seq1 = pF1KA0156.tfa, 2889 bp
seq2 = pF1KA0156/gi568815586r_108423460.tfa (gi568815586r:108423460_108661154), 237695 bp

>pF1KA0156 2889
>gi568815586r:108423460_108661154 (Chr12)

(complement)

1-312  (100001-100312)   100% ->
313-439  (111941-112067)   100% ->
440-544  (113164-113268)   100% ->
545-729  (115832-116016)   100% ->
730-781  (116677-116728)   100% ->
782-906  (118003-118127)   100% ->
907-1062  (122066-122221)   100% ->
1063-1201  (122952-123090)   100% ->
1202-1309  (123560-123667)   100% ->
1310-1387  (124370-124447)   100% ->
1388-1446  (124583-124641)   100% ->
1447-1556  (125687-125796)   100% ->
1557-1669  (128821-128933)   100% ->
1670-1746  (129875-129951)   100% ->
1747-1915  (130845-131013)   99% ->
1916-2370  (134602-135056)   100% ->
2371-2523  (135546-135698)   100% ->
2524-2714  (136649-136839)   99% ->
2715-2889  (137521-137695)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTGCGGCCGAAACCTCGGCTTCAGAACCCGAGGCTGAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACTGCGGCCGAAACCTCGGCTTCAGAACCCGAGGCTGAGTCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGGCCCAAGGCTGACGGAGAGGAGGATGAGGTTAAGGCGGCTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGGCCCAAGGCTGACGGAGAGGAGGATGAGGTTAAGGCGGCTAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGGAGGAAGGTGTTATCGCGGGCTGTGGCCGCTGCGACATACAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAAGGAGGAAGGTGTTATCGCGGGCTGTGGCCGCTGCGACATACAAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGGGCCAGCGTGGGATCAGCAGGAGGAAGGCGTGAGCGAGAGCGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGGGCCAGCGTGGGATCAGCAGGAGGAAGGCGTGAGCGAGAGCGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATGAGTACGCCATGGCTTCCTCCGCGGAGAGCTCCCCCGGGGAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGATGAGTACGCCATGGCTTCCTCCGCGGAGAGCTCCCCCGGGGAGTACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTGGGAATATGACGAAGAGGAGGAGAAAAACCAGCTGGAGATTGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTGGGAATATGACGAAGAGGAGGAGAAAAACCAGCTGGAGATTGAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGGAGCAG         TTGTCTATCAACGTCTATGACTACAACTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGGAGCAGGTG...TAGTTGTCTATCAACGTCTATGACTACAACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCATGTGGACTTGATCAGACTGCTCAGGCTGGAAGGGGAGCTTACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111970 CCATGTGGACTTGATCAGACTGCTCAGGCTGGAAGGGGAGCTTACCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGAGGATGGCCCGCCAGAAGATGAGTGAAATCTTTCCCTTGACTGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112020 TGAGGATGGCCCGCCAGAAGATGAGTGAAATCTTTCCCTTGACTGAAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    440        AGCTCTGGCTGGAGTGGCTGCATGACGAGATCAGCATGGCCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112070 A...TAGAGCTCTGGCTGGAGTGGCTGCATGACGAGATCAGCATGGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGATGGCCTGGACAGAGAGCACGTGTATGACCTCTTTGAGAAAGCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113207 GGATGGCCTGGACAGAGAGCACGTGTATGACCTCTTTGAGAAAGCCGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGGATTACATTT         GTCCTAACATTTGGCTAGAGTATGGCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113257 AGGATTACATTTGTA...TAGGTCCTAACATTTGGCTAGAGTATGGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACTCAGTTGGTGGGATTGGTCAGAAAGGTGGCCTTGAGAAAGTTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115861 TACTCAGTTGGTGGGATTGGTCAGAAAGGTGGCCTTGAGAAAGTTCGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGTGTTTGAAAGGGCTCTCTCGTCTGTTGGTTTACATATGACCAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115911 CGTGTTTGAAAGGGCTCTCTCGTCTGTTGGTTTACATATGACCAAAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGCCCTCTGGGAGGCTTACCGAGAGTTTGAAAGTGCGATTGTGGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115961 TCGCCCTCTGGGAGGCTTACCGAGAGTTTGAAAGTGCGATTGTGGAAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCTCGG         CTTGAGAAAGTCCACAGTCTTTTCCGGCGACAGTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116011 GCTCGGGTG...CAGCTTGAGAAAGTCCACAGTCTTTTCCGGCGACAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGCGATCCCACTCTATG         ATATGGAGGCCACATTTGCAGAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 116712 GGCGATCCCACTCTATGGTA...TAGATATGGAGGCCACATTTGCAGAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGAAGAATGGTCAGAAGACCCAATACCAGAGTCAGTAATTCAGAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118027 ATGAAGAATGGTCAGAAGACCCAATACCAGAGTCAGTAATTCAGAACTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AACAAAGCACTACAGCAGCTGGAGAAATATAAACCCTATGAAGAAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118077 AACAAAGCACTACAGCAGCTGGAGAAATATAAACCCTATGAAGAAGCACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 G         TTGCAGGCAGAGGCACCAAGGCTGGCAGAATATCAAGCAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118127 GGTA...CAGTTGCAGGCAGAGGCACCAAGGCTGGCAGAATATCAAGCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATATCGATTTTGAGATGAAAATTGGCGATCCTGCTCGCATTCAGTTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122106 ATATCGATTTTGAGATGAAAATTGGCGATCCTGCTCGCATTCAGTTGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTGAGCGCGCCCTGGTCGAGAACTGCCTTGTCCCAGACTTATGGATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122156 TTTGAGCGCGCCCTGGTCGAGAACTGCCTTGTCCCAGACTTATGGATCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTACAGTCAGTACCTA         GATCGACAACTGAAAGTAAAGGATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122206 TTACAGTCAGTACCTAGTA...TAGGATCGACAACTGAAAGTAAAGGATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGTTTTATCTGTACATAACCGCGCTATTAGAAACTGCCCCTGGACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122977 TGGTTTTATCTGTACATAACCGCGCTATTAGAAACTGCCCCTGGACAGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCCTTATGGAGTCGGTACCTCTTGGCCATGGAGAGACATGGAGTTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123027 GCCTTATGGAGTCGGTACCTCTTGGCCATGGAGAGACATGGAGTTGATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCAAGTAATTTCTG         TAACCTTCGAGAAAGCTTTGAATGCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 123077 TCAAGTAATTTCTGGTG...CAGTAACCTTCGAGAAAGCTTTGAATGCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCTTCATCCAGGCCACTGATTATGTGGAGATTTGGCAGGCATACCTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123587 GCTTCATCCAGGCCACTGATTATGTGGAGATTTGGCAGGCATACCTTGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TACCTGAGGAGAAGGGTTGATTTCAAACAAG         ACTCCAGTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 123637 TACCTGAGGAGAAGGGTTGATTTCAAACAAGGTA...TAGACTCCAGTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGAGCTGGAGGAGTTGAGGGCCGCCTTTACTCGTGCCTTGGAGTATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124380 AGAGCTGGAGGAGTTGAGGGCCGCCTTTACTCGTGCCTTGGAGTATCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGCAGGAGGTGGAAGAGC         GTTTCAATGAGAGTGGTGATCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 124430 AGCAGGAGGTGGAAGAGCGTA...AAGGTTTCAATGAGAGTGGTGATCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGCTGCGTGATTATGCAGAACTGGGCTAGGATTGAG         GCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 124606 AGCTGCGTGATTATGCAGAACTGGGCTAGGATTGAGGTA...TAGGCTCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 ACTGTGCAATAACATGCAGAAAGCTCGGGAACTCTGGGATAGCATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125692 ACTGTGCAATAACATGCAGAAAGCTCGGGAACTCTGGGATAGCATCATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCAGAGGAAATGCCAAGTACGCCAACATGTGGCTAGAGTATTACAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125742 CCAGAGGAAATGCCAAGTACGCCAACATGTGGCTAGAGTATTACAACCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GAAAG         AGCTCATGGTGACACCCAGCACTGCCGGAAGGCTCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125792 GAAAGGTA...TAGAGCTCATGGTGACACCCAGCACTGCCGGAAGGCTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCACCGGGCCGTCCAGTGCACCAGTGACTACCCAGAGCACGTCTGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128857 GCACCGGGCCGTCCAGTGCACCAGTGACTACCCAGAGCACGTCTGCGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGTTACTCACCATGGAGAGGACAGAAG         GTTCTTTAGAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 128907 TGTTACTCACCATGGAGAGGACAGAAGGTG...AAGGTTCTTTAGAAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TGGGATATAGCTGTTCAGAAAACTGAAACCCGATTAGCTCGTGTCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129889 TGGGATATAGCTGTTCAGAAAACTGAAACCCGATTAGCTCGTGTCAATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCAGAGAATGAAG         GCTGCAGAGAAGGAAGCAGCCCTTGTGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 129939 GCAGAGAATGAAGGTA...TAGGCTGCAGAGAAGGAAGCAGCCCTTGTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AGCAAGAAGAAGAAAAGGCTGAACAACGGAAAAGAGCTCGGGCTGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130873 AGCAAGAAGAAGAAAAGGCTGAACAACGGAAAAGAGCTCGGGCTGAGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AAAGCGTTAAAAAAGAAGAAAAAGATCAGAGGCCCAGAGAAGCGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130923 AAAGCGTTAAAAAAGAAGAAAAAGATCAGAGGCCCAGAGAAGCGCGGAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 AGATGAGGACGATGAGAAAGAGTGGGGCGATGATGAAGAAG         
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 130973 AGATGAGGATGATGAGAAAGAGTGGGGCGATGATGAAGAAGGTA...TAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AGCAGCCTTCCAAACGCAGAAGGGTCGAGAACAGCATCCCTGCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134602 AGCAGCCTTCCAAACGCAGAAGGGTCGAGAACAGCATCCCTGCAGCTGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GAAACACAAAATGTAGAAGTAGCAGCAGGGCCCGCTGGGAAATGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134652 GAAACACAAAATGTAGAAGTAGCAGCAGGGCCCGCTGGGAAATGTGCTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CGTAGATGTGGAGCCCCCTTCGAAGCAGAAGGAGAAGGCAGCCTCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134702 CGTAGATGTGGAGCCCCCTTCGAAGCAGAAGGAGAAGGCAGCCTCCCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGAGGGACATGCCCAAGGTGCTGCACGACAGCAGCAAGGACAGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134752 AGAGGGACATGCCCAAGGTGCTGCACGACAGCAGCAAGGACAGCATCACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GTCTTTGTCAGCAACCTGCCCTACAGCATGCAGGAGCCGGACACGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134802 GTCTTTGTCAGCAACCTGCCCTACAGCATGCAGGAGCCGGACACGAAGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CAGGCCACTCTTCGAGGCCTGTGGGGAGGTGGTCCAGATCCGACCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134852 CAGGCCACTCTTCGAGGCCTGTGGGGAGGTGGTCCAGATCCGACCCATCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TCAGCAACCGTGGGGATTTCCGAGGTTACTGCTACGTGGAGTTTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134902 TCAGCAACCGTGGGGATTTCCGAGGTTACTGCTACGTGGAGTTTAAAGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GAGAAATCAGCCCTTCAGGCACTGGAGATGGACCGGAAAAGTGTAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134952 GAGAAATCAGCCCTTCAGGCACTGGAGATGGACCGGAAAAGTGTAGAAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GAGGCCAATGTTTGTTTCCCCCTGTGTGGATAAGAGCAAAAACCCCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135002 GAGGCCAATGTTTGTTTCCCCCTGTGTGGATAAGAGCAAAAACCCCGATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TTAAG         GTGTTCAGGTACAGCACTTCCCTAGAGAAACACAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135052 TTAAGGTA...TAGGTGTTCAGGTACAGCACTTCCCTAGAGAAACACAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CTGTTCATCTCAGGCCTGCCTTTCTCCTGTACTAAAGAGGAACTAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135582 CTGTTCATCTCAGGCCTGCCTTTCTCCTGTACTAAAGAGGAACTAGAAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 AATCTGTAAGGCTCATGGCACCGTGAAGGACCTCAGGCTGGTCACCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135632 AATCTGTAAGGCTCATGGCACCGTGAAGGACCTCAGGCTGGTCACCAACC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 GGGCTGGCAAACCAAAG         GGCCTGGCCTACGTGGAGTATGAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135682 GGGCTGGCAAACCAAAGGTC...CAGGGCCTGGCCTACGTGGAGTATGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 AATGAATCCCAGGCGTCGCAGGCTGTGATGAAGATGGACGGCATGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136673 AATGAATCCCAGGCGTCGCAGGCTGTGATGAAGATGGACGGCATGACTAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CAAAGAGAACATCATCAAAGTGGCAATCAGCAACCCTCCTCAGAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136723 CAAAGAGAACATCATCAAAGTGGCAATCAGCAACCCTCCTCAGAGGAAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TTCCAGAGAAGCCAGAGACCAGGAAGGCACCAGGTGGCCCCATGCTTTTG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136773 TTCCAGAGAAGCCGGAGACCAGGAAGGCACCAGGTGGCCCCATGCTTTTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 CCGCAGACATACGGAGC         GAGGGGGAAGGGAAGGACGCAGCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 136823 CCGCAGACATACGGAGCGTA...TAGGAGGGGGAAGGGAAGGACGCAGCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 GTCTCTACTGCCTCGTGCCCTGCAGCGCCCAAGTGCTGCAGCTCCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137545 GTCTCTACTGCCTCGTGCCCTGCAGCGCCCAAGTGCTGCAGCTCCTCAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 CTGAGAACGGCCCTGCCGCGGCTCCTGCAGTTGCCGCCCCAGCAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137595 CTGAGAACGGCCCTGCCGCGGCTCCTGCAGTTGCCGCCCCAGCAGCCACC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 GAGGCACCCAAGATGTCCAATGCCGATTTTGCCAAGCTGTTTCTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137645 GAGGCACCCAAGATGTCCAATGCCGATTTTGCCAAGCTGTTTCTGAGAAA

   3050 
   2889 G
        |
 137695 G