seq1 = pF1KA0249.tfa, 2688 bp
seq2 = pF1KA0249/gi568815580r_2820296.tfa (gi568815580r:2820296_3060840), 240545 bp

>pF1KA0249 2688
>gi568815580r:2820296_3060840 (Chr18)

(complement)

1-192  (100001-100192)   100% ->
193-288  (106242-106337)   100% ->
289-590  (109485-109786)   100% ->
591-698  (120129-120236)   100% ->
699-822  (121238-121361)   100% ->
823-1168  (122804-123149)   100% ->
1169-1268  (126391-126490)   100% ->
1269-1456  (129398-129585)   100% ->
1457-1550  (131683-131776)   100% ->
1551-1620  (132181-132250)   100% ->
1621-1710  (133030-133119)   100% ->
1711-1793  (134036-134118)   100% ->
1794-1938  (135473-135617)   100% ->
1939-2087  (136295-136443)   100% ->
2088-2174  (136980-137066)   100% ->
2175-2327  (138642-138794)   100% ->
2328-2442  (139194-139308)   100% ->
2443-2546  (139960-140063)   100% ->
2547-2688  (140404-140545)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTATGTGGGACAGCTGGCTGGGCAGGTGATTGTCACTGTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTATGTGGGACAGCTGGCTGGGCAGGTGATTGTCACTGTGAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCTACAAGGGCATTAACCAGGCCACCCTCTCTGGGTGCATTGATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTCTACAAGGGCATTAACCAGGCCACCCTCTCTGGGTGCATTGATGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGTGGTACAGCAGCAGGATGGCAGCTATCAGTGTTCACCTTTTCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGTGGTACAGCAGCAGGATGGCAGCTATCAGTGTTCACCTTTTCACGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGTTTGGAAAGCTGGGAGTCCTGAGATCCAAAGAGAAAGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100151 CGGTTTGGAAAGCTGGGAGTCCTGAGATCCAAAGAGAAAGTGGTG...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  ATTGATATAGAAATCAACGGCAGTGCAGTGGATCTTCACATGAAGTTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106241 GATTGATATAGAAATCAACGGCAGTGCAGTGGATCTTCACATGAAGTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGATAACGGAGAAGCTTTCTTTGTTGAGGAGACTGAAGAAGAATAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106291 GTGATAACGGAGAAGCTTTCTTTGTTGAGGAGACTGAAGAAGAATATGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       GAAAAGCTTCCTGCTTACCTTGCCACCTCACCAATTCCTACTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106341 ...AAGGAAAAGCTTCCTGCTTACCTTGCCACCTCACCAATTCCTACTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGATCAGTTCTTTAAAGATATTGACACCCCTTTGGTGAAATCGGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109529 AGATCAGTTCTTTAAAGATATTGACACCCCTTTGGTGAAATCGGGTGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAAACACCATCTCAGAGTTCAGACATCTCACACGTCTTGGAAACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109579 ATGAAACACCATCTCAGAGTTCAGACATCTCACACGTCTTGGAAACAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACAATTTTTACTCCAAGTTCTGTGAAAAAGAAAAAACGAAGGAGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109629 ACAATTTTTACTCCAAGTTCTGTGAAAAAGAAAAAACGAAGGAGAAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATACAAACAGGACAGTAAGAAGGAAGAGCAGGCCGCATCTGCTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109679 ATACAAACAGGACAGTAAGAAGGAAGAGCAGGCCGCATCTGCTGCTGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGACACATGTGATGTAGGCGTGAGCTCCGATGATGACAAGGGGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109729 AAGACACATGTGATGTAGGCGTGAGCTCCGATGATGACAAGGGGGCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCAGCACG         AGGATCTTCAAATGCTTCCTTGAAAGAAGAAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109779 GCAGCACGGTA...CAGAGGATCTTCAAATGCTTCCTTGAAAGAAGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATGTAAAGAGCCTTTGCTCTTCCATTCTGGGGATCATTACCCCTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120162 ATGTAAAGAGCCTTTGCTCTTCCATTCTGGGGATCATTACCCCTTATCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGGAGATTGGTCCCCTTTAGAGAC         CACCTATCCCCAGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 120212 ATGGAGATTGGTCCCCTTTAGAGACGTA...CAGCACCTATCCCCAGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCGTGTCCTAAGAGTGATTCAGAGCTGGAGGTGAAACCTGCGGAGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121254 GCGTGTCCTAAGAGTGATTCAGAGCTGGAGGTGAAACCTGCGGAGAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCTCAGATCAGAGTCTCACATGGAGTGGACGTGGGGCGGATTCCCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121304 GCTCAGATCAGAGTCTCACATGGAGTGGACGTGGGGCGGATTCCCAGAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCACCAAG         GTCAGCAAAAGAGAACGATCTGACCATCATCCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121354 CCACCAAGGTA...TAGGTCAGCAAAAGAGAACGATCTGACCATCATCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGGACAGCTACAATTACACCATCAGAAAATACTCATTTTCGGGTAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122837 AGGACAGCTACAATTACACCATCAGAAAATACTCATTTTCGGGTAATTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGTGAGGACAACCTCATCAGTGAAGTTGAGAAGGATGCTTCCATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122887 CAGTGAGGACAACCTCATCAGTGAAGTTGAGAAGGATGCTTCCATGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACACTGTCTGTACCATAGTGAAGCCCAAACCCAGAGCCCTGGGTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122937 ACACTGTCTGTACCATAGTGAAGCCCAAACCCAGAGCCCTGGGTACACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ATGAGCGACCCAACATCTGTGGCAGAGCTTCTCGAACCTCCTCTTGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122987 ATGAGCGACCCAACATCTGTGGCAGAGCTTCTCGAACCTCCTCTTGAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TACTCAGATTTCATCTATGTTAGATGCTGACCACCTTCCCAACGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123037 TACTCAGATTTCATCTATGTTAGATGCTGACCACCTTCCCAACGCAGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TAGCGGAGGCGCCCTCAGAATCCAAACCGGCAGCTAAAGTAGACTCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123087 TAGCGGAGGCGCCCTCAGAATCCAAACCGGCAGCTAAAGTAGACTCGCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TCAAAGAAGAAAG         GTGTTCACAAAAGAAGCCAACACCAGGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 123137 TCAAAGAAGAAAGGTA...CAGGTGTTCACAAAAGAAGCCAACACCAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ACCTGATGATATTTACCTTGATGACTTAAAGGGTCTAGAACCTGAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126419 ACCTGATGATATTTACCTTGATGACTTAAAGGGTCTAGAACCTGAAGTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAGCTCTTTATTTCCCTAAAAG         TGAATCGGAGCCCGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 126469 CAGCTCTTTATTTCCCTAAAAGGTA...CAGTGAATCGGAGCCCGGTTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AGGCAGTGGCCCGAGTCTGACACACTCTCTGGCTCCCAGTCCCCACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129417 AGGCAGTGGCCCGAGTCTGACACACTCTCTGGCTCCCAGTCCCCACAGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CGTGGGAAGCGCAGCTGCAGATAGCGGCACCGAGTGCCTCTCAGATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129467 CGTGGGAAGCGCAGCTGCAGATAGCGGCACCGAGTGCCTCTCAGATTCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCATGGACTTGCCTGACGTTACCCTCTCCCTTTGCGGGGGCCTCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129517 CCATGGACTTGCCTGACGTTACCCTCTCCCTTTGCGGGGGCCTCAGTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AATGGAGAAATTTCAAAAG         AAAAATTCATGGAGCATATCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 129567 AATGGAGAAATTTCAAAAGGTA...CAGAAAAATTCATGGAGCATATCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TACTTATCACGAATTTGCAGAAAACCCTGGACTTATAGACAATCCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131705 TACTTATCACGAATTTGCAGAAAACCCTGGACTTATAGACAATCCTAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TTGTAATAAGGATATATAATCG         TTACTATAACTGGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 131755 TTGTAATAAGGATATATAATCGGTA...CAGTTACTATAACTGGGCTTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GCAGCTCCCATGATCCTTAGCTTGCAAGTATTCCAGAAGAGCTTGCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132200 GCAGCTCCCATGATCCTTAGCTTGCAAGTATTCCAGAAGAGCTTGCCTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 G         GCCACAGTTGAGTCCTGGGTGAAAGACAAGATGCCAAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132250 GGTG...CAGGCCACAGTTGAGTCCTGGGTGAAAGACAAGATGCCAAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AATCTGGTCGCTGGTGGTTTTGGCGAAAGAGAGAAAGCATGACCAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133070 AATCTGGTCGCTGGTGGTTTTGGCGAAAGAGAGAAAGCATGACCAAACAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711          CTGCCAGAATCCAAGGAGGGAAAATCTGAGGCACCGCCAGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133120 GTA...CAGCTGCCAGAATCCAAGGAGGGAAAATCTGAGGCACCGCCAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CAGTGACCTGCCATCCAGCTCCAAGGAGCCGGCCGGTGCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 134077 CAGTGACCTGCCATCCAGCTCCAAGGAGCCGGCCGGTGCCAGGTG...CA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1794  GCCGGCCGAGAATGACTCCTCGAGTGACGAGGGATCACAGGAGCTCGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135472 GGCCGGCCGAGAATGACTCCTCGAGTGACGAGGGATCACAGGAGCTCGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAATCCATCACAGTGGACCCCATCCCCACAGAGCCCCTGAGCCACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135522 GAATCCATCACAGTGGACCCCATCCCCACAGAGCCCCTGAGCCACGGCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CACAACTTCATATAAGAAGTCTCTCCGCCTCTCCTCAGACCAGATC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 135572 CACAACTTCATATAAGAAGTCTCTCCGCCTCTCCTCAGACCAGATCGTG.

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939      GCAAAACTGAAGCTCCACGATGGCCCAAATGATGTTGTGTTTAGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135622 ..AAGGCAAAACTGAAGCTCCACGATGGCCCAAATGATGTTGTGTTTAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 ATTACAACCCAGTATCAAGGCACCTGTCGCTGTGCAGGGACCATTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136340 ATTACAACCCAGTATCAAGGCACCTGTCGCTGTGCAGGGACCATTTACCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 GTGGAACTGGAATGACAAGATCATCATTTCTGATATTGATGGGACAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136390 GTGGAACTGGAATGACAAGATCATCATTTCTGATATTGATGGGACAATAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 CCAA         GTCGGATGCTTTGGGACAGATTCTCCCACAGCTGGGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136440 CCAAGTA...TAGGTCGGATGCTTTGGGACAGATTCTCCCACAGCTGGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 AAAGACTGGACCCACCAGGGTATAGCAAAGCTCTACCATTCCATCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137017 AAAGACTGGACCCACCAGGGTATAGCAAAGCTCTACCATTCCATCAATGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175          GAATGGCTACAAGTTTCTGTACTGCTCGGCTCGTGCCATCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137067 GTA...CAGGAATGGCTACAAGTTTCTGTACTGCTCGGCTCGTGCCATCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GCATGGCCGACATGACCCGTGGCTACCTGCACTGGGTCAATGACAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138683 GCATGGCCGACATGACCCGTGGCTACCTGCACTGGGTCAATGACAAGGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 ACAATCTTGCCCCGGGGCCCCCTGATGCTGTCCCCCAGCAGCTTGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138733 ACAATCTTGCCCCGGGGCCCCCTGATGCTGTCCCCCAGCAGCTTGTTCTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CGCCTTCCACAG         AGAAGTGATAGAAAAGAAACCAGAGAAGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 138783 CGCCTTCCACAGGTA...TAGAGAAGTGATAGAAAAGAAACCAGAGAAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TCAAAATTGAGTGTCTAAATGATATCAAGAATCTGTTTGCCCCGTCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139223 TCAAAATTGAGTGTCTAAATGATATCAAGAATCTGTTTGCCCCGTCTAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CAGCCCTTCTATGCTGCCTTTGGAAACCGTCCAAAT         GATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 139273 CAGCCCTTCTATGCTGCCTTTGGAAACCGTCCAAATGTG...CAGGATGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CTATGCCTACACACAAGTTGGAGTTCCAGACTGTAGAATATTCACCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139965 CTATGCCTACACACAAGTTGGAGTTCCAGACTGTAGAATATTCACCGTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 ACCCCAAGGGTGAATTAATACAAGAAAGAACCAAAGGAAACAAGTCATC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 140015 ACCCCAAGGGTGAATTAATACAAGAAAGAACCAAAGGAAACAAGTCATCG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2547         GTATCACAGGCTGAGTGAGCTCGTGGAGCATGTGTTCCCCCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140065 TA...TAGGTATCACAGGCTGAGTGAGCTCGTGGAGCATGTGTTCCCCCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 TCTCAGTAAGGAGCAGAATTCCGCTTTTCCCTGCCCGGAGTTCAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140446 TCTCAGTAAGGAGCAGAATTCCGCTTTTCCCTGCCCGGAGTTCAGCTCCT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TCTGCTACTGGCGAGACCCGATCCCTGAAGTGGACCTGGATGACCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140496 TCTGCTACTGGCGAGACCCGATCCCTGAAGTGGACCTGGATGACCTGTCT