCAGTGCCAAGAAAAGACGCCAGTTTCTCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AAAGCCCCTGAGGGTCCTCCAAGAAAAGATAAGAATTTGCCAAATGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AAAGCCCCTGAGGGTCCTCCAAGAAAAGATAAGAATTTGCCAAATGTGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TATCAGTGAGAAGCGCAACATCCACGCAGCAGCTCATCAGGTACAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TATCAGTGAGAAGCGCAACATCCACGCAGCAGCTCATCAGGTACAAGTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 TTCCATATCCATTTACCCACCATCGGCAATTTGAAAGGACCATCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TTCCATATCCATTTACCCACCATCGGCAATTTGAAAGGACCATCCAGACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CCTATAGGATCCACATGGAACACCCAGAGGGCTTTCCAAAAGCTGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CCTATAGGATCCACATGGAACACCCAGAGGGCTTTCCAAAAGCTGACTAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 TCCCAAGGTCGTCACCAAGCCAGGCCATATCATTAAGCCCATAAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 TCCCAAGGTCGTCACCAAGCCAGGCCATATCATTAAGCCCATAAAAGCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 AGGATGTGGGCTACCAGTCTTCCTCAAGGTCAGACCTGCCTGTCATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 AGGATGTGGGCTACCAGTCTTCCTCAAGGTCAGACCTGCCTGTCATACAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2251 AGGAATCCAAAACGAATCACCACACGTCACAATAAAGAAGAAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 AGGAATCCAAAACGAATCACCACACGTCACAATAAAGAAGAAAAACTG