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seq2 = pF1KA0148/gi568815586r_109832981.tfa (gi568815586r:109832981_110096224), 263244 bp

>pF1KA0148 2043
>gi568815586r:109832981_110096224 (Chr12)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-186  (104465-104598)   100% ->
187-299  (106423-106535)   100% ->
300-405  (107157-107262)   100% ->
406-492  (112531-112617)   100% ->
493-623  (112722-112852)   100% ->
624-718  (115179-115273)   100% ->
719-770  (128722-128767)   88% ->
771-822  (130648-130699)   100% ->
823-895  (134540-134612)   100% ->
896-998  (134850-134951)   98% ->
999-1105  (136272-136378)   100% ->
1106-1248  (142991-143133)   100% ->
1249-1497  (148721-148969)   100% ->
1498-1580  (156978-157060)   100% ->
1581-1769  (157657-157845)   100% ->
1770-1833  (162140-162203)   100% ->
1834-2043  (163035-163244)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAAACGGCTCCGGAGCAGCGAGGTGTGCGCTGACTGCAGCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAAACGGCTCCGGAGCAGCGAGGTGTGCGCTGACTGCAGCGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GG         ATCCTTCCTGGGCATCAGTAAATAGGGGAACGTTTTTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGTG...CAGATCCTTCCTGGGCATCAGTAAATAGGGGAACGTTTTTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGATGAGTGCTGCAGTGTCCATCGGAGTCTAGGGCGCCATATCTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104504 GTGATGAGTGCTGCAGTGTCCATCGGAGTCTAGGGCGCCATATCTCCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAGGCATCTGAAACACACACCGTGGCCTCCAACACTGCTTCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104554 GTGAGGCATCTGAAACACACACCGTGGCCTCCAACACTGCTTCAGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     ATGGTTGAGACCTTGTATAATAACGGTGCTAACTCTATATGGGAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104604 .TAGATGGTTGAGACCTTGTATAATAACGGTGCTAACTCTATATGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTCTTTGCTGGACCCTGCGTCTATTATGAGTGGAAGACGTAAAGCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106469 ATTCTTTGCTGGACCCTGCGTCTATTATGAGTGGAAGACGTAAAGCTAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCACAGGATAAAGTACA         TCCCAATAAAGCGGAATTCATCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106519 CCACAGGATAAAGTACAGTG...CAGTCCCAATAAAGCGGAATTCATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCCAAGTATCAGATGTTAGCGTTCGTCCATCGCTTGCCCTGCCGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107181 AGCCAAGTATCAGATGTTAGCGTTCGTCCATCGCTTGCCCTGCCGGGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGATAGTGTGACTGCCAAAGATCTTAGCAAG         CAACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 107231 ACGATAGTGTGACTGCCAAAGATCTTAGCAAGGTG...CAGCAACTCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGAGCGTGAGAACAGGGAATCTTGAAACCTGTTTGAGACTGTTATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112540 TCGAGCGTGAGAACAGGGAATCTTGAAACCTGTTTGAGACTGTTATCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGGAGCACAAGCCAACTTCTTTCATCCT         GAAAAAGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112590 AGGAGCACAAGCCAACTTCTTTCATCCTGTA...TAGGAAAAAGGAAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCCCACTCCATGTTGCCTCCAAAGCAGGGCAGATTTTACAGGCTGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112735 CCCCACTCCATGTTGCCTCCAAAGCAGGGCAGATTTTACAGGCTGAATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTGGCAGTATATGGAGCAGACCCAGGCACACAGGATTCTAGTGGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112785 TTGGCAGTATATGGAGCAGACCCAGGCACACAGGATTCTAGTGGGAAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCCGTTGATTATGCAAG         GCAAGGAGGGCACCATGAGCTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 112835 TCCCGTTGATTATGCAAGGTA...TAGGCAAGGAGGGCACCATGAGCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAGAGCGCCTCGTGGAAATACAGTATGAGCTAACGGACAGACTAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115202 CAGAGCGCCTCGTGGAAATACAGTATGAGCTAACGGACAGACTAGCCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATCTCTGTGGCAGGAAACCAG         ATCACAAAAATGGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115252 TATCTCTGTGGCAGGAAACCAGGTG...CAGATCACAAAAATGGACAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTTTATAATACCTCAAATGGCAGACAGACGGCT         CAGCCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||------>>>...>>>||||||||
 128741 CTTTATAATACCTCAAATGGCAGACAG      GTA...TAGCAGCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATTTGTCTGAATTGGCAAAAGCTGCTAAGAAGAAACTTCAATCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 130656 ATTTGTCTGAATTGGCAAAAGCTGCTAAGAAGAAACTTCAATCTGTG...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    823    CTAAGTAATCATTTGTTTGAAGAACTTGCCATGGATGTGTACGATGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134537 CAGCTAAGTAATCATTTGTTTGAAGAACTTGCCATGGATGTGTACGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 AGTTGACAGGCGAGAGACGGATGCAG         TCTGGCTTGCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 134587 AGTTGACAGGCGAGAGACGGATGCAGGTG...TAGTCTGGCTTGCCACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 AAAACCACAGCGCCCTGGTAACCGAGACAACGGTCGTCCCCTTTCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134865 AAAACCACAGCGCCCTGGTAACCGAGACAACGGTCGTCCCCTTTCTTCCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GTCAATCCTGAGTACTCATCAACACGAAATCAGGGCAG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||-|| >>>...>>>|||
 134915 GTCAATCCTGAGTACTCATCAACACGAAATCAGG CAAGTG...CAGACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GAAGTTAGCTCGGTTCAACGCCCATGAGTTTGCCACGCTGGTCATTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136275 GAAGTTAGCTCGGTTCAACGCCCATGAGTTTGCCACGCTGGTCATTGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TTCTCAGTGACGCCAAGAGGAGACAGCAGGGCAGTTCTCTCTCGGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136325 TTCTCAGTGACGCCAAGAGGAGACAGCAGGGCAGTTCTCTCTCGGGTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AAAG         ACAATGTGGAGCTCATACTGAAAACCATCAATAACCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136375 AAAGGTA...TAGACAATGTGGAGCTCATACTGAAAACCATCAATAACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 GCACAGCGTTGAGAGTCAAGACAACGATCAGCCCGACTATGACAGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143028 GCACAGCGTTGAGAGTCAAGACAACGATCAGCCCGACTATGACAGCGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 CATCAGACGAAGACACAGATTTGGAAACCACTGCAAGCAAAACAAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143078 CATCAGACGAAGACACAGATTTGGAAACCACTGCAAGCAAAACAAACCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CAGAAG         CTTCAAACACTCCAGAGTGAAAATTCGAACCTCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143128 CAGAAGGTG...CAGCTTCAAACACTCCAGAGTGAAAATTCGAACCTCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 GAAACAGGCCACAACCAATGTATATCAGGTGCAAACTGGTTCTGAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148756 GAAACAGGCCACAACCAATGTATATCAGGTGCAAACTGGTTCTGAGTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CAGACACTTCCAACCACTCTTCCTTAAAGAGACGTCCGTCTGCCCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148806 CAGACACTTCCAACCACTCTTCCTTAAAGAGACGTCCGTCTGCCCGGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 AGTAGGCCCATGTCCATGTACGAGACCGGATCAGGTCAGAAACCATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148856 AGTAGGCCCATGTCCATGTACGAGACCGGATCAGGTCAGAAACCATATCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CCCAATGGGAGAAGCGAGCCGCCCCGAAGAGAGCAGGATGAGACTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148906 CCCAATGGGAGAAGCGAGCCGCCCCGAAGAGAGCAGGATGAGACTCCAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCTTCCCCGCGCAC         GCATCCAGGCTGGAGAAGCAGAACAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 148956 CCTTCCCCGCGCACGTA...TAGGCATCCAGGCTGGAGAAGCAGAACAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 ACACCTGAGAGTGACTACGACAACACTCCCAACGACATGGAGCCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157005 ACACCTGAGAGTGACTACGACAACACTCCCAACGACATGGAGCCAGATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CATGGG         GTCAAGCCGAAAGGGACGGCAAAGAAGTATGGTGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157055 CATGGGGTA...CAGGTCAAGCCGAAAGGGACGGCAAAGAAGTATGGTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 GGCCAGGGGATGGCTTGGTACCAGACACAGCAGAACCCCATGTGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157692 GGCCAGGGGATGGCTTGGTACCAGACACAGCAGAACCCCATGTGGCCCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 AGCCCCACTCTCCCTAGCACCGAAGATGTCATCAGGAAGACTGAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157742 AGCCCCACTCTCCCTAGCACCGAAGATGTCATCAGGAAGACTGAACAGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CACCAAAAACATACAGGAGCTCTTAAGAGCAGCCCAAGAAAATAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157792 CACCAAAAACATACAGGAGCTCTTAAGAGCAGCCCAAGAAAATAAACATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 ACAG         TTATATTCCCTGCTCAGAGAGGATACACGTAGCTGTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157842 ACAGGTA...CAGTTATATTCCCTGCTCAGAGAGGATACACGTAGCTGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 ACAGAAATGGCAGCATTATTCCCCAAA         AAACCCAAGTCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 162177 ACAGAAATGGCAGCATTATTCCCCAAAGTA...TAGAAACCCAAGTCTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 TATGGTGAGGACTTCCCTTCGTTTACTGACGTCCAGTGCCTACCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163049 TATGGTGAGGACTTCCCTTCGTTTACTGACGTCCAGTGCCTACCGACTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 AGTCAGAGTGCAAGAAGACCCTCCCAGGGGACCCCGGCTCACCCACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163099 AGTCAGAGTGCAAGAAGACCCTCCCAGGGGACCCCGGCTCACCCACAGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 GTTCAGCTGGTCACGCAGCAGGTCATCCAGTGTGCGTACGACATCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163149 GTTCAGCTGGTCACGCAGCAGGTCATCCAGTGTGCGTACGACATCGCCAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1998 GGCTGCCAAGCAGCTGGTTACCATCACCACCAAAGAGAACAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163199 GGCTGCCAAGCAGCTGGTTACCATCACCACCAAAGAGAACAACAAC