seq1 = pF1KA0099.tfa, 3486 bp
seq2 = pF1KA0099/gi568815597r_30833214.tfa (gi568815597r:30833214_31159566), 326353 bp

>pF1KA0099 3486
>gi568815597r:30833214_31159566 (Chr1)

(complement)

1-363  (100001-100363)   100% ->
364-432  (130703-130771)   100% ->
433-541  (152465-152573)   100% ->
542-720  (153536-153714)   100% ->
721-887  (164347-164513)   100% ->
888-1158  (166907-167177)   100% ->
1159-1252  (178162-178255)   100% ->
1253-1357  (179401-179505)   100% ->
1358-1509  (184765-184916)   100% ->
1510-1648  (191075-191213)   100% ->
1649-1792  (192257-192400)   100% ->
1793-2008  (193370-193585)   100% ->
2009-2245  (194657-194893)   100% ->
2246-2513  (205586-205853)   99% ->
2514-2643  (207204-207333)   98% ->
2644-2778  (209306-209440)   100% ->
2779-2916  (214084-214221)   100% ->
2917-3042  (217444-217569)   100% ->
3043-3164  (218295-218416)   100% ->
3165-3357  (222732-222924)   100% ->
3358-3486  (226225-226353)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGTTGCATGTGTCTTGAAGAGAAAAGCAGTGCTTTGGCAGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCAGCCCCCACCTGAAACATCACCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCAGCCCCCACCTGAAACATCACCCTCAAGAACCAGCTAATCCCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCTGTTGTTTTGACATCTGGAACAGGGTCGCAAGCGCAGCCACAACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGCAAATCAGGCTCTTGCAGCTGGGACTCACTCCAGCCCTGTCCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCTATAGGAGTTGCAGGCCGTTCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCTATAGGAGTTGCAGGCCGTTCCCAGGACGACGCTATGGTGGACTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTTCAGAGGCAGCATGGTGAGCAGCTTGGGGGAGGAGGAAGTGGAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGGCTATAATAATAGCAAACATCGATGGCCTACTGGGGATAACATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCAGAACATCAG         GTGCGTTCCATGGATGAACTGAATCATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCAGAACATCAGGTA...TAGGTGCGTTCCATGGATGAACTGAATCATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 130731 ATTTTCAAGCACTTGCTCTGGAGGGAAGAGCGATGGGAGAGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCTCTTGCCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152465 CAGCTCTTGCCAGGTAAAAAGTTTTGGGAAACAGATGAATCCAGCAAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCGAGACAGTGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152515 TGGACCAAAAGGAATATTCCTGGGTGATCAATGGCGAGACAGTGCCTGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAACATCAG         ATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 152565 GAACATCAGGTA...TAGATCATTCAGTTTCCCAGCCAATCATGGTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGAAGACCTGGTCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153568 AGAAGACCTGGTCAGAGTTTCCATGTGAACAGTGAGGTCAATTCTGTACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTGGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153618 GTCCCCACGATCGGAGAGTGGGGGACTAGGCGTTAGCATGGTGGAGTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 153668 TGTTGAGCTCATCCCCGGGCGATTCCTGTCTAAGAAAAGGAGGATTTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    721       GGCCCAAGGGATGCAGACAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153718 ...CAGGGCCCAAGGGATGCAGACAGTGATGAAAACGACAAAGGTGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164391 GAAGAACAAGGGTACGTTTGATGGAGATAAGCTAGGAGATTTGAAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164441 AGGGTGATGTGATGGACAAGACCAATGGTTTACCAGTGCAGAATGGGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GATGCAGACGTCAAAGATTTTAG         CCGTACCCCTGGTAATTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 164491 GATGCAGACGTCAAAGATTTTAGGTT...TAGCCGTACCCCTGGTAATTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166925 CCAGAACTCTGCTAATGAAGTGGATCTTCTGGGTCCAAACCAGAATGGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166975 CTGAGGGCTTAGCCCAGCTGACCAGCACCAATGGTGCCAAGCCTGTGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167025 GATTTCTCCAACATGGAGTCCCAGAGTGTCCCCTTGGACCCCATGGAACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167075 TGTGGGCATGGAGCCTCTTCAGTTTGATTATTCAGGCACGCAGGTACCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGGACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167125 TGGACTCAGCAGCAGCAACTGTGGGACTTTTTGACTACAATTCTCAACAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAG         CTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGCTGTCCAGCAGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167175 CAGGTA...CAGCTGTTCCAAAGACCTAATGCGCTTGCTGTCCAGCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178200 GACAGCTGCTCAGCAGCAGCAGTATGCACTGGCAGCTGCTCATCAGCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACATCG         CAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178250 ACATCGGTA...CAGCAGGTTTAGCTCCCGCTGCGTTTGTCCCCAATCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179436 TACATCATCAGCGCTGCTCCCCCAGGGACGGACCCCTACACAGCTGGATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGCTGCAGCAGCGACACTAG         GCCCAGCTGTGGTCCCTCACC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 179486 GGCTGCAGCAGCGACACTAGGTG...TAGGCCCAGCTGTGGTCCCTCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AGTATTATGGAGTTACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184786 AGTATTATGGAGTTACTCCCTGGGGAGTCTACCCTGCCAGTCTTTTCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTAATCAACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184836 CAGCAAGCTGCCGCTGCCGCTGCAGCAACTAATTCAGCTAATCAACAGAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAG         GTTCTCCGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 184886 CACCCCACAGGCTCAGCAAGGACAGCAGCAGGTA...CAGGTTCTCCGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191085 GAGGAGCCAGCCAACGTCCTTTGACCCCAAACCAGAACCAGCAGGGACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191135 CAAACGGATCCCCTTGTGGCAGCTGCAGCAGTGAATTCTGCCCTTGCATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAG         GTTATCCGGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 191185 TGGACAAGGTCTGGCAGCAGGCATGCCAGGTG...TAGGTTATCCGGTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192269 TGGCTCCTGCTGCTTACTATGACCAAACTGGTGCCCTTGTAGTGAATGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192319 GGCGCGAGAAATGGTCTTGGAGCTCCTGTTCGACTTGTAGCTCCTGCCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 AGTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAG         GAACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 192369 AGTCATCATTAGTTCCTCAGCTGCACAAGCAGGTG...TAGGAACACAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 AGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCAATAACAACCTGGCATCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193379 AGCCTCAGCCCCAGCCCCAGCAGCAGCCCAATAACAACCTGGCATCCAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193429 TCTTTCTACGGCAACAACTCTCTGAACAGCAATTCACAGAGCAGCTCCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CTTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193479 CTTCTCCCAGGGCTCTGCCCAGCCTGCCAACACATCCTTGGGATTCGGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193529 GTAGCAGTTCTCTCGGCGCCACCCTGGGATCCGCCCTTGGAGGGTTTGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 ACAGCAG         TTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193579 ACAGCAGGTA...TAGTTGCAAACTCCAACACTGGCAGTGGCTCCCGCCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TGACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194691 TGACTCCCTGACTGGCAGCAGTGACCTTTATAAGAGGACATCGAGCAGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTTAGCTTTTCCTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194741 TGACCCCCATTGGACACAGTTTTTATAACGGCCTTAGCTTTTCCTCCTCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194791 CCTGGACCCGTGGGCATGCCTCTCCCTAGTCAGGGACCAGGACATTCACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 GACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194841 GACACCACCTCCTTCCCTCTCTTCACATGGATCCTCTTCAAGCTTAAACC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 TGG         GAGGACTCACGAACGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 194891 TGGGTA...CAGGAGGACTCACGAATGGCAGTGGAAGATACATCTCTGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205624 GCTCCAGGCGCTGAAGCCAAGTACCGCAGTGCAAGCAGCGCCTCCAGCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 CTTCAGCCCGAGCAGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205674 CTTCAGCCCGAGCAGCACTCTTTTCTCTTCCTCTCGTTTGCGATATGGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 TGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGAAGATTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205724 TGTCTGATGTCATGCCTTCTGGCAGGAGCAGGCTTTTGGAAGATTTTCGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205774 AACAACCGGTACCCCAATTTACAACTGCGGGAGATTGCTGGACATATAAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 GGAATTTTCCCAAGACCAGCATGGGTCCAG         ATTCATTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 205824 GGAATTTTCCCAAGACCAGCATGGGTCCAGGTG...CAGATTCATTCAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 TGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207215 TGAAACTGGAGCGTGCCACACCAGCTGAGCGCCAGCTTGTCTTCAATGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 ATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCAATGTGGATGTGTTTGGTAATTACGT
        |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
 207265 ATCCTCCAGGCTGCCTACCAACTCATGGTGGATGTGTTTGGTAATTACGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 CATTCAGAAGTTCTTTGAA         TTTGGCAGTCTTGAACAGAAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 207315 CATTCAGAAGTTCTTTGAAGTA...TAGTTTGGCAGTCTTGAACAGAAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 TGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209328 TGGCTTTGGCAGAACGGATTCGAGGCCACGTCCTGTCATTGGCACTACAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 ATGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209378 ATGTATGGCTGCCGTGTTATCCAGAAAGCTCTTGAGTTTATTCCTTCAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 CCAGCAGGTAATT         AATGAGATGGTTCGGGAACTAGATGGCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 209428 CCAGCAGGTAATTGTA...TAGAATGAGATGGTTCGGGAACTAGATGGCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 ATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214112 ATGTCTTGAAGTGTGTGAAAGATCAGAATGGCAATCACGTGGTTCAGAAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 TGCATTGAATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214162 TGCATTGAATGTGTACAGCCCCAGTCTTTGCAATTTATCATCGATGCGTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 TAAGGGACAG         GTATTTGCCTTATCCACACATCCTTATGGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 214212 TAAGGGACAGGTA...TAGGTATTTGCCTTATCCACACATCCTTATGGCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 GCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217475 GCCGAGTGATTCAGAGAATCCTGGAGCACTGTCTCCCTGACCAGACACTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 CCTATTTTAGAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 217525 CCTATTTTAGAGGAGCTTCACCAGCACACAGAGCAGCTTGTACAGGTA..

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3043     GATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217575 .CAGGATCAATATGGAAATTATGTAATCCAACATGTACTGGAGCACGGTC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 GTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218341 GTCCTGAGGATAAAAGCAAAATTGTAGCAGAAATCCGAGGCAATGTACTT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 GTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAAG         CAATGTTGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 218391 GTATTGAGTCAGCACAAATTTGCAAGGTA...CAGCAATGTTGTGGAGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3180 GTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222747 GTGTGTTACTCACGCCTCACGTACGGAGCGCGCTGTGCTCATCGATGAGG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3230 TGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222797 TGTGCACCATGAACGACGGTCCCCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3280 GACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGATGATTGACGTGGCGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222847 GACCAGTATGCCAACTACGTGGTCCAGAAGATGATTGACGTGGCGGAGCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 AGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAG         ATCCGGCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 222897 AGGCCAGCGGAAGATCGTCATGCATAAGGTA...CAGATCCGGCCCCACA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3371 TCGCAACTCTTCGTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226238 TCGCAACTCTTCGTAAGTACACCTATGGCAAGCACATTCTGGCCAAGCTG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3421 GAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCCATCTGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226288 GAGAAGTACTACATGAAGAACGGTGTTGACTTAGGGCCCATCTGTGGCCC

   3650     .    :    .
   3471 CCCTAATGGTATCATC
        ||||||||||||||||
 226338 CCCTAATGGTATCATC