seq1 = pF1KA0178.tfa, 3699 bp
seq2 = pF1KA0178/gi568815575r_53280106.tfa (gi568815575r:53280106_53522600), 242495 bp

>pF1KA0178 3699
>gi568815575r:53280106_53522600 (ChrX)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-298  (107432-107620)   100% ->
299-411  (107731-107843)   100% ->
412-615  (109166-109369)   100% ->
616-854  (109463-109701)   100% ->
855-1113  (110348-110606)   100% ->
1114-1254  (110700-110840)   100% ->
1255-1337  (113098-113180)   100% ->
1338-1545  (113332-113539)   100% ->
1546-1731  (116645-116830)   100% ->
1732-1911  (116929-117108)   100% ->
1912-2058  (117210-117356)   100% ->
2059-2196  (117452-117589)   100% ->
2197-2313  (118708-118824)   100% ->
2314-2420  (118929-119035)   100% ->
2421-2562  (122871-123012)   100% ->
2563-2708  (125984-126129)   100% ->
2709-2862  (126221-126374)   100% ->
2863-2973  (127713-127823)   100% ->
2974-3130  (139348-139504)   100% ->
3131-3285  (139941-140095)   100% ->
3286-3437  (140218-140369)   100% ->
3438-3507  (141514-141583)   100% ->
3508-3618  (141871-141981)   100% ->
3619-3699  (142415-142495)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTTCCTGAAACTGATTGAGATTGAGAACTTTAAGTCGTACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTTCCTGAAACTGATTGAGATTGAGAACTTTAAGTCGTACAAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGACAGATTATCGGACCATTTCAGAGGTTCACCGCCATCATTGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGACAGATTATCGGACCATTTCAGAGGTTCACCGCCATCATTGGACCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGCTCTG         GTAAGTCAAATCTCATGGATGCCATCAGCTTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGCTCTGGTG...TAGGTAAGTCAAATCTCATGGATGCCATCAGCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGCTAGGTGAAAAAACCAGCAACCTGCGGGTAAAGACCCTGCGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107464 GTGCTAGGTGAAAAAACCAGCAACCTGCGGGTAAAGACCCTGCGGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCCATGGAGCTCCTGTGGGCAAGCCAGCTGCCAACCGGGCCTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107514 GATCCATGGAGCTCCTGTGGGCAAGCCAGCTGCCAACCGGGCCTTTGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCATGGTCTACTCTGAGGAGGGTGCTGAGGACCGTACCTTTGCCCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107564 GCATGGTCTACTCTGAGGAGGGTGCTGAGGACCGTACCTTTGCCCGTGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTGTAG         GAGGTTCTTCTGAGTACAAGATCAACAACAAAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107614 ATTGTAGGTG...TAGGAGGTTCTTCTGAGTACAAGATCAACAACAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTCCAACTACATGAGTACAGTGAGGAATTAGAGAAGTTGGGCATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107765 GGTCCAACTACATGAGTACAGTGAGGAATTAGAGAAGTTGGGCATTCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAAAGCTCGTAACTTCCTCGTTTTCCAG         GGTGCTGTGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107815 TCAAAGCTCGTAACTTCCTCGTTTTCCAGGTG...TAGGGTGCTGTGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTATTGCCATGAAGAACCCCAAAGAGAGGACAGCTCTATTTGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109178 TCTATTGCCATGAAGAACCCCAAAGAGAGGACAGCTCTATTTGAAGAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAGTCGTTCTGGGGAGCTGGCGCAGGAGTATGACAAGCGAAAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109228 TAGTCGTTCTGGGGAGCTGGCGCAGGAGTATGACAAGCGAAAGAAGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGTGAAGGCTGAAGAGGACACACAGTTTAATTACCATCGCAAGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109278 TGGTGAAGGCTGAAGAGGACACACAGTTTAATTACCATCGCAAGAAAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTGCGGCTGAACGCAAGGAAGCAAAGCAGGAGAAAGAAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109328 ATTGCGGCTGAACGCAAGGAAGCAAAGCAGGAGAAAGAAGAGGTA...CA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    616  GCTGACCGGTACCAGCGCCTGAAGGATGAGGTAGTACGGGCTCAGGTAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109462 GGCTGACCGGTACCAGCGCCTGAAGGATGAGGTAGTACGGGCTCAGGTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCTGCAGCTCTTTAAGCTTTACCATAATGAAGTGGAAATTGAGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109512 AGCTGCAGCTCTTTAAGCTTTACCATAATGAAGTGGAAATTGAGAAGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACAAGGAACTGGCCTCAAAGAACAAGGAGATCGAGAAGGACAAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109562 AACAAGGAACTGGCCTCAAAGAACAAGGAGATCGAGAAGGACAAGAAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATGGACAAGGTGGAGGATGAACTGAAGGAGAAGAAGAAGGAGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109612 TATGGACAAGGTGGAGGATGAACTGAAGGAGAAGAAGAAGGAGCTGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAATGATGCGGGAGCAGCAGCAGATTGAGAAGGAGATCAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109662 AAATGATGCGGGAGCAGCAGCAGATTGAGAAGGAGATCAAGTA...AAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGAAGGACTCAGAATTGAACCAGAAGCGGCCTCAGTACATCAAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110349 GAGAAGGACTCAGAATTGAACCAGAAGCGGCCTCAGTACATCAAAGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGAGAACACCTCCCACAAAATCAAGAAGCTGGAAGCAGCCAAGAAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110399 GGAGAACACCTCCCACAAAATCAAGAAGCTGGAAGCAGCCAAGAAGTCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGCAGAATGCTCAGAAGCACTACAAGAAGCGTAAAGGTGACATGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110449 TGCAGAATGCTCAGAAGCACTACAAGAAGCGTAAAGGTGACATGGATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGAGAAGGAGATGCTGTCAGTGGAGAAGGCTCGGCAGGAGTTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110499 CTGGAGAAGGAGATGCTGTCAGTGGAGAAGGCTCGGCAGGAGTTTGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACGGATGGAAGAAGAGAGTCAGAGTCAGGGCAGAGATTTGACGTTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110549 ACGGATGGAAGAAGAGAGTCAGAGTCAGGGCAGAGATTTGACGTTGGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGAATCAG         GTGAAGAAATACCACCGGTTGAAAGAAGAAGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110599 AGAATCAGGTA...CAGGTGAAGAAATACCACCGGTTGAAAGAAGAAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AGCAAGAGAGCAGCTACCCTGGCCCAGGAGCTGGAGAAATTCAATCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110733 AGCAAGAGAGCAGCTACCCTGGCCCAGGAGCTGGAGAAATTCAATCGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCAGAAAGCTGACCAGGACCGTCTGGATCTGGAAGAACGGAAGAAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110783 CCAGAAAGCTGACCAGGACCGTCTGGATCTGGAAGAACGGAAGAAAGTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGACAGAG         GCCAAGATCAAGCAAAAGCTGCGGGAAATTGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110833 AGACAGAGGTG...CAGGCCAAGATCAAGCAAAAGCTGCGGGAAATTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAGAATCAGAAGCGGATTGAGAAACTGGAGGAATACATCACCACTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113131 GAGAATCAGAAGCGGATTGAGAAACTGGAGGAATACATCACCACTAGCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338          GCAGTCCCTAGAAGAGCAGAAGAAGCTAGAGGGGGAGCTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113181 GTA...TAGGCAGTCCCTAGAAGAGCAGAAGAAGCTAGAGGGGGAGCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAGAGGAGGTGGAGATGGCCAAGCGGCGTATTGATGAAATCAATAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113373 CAGAGGAGGTGGAGATGGCCAAGCGGCGTATTGATGAAATCAATAAGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CTGAACCAGGTGATGGAGCAGCTAGGGGATGCCCGCATCGACCGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113423 CTGAACCAGGTGATGGAGCAGCTAGGGGATGCCCGCATCGACCGCCAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GAGCAGCCGCCAGCAGCGAAAGGCAGAGATAATGGAAAGCATCAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113473 GAGCAGCCGCCAGCAGCGAAAGGCAGAGATAATGGAAAGCATCAAGCGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TTTACCCTGGCTCTGTG         TACGGCCGCCTCATTGACCTATGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 113523 TTTACCCTGGCTCTGTGGTA...CAGTACGGCCGCCTCATTGACCTATGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGCCCACACAAAAGAAGTATCAGATTGCTGTAACCAAGGTTTTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116669 CAGCCCACACAAAAGAAGTATCAGATTGCTGTAACCAAGGTTTTGGGCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GAACATGGATGCCATTATTGTGGACTCGGAGAAGACAGGCCGGGACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116719 GAACATGGATGCCATTATTGTGGACTCGGAGAAGACAGGCCGGGACTGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TTCAGTATATCAAGGAGCAGCGTGGGGAGCCTGAGACCTTCTTGCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116769 TTCAGTATATCAAGGAGCAGCGTGGGGAGCCTGAGACCTTCTTGCCTCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GACTACCTGGAG         GTGAAGCCTACAGATGAGAAACTCCGGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 116819 GACTACCTGGAGGTG...CAGGTGAAGCCTACAGATGAGAAACTCCGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GCTGAAGGGGGCCAAGCTAGTGATTGATGTGATTCGCTATGAGCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116958 GCTGAAGGGGGCCAAGCTAGTGATTGATGTGATTCGCTATGAGCCACCTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ATATCAAAAAGGCCCTGCAGTATGCTTGTGGCAATGCCCTTGTCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117008 ATATCAAAAAGGCCCTGCAGTATGCTTGTGGCAATGCCCTTGTCTGTGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 AACGTGGAAGATGCCCGCCGCATTGCCTTTGGAGGCCACCAGCGCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117058 AACGTGGAAGATGCCCGCCGCATTGCCTTTGGAGGCCACCAGCGCCACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 G         ACAGTGGCACTGGATGGAACCCTATTCCAGAAGTCAGGAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117108 GGTG...TAGACAGTGGCACTGGATGGAACCCTATTCCAGAAGTCAGGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TGATCTCTGGTGGGGCCAGTGACCTGAAGGCCAAGGCACGGCGCTGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117250 TGATCTCTGGTGGGGCCAGTGACCTGAAGGCCAAGGCACGGCGCTGGGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 GAGAAAGCAGTAGACAAGTTGAAAGAGAAGAAGGAGCGCTTGACAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117300 GAGAAAGCAGTAGACAAGTTGAAAGAGAAGAAGGAGCGCTTGACAGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 GCTGAAA         GAGCAGATGAAGGCAAAACGGAAAGAGGCAGAGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117350 GCTGAAAGTA...CAGGAGCAGATGAAGGCAAAACGGAAAGAGGCAGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGCGTCAGGTGCAGTCTCAGGCCCATGGACTGCAGATGCGGCTCAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117486 TGCGTCAGGTGCAGTCTCAGGCCCATGGACTGCAGATGCGGCTCAAGTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 TCCCAGAGTGACCTAGAACAGACCAAGACACGACATCTAGCCCTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117536 TCCCAGAGTGACCTAGAACAGACCAAGACACGACATCTAGCCCTGAATCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 GCAG         GAAAAATCCAAGCTGGAGAGTGAGCTAGCCAACTTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117586 GCAGGTG...TAGGAAAAATCCAAGCTGGAGAGTGAGCTAGCCAACTTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 GGCCTCGCATTAATGATATCAAGAGGATCATTCAGAGCCGAGAGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118745 GGCCTCGCATTAATGATATCAAGAGGATCATTCAGAGCCGAGAGAGGGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 ATGAAAGACTTGAAGGAGAAGATGAACCAG         GTAGAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 118795 ATGAAAGACTTGAAGGAGAAGATGAACCAGGTT...CAGGTAGAGGATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GGTGTTTGAAGAGTTTTGTCGGGAGATTGGTGTGCGCAACATCCGGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118940 GGTGTTTGAAGAGTTTTGTCGGGAGATTGGTGTGCGCAACATCCGGGAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TTGAGGAAGAAAAGGTGAAACGGCAGAATGAAATCGCCAAGAAGCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118990 TTGAGGAAGAAAAGGTGAAACGGCAGAATGAAATCGCCAAGAAGCGGTA.

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421      TTTGGAGTTTGAGAATCAGAAGACTCGCTTGGGCATTCAGTTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119040 ..CAGTTTGGAGTTTGAGAATCAGAAGACTCGCTTGGGCATTCAGTTGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 TTTTGAAAAGAACCAACTGAAGGAGGACCAAGATAAAGTACACATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122916 TTTTGAAAAGAACCAACTGAAGGAGGACCAAGATAAAGTACACATGTGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 AGCAGACAGTGAAAAAAGATGAAAATGAGATAGAAAAGCTCAAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 122966 AGCAGACAGTGAAAAAAGATGAAAATGAGATAGAAAAGCTCAAAAAGGTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2563       GAGGAACAAAGACACATGAAGATCATAGATGAGACCATGGCTCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123016 ...CAGGAGGAACAAAGACACATGAAGATCATAGATGAGACCATGGCTCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCTACAAGACCTGAAGAATCAGCATCTGGCCAAGAAGTCGGAAGTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126028 GCTACAAGACCTGAAGAATCAGCATCTGGCCAAGAAGTCGGAAGTGAATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 ACAAGAATCATGAGATGGAGGAGATTCGTAAGAAACTCGGGGGCGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126078 ACAAGAATCATGAGATGGAGGAGATTCGTAAGAAACTCGGGGGCGCCAAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 AA         GGAAATGACCCATTTACAGAAGGAGGTGACAGCCATTGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126128 AAGTG...TAGGGAAATGACCCATTTACAGAAGGAGGTGACAGCCATTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 GACCAAGCTTGAACAGAAGCGCAGTGACCGTCACAACTTGCTACAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126260 GACCAAGCTTGAACAGAAGCGCAGTGACCGTCACAACTTGCTACAGGCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 GTAAGATGCAGGACATTAAGTTGCCACTGTCAAAAGGCACCATGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126310 GTAAGATGCAGGACATTAAGTTGCCACTGTCAAAAGGCACCATGGATGAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 ATTAGTCAGGAAGAG         GGTAGCTCCCAGGGGGAGGACTCAGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 126360 ATTAGTCAGGAAGAGGTG...CAGGGTAGCTCCCAGGGGGAGGACTCAGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 GAGTGGTTCACAGAGAATTTCCAGTATCTATGCACGAGAGGCCCTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127739 GAGTGGTTCACAGAGAATTTCCAGTATCTATGCACGAGAGGCCCTCATTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 AGATTGACTACGGTGATCTGTGTGAGGATCTGAAG         GATGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 127789 AGATTGACTACGGTGATCTGTGTGAGGATCTGAAGGTG...CAGGATGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 CAGGCTGAGGAAGAGATCAAGCAAGAGATGAACACACTGCAGCAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139354 CAGGCTGAGGAAGAGATCAAGCAAGAGATGAACACACTGCAGCAGAAGCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 GAATGAGCAGCAGAGTGTGCTTCAGCGTATTGCCGCCCCCAACATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139404 GAATGAGCAGCAGAGTGTGCTTCAGCGTATTGCCGCCCCCAACATGAAGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 CCATGGAAAAGCTGGAAAGTGTCCGAGACAAGTTCCAGGAGACCTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139454 CCATGGAAAAGCTGGAAAGTGTCCGAGACAAGTTCCAGGAGACCTCAGAT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3130 G         AGTTTGAAGCAGCCCGAAAGCGAGCAAAGAAGGCCAAGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139504 GGTA...CAGAGTTTGAAGCAGCCCGAAAGCGAGCAAAGAAGGCCAAGCA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3171 GGCATTCGAACAGATCAAGAAGGAGCGCTTTGACCGCTTCAATGCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139981 GGCATTCGAACAGATCAAGAAGGAGCGCTTTGACCGCTTCAATGCTTGTT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3221 TTGAATCTGTGGCTACCAACATTGATGAGATCTATAAGGCCCTGTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140031 TTGAATCTGTGGCTACCAACATTGATGAGATCTATAAGGCCCTGTCCCGC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3271 AATAGCAGTGCCCAG         GCATTCCTGGGCCCTGAGAACCCTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 140081 AATAGCAGTGCCCAGGTA...TAGGCATTCCTGGGCCCTGAGAACCCTGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3312 AGAGCCCTACTTGGATGGCATCAACTACAACTGTGTGGCTCCTGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140244 AGAGCCCTACTTGGATGGCATCAACTACAACTGTGTGGCTCCTGGGAAAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3362 GCTTCCGGCCTATGGACAACTTGTCAGGCGGGGAGAAGACAGTGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140294 GCTTCCGGCCTATGGACAACTTGTCAGGCGGGGAGAAGACAGTGGCAGCT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3412 CTGGCCCTGCTCTTTGCCATCCACAG         CTACAAGCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 140344 CTGGCCCTGCTCTTTGCCATCCACAGGTA...CAGCTACAAGCCAGCCCC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3453 CTTCTTCGTCCTGGATGAGATTGATGCTGCCTTGGATAACACCAACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141529 CTTCTTCGTCCTGGATGAGATTGATGCTGCCTTGGATAACACCAACATTG

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3503 GCAAG         GTGGCAAATTACATCAAGGAGCAGTCGACTTGCAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141579 GCAAGGTG...CAGGTGGCAAATTACATCAAGGAGCAGTCGACTTGCAAC

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3544 TTCCAGGCCATCGTCATCTCTCTCAAGGAGGAGTTCTACACCAAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141907 TTCCAGGCCATCGTCATCTCTCTCAAGGAGGAGTTCTACACCAAGGCCGA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3594 GAGCCTCATTGGAGTCTATCCTGAG         CAAGGGGACTGTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 141957 GAGCCTCATTGGAGTCTATCCTGAGGTA...CAGCAAGGGGACTGTGTGA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3635 TCAGCAAAGTCCTGACCTTCGACCTCACCAAGTACCCAGATGCCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142431 TCAGCAAAGTCCTGACCTTCGACCTCACCAAGTACCCAGATGCCAACCCC

   3900     .    :    .
   3685 AACCCCAATGAGCAG
        |||||||||||||||
 142481 AACCCCAATGAGCAG