seq1 = pF1KA0130.tfa, 2967 bp
seq2 = pF1KA0130/gi568815581r_39919532.tfa (gi568815581r:39919532_40153598), 234067 bp

>pF1KA0130 2967
>gi568815581r:39919532_40153598 (Chr17)

(complement)

1-130  (100001-100130)   99% ->
131-213  (100219-100301)   100% ->
214-252  (117445-117483)   100% ->
253-326  (117804-117877)   100% ->
327-559  (118250-118482)   100% ->
560-671  (120143-120254)   99% ->
672-822  (120393-120543)   100% ->
823-936  (120837-120950)   100% ->
937-984  (121509-121556)   100% ->
985-1067  (121979-122061)   100% ->
1068-1154  (122354-122440)   100% ->
1155-1266  (123740-123851)   100% ->
1267-1409  (124631-124773)   100% ->
1410-1447  (125653-125690)   100% ->
1448-1530  (126134-126216)   100% ->
1531-1709  (126565-126743)   100% ->
1710-1809  (126853-126952)   100% ->
1810-1985  (127268-127443)   100% ->
1986-2250  (130204-130468)   99% ->
2251-2432  (130773-130954)   100% ->
2433-2523  (131115-131205)   100% ->
2524-2623  (131545-131644)   100% ->
2624-2704  (133246-133326)   100% ->
2705-2853  (133666-133814)   100% ->
2854-2967  (133954-134067)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTGGTCAACCTGAAGCAAGCCATTTTGCAAGCCTGGAAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTGGTCAACCTGAAGCAAGCCATTTTGCAAGCCTGGAAGGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGAGTTACTACCAATGGGCAATCAACATGAAGAAATTCTTTCCTAAAG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGAGTGACTACCAATGGGCAATCAACATGAAGAAATTCTTTCCTAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGCCACCTGGGATATTCTCAACCTGGCAG         ATGCGTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 GAGCCACCTGGGATATTCTCAACCTGGCAGGTC...CAGATGCGTTACTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCAGGCCATGATTGGACCATCCCCCAATCCTCTCATCTTGTCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100230 GAGCAGGCCATGATTGGACCATCCCCCAATCCTCTCATCTTGTCCTACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGTATGCCATTAGTTCCCAG         ATGGTGTCCTACTCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100280 GAAGTATGCCATTAGTTCCCAGGTA...CAGATGGTGTCCTACTCTTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCTCACAGCCATCAGTAAG         TTTGATGACTTTTCTCGGGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117464 TCCTCACAGCCATCAGTAAGGTA...CAGTTTGATGACTTTTCTCGGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGTGTGTCCAGGCATTGCTGGACATCATGGACATGTTTTGTGACCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117825 CTGTGTGTCCAGGCATTGCTGGACATCATGGACATGTTTTGTGACCGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAG         CTGTCACGGCAAAGCAGAGGAATGCATCGGACTGTGCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117875 GAGGTA...TAGCTGTCACGGCAAAGCAGAGGAATGCATCGGACTGTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GAGCCCTTCTTAGCGCCCTCCACTGGCTGCTGCGCTGCACGGCAGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118288 GAGCCCTTCTTAGCGCCCTCCACTGGCTGCTGCGCTGCACGGCAGCCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAGAGCGGCTGCGGGAGGGGCTGGAGGCCGGCACTCCAGCCGCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118338 GCAGAGCGGCTGCGGGAGGGGCTGGAGGCCGGCACTCCAGCCGCTGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGCAGCTTGCCATGTGCCTTCAGCGCCTGGAGAAAACCCTCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118388 GAAGCAGCTTGCCATGTGCCTTCAGCGCCTGGAGAAAACCCTCAGCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAAGAACCGGGCCCTGCTGCACATCGCCAAACTAGAGGAGGCCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 118438 CCAAGAACCGGGCCCTGCTGCACATCGCCAAACTAGAGGAGGCCTGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    560     CTTCTTGGACTGCCATCGAGCATTCTCTCTTGAAACTTGGAGAGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118488 .CAGCTTCTTGGACTGCCATCGAGCATTCTCTCTTGAAACTTGGAGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTGACCAATCTCAGCAACCCGCAGCTCCGGAGTCAGGCCGAGCAGTGTG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120189 CCTGGCCAATCTCAGCAACCCGCAGCTCCGGAGTCAGGCCGAGCAGTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCACCCTCATTAGGAG         CATCCCCACGATGCTGTCTGTGCAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 120239 GCACCCTCATTAGGAGGTA...CAGCATCCCCACGATGCTGTCTGTGCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCGGAGCAGATGCACAAGACCGGCTTCCCCACTGTCCACGCCGTGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120418 GCGGAGCAGATGCACAAGACCGGCTTCCCCACTGTCCACGCCGTGATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTCGAGGGCACCATGAACCTGACAGGCGAGACGCAGTCCCTGGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120468 GCTCGAGGGCACCATGAACCTGACAGGCGAGACGCAGTCCCTGGTGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTGACGATGGTGAAGCGCATGCAG         CATATCCCCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 120518 AGCTGACGATGGTGAAGCGCATGCAGGTG...CAGCATATCCCCACCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTTTTTGTCCTGGAGATCTGGAAAGCTTGCTTCGTGGGGCTCATTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120852 CTTTTTGTCCTGGAGATCTGGAAAGCTTGCTTCGTGGGGCTCATTGAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCCCGAGGGTACGGAGGAGCTCAAGTGGACAGCTTTCACTTTCCTCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 120902 TCCCGAGGGTACGGAGGAGCTCAAGTGGACAGCTTTCACTTTCCTCAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937         ATTCCACAGGTTTTGGTGAAGTTGAAGAAGTACTCTCATGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120952 TA...TAGATTCCACAGGTTTTGGTGAAGTTGAAGAAGTACTCTCATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GACAAG         GACTTCACTGAGGATGTCAACTGTGCTTTTGAGTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121551 GACAAGGTG...TAGGACTTCACTGAGGATGTCAACTGTGCTTTTGAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTGCTGAAGCTCACCCCCTTGTTGGACAAAGCTGACCAGCGCTGCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 122014 CCTGCTGAAGCTCACCCCCTTGTTGGACAAAGCTGACCAGCGCTGCAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1068        CTGTGACTGTACAAACTTCCTGCTCCAAGAATGTGGCAAGCAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122064 A...CAGCTGTGACTGTACAAACTTCCTGCTCCAAGAATGTGGCAAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GGGCTTCTGTCTGAGGCCAGCGTCAACAACCTTATGGCTAAGCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 122397 GGGCTTCTGTCTGAGGCCAGCGTCAACAACCTTATGGCTAAGCGGTA...

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1155    CAAAGCGGACCGAGAGCACGCACCCCAGCAGAAATCGGGAGAGAATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123737 CAGCAAAGCGGACCGAGAGCACGCACCCCAGCAGAAATCGGGAGAGAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CCAACATCCAGCCCAACATCCAGCTGATCCTCCGGGCGGAGCCCACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123787 CCAACATCCAGCCCAACATCCAGCTGATCCTCCGGGCGGAGCCCACTGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 ACAAACATCCTCAAG         ACGATGGATGCAGACCACTCTAAGTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123837 ACAAACATCCTCAAGGTG...CAGACGATGGATGCAGACCACTCTAAGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ACCGGAGGGACTGCTGGGAGTCCTGGGCCACATGCTGTCCGGGAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124657 ACCGGAGGGACTGCTGGGAGTCCTGGGCCACATGCTGTCCGGGAAGAGTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TGGACTTGCTGCTGGCTGCCGCCGCCGCCACTGGAAAGCTGAAATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124707 TGGACTTGCTGCTGGCTGCCGCCGCCGCCACTGGAAAGCTGAAATCCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GCCCGGAAATTCATCAA         TTTGAATGAATTCACAACCTATGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 124757 GCCCGGAAATTCATCAAGTG...CAGTTTGAATGAATTCACAACCTATGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CAGCGAAGAAAGCA         CCAAACCGGCCTCCGTCCGGGCCCTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 125677 CAGCGAAGAAAGCAGTA...CAGCCAAACCGGCCTCCGTCCGGGCCCTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TGTTTGACATCTCCTTCCTCATGCTGTGCCATGTGGCCCAGACCTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126161 TGTTTGACATCTCCTTCCTCATGCTGTGCCATGTGGCCCAGACCTATGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 TCAGAG         GTGATTCTGTCCGAGTCGCGCACAGGAGCTGAGGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126211 TCAGAGGTG...CAGGTGATTCTGTCCGAGTCGCGCACAGGAGCTGAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 GCCCTTCTTCGAGACCTGGATGCAGACCTGCATGCCTGAGGAGGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126600 GCCCTTCTTCGAGACCTGGATGCAGACCTGCATGCCTGAGGAGGGCAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TCCTGAACCCTGACCACCCCTGCTTCCGCCCCGACTCCACCAAAGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126650 TCCTGAACCCTGACCACCCCTGCTTCCGCCCCGACTCCACCAAAGTGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TCCCTGGTGGCCCTGCTCAACAACTCCTCGGAGATGAAGCTAGT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 126700 TCCCTGGTGGCCCTGCTCAACAACTCCTCGGAGATGAAGCTAGTGTC...

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1710    GCAGATGAAGTGGCATGAGGCCTGTCTCAGCATCTCAGCCGCCATCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126850 CAGGCAGATGAAGTGGCATGAGGCCTGTCTCAGCATCTCAGCCGCCATCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 TGGAAATCCTCAATGCCTGGGAGAATGGGGTCCTGGCCTTCGAGTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126900 TGGAAATCCTCAATGCCTGGGAGAATGGGGTCCTGGCCTTCGAGTCCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 CAG         AAAATCACTGATAACATCAAAGGGAAGGTATGCAGTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126950 CAGGTA...TAGAAAATCACTGATAACATCAAAGGGAAGGTATGCAGTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 GGCGGTGTGTGCTGTGGCTTGGCTTGTGGCCCACGTCCGGATGCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127306 GGCGGTGTGTGCTGTGGCTTGGCTTGTGGCCCACGTCCGGATGCTGGGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TGGATGAGCGTGAGAAGTCGCTGCAGATGATCCGCCAGCTGGCAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127356 TGGATGAGCGTGAGAAGTCGCTGCAGATGATCCGCCAGCTGGCAGGGCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 CTGTTTAGTGAGAACACCCTGCAGTTCTACAATGAGAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127406 CTGTTTAGTGAGAACACCCTGCAGTTCTACAATGAGAGGTC...CAGGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 GGTGATCATGAACTCGATCCTGGAGCGCATGTGTGCCGACGTGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130207 GGTGATCATGAACTCGATCCTGGAGCGCATGTGTGCCGACGTGCTGCAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 AGACAGCCACGCAGATCAAGTTTCCCTCCACCGGGGTGGACACAATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130257 AGACAGCCACGCAGATCAAGTTTCCCTCCACCGGGGTGGACACAATGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 TACTGGAACCTGCTGCCCCCCAAGCGGCCCATCAAAGAGGTGCTGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130307 TACTGGAACCTGCTGCCCCCCAAGCGGCCCATCAAAGAGGTGCTGACGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CATTTTTGCCAAGGTGCTGGAGAAGGGCTGGGTAGACAGCCGCTCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 130357 CATTTTTGCCAAGGTGCTGGAGAAGGGCTGGGTGGACAGCCGCTCCATCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 ACATCTTTGACACCCTGCTGCACATGGGCGGCGTCTACTGGTTCTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130407 ACATCTTTGACACCCTGCTGCACATGGGCGGCGTCTACTGGTTCTGCAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 AACCTGATTAAG         GAGCTGCTGAAGGAGACGCGGAAGGAGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 130457 AACCTGATTAAGGTA...TAGGAGCTGCTGAAGGAGACGCGGAAGGAGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CACGCTGCGGGCAGTGGAGCTGCTCTACTCCATCTTCTGCCTGGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130802 CACGCTGCGGGCAGTGGAGCTGCTCTACTCCATCTTCTGCCTGGACATGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AGCAAGTGACCCTGGTCCTGCTGGGCCACATCCTACCTGGCCTGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130852 AGCAAGTGACCCTGGTCCTGCTGGGCCACATCCTACCTGGCCTGCTCACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GACTCCTCCAAGTGGCACAGCCTCATGGACCCCCCGGGCACTGCTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130902 GACTCCTCCAAGTGGCACAGCCTCATGGACCCCCCGGGCACTGCTCTTGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 CAA         GCTGGCCGTGTGGTGTGCCCTCAGTTCCTACTCCTCCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130952 CAAGTA...CAGGCTGGCCGTGTGGTGTGCCCTCAGTTCCTACTCCTCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 ACAAGGGACAGGCGTCCACCCGCCAGAAGAAGAGACACCGCGAAGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131153 ACAAGGGACAGGCGTCCACCCGCCAGAAGAAGAGACACCGCGAAGACATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 GAG         GATTATATCAGCCTCTTCCCCCTGGACGATGTGCAGCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131203 GAGGTA...TAGGATTATATCAGCCTCTTCCCCCTGGACGATGTGCAGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 TTCGAAGTTGATGCGACTGCTGAGCTCTAATGAGGACGATGCCAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131583 TTCGAAGTTGATGCGACTGCTGAGCTCTAATGAGGACGATGCCAACATCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 TTTCGAGCCCCA         CAGACCGATCCATGAGCAGCTCCCTCTCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131633 TTTCGAGCCCCAGTG...CAGCAGACCGATCCATGAGCAGCTCCCTCTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 GCCTCTCAGCTCCACACGGTCAACATGCGGGACCCTCTGAACCGAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133275 GCCTCTCAGCTCCACACGGTCAACATGCGGGACCCTCTGAACCGAGTCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 GG         CCAACCTGTTCCTGCTCATCTCCTCCATCCTGGGGTCTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133325 GGGTG...CAGCCAACCTGTTCCTGCTCATCTCCTCCATCCTGGGGTCTC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 GCACCGCTGGCCCCCACACCCAGTTCGTGCAGTGGTTCATGGAGGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133705 GCACCGCTGGCCCCCACACCCAGTTCGTGCAGTGGTTCATGGAGGAGTGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 GTGGACTGCCTGGAGCAGGGTGGCCGTGGCAGCGTCCTGCAGTTCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133755 GTGGACTGCCTGGAGCAGGGTGGCCGTGGCAGCGTCCTGCAGTTCATGCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 CTTCACCACC         GTGTCGGAACTGGTGAAGGTGTCAGCCATGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 133805 CTTCACCACCGTG...CAGGTGTCGGAACTGGTGAAGGTGTCAGCCATGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 CCAGCCCCAAGGTGGTTCTGGCCATCACGGACCTCAGCCTGCCCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133985 CCAGCCCCAAGGTGGTTCTGGCCATCACGGACCTCAGCCTGCCCCTGGGC

   3150     .    :    .    :    .    :
   2935 CGCCAGGTGGCTGCTAAAGCCATTGCTGCACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 134035 CGCCAGGTGGCTGCTAAAGCCATTGCTGCACTC