seq1 = pF1KA0095.tfa, 2457 bp
seq2 = pF1KA0095/gi568815582f_56648248.tfa (gi568815582f:56648248_56944606), 296359 bp

>pF1KA0095 2457
>gi568815582f:56648248_56944606 (Chr16)

1-179  (100001-100179)   100% ->
180-297  (110291-110408)   100% ->
298-360  (150229-150291)   100% ->
361-489  (157257-157385)   100% ->
490-564  (170417-170491)   100% ->
565-654  (173257-173346)   98% ->
655-794  (175460-175599)   100% ->
795-927  (180730-180862)   100% ->
928-1085  (182281-182438)   100% ->
1086-1251  (183595-183760)   100% ->
1252-1345  (184048-184141)   100% ->
1346-1537  (184968-185159)   100% ->
1538-1664  (185881-186007)   100% ->
1665-1737  (186123-186195)   100% ->
1738-1782  (186487-186531)   100% ->
1783-1899  (188354-188470)   100% ->
1900-2018  (189361-189479)   100% ->
2019-2136  (190705-190822)   100% ->
2137-2220  (191274-191357)   98% ->
2221-2349  (193458-193586)   100% ->
2350-2457  (196252-196359)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATACTGAGGGGTTTGGTGAGCTCCTTCAGCAAGCTGAACAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATACTGAGGGGTTTGGTGAGCTCCTTCAGCAAGCTGAACAGCTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGAGACTGAGGGCATCTCAGAGCTTCCCCATGTGGAACGGAACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGAGACTGAGGGCATCTCAGAGCTTCCCCATGTGGAACGGAACTTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGATCCAGCAGGCGGGAGAGCGCCTGCGTTCCCGTACCCTAACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGATCCAGCAGGCGGGAGAGCGCCTGCGTTCCCGTACCCTAACACGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGTCCCAGGAGACGGCAGATGTCAAGGC         GTCAGTTCTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100151 ACGTCCCAGGAGACGGCAGATGTCAAGGCGTG...TAGGTCAGTTCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGGTCTCGGGGACTTGACATATCCCACATCTCCCAGCGATTGGAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110303 CGGGTCTCGGGGACTTGACATATCCCACATCTCCCAGCGATTGGAGAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAGTGCAGCCACCACCTTTGAGCCTCTTGAGCCTGTGAAGGACACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110353 TGAGTGCAGCCACCACCTTTGAGCCTCTTGAGCCTGTGAAGGACACTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTCAG         GGCTTCCTGAAGAATGAGAAGGACAATGCCCTGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110403 ATTCAGGTA...TAGGGCTTCCTGAAGAATGAGAAGGACAATGCCCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCTGCCATCGAAGAGTCCCGGAAGAGG         ACCTTCGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 150264 GTCTGCCATCGAAGAGTCCCGGAAGAGGGTA...CAGACCTTCGGCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGAGGAGTACCATCGGGAGTCAATGTTGGTTGAGTGGGAGCAAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157270 CTGAGGAGTACCATCGGGAGTCAATGTTGGTTGAGTGGGAGCAAGTGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGCGAATTCTGCACACACTGCTGGCATCAGGAGAAGACGCCCTTGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157320 CAGCGAATTCTGCACACACTGCTGGCATCAGGAGAAGACGCCCTTGACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TACTCAAGAAAGCGAG         CCAAGCTACATCAGTGATGTGGGAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 157370 TACTCAAGAAAGCGAGGTA...CAGCCAAGCTACATCAGTGATGTGGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCCCTGGTCGAAGCTCTCTGGATAACATCGAGATGGCCTATGCGCGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170442 CCCCTGGTCGAAGCTCTCTGGATAACATCGAGATGGCCTATGCGCGGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          ATTTATATCTATAATGAGAAAATTGTAAATGGACACCTGCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170492 GTG...CAGATTTATATCTATAATGAGAAAATTGTAAATGGACACCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCCTAACCTGGTGGACCTTTGTGCTTCCGTCGCAGAGCTGGATGATAAG 
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||>
 173298 GCCTAACCTGGTGGACCTTTGTGCTTCCGTCGCAGAGCTCGATGATAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655         AGCATTTCCGACATGTGGACCATGGTAAAACAAATGACAGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173348 TA...CAGAGCATTTCCGACATGTGGACCATGGTAAAACAAATGACAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GTGTTGTTGACACCGGCAACGGATGCCCTGAAGAACCGCAGCAGCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175502 GTGTTGTTGACACCGGCAACGGATGCCCTGAAGAACCGCAGCAGCGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGTGCGCATGGAGTTTGTCAGGCAGGCCTTGGCGTACCTTGAGCAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 175552 AGTGCGCATGGAGTTTGTCAGGCAGGCCTTGGCGTACCTTGAGCAGAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795        TTATAAGAATTACACCCTTGTGACTGTCTTTGGAAATTTGCAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175602 A...CAGTTATAAGAATTACACCCTTGTGACTGTCTTTGGAAATTTGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGGCCCAGCTGGGCGGGGTGCCTGGGACTTACCAATTGGTTCGAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180773 CAGGCCCAGCTGGGCGGGGTGCCTGGGACTTACCAATTGGTTCGAAGTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTGAACATTAAACTGCCAGCTCCCTTGCCTGGACTACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 180823 CCTGAACATTAAACTGCCAGCTCCCTTGCCTGGACTACAGGTA...TAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGGAGAGGTGGAAGGCCATCCTGTGTGGGCGCTAATTTACTACTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182282 ATGGAGAGGTGGAAGGCCATCCTGTGTGGGCGCTAATTTACTACTGCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CGCTGTGGAGACCTGCTTGCCGCTTCACAGGTAGTTAATCGAGCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182332 CGCTGTGGAGACCTGCTTGCCGCTTCACAGGTAGTTAATCGAGCCCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCAGCTGGGAGAGTTTAAAACCTGGTTCCAGGAGTACATGAACAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182382 CCAGCTGGGAGAGTTTAAAACCTGGTTCCAGGAGTACATGAACAGCAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACAGAAG         ATTGTCCCCAGCTACGGAAAACAAGCTCCGGCTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182432 ACAGAAGGTA...TAGATTGTCCCCAGCTACGGAAAACAAGCTCCGGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CATTACCGTAGGGCCCTCAGGAACAATACAGATCCCTACAAGCGGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183629 CATTACCGTAGGGCCCTCAGGAACAATACAGATCCCTACAAGCGGGCCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTACTGTATCATTGGCAGATGTGACGTCACCGACAACCAGAGTGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183679 GTACTGTATCATTGGCAGATGTGACGTCACCGACAACCAGAGTGAAGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CGGACAAAACTGAGGATTACCTGTGGCTGAAG         TTGAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 183729 CGGACAAAACTGAGGATTACCTGTGGCTGAAGGTA...TAGTTGAACCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GTGTGTTTTGACGACGATGGCACCAGCTCCCCACAAGACAGGCTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184057 GTGTGTTTTGACGACGATGGCACCAGCTCCCCACAAGACAGGCTCACTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTCACAGTTCCAGAAGCAGTTGTTGGAAGACTATG         GCGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 184107 CTCACAGTTCCAGAAGCAGTTGTTGGAAGACTATGGTA...CAGGCGAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCCACTTTACGGTGAACCAGCAACCCTTCCTCTACTTCCAAGTCCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184974 CCCACTTTACGGTGAACCAGCAACCCTTCCTCTACTTCCAAGTCCTGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CTGACAGCGCAGTTTGAAGCAGCAGTTGCCTTTCTTTTCCGCATGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185024 CTGACAGCGCAGTTTGAAGCAGCAGTTGCCTTTCTTTTCCGCATGGAGCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCTGCGCTGCCATGCTGTCCATGTAGCACTGGTGCTGTTTGAGCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185074 GCTGCGCTGCCATGCTGTCCATGTAGCACTGGTGCTGTTTGAGCTGAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TGCTTTTAAAGTCCTCTGGACAGAGTGCTCAGCTCC         TCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 185124 TGCTTTTAAAGTCCTCTGGACAGAGTGCTCAGCTCCGTG...CAGTCAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CACGAGCCTGGTGACCCTCCTTGCTTGCGGCGGCTGAACTTCGTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185886 CACGAGCCTGGTGACCCTCCTTGCTTGCGGCGGCTGAACTTCGTGCGGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCTCATGCTGTACACCCGGAAGTTTGAGTCCACGGACCCAAGGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185936 CCTCATGCTGTACACCCGGAAGTTTGAGTCCACGGACCCAAGGGAGGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TCCAGTACTTCTATTTCCTCAG         GGATGAGAAAGATAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 185986 TCCAGTACTTCTATTTCCTCAGGTA...CAGGGATGAGAAAGATAGTCAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGAGAAAACATGTTTCTGCGCTGTGTGAGTGAGCTTGTGATTGAAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186142 GGAGAAAACATGTTTCTGCGCTGTGTGAGTGAGCTTGTGATTGAAAGCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AGAG         TTCGATATGATTCTTGGGAAACTAGAGAATGACGGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186192 AGAGGTG...CAGTTCGATATGATTCTTGGGAAACTAGAGAATGACGGAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GTAGAAAG         CCTGGAGTCATAGATAAGTTTACTAGTGACACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 186524 GTAGAAAGGTG...CAGCCTGGAGTCATAGATAAGTTTACTAGTGACACA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AAGCCTATTATCAACAAAGTTGCTTCTGTGGCAGAAAATAAAGGACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188387 AAGCCTATTATCAACAAAGTTGCTTCTGTGGCAGAAAATAAAGGACTGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGAAGAGGCAGCAAAGCTGTATGACCTTGCCAAG         AATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 188437 TGAAGAGGCAGCAAAGCTGTATGACCTTGCCAAGGTA...CAGAATGCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ACAAGGTACTGGAGCTGATGAACAAACTGCTGAGCCCTGTCGTCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189368 ACAAGGTACTGGAGCTGATGAACAAACTGCTGAGCCCTGTCGTCCCCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 ATCAGTGCCCCGCAATCCAACAAGGAGAGGCTGAAGAACATGGCACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189418 ATCAGTGCCCCGCAATCCAACAAGGAGAGGCTGAAGAACATGGCACTCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CATTGCCGAACG         GTATAGGGCTCAAGGAATAAGCGCAAATA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 189468 CATTGCCGAACGGTA...CAGGTATAGGGCTCAAGGAATAAGCGCAAATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AATTTGTGGACTCCACGTTCTATCTTCTTTTGGACTTGATCACCTTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190734 AATTTGTGGACTCCACGTTCTATCTTCTTTTGGACTTGATCACCTTTTTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GACGAGTATCATAGTGGTCATATTGATAGAGCTTTTGAT         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 190784 GACGAGTATCATAGTGGTCATATTGATAGAGCTTTTGATGTA...CAGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CATTGAGCGCTTGAAGCTGGTGCCCCTGAATCAGGAAAGTGTGGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191276 CATTGAGCGCTTGAAGCTGGTGCCCCTGAATCAGGAAAGTGTGGAAGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 GAGTGGCTGCTTTCAGAAATTTCAGTGATGAA         ATCAGGCAC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 191326 GAGTGGCTGCCTTCAGAAATTTCAGTGATGAAGTA...TAGATCAGGCAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 AACCTCTCAGAAGTGCTTCTTGCCACCATGAACATCTTGTTCACACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193467 AACCTCTCAGAAGTGCTTCTTGCCACCATGAACATCTTGTTCACACAGTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 TAAGAGGCTCAAGGGGACAAGTCCATCCTCGTCATCCAGGCCCCAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193517 TAAGAGGCTCAAGGGGACAAGTCCATCCTCGTCATCCAGGCCCCAGCGAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 TCATCGAGGACCGCGACTCT         CAACTCCGAAGTCAAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 193567 TCATCGAGGACCGCGACTCTGTA...CAGCAACTCCGAAGTCAAGCCCGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371 ACTCTGATTACCTTTGCTGGAATGATACCATACCGAACGTCTGGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196273 ACTCTGATTACCTTTGCTGGAATGATACCATACCGAACGTCTGGGGACAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .
   2421 CAATGCGAGGCTGGTGCAGATGGAGGTCCTCATGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196323 CAATGCGAGGCTGGTGCAGATGGAGGTCCTCATGAAT