Result of SIM4 for
pF1KA0196
seq1 = pF1KA0196.tfa, 3477 bp
seq2 = pF1KA0196/gi568815590r_124924620.tfa (gi568815590r:124924620_125183898), 259279 bp
>pF1KA0196 3477
>gi568815590r:124924620_125183898 (Chr8)
(complement)
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2200-2379 (134714-134893) 100% ->
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2771-2850 (139995-140074) 100% ->
2851-2954 (144001-144104) 100% ->
2955-3084 (144940-145069) 100% ->
3085-3181 (146566-146662) 100% ->
3182-3335 (151505-151658) 99% ->
3336-3423 (155192-155279) 100% ->
3424-3477 (159226-159279) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTTGGACTTTCTAGCCGAGAACAACCTCTGTGGCCAAGCAATCCTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTTGGACTTTCTAGCCGAGAACAACCTCTGTGGCCAAGCAATCCTAAG
50 . : . : . : . : . :
51 GATTGTTTCCTGTGGTAATGCCATCATTGCTGAACTTTTGAGACTCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GATTGTTTCCTGTGGTAATGCCATCATTGCTGAACTTTTGAGACTCTCTG
100 . : . : . : . : . :
101 AGTTTATTCCTGCTGTGTTCAGGTTAAAAGACAGAGCTGATCAACAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGTTTATTCCTGCTGTGTTCAGGTTAAAAGACAGAGCTGATCAACAGAAA
150 . : . : . : . : . :
151 TATGGAGATATCATATTTGATTTCAGCTATTTTAAG GGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
100151 TATGGAGATATCATATTTGATTTCAGCTATTTTAAGGTA...CAGGGTCC
200 . : . : . : . : . :
192 AGAATTATGGGAAAGCAAACTGGATGCTAAGCCAGAGCTACAGGATTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100646 AGAATTATGGGAAAGCAAACTGGATGCTAAGCCAGAGCTACAGGATTTAG
250 . : . : . : . : . :
242 ATGAAGAATTTCGTGAAAACAACATAGAAATTGTGACCAGATTTTATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100696 ATGAAGAATTTCGTGAAAACAACATAGAAATTGTGACCAGATTTTATTTA
300 . : . : . : . : . :
292 GCATTTCAAAGTGTACATAAATATATTGTAGACTTAAACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
100746 GCATTTCAAAGTGTACATAAATATATTGTAGACTTAAACAGGTA...TAG
350 . : . : . : . : . :
333 ATATCTAGATGATCTCAATGAAGGGGTTTATATTCAGCAAACCTTAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101432 ATATCTAGATGATCTCAATGAAGGGGTTTATATTCAGCAAACCTTAGAAA
400 . : . : . : . : . :
383 CTGTGCTTCTCAATGAAGATGGAAAACAACTTCTA TGTGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
101482 CTGTGCTTCTCAATGAAGATGGAAAACAACTTCTAGTA...TAGTGTGAA
450 . : . : . : . : . :
424 GCACTGTACTTATATGGAGTTATGCTACTGGTCATTGACCAAAAGATTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102144 GCACTGTACTTATATGGAGTTATGCTACTGGTCATTGACCAAAAGATTGA
500 . : . : . : . : . :
474 AGGAGAAGTCAGAGAGAGGATGCTGGTTTCTTACTACCGATACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
102194 AGGAGAAGTCAGAGAGAGGATGCTGGTTTCTTACTACCGATACAGGTA..
550 . : . : . : . : . :
519 TGCTGCTCGATCTTCTGCTGATTCAAATATGGACGATATTTGTAAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102244 .CAGTGCTGCTCGATCTTCTGCTGATTCAAATATGGACGATATTTGTAAG
600 . : . : . : . : . :
565 CTGCTTCGAAGTACAGGTTATTCTAGCCAACCAGGTGCCAAAAGACCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105015 CTGCTTCGAAGTACAGGTTATTCTAGCCAACCAGGTGCCAAAAGACCATC
650 . : . : . : . : . :
615 CAACTATCCCGAGAGCTATTTCCAGAGAGTGCCTATCAACGAATCCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105065 CAACTATCCCGAGAGCTATTTCCAGAGAGTGCCTATCAACGAATCCTTCA
700 . : . : . : . : . :
665 TCAGTATGGTCATTGGTCGACTGAGATCTGATGATATTTACAACCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
105115 TCAGTATGGTCATTGGTCGACTGAGATCTGATGATATTTACAACCAGGTG
750 . : . : . : . : . :
712 GTCTCAGCGTATCCTTTGCCGGAGCATCGCAGCACAGCCCTGGC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105165 ...CAGGTCTCAGCGTATCCTTTGCCGGAGCATCGCAGCACAGCCCTGGC
800 . : . : . : . : . :
756 AAACCAAGCTGCCATGCTGTACGTGATTCTCTACTTTGAGCCTTCCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107443 AAACCAAGCTGCCATGCTGTACGTGATTCTCTACTTTGAGCCTTCCATCC
850 . : . : . : . : . :
806 TTCACACCCATCAAGCAAAAATGAGAGAGATAGTGGATAAATACTTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107493 TTCACACCCATCAAGCAAAAATGAGAGAGATAGTGGATAAATACTTTCCA
900 . : . : . : . : . :
856 GATAATTGG GTAATTAGTATTTACATGGGGATCACAGTTAA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
107543 GATAATTGGGCA...CAGGTAATTAGTATTTACATGGGGATCACAGTTAA
950 . : . : . : . : . :
897 TCTAGTAGATGCTTGGGAACCTTACAAAGCTGCAAAAACTGCTTTAAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108820 TCTAGTAGATGCTTGGGAACCTTACAAAGCTGCAAAAACTGCTTTAAATA
1000 . : . : . : . : . :
947 ATACCCTGGACCTTTCAAATGTCAGAGAACAG GCAAGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
108870 ATACCCTGGACCTTTCAAATGTCAGAGAACAGGTA...AAGGCAAGCAGA
1050 . : . : . : . : . :
988 TATGCTACTGTCAGTGAAAGAGTGCATGCTCAAGTGCAGCAATTTCTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110584 TATGCTACTGTCAGTGAAAGAGTGCATGCTCAAGTGCAGCAATTTCTAAA
1100 . : . : . : . : . :
1038 AGAAGGTTATTTAAGGGAGGAGATGGTTCTGGACAATATCCCAAAGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110634 AGAAGGTTATTTAAGGGAGGAGATGGTTCTGGACAATATCCCAAAGCTTC
1150 . : . : . : . : . :
1088 TGAACTGCCTGAGAGACTGCAATGTTGCCATCCGATGGCTGATGCTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110684 TGAACTGCCTGAGAGACTGCAATGTTGCCATCCGATGGCTGATGCTTCAT
1200 . : . : . : . : . :
1138 ACAGCAGACTCAG CCTGTGACCCAAACAACAAACGCCTTCG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
110734 ACAGCAGACTCAGGTA...TAGCCTGTGACCCAAACAACAAACGCCTTCG
1250 . : . : . : . : . :
1179 TCAAATCAAGGACCAGATTCTAACAGACTCTCGGTACAATCCCAGGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116208 TCAAATCAAGGACCAGATTCTAACAGACTCTCGGTACAATCCCAGGATCC
1300 . : . : . : . : . :
1229 TCTTCCAGCTGCTGTTGGATACTGCACAATTTGAGTTTATACTCAAAGAG
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
116258 TCTTCCAGCTGCTGTTAGATACTGCACAATTTGAGTTTATACTCAAAGAG
1350 . : . : . : . : . :
1279 ATGTTCAAGCAAATGCTTTCAGAAAAGCAAACCAAATGGGA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116308 GTA...CAGATGTTCAAGCAAATGCTTTCAGAAAAGCAAACCAAATGGGA
1400 . : . : . : . : . :
1320 GCATTACAAGAAAGAGGGTTCGGAGCGGATGACTGAGCTTGCTGATGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120289 GCATTACAAGAAAGAGGGTTCGGAGCGGATGACTGAGCTTGCTGATGTCT
1450 . : . : . : . : . :
1370 TTTCAGGAGTGAAACCCCTAACCAGAGTGGAGAAAAATG AA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
120339 TTTCAGGAGTGAAACCCCTAACCAGAGTGGAGAAAAATGGTA...TAGAA
1500 . : . : . : . : . :
1411 AACCTTCAAGCTTGGTTCAGAGAGATCTCAAAACAAATATTGTCTTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122707 AACCTTCAAGCTTGGTTCAGAGAGATCTCAAAACAAATATTGTCTTTAAA
1550 . : . : . : . : . :
1461 TTATGATGATTCTACTGCTGCGGGCAGAAAAACTGTACAACTGATACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122757 TTATGATGATTCTACTGCTGCGGGCAGAAAAACTGTACAACTGATACAAG
1600 . : . : . : . : . :
1511 CTTTGGAAGAG GTTCAAGAATTCCACCAGTTGGAATCCAAT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
122807 CTTTGGAAGAGGTA...CAGGTTCAAGAATTCCACCAGTTGGAATCCAAT
1650 . : . : . : . : . :
1552 CTGCAAGTATGTCAGTTTCTTGCCGATACTCGAAAGTTTCTTCATCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124387 CTGCAAGTATGTCAGTTTCTTGCCGATACTCGAAAGTTTCTTCATCAAAT
1700 . : . : . : . : . :
1602 GATCAGAACCATTAACATTAAAGAGGAGGTTCTGATCACAATGCAGATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124437 GATCAGAACCATTAACATTAAAGAGGAGGTTCTGATCACAATGCAGATCG
1750 . : . : . : . : . :
1652 TTGGGGACCTTTCTTTCGCTTGGCAGTTGATTGACAG TTTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
124487 TTGGGGACCTTTCTTTCGCTTGGCAGTTGATTGACAGGTA...CAGTTTC
1800 . : . : . : . : . :
1693 ACATCCATCATGCAAGAAAGCATAAGGGTAAATCCATCCATGGTTACTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124606 ACATCCATCATGCAAGAAAGCATAAGGGTAAATCCATCCATGGTTACTAA
1850 . : . : . : . : . :
1743 ACTCAGAGCTACCTTCCTAAAG CTTGCCTCTGCCCTCGATC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
124656 ACTCAGAGCTACCTTCCTAAAGGTA...CAGCTTGCCTCTGCCCTCGATC
1900 . : . : . : . : . :
1784 TGCCCCTTCTTCGTATTAATCAGGCAAATAGCCCCGACCTGCTCAGCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126252 TGCCCCTTCTTCGTATTAATCAGGCAAATAGCCCCGACCTGCTCAGCGTG
1950 . : . : . : . : . :
1834 TCACAGTACTATTCTGGAGAGTTGGTATCCTATGTGAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
126302 TCACAGTACTATTCTGGAGAGTTGGTATCCTATGTGAGAAAAGTA...AA
2000 . : . : . : . : . :
1876 GTTTTGCAGATCATCCCAGAAAGCATGTTTACATCTCTTCTAAAGATCA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127081 GGTTTTGCAGATCATCCCAGAAAGCATGTTTACATCTCTTCTAAAGATCA
2050 . : . : . : . : . :
1925 TAAAGCTTCAGACCCACGACATTATTGAAGTGCCTACCCGCCTGGACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127131 TAAAGCTTCAGACCCACGACATTATTGAAGTGCCTACCCGCCTGGACAAA
2100 . : . : . : . : . :
1975 GACAAGCTGAGGGACTATGCTCAGCTAGGCCCACGATACGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
127181 GACAAGCTGAGGGACTATGCTCAGCTAGGCCCACGATACGAGGTG...TA
2150 . : . : . : . : . :
2017 GTTGCCAAGCTTACTCATGCTATTTCCATTTTTACTGAAGGCATCTTAA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128227 GGTTGCCAAGCTTACTCATGCTATTTCCATTTTTACTGAAGGCATCTTAA
2200 . : . : . : . : . :
2066 TGATGAAAACGACTTTGGTTGGCATCATCAAG GTGGATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
128277 TGATGAAAACGACTTTGGTTGGCATCATCAAGGTA...TAGGTGGATCCA
2250 . : . : . : . : . :
2107 AAGCAGTTGCTGGAAGATGGAATAAGGAAAGAGCTTGTGAAGCGCGTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133243 AAGCAGTTGCTGGAAGATGGAATAAGGAAAGAGCTTGTGAAGCGCGTTGC
2300 . : . : . : . : . :
2157 CTTTGCCCTGCATAGGGGACTGATATTCAACCCTCGAGCCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
133293 CTTTGCCCTGCATAGGGGACTGATATTCAACCCTCGAGCCAAGGTA...C
2350 . : . : . : . : . :
2200 CCAAGTGAATTGATGCCCAAGCTGAAAGAGTTGGGAGCGACCATGGAT
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134712 AGCCAAGTGAATTGATGCCCAAGCTGAAAGAGTTGGGAGCGACCATGGAT
2400 . : . : . : . : . :
2248 GGATTCCATCGTTCTTTTGAATACATACAGGACTATGTCAACATTTATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134762 GGATTCCATCGTTCTTTTGAATACATACAGGACTATGTCAACATTTATGG
2450 . : . : . : . : . :
2298 TCTGAAGATTTGGCAGGAAGAAGTATCTCGTATCATAAATTACAACGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134812 TCTGAAGATTTGGCAGGAAGAAGTATCTCGTATCATAAATTACAACGTGG
2500 . : . : . : . : . :
2348 AGCAAGAGTGTAATAACTTTCTAAGAACGAAG ATTCAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
134862 AGCAAGAGTGTAATAACTTTCTAAGAACGAAGGTA...TAGATTCAAGAT
2550 . : . : . : . : . :
2389 TGGCAAAGCATGTACCAGTCCACTCATATTCCAATACCCAAGTTTACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136577 TGGCAAAGCATGTACCAGTCCACTCATATTCCAATACCCAAGTTTACCCC
2600 . : . : . : . : . :
2439 TGTGGATGAGTCTGTAACGTTTATTGGTCGACTCTGCAGAGAAATCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136627 TGTGGATGAGTCTGTAACGTTTATTGGTCGACTCTGCAGAGAAATCCTGC
2650 . : . : . : . : . :
2489 GGATCACAGACCCAAA AATGACATGTCACATAGACCAGCTG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
136677 GGATCACAGACCCAAAGTA...TAGAATGACATGTCACATAGACCAGCTG
2700 . : . : . : . : . :
2530 AACACTTGGTATGATATGAAAACTCATCAGGAAGTGACCAGCAGCCGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139226 AACACTTGGTATGATATGAAAACTCATCAGGAAGTGACCAGCAGCCGCCT
2750 . : . : . : . : . :
2580 CTTCTCAGAAATCCAGACCACCTTGGGAACCTTTGGTCTAAATGGCTTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139276 CTTCTCAGAAATCCAGACCACCTTGGGAACCTTTGGTCTAAATGGCTTAG
2800 . : . : . : . : . :
2630 ACAGGCTTCTGTGCTTTATGATTGTAAAAGAGTTACAG AAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
139326 ACAGGCTTCTGTGCTTTATGATTGTAAAAGAGTTACAGGTG...TAGAAT
2850 . : . : . : . : . :
2671 TTCCTCAGTATGTTTCAGAAAATTATCCTGAGAGACAGAACTGTTCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139808 TTCCTCAGTATGTTTCAGAAAATTATCCTGAGAGACAGAACTGTTCAGGA
2900 . : . : . : . : . :
2721 CACTTTAAAAACCCTCATGAATGCTGTCAGTCCCCTAAAAAGTATTGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139858 CACTTTAAAAACCCTCATGAATGCTGTCAGTCCCCTAAAAAGTATTGTCG
2950 . : . : . : . : . :
2771 CAAATTCAAATAAAATTTATTTTTCCGCCATTGCCAAAACA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139908 GTG...CAGCAAATTCAAATAAAATTTATTTTTCCGCCATTGCCAAAACA
3000 . : . : . : . : . :
2812 CAGAAGATTTGGACTGCGTATCTCGAGGCTATAATGAAG GT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
140036 CAGAAGATTTGGACTGCGTATCTCGAGGCTATAATGAAGGTA...CAGGT
3050 . : . : . : . : . :
2853 TGGGCAGATGCAGATTCTGAGACAACAGATTGCCAATGAATTAAATTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144003 TGGGCAGATGCAGATTCTGAGACAACAGATTGCCAATGAATTAAATTATT
3100 . : . : . : . : . :
2903 CTTGTCGGTTTGATTCTAAACATCTGGCAGCTGCTCTGGAGAATCTCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144053 CTTGTCGGTTTGATTCTAAACATCTGGCAGCTGCTCTGGAGAATCTCAAT
3150 . : . : . : . : . :
2953 AA GGCTCTCCTAGCAGACATTGAAGCCCACTATCAGGACCC
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144103 AAGTA...TAGGGCTCTCCTAGCAGACATTGAAGCCCACTATCAGGACCC
3200 . : . : . : . : . :
2994 TTCACTTCCTTACCCCAAAGAAGATAACACACTTTTATATGAAATCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144979 TTCACTTCCTTACCCCAAAGAAGATAACACACTTTTATATGAAATCACAG
3250 . : . : . : . : . :
3044 CCTATCTGGAGGCAGCTGGCATTCACAACCCACTGAATAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
145029 CCTATCTGGAGGCAGCTGGCATTCACAACCCACTGAATAAGGTG...CAG
3300 . : . : . : . : . :
3085 ATATACATAACAACAAAGCGCTTACCCTATTTTCCAATTGTAAACTTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146566 ATATACATAACAACAAAGCGCTTACCCTATTTTCCAATTGTAAACTTTCT
3350 . : . : . : . : . :
3135 ATTTTTGATCGCTCAGTTGCCAAAACTTCAATACAACAAAAATCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
146616 ATTTTTGATCGCTCAGTTGCCAAAACTTCAATACAACAAAAATCTGGGTA
3400 . : . : . : . : . :
3182 GAATGGTCTGCCGAAAACCGACCGACCCGGTTGATTGGCCACCG
...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146666 ...CAGGAATGGTCTGCCGAAAACCGACCGACCCGGTTGATTGGCCACCA
3450 . : . : . : . : . :
3226 CTTGTCCTGGGACTGCTCACTCTGCTGAAGCAGTTCCATTCCCGGTACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151549 CTTGTCCTGGGACTGCTCACTCTGCTGAAGCAGTTCCATTCCCGGTACAC
3500 . : . : . : . : . :
3276 CGAGCAGTTCCTGGCGCTGATTGGCCAGTTTATCTGCTCCACGGTGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151599 CGAGCAGTTCCTGGCGCTGATTGGCCAGTTTATCTGCTCCACGGTGGAGC
3550 . : . : . : . : . :
3326 AGTGTACAAG CCAGAAGATACCTGAAATTCCTGCAGATGTT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
151649 AGTGTACAAGGTA...CAGCCAGAAGATACCTGAAATTCCTGCAGATGTT
3600 . : . : . : . : . :
3367 GTGGGTGCCCTTCTGTTCCTGGAGGATTATGTTCGGTACACAAAGCTACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155223 GTGGGTGCCCTTCTGTTCCTGGAGGATTATGTTCGGTACACAAAGCTACC
3650 . : . : . : . : . :
3417 CAGGAGG GTTGCTGAAGCACATGTGCCTAATTTCATTTTTG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
155273 CAGGAGGGTA...CAGGTTGCTGAAGCACATGTGCCTAATTTCATTTTTG
3700 . : . :
3458 ATGAGTTCAGAACAGTGCTG
||||||||||||||||||||
159260 ATGAGTTCAGAACAGTGCTG